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芥藍(lán)miR156a家族進(jìn)化特性及表達(dá)分析

發(fā)布時(shí)間:2023-11-24 22:17
  miRNA廣泛參與植物的發(fā)育過(guò)程。芥藍(lán)形態(tài)多樣,葉片發(fā)育因品種而異。為了解miR156a家族的進(jìn)化特性及其在芥藍(lán)葉片發(fā)育中的表達(dá)模式。該研究對(duì)芥藍(lán)miR156a成員及其前體pre-miR156a成員進(jìn)行生物信息學(xué)分析,比較不同品種芥藍(lán)葉形的差異,并采用qRT-PCR方法分析芥藍(lán)不同組織部位中pre-miR156a的表達(dá)水平、以及葉形相似的芥藍(lán)品種‘翠寶’和‘改良香菇’中不同類(lèi)型葉片的pre-miR156a成員及其靶基因的表達(dá)水平。結(jié)果表明:(1)多序列比對(duì)和進(jìn)化樹(shù)分析發(fā)現(xiàn)芥藍(lán)miR156a家族成員和pre-miR156a-3p1在進(jìn)化過(guò)程中高度保守;二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn)pre-miR156a每個(gè)成員均能形成莖環(huán)結(jié)構(gòu)并包含2~3個(gè)miR156a成員序列;靶基因預(yù)測(cè)顯示miR156a-5p和miR156a主要靶向SPL,而miR156a-3p1則靶向CTPS等不同的基因。(2)‘翠寶’和‘改良香菇’芥藍(lán)的葉形最為相似,qRT-PCR分析顯示,pre-miR156a在‘翠寶’營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)期的葉片中高度表達(dá)。(3)pre-miR156a成員在‘翠寶’和‘改良...

【文章頁(yè)數(shù)】:10 頁(yè)

【文章目錄】:
1 材料和方法
    1.1 材料種植及取樣
    1.2 引物設(shè)計(jì)及靶基因預(yù)測(cè)
    1.3 熒光定量PCR分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 植物miR156a序列分析
    2.2 植物pre-miR156a進(jìn)化樹(shù)分析
    2.3 芥藍(lán)pre-miR156a成員二級(jí)結(jié)構(gòu)分析
    2.4 芥藍(lán)miR156a成員靶基因預(yù)測(cè)分析
    2.5 pre-miR156a成員和SPL2/10/15在‘翠寶’和‘改良香菇’芥藍(lán)不同類(lèi)型葉片中的表達(dá)分析
3 討 論
    3.1 芥藍(lán)miR156a成員進(jìn)化分析
    3.2 芥藍(lán)miR156a成員靶基因SPL分析
    3.3 芥藍(lán)miR156a成員及其候選靶基因在不同類(lèi)型葉片中的表達(dá)模式
4 結(jié) 論



本文編號(hào):3866698

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