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芥藍miR156a家族進化特性及表達分析

發(fā)布時間:2023-11-24 22:17
  miRNA廣泛參與植物的發(fā)育過程。芥藍形態(tài)多樣,葉片發(fā)育因品種而異。為了解miR156a家族的進化特性及其在芥藍葉片發(fā)育中的表達模式。該研究對芥藍miR156a成員及其前體pre-miR156a成員進行生物信息學分析,比較不同品種芥藍葉形的差異,并采用qRT-PCR方法分析芥藍不同組織部位中pre-miR156a的表達水平、以及葉形相似的芥藍品種‘翠寶’和‘改良香菇’中不同類型葉片的pre-miR156a成員及其靶基因的表達水平。結(jié)果表明:(1)多序列比對和進化樹分析發(fā)現(xiàn)芥藍miR156a家族成員和pre-miR156a-3p1在進化過程中高度保守;二級結(jié)構(gòu)預測發(fā)現(xiàn)pre-miR156a每個成員均能形成莖環(huán)結(jié)構(gòu)并包含2~3個miR156a成員序列;靶基因預測顯示miR156a-5p和miR156a主要靶向SPL,而miR156a-3p1則靶向CTPS等不同的基因。(2)‘翠寶’和‘改良香菇’芥藍的葉形最為相似,qRT-PCR分析顯示,pre-miR156a在‘翠寶’營養(yǎng)生長期的葉片中高度表達。(3)pre-miR156a成員在‘翠寶’和‘改良...

【文章頁數(shù)】:10 頁

【文章目錄】:
1 材料和方法
    1.1 材料種植及取樣
    1.2 引物設計及靶基因預測
    1.3 熒光定量PCR分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 植物miR156a序列分析
    2.2 植物pre-miR156a進化樹分析
    2.3 芥藍pre-miR156a成員二級結(jié)構(gòu)分析
    2.4 芥藍miR156a成員靶基因預測分析
    2.5 pre-miR156a成員和SPL2/10/15在‘翠寶’和‘改良香菇’芥藍不同類型葉片中的表達分析
3 討 論
    3.1 芥藍miR156a成員進化分析
    3.2 芥藍miR156a成員靶基因SPL分析
    3.3 芥藍miR156a成員及其候選靶基因在不同類型葉片中的表達模式
4 結(jié) 論



本文編號:3866698

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