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基于SSR標記的北美地區(qū)美洲黃蓮居群遺傳多樣性及結(jié)構(gòu)的分析

發(fā)布時間:2023-11-05 11:44
  美洲黃蓮(Nelumbo lutea)也稱為黃蓮,屬于蓮科(Nyphaeaceae)中的蓮屬(Nelumbo)。這個物種在北美的分布范圍包括美國的中部、東部以及最北部的五大湖地區(qū)。美洲黃蓮生長在河流,湖泊,沼澤或池塘的靜水域,巨大而美麗的花朵涌現(xiàn)在水面之上。美洲黃蓮是美國土著部落的重要食物資源,也是全球受歡迎的觀賞植物。然而,它的棲息地卻受到自然和人類活動的破壞。有關(guān)美洲黃蓮這個物種的遺傳多樣性知之甚少。本次實驗采集了美國的19個美洲黃蓮居群,共326個個體,基于所篩選的12對SSR引物,研究分析了該物種的遺傳多樣性及結(jié)構(gòu),研究結(jié)果可為進一步利用及保護美洲黃蓮種質(zhì)資源提供理論依據(jù)和實踐參考,同時,提供分子學(xué)數(shù)據(jù)用于美洲黃蓮居群間的變異與分化研究。主要研究結(jié)果如下:1.美洲黃蓮物種水平上的遺傳多樣性:326個美洲黃蓮個體基于12對SSR位點共擴增得到141個不同的等位基因,每個位點產(chǎn)生的等位基因數(shù)(NT)在11?33之間,平均每個位點產(chǎn)生22.83個等位基因。12對SSR標記的有效等位基因數(shù)(Ne)平均值為2.401。觀測雜合度(H0...

【文章頁數(shù)】:52 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 前言
    1.1 美洲黃蓮介紹
        1.1.1 美洲黃蓮形態(tài)特征及地理分布
        1.1.2 美洲黃蓮分類及種間關(guān)系
        1.1.3 美洲黃蓮繁殖方式及資源現(xiàn)狀
        1.1.4 美洲黃蓮的栽培史及用途
    1.2 基于分子標記的植物遺傳多樣性與居群遺傳結(jié)構(gòu)
        1.2.1 遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)基本概念
        1.2.2 影響遺傳多樣性與遺傳結(jié)構(gòu)的因素
        1.2.3 分子標記基本概念
        1.2.4 SSR分子標記
        1.2.5 微衛(wèi)星突變機制與突變率
    1.3 美洲黃蓮研究現(xiàn)狀
        1.3.1 分子標記研究
        1.3.2 基因組測序
        1.3.3 遺傳圖譜構(gòu)建
    1.4 研究目的及意義
第二章 材料和方法
    2.1 實驗材料
    2.2 試劑與儀器
        2.2.1 實驗試劑
        2.2.2 實驗儀器
    2.3 實驗方法
        2.3.1 總DNA提取方法
        2.3.2 SSR標記和PCR擴增
        2.3.3 數(shù)據(jù)分析
第三章 結(jié)果分析
    3.1 DNA質(zhì)量檢測
    3.2 引物篩選與PCR擴增
    3.3 美洲黃蓮居群的遺傳多樣性
        3.3.1 SSR位點的哈迪-溫伯格平衡檢測
        3.3.2 SSR位點的多態(tài)性檢測
        3.3.3 19個美洲黃蓮居群的遺傳多樣性
    3.4 美洲黃蓮居群的遺傳分化與遺傳結(jié)構(gòu)
        3.4.1 美洲黃蓮居群的遺傳分化
        3.4.2 美洲黃蓮居群的遺傳結(jié)構(gòu)
        3.4.3 聚類分析
        3.4.4 Structure軟件分析
第四章 討論
參考文獻
致謝



本文編號:3860965

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