芍藥灰霉病抗性差異的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析研究
發(fā)布時(shí)間:2023-08-25 23:19
芍藥是中國(guó)的傳統(tǒng)名花,因其極高的觀賞價(jià)值而被廣泛應(yīng)用于植物造景和庭院綠化中,目前在世界50多個(gè)國(guó)家廣為栽培。然而在生產(chǎn)實(shí)踐中,芍藥容易感染灰霉病,導(dǎo)致其葉片干枯壞死,莖部凹陷折倒,花瓣褐色腐爛,甚至整個(gè)植株死亡,嚴(yán)重影響植株的觀賞效果和商業(yè)價(jià)值。因此,明晰芍藥抗灰霉病的關(guān)鍵基因和miRNA及其分子調(diào)控機(jī)制,對(duì)芍藥抗灰霉病品種的選育工作具有重要的理論價(jià)值。為此,本研究對(duì)揚(yáng)州地區(qū)芍藥灰霉病的病原進(jìn)行了形態(tài)和分子鑒定,并對(duì)抗病品種‘紫鳳羽’和感病品種‘大富貴’進(jìn)行了數(shù)字基因表達(dá)譜和小RNA測(cè)序分析,鑒定了與抗病相關(guān)的代謝途徑,挖掘了與抗病相關(guān)的差異表達(dá)基因和miRNA,主要結(jié)果如下:(1)采集芍藥灰霉病病葉進(jìn)行病原菌分離培養(yǎng),待其產(chǎn)孢后鏡檢,初步鑒定為葡萄孢屬(Botrytis);致病性及寄主范圍的測(cè)定顯示病原菌不僅侵染芍藥,也能導(dǎo)致梔子、番茄、月季、山茶、青椒、黃瓜、白菜這7種寄主植物發(fā);rDNA-ITS序列分析表明其與Genbank中的灰葡萄孢同源性達(dá)到99%;以上結(jié)果鑒定揚(yáng)州地區(qū)芍藥灰霉病病原是灰葡萄孢(Botrytis cinerea Pers.)(2)采集抗病品種‘紫鳳羽’和感病...
【文章頁數(shù)】:87 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略詞表
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 植物抗病機(jī)制研究進(jìn)展
1.1 植物抗病類型
1.2 植物抗病相關(guān)基因
2 高通量測(cè)序技術(shù)在植物抗病研究中的應(yīng)用
2.1 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
2.2 數(shù)字基因表達(dá)譜測(cè)序
2.3 小RNA測(cè)序
3 芍藥病害研究進(jìn)展
3.1 露地芍藥病害
3.2 設(shè)施芍藥病害
3.3 芍藥病害研究中存在的問題
4 研究的目的和意義
第二章 芍藥灰霉病病原鑒定
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2 結(jié)果與分析
2.1 芍藥灰霉病田間癥狀
2.2 病原菌形態(tài)特征
2.3 病原菌致病性
2.4 病原菌寄主范圍
2.5 病原菌rDNA-ITS序列
2.6 芍藥灰霉病病原鑒定結(jié)果
3 討論
第三章 芍藥灰霉病抗性差異的數(shù)字基因表達(dá)譜分析
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2 結(jié)果與分析
2.1 測(cè)序數(shù)據(jù)比對(duì)及質(zhì)量評(píng)估
2.2 差異表達(dá)基因的篩選與分析
2.3 差異表達(dá)基因的功能富集分析
2.4 候選抗病相關(guān)基因的表達(dá)模式分析
2.5 候選基因表達(dá)水平的qRT-PCR驗(yàn)證
3 討論
第四章 芍藥灰霉病抗性差異的小RNA測(cè)序分析
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2 結(jié)果與分析
2.1 小RNA測(cè)序質(zhì)量分析
2.2 保守miRNA的鑒定
2.3 新miRNA的鑒定
2.4 miRNA及其靶基因的差異表達(dá)分析
2.5 候選B.cinerea響應(yīng)miRNA及其靶基因的分析
2.6 靶基因表達(dá)水平的qRT-PCR驗(yàn)證
3 討論
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
本文編號(hào):3843497
【文章頁數(shù)】:87 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
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ABSTRACT
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第一章 文獻(xiàn)綜述
1 植物抗病機(jī)制研究進(jìn)展
1.1 植物抗病類型
1.2 植物抗病相關(guān)基因
2 高通量測(cè)序技術(shù)在植物抗病研究中的應(yīng)用
2.1 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
2.2 數(shù)字基因表達(dá)譜測(cè)序
2.3 小RNA測(cè)序
3 芍藥病害研究進(jìn)展
3.1 露地芍藥病害
3.2 設(shè)施芍藥病害
3.3 芍藥病害研究中存在的問題
4 研究的目的和意義
第二章 芍藥灰霉病病原鑒定
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2 結(jié)果與分析
2.1 芍藥灰霉病田間癥狀
2.2 病原菌形態(tài)特征
2.3 病原菌致病性
2.4 病原菌寄主范圍
2.5 病原菌rDNA-ITS序列
2.6 芍藥灰霉病病原鑒定結(jié)果
3 討論
第三章 芍藥灰霉病抗性差異的數(shù)字基因表達(dá)譜分析
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2 結(jié)果與分析
2.1 測(cè)序數(shù)據(jù)比對(duì)及質(zhì)量評(píng)估
2.2 差異表達(dá)基因的篩選與分析
2.3 差異表達(dá)基因的功能富集分析
2.4 候選抗病相關(guān)基因的表達(dá)模式分析
2.5 候選基因表達(dá)水平的qRT-PCR驗(yàn)證
3 討論
第四章 芍藥灰霉病抗性差異的小RNA測(cè)序分析
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2 結(jié)果與分析
2.1 小RNA測(cè)序質(zhì)量分析
2.2 保守miRNA的鑒定
2.3 新miRNA的鑒定
2.4 miRNA及其靶基因的差異表達(dá)分析
2.5 候選B.cinerea響應(yīng)miRNA及其靶基因的分析
2.6 靶基因表達(dá)水平的qRT-PCR驗(yàn)證
3 討論
參考文獻(xiàn)
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本文編號(hào):3843497
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