茄子黃萎病抗性鑒定與SSR標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析
發(fā)布時(shí)間:2023-12-02 08:45
茄子黃萎病(Verticillium wilt)為威脅茄子生產(chǎn)最嚴(yán)重的病害之一,是由大麗輪枝孢(Verticillium dahlia Kleb)引起的一種世界性土傳病害,發(fā)生普遍,危害嚴(yán)重,可大幅度降低茄子的產(chǎn)量和品質(zhì)。本研究廣泛收集各種茄子材料(包括栽培種、半栽培種和野生種等),根據(jù)不同來源和性狀,選出255份茄子種質(zhì)資源進(jìn)行黃萎病抗性鑒定工作。另一方面,利用均勻分布在遺傳圖譜上的196個(gè)標(biāo)記對(duì)這255份茄子代表性材料進(jìn)行了遺傳多樣性分析。同時(shí),在進(jìn)行材料群體結(jié)構(gòu)和標(biāo)記間連鎖不平衡分析的基礎(chǔ)上,利用關(guān)聯(lián)分析方法對(duì)供試材料的抗黃萎病病情指數(shù)與SSR標(biāo)記進(jìn)行了關(guān)聯(lián)分析。研究結(jié)果如下:(1)鑒定的255份品種病情指數(shù)在6.7~84之間,抗性差異明顯。其中抗性品種10份,病情指數(shù)為6.7~15;中抗病品種36份,病情指數(shù)為16.7~30;耐病品種149份,病情指數(shù)為31~50;中感品種50份,病情指數(shù)為52.5~67.5;感病品種6份,病情指數(shù)為71~84:另有4個(gè)品種接種不成功。中抗的36份材料占材料總數(shù)的14.1%,其中有三份材料為地方栽培品種。(2)利用196對(duì)引物在所有供試材料組成...
【文章頁數(shù)】:64 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
ABSTRACT
縮略語表
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 茄子抗黃萎病的研究進(jìn)展
1.1.1 黃萎病病原菌鑒定及致病力分化
1.1.2 黃萎病菌致病機(jī)理及抗病機(jī)制
1.1.3 抗黃萎病常規(guī)育種的研究
1.1.4 抗黃萎病分子輔助育種的研究
1.1.5 抗黃萎病基因克隆的研究
1.2 分子標(biāo)記技術(shù)的發(fā)展及應(yīng)用
1.2.1 分子遺傳標(biāo)記技術(shù)的發(fā)展及SSR標(biāo)記特點(diǎn)
1.2.2 SSR分子標(biāo)記技術(shù)在茄子種質(zhì)資源分類上的應(yīng)用
1.3 茄子數(shù)量性狀關(guān)聯(lián)分析的研究
1.3.1 關(guān)聯(lián)分析的方法及步驟
1.3.2 關(guān)聯(lián)分析與連鎖不平衡
1.3.3 關(guān)聯(lián)定位群體的構(gòu)建
1.3.4 關(guān)聯(lián)分析的應(yīng)用與展望
1.4 本研究的目的和意義
1.5 本研究的技術(shù)路線
第二章 茄子種質(zhì)資源黃萎病抗性鑒定
1 材料和方法
1.1 供試材料
1.1.1 供試材料來源
1.1.2 鑒定材料準(zhǔn)備
1.1.3 供試菌株
1.2 方法
1.2.1 孢子懸浮液的制備
1.2.2 接種方法
1.2.3 病情調(diào)查及分級(jí)標(biāo)準(zhǔn)
2 結(jié)果與分析
2.1 鑒定結(jié)果
2.2 抗病類型及其地區(qū)分布
3 討論
3.1 茄子黃萎病抗性篩選
3.2 抗黃萎病類型劃分
第三章 利用關(guān)聯(lián)分析方法挖掘茄子黃萎病抗性位點(diǎn)
1 材料和方法
1.1 供試材料
1.1.1 供試材料來源
1.1.2 SSR引物來源及信息
1.1.3 表型性狀的調(diào)查和分析
1.2 方法
1.2.1 茄子基因DNA的提取與檢測(cè)
1.2.2 DNA工作液及SSR引物工作液制備
1.2.3 多態(tài)性SSR引物的篩選
1.2.4 PCR反應(yīng)體系及反應(yīng)程序的建立
1.2.5 聚丙烯酰胺凝膠電泳
1.2.6 遺傳多樣性及聚類分析
1.2.7 群體親緣關(guān)系系數(shù)分析
1.2.8 群體結(jié)構(gòu)分析
1.2.9 關(guān)聯(lián)分析
1.2.10 優(yōu)異等位變異位點(diǎn)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 DNA樣品質(zhì)量檢測(cè)
2.2 多態(tài)性引物的篩選及PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的可行性分析
2.3 群體遺傳多樣性分析
2.4 茄子品種聚類分析
2.5 群體親緣關(guān)系系數(shù)分析
2.6 材料群體結(jié)構(gòu)分析
2.7 各亞群之間的遺傳關(guān)系分析
2.8 連鎖不平衡分析
2.9 SSR標(biāo)記與茄子黃萎病抗性的關(guān)聯(lián)分析
