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MdTAS4-siR81(-)靶向MdbHLH3調(diào)控蘋果果皮花青苷形成機(jī)理研究及蘋果WD40蛋白家族分析

發(fā)布時(shí)間:2023-01-25 21:21
  花青苷含量決定了蘋果果皮顏色,目前關(guān)于蘋果花青苷的研究主要集中于轉(zhuǎn)錄水平,而在轉(zhuǎn)錄后水平的研究相對較少,小RNA主要在轉(zhuǎn)錄后水平發(fā)揮功能從而影響植物的表型。本研究首先從不套袋‘澳洲青蘋’綠色果皮和套袋處理后紅色果皮小RNA高通量測序結(jié)果中找出了差異表達(dá)的小RNA:MdTAS4-siR81(-)。并對MdTAS4-siR81(-)在果實(shí)著色中的功能進(jìn)行了研究。WD40,bHLH,MYB復(fù)合物可通過調(diào)控結(jié)構(gòu)基因影響花青苷的形成,目前MYB和bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族已經(jīng)在蘋果中被全面鑒定,而WD40蛋白還沒有相關(guān)報(bào)道,本研究對蘋果新基因組中WD40基因進(jìn)行了鑒定,分類,進(jìn)化分析及表達(dá)分析。獲得了以下結(jié)果:1.小RNA高通量測序結(jié)果中,不套袋‘澳洲青蘋’綠色果皮中MdTAS4-siR81(-)顯著高于套袋‘澳洲青蘋’紅色果皮。在‘澳洲靑蘋’和‘新紅星’著色過程中,MdbHLH3與花青苷含量有一個(gè)相同的變化趨勢,而MdTAS4-siR81(-)與MdbHLH3有一個(gè)相反的變化趨勢。5’RACE證明在‘澳洲靑蘋’和‘新紅星’中MdTAS4-siR81(-)均可靶向切割MdbHLH3。蘋果果皮中瞬時(shí)過表... 

【文章頁數(shù)】:76 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1.1 花青苷合成途徑
        1.1.1 花青苷合成相關(guān)結(jié)構(gòu)基因
        1.1.2 花青苷合成相關(guān)調(diào)節(jié)基因
    1.2 小RNA概述
        1.2.1 小RNA的產(chǎn)生
        1.2.2 小RNA作用機(jī)制
        1.2.3 小RNA研究方法
        1.2.4 小RNA的功能研究
        1.2.5 小RNA生物學(xué)功能
    1.3 WD40基因的研究
        1.3.1 WD40基因的結(jié)構(gòu)
        1.3.2 WD40基因的功能
    1.4 本研究的目的及意義
第二章 MdTAS4-siR81(-)靶向MdbHLH3調(diào)控蘋果果皮花青苷的形成
    2.1 試驗(yàn)材料
    2.2 試驗(yàn)方法
        2.2.1 花青苷及原花青素總量測定
        2.2.2 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
        2.2.3 利用5’RACE驗(yàn)證TAS4-siR81(-)靶基因切割位點(diǎn)
        2.2.4 小RNA過表達(dá)載體構(gòu)建
        2.2.5 瞬時(shí)轉(zhuǎn)化蘋果
        2.2.6 擬南芥轉(zhuǎn)化及篩選
    2.3 結(jié)果與分析
        2.3.1 轉(zhuǎn)錄組差異表達(dá)分析
        2.3.2 果實(shí)著色中花青苷含量變化
        2.3.3 果實(shí)著色過程中MdTAS4-siR81(-)和MdbHLH3表達(dá)模式
        2.3.4 利用5’RACE驗(yàn)證MdTAS4-siR81(-)切割靶基因MdbHLH3
        2.3.5 果皮中MdTAS4-siR81(-)和MdbHLH3瞬時(shí)過表達(dá)
        2.3.6 MdTAS4-siR81(-)及靶基因MdbHLH3穩(wěn)定轉(zhuǎn)化擬南芥
    2.4 討論
        2.4.1 果實(shí)著色過程中MdTAS4-siR81(-)和MdbHLH3的變化趨勢
        2.4.2 利用5’RACE驗(yàn)證MdTAS4-siR81(-)切割MdbHLH3
        2.4.3 MdTAS4-siR81(-)靶向MdbHLH3調(diào)控花青苷形成
第三章 蘋果WD40蛋白家族的鑒定及表達(dá)分析
    3.1 試驗(yàn)材料
    3.2 試驗(yàn)方法
        3.2.1 蘋果WD40基因鑒定及染色體定位
        3.2.2 蘋果WD40基因的分類及進(jìn)化分析
        3.2.3 蘋果WD40基因的內(nèi)含子/外顯子結(jié)構(gòu)
        3.2.4 蘋果WD40基因的共線性分析
        3.2.5 蘋果WD40基因的表達(dá)分析
        3.2.6 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)及分析
    3.3 結(jié)果
        3.3.1 蘋果WD40基因全基因組鑒定及染色體定位
        3.3.2 蘋果WD40蛋白的分類
        3.3.3 蘋果與擬南芥WD40基因的進(jìn)化分析
        3.3.4 蘋果WD40基因家族的擴(kuò)增模式
        3.3.5 蘋果與擬南芥中WD40基因的共線性分析
        3.3.6 蘋果WD40基因GO注釋分析
        3.3.7 蘋果WD40基因在不同生長階段的器官表達(dá)模式
        3.3.8 蘋果WD40基因?qū)BA,干旱,低溫脅迫響應(yīng)
    3.4 討論
        3.4.1 蘋果WD40基因家族的鑒定、分類以及進(jìn)化分析
        3.4.2 蘋果WD40基因的擴(kuò)增
        3.4.3 蘋果WD40基因與擬南芥WD40基因的共線性分析
        3.4.4 蘋果WD40基因GO分析
        3.4.5 蘋果WD40基因組織特異性表達(dá)以及對ABA,干旱,低溫的響應(yīng)
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
作者簡介


