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蘋果全基因組PIN和SMXL成員鑒定、系統(tǒng)進化及在腋芽萌發(fā)中的表達分析

發(fā)布時間:2023-10-14 08:52
  蘋果(Malus×domestica Borkh.)作為重要的經(jīng)濟果樹,提高產(chǎn)量是關鍵目標。植物分枝是影響植物地上株型和產(chǎn)量的關鍵因素,多分枝的理想株型的理論研究顯得尤為重要。在模式植物水稻和擬南芥中PIN蛋白和SMXL蛋白對家族鑒定和表達分析以及功能已經(jīng)取得了系統(tǒng)深入的研究,研究表明PIN和SMXL蛋白在參與調(diào)控植物分枝起著極為重要的作用,然而MdPIN和MdSMXL調(diào)控蘋果腋芽萌發(fā)的研究尚未報道。本研究以蘋果全基因組為模板,鑒定蘋果PIN和SMXL家族成員,分析進化關系、基因結構、保守結構域、啟動子作用元件和同線性分析,明確蘋果PIN和SMXL家族基因在不同基因型和不同組織的表達特性以及不同激素處理后相關基因的表達模式。初步探索蘋果PIN和SMXL家族基因的結構特性和調(diào)控蘋果腋芽萌發(fā)的機制。主要的研究結果如下:1.蘋果PIN家族成員鑒定、進化及在腋芽萌發(fā)中的表達特性;(1)蘋果PIN家族成員鑒定。從蘋果金冠基因組中鑒定得到18個生長素輸出載體蛋白PIN-formed(PIN),根據(jù)它們所在染色體的位置順序依次被命名。(2)蘋果PIN家族成員結構及其進化特性。蘋果PIN基因結構呈現(xiàn)多...

【文章頁數(shù)】:62 頁

【學位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 文獻綜述
    1.1 植物分枝發(fā)育的調(diào)控機制研究進展
        1.1.1 植物分枝發(fā)育過程研究
        1.1.2 植物激素調(diào)控分枝發(fā)育的機制研究
        1.1.3 轉錄因子調(diào)控分枝發(fā)育的機制研究
        1.1.4 外界因子調(diào)控分枝發(fā)育的機制研究
        1.1.5 多種調(diào)控途徑對植物分枝發(fā)育的協(xié)同調(diào)控作用模式
    1.2 PIN家族基因的研究進展
        1.2.1 PIN家族基因的結構分析
        1.2.2 PIN家族基因的功能分析
    1.3 SMXL 家族基因的研究進展
        1.3.1 SMXL家族基因的結構分析
        1.3.2 SMXL家族基因的功能分析
    1.4 研究的目的和意義
第二章 蘋果全基因組PIN成員鑒定及MdPIN15的克隆和在腋芽萌發(fā)中的表達分析
    2.1 材料與處理
        2.1.1 材料
        2.1.2 處理
    2.2 方法
        2.2.1 采樣
        2.2.2 MdPIN的鑒定與系統(tǒng)進化分析
        2.2.3 外顯子與內(nèi)含子結構和保守基序分析
        2.2.4 基因表達分析和啟動子順式作用元件分析
        2.2.5 引物設計和PCR反應體系
        2.2.6 基因表達特性分析
    2.3 結果與分析
        2.3.1 蘋果全基因組PIN基因的鑒定
        2.3.2 蘋果全基因組PIN基因結構與等位進化分析
        2.3.3 MdPIN基因家族啟動子元件分析
        2.3.4 MdPIN基因家族在不同器官中表達分析
        2.3.5 MdPIN15的克隆
        2.3.6 MdPIN15在‘長富2號’蘋果不同器官中的表達分析
        2.3.7 不同處理對腋芽的萌發(fā)率和長度的影響
        2.3.8 MdPIN15在腋芽萌發(fā)中的表達分析
第三章 蘋果全基因組SMXL家族鑒定、系統(tǒng)進化與腋芽萌發(fā)中表達分析
    3.1 材料與處理
        3.1.1 材料
        3.1.2 處理
    3.2 方法
        3.2.1 采樣
        3.2.2 MdSMXL的鑒定
        3.2.3 系統(tǒng)進化分析、染色體定位和基因結構
        3.2.4 理化特性、蛋白結構和啟動子作用元件分析
        3.2.5 串聯(lián)復制、同線性分析和基因表達分析
        3.2.6 引物設計
    3.3 結果與分析
        3.3.1 蘋果全基因組MdSMXL基因的鑒定
        3.3.2 系統(tǒng)進化分析和基因結構
        3.3.3 MdSMXL蛋白結構分析和保守結構域分布
        3.3.4 蘋果SMXL基因的同線性分析
        3.3.5 蘋果SMXL基因的組織特異性分析
        3.3.6 蘋果SMXL基因的啟動子分析
        3.3.7 蘋果SMXL基因的表達分析
第四章 討論
    4.1 蘋果PIN家族基因的結構和響應激素調(diào)控蘋果分枝發(fā)育
    4.2 蘋果SMXL家族基因的結構和響應激素調(diào)控蘋果分枝發(fā)育
    4.3 蘋果PIN和SMXL家族基因協(xié)調(diào)參與調(diào)控蘋果分枝發(fā)育
第五章 結論
參考文獻
致謝
作者簡介



本文編號:3853996

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