森林草莓中組蛋白甲基化修飾酶基因的鑒定與分析
發(fā)布時間:2023-05-26 23:34
組蛋白修飾在動植物生長發(fā)育過程中有著重要作用。而組蛋白甲基化作為一種重要的組蛋白修飾,對于植物的生長發(fā)育至關(guān)重要。組蛋白甲基化修飾由組蛋白甲基化酶和去甲基化酶所調(diào)控。目前在植物中已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了包含SET結(jié)構(gòu)域的組蛋白甲基化酶,根據(jù)SET結(jié)構(gòu)域序列的保守性可以將其分為7類,而且每一類都具有其特定的結(jié)構(gòu)和功能。同時,在植物中已發(fā)現(xiàn)的的去甲基化酶有JmjC和LSD兩大類。二倍體森林草莓全基因組序列的測定,為基因組水平上研究與草莓性狀相關(guān)基因奠定了堅實(shí)的基礎(chǔ)。目前,植物中組蛋白甲基化酶和去甲基化酶相關(guān)基因在擬南芥中的研究已相對完善,這對于研究草莓中組蛋白甲基化修飾酶相關(guān)基因提供了重要依據(jù)。草莓是一種營養(yǎng)豐富且極具經(jīng)濟(jì)價值的園藝作物,對組蛋白甲基化在草莓果實(shí)生長發(fā)育中的研究,將會為草莓新品種培育提供重要的參考依據(jù)。本研究以生物信息學(xué)和分子生物學(xué)相結(jié)合的方式,搜索并鑒定出草莓中組蛋白甲基化修飾酶相關(guān)基因,并以擬南芥、葡萄、中國蓮、玉米、水稻、無油樟、卷柏七個個物種為對照,系統(tǒng)地研究了這些基因在草莓中的進(jìn)化歷程。同時,我們還研究了這些基因在森林草莓果實(shí)不同發(fā)育階段的表達(dá)模式以及逆境條件下的表達(dá)水平的變化...
【文章頁數(shù)】:86 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 草莓起源和種類
2 組蛋白甲基化的研究進(jìn)展
2.1 組蛋白甲基化
2.2 組蛋白甲基化酶的分類、結(jié)構(gòu)和功能
3 組蛋白去甲基化研究進(jìn)展
3.1 組蛋白去甲基化
3.2 組蛋白去甲基化酶及其功能
4 組蛋白甲基化對基因表達(dá)的調(diào)控
5 組蛋白甲基化酶在植物生長發(fā)育過程中的作用
6 組蛋白去甲基化酶在植物生長發(fā)育過程中的作用
7 研究的目的和意義
參考文獻(xiàn)
第二章 組蛋白甲基化酶基因的生物信息學(xué)分析
1 材料和方法
1.1 物種選擇和數(shù)據(jù)來源
1.2 組蛋白賴氨酸甲基化酶基因的鑒定
1.3 多序列比對和系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建
1.4 組蛋白甲基化酶結(jié)構(gòu)域鑒定和Motif分析
1.5 組蛋白甲基化酶基因染色體定位和擴(kuò)張分析
2 結(jié)果與分析
2.1 森林草莓中組蛋白甲基化酶基因的鑒定
2.2 森林草莓中SET基因的進(jìn)化和擴(kuò)張
3 討論
參考文獻(xiàn)
第三章 組蛋白去甲基化酶基因的生物信息學(xué)分析
1 材料和方法
1.1 組蛋白去甲基化酶基因的鑒定
1.2 多序列比對和系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建
1.3 組蛋白去甲基化酶結(jié)構(gòu)域組成分析
2 結(jié)果與分析
2.1 森林草莓中組蛋白去甲基化酶基因的鑒定
2.2 森林草莓中組蛋白去甲基化酶基因的進(jìn)化分析
3 討論
參考文獻(xiàn)
第四章 組蛋白甲基化酶和去甲基化酶基因的表達(dá)分析
1 材料和方法
1.1 植物材料
1.2 冷脅迫和熱脅迫處理
1.3 草莓組織RNA的提取
1.4 RNA電泳分析
1.5 RNA純度檢驗(yàn)
1.6 實(shí)時熒光定量PCR
1.7 組蛋白甲基修飾酶基因表達(dá)數(shù)據(jù)來源和數(shù)據(jù)處理
2 結(jié)果與分析
2.1 森林草莓花和果實(shí)發(fā)育中組蛋白甲基化酶和去甲基化酶基因的表達(dá)模式
2.2 森林草莓SET基因在冷脅迫和熱脅迫下的表達(dá)模式
3 討論
參考文獻(xiàn)
全文討論
參考文獻(xiàn)
全文結(jié)論
創(chuàng)新點(diǎn)
附錄
攻讀碩士期間的論文發(fā)表情況
致謝
本文編號:3823478
【文章頁數(shù)】:86 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 草莓起源和種類
2 組蛋白甲基化的研究進(jìn)展
2.1 組蛋白甲基化
2.2 組蛋白甲基化酶的分類、結(jié)構(gòu)和功能
3 組蛋白去甲基化研究進(jìn)展
3.1 組蛋白去甲基化
3.2 組蛋白去甲基化酶及其功能
4 組蛋白甲基化對基因表達(dá)的調(diào)控
5 組蛋白甲基化酶在植物生長發(fā)育過程中的作用
6 組蛋白去甲基化酶在植物生長發(fā)育過程中的作用
7 研究的目的和意義
參考文獻(xiàn)
第二章 組蛋白甲基化酶基因的生物信息學(xué)分析
1 材料和方法
1.1 物種選擇和數(shù)據(jù)來源
1.2 組蛋白賴氨酸甲基化酶基因的鑒定
1.3 多序列比對和系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建
1.4 組蛋白甲基化酶結(jié)構(gòu)域鑒定和Motif分析
1.5 組蛋白甲基化酶基因染色體定位和擴(kuò)張分析
2 結(jié)果與分析
2.1 森林草莓中組蛋白甲基化酶基因的鑒定
2.2 森林草莓中SET基因的進(jìn)化和擴(kuò)張
3 討論
參考文獻(xiàn)
第三章 組蛋白去甲基化酶基因的生物信息學(xué)分析
1 材料和方法
1.1 組蛋白去甲基化酶基因的鑒定
1.2 多序列比對和系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建
1.3 組蛋白去甲基化酶結(jié)構(gòu)域組成分析
2 結(jié)果與分析
2.1 森林草莓中組蛋白去甲基化酶基因的鑒定
2.2 森林草莓中組蛋白去甲基化酶基因的進(jìn)化分析
3 討論
參考文獻(xiàn)
第四章 組蛋白甲基化酶和去甲基化酶基因的表達(dá)分析
1 材料和方法
1.1 植物材料
1.2 冷脅迫和熱脅迫處理
1.3 草莓組織RNA的提取
1.4 RNA電泳分析
1.5 RNA純度檢驗(yàn)
1.6 實(shí)時熒光定量PCR
1.7 組蛋白甲基修飾酶基因表達(dá)數(shù)據(jù)來源和數(shù)據(jù)處理
2 結(jié)果與分析
2.1 森林草莓花和果實(shí)發(fā)育中組蛋白甲基化酶和去甲基化酶基因的表達(dá)模式
2.2 森林草莓SET基因在冷脅迫和熱脅迫下的表達(dá)模式
3 討論
參考文獻(xiàn)
全文討論
參考文獻(xiàn)
全文結(jié)論
創(chuàng)新點(diǎn)
附錄
攻讀碩士期間的論文發(fā)表情況
致謝
本文編號:3823478
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