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]黑枸杞花青苷的研究進(jìn)展[J]. 李雯,陳小玲,劉彩芬,李新生,陳志遠(yuǎn).  生物資源. 2017(03)
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[3]植物非編碼RNA的研究進(jìn)展與展望[J]. 王佳偉,毛穎波,戚益軍.  中國基礎(chǔ)科學(xué). 2016(02)
[4]‘澳洲青蘋’果實(shí)解袋后果皮花青苷合成的變化[J]. 孟蕊,王亞杰,張伯虎,武月妮,楊亞州,趙政陽.  食品科學(xué). 2015(22)
[5]擬南芥At-pri-miR828基因的克隆及其對番茄的遺傳轉(zhuǎn)化[J]. 賈小云,于治芹,梁建萍,唐貴良,金雷皓,張莉,賀立恒,李潤植.  園藝學(xué)報(bào). 2013(12)
[6]擬南芥MicroRNA828負(fù)調(diào)控蔗糖誘導(dǎo)的花青素合成[J]. 謝燁,孫毅,李淡寧,黃繼榮.  植物生理學(xué)報(bào). 2013(02)
[7]植物小分子RNA研究進(jìn)展[J]. 武亮,戚益軍.  生命科學(xué). 2010(07)
[8]32種果樹microRNA的生物信息學(xué)預(yù)測與分析[J]. 宋長年,賈啟東,王晨,李飛,章鎮(zhèn),房經(jīng)貴.  園藝學(xué)報(bào). 2010(06)
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[10]反式作用干擾小RNA[J]. 溫劍,李思光,羅玉萍.  生命的化學(xué). 2007(05)

博士論文
[1]miR168啟動(dòng)子功能特異性解析及microRNA在蘋果果皮著色過程中的功能研究[D]. 曲東.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[2]蘋果高密度遺傳連鎖圖譜構(gòu)建與重要果實(shí)品質(zhì)性狀QTL定位[D]. 孫瑞.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[3]玉米小分子RNA及其靶基因的鑒定與功能分析[D]. 康明明.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[4]蘋果MdTTG1、MdMYB9與MdMYB11基因調(diào)控花青苷合成的作用機(jī)制研究[D]. 安秀紅.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[5]蘋果bHLH轉(zhuǎn)錄因子MdTTL1對低溫誘導(dǎo)花青苷合成和果實(shí)著色的多途徑調(diào)控[D]. 謝興斌.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011

碩士論文
[1]葡萄轉(zhuǎn)錄因子VqbZIP39及VlbZIP36基因功能研究[D]. 涂明星.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[2]番茄SlMYBL基因的表達(dá)分析及功能研究[D]. 劉霞.重慶大學(xué) 2014
[3]“澳洲青蘋”蘋果解袋后果實(shí)中花青苷的合成及相關(guān)基因的表達(dá)調(diào)控分析[D]. 王立新.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2013



本文編號(hào):3731806

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