2.10 優(yōu)異等位變異位點(diǎn)分析
3 討論
3.1 茄子SSR標(biāo)記變異位點(diǎn)
3.2 茄子種質(zhì)間遺傳親緣關(guān)系
3.3 群體遺傳結(jié)構(gòu)
3.4 關(guān)聯(lián)分析中群體結(jié)構(gòu)的影響
3.5 茄子供試群體LD評(píng)價(jià)
3.6 關(guān)聯(lián)分析挖掘黃萎病抗性相關(guān)位點(diǎn)
第四章 全文結(jié)論
4.1 茄子黃萎病抗性鑒定
4.2 茄子種質(zhì)資源遺傳多樣性及群體結(jié)構(gòu)分析
4.3 茄子抗黃萎病關(guān)聯(lián)分析及優(yōu)異等位基因挖掘
4.4 后期研究?jī)?nèi)容
參考文獻(xiàn)
致謝
本文編號(hào):3869316
【文章頁數(shù)】:64 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
ABSTRACT
縮略語表
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 茄子抗黃萎病的研究進(jìn)展
1.1.1 黃萎病病原菌鑒定及致病力分化
1.1.2 黃萎病菌致病機(jī)理及抗病機(jī)制
1.1.3 抗黃萎病常規(guī)育種的研究
1.1.4 抗黃萎病分子輔助育種的研究
1.1.5 抗黃萎病基因克隆的研究
1.2 分子標(biāo)記技術(shù)的發(fā)展及應(yīng)用
1.2.1 分子遺傳標(biāo)記技術(shù)的發(fā)展及SSR標(biāo)記特點(diǎn)
1.2.2 SSR分子標(biāo)記技術(shù)在茄子種質(zhì)資源分類上的應(yīng)用
1.3 茄子數(shù)量性狀關(guān)聯(lián)分析的研究
1.3.1 關(guān)聯(lián)分析的方法及步驟
1.3.2 關(guān)聯(lián)分析與連鎖不平衡
1.3.3 關(guān)聯(lián)定位群體的構(gòu)建
1.3.4 關(guān)聯(lián)分析的應(yīng)用與展望
1.4 本研究的目的和意義
1.5 本研究的技術(shù)路線
第二章 茄子種質(zhì)資源黃萎病抗性鑒定
1 材料和方法
1.1 供試材料
1.1.1 供試材料來源
1.1.2 鑒定材料準(zhǔn)備
1.1.3 供試菌株
1.2 方法
1.2.1 孢子懸浮液的制備
1.2.2 接種方法
1.2.3 病情調(diào)查及分級(jí)標(biāo)準(zhǔn)
2 結(jié)果與分析
2.1 鑒定結(jié)果
2.2 抗病類型及其地區(qū)分布
3 討論
3.1 茄子黃萎病抗性篩選
3.2 抗黃萎病類型劃分
第三章 利用關(guān)聯(lián)分析方法挖掘茄子黃萎病抗性位點(diǎn)
1 材料和方法
1.1 供試材料
1.1.1 供試材料來源
1.1.2 SSR引物來源及信息
1.1.3 表型性狀的調(diào)查和分析
1.2 方法
1.2.1 茄子基因DNA的提取與檢測(cè)
1.2.2 DNA工作液及SSR引物工作液制備
1.2.3 多態(tài)性SSR引物的篩選
1.2.4 PCR反應(yīng)體系及反應(yīng)程序的建立
1.2.5 聚丙烯酰胺凝膠電泳
1.2.6 遺傳多樣性及聚類分析
1.2.7 群體親緣關(guān)系系數(shù)分析
1.2.8 群體結(jié)構(gòu)分析
1.2.9 關(guān)聯(lián)分析
1.2.10 優(yōu)異等位變異位點(diǎn)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 DNA樣品質(zhì)量檢測(cè)
2.2 多態(tài)性引物的篩選及PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的可行性分析
2.3 群體遺傳多樣性分析
2.4 茄子品種聚類分析
2.5 群體親緣關(guān)系系數(shù)分析
2.6 材料群體結(jié)構(gòu)分析
2.7 各亞群之間的遺傳關(guān)系分析
2.8 連鎖不平衡分析
2.9 SSR標(biāo)記與茄子黃萎病抗性的關(guān)聯(lián)分析
2.10 優(yōu)異等位變異位點(diǎn)分析
3 討論
3.1 茄子SSR標(biāo)記變異位點(diǎn)
3.2 茄子種質(zhì)間遺傳親緣關(guān)系
3.3 群體遺傳結(jié)構(gòu)
3.4 關(guān)聯(lián)分析中群體結(jié)構(gòu)的影響
3.5 茄子供試群體LD評(píng)價(jià)
3.6 關(guān)聯(lián)分析挖掘黃萎病抗性相關(guān)位點(diǎn)
第四章 全文結(jié)論
4.1 茄子黃萎病抗性鑒定
4.2 茄子種質(zhì)資源遺傳多樣性及群體結(jié)構(gòu)分析
4.3 茄子抗黃萎病關(guān)聯(lián)分析及優(yōu)異等位基因挖掘
4.4 后期研究?jī)?nèi)容
參考文獻(xiàn)
致謝
本文編號(hào):3869316
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