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基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序開(kāi)發(fā)SSR標(biāo)記解析苔草遺傳多樣性和種群結(jié)構(gòu)

發(fā)布時(shí)間:2022-12-04 13:37
  苔草為莎草科苔草屬(Carex L.)多年生草本植物,具有自繁能力強(qiáng)、生長(zhǎng)持續(xù)時(shí)間長(zhǎng)等特點(diǎn),在園林綠化、草牧業(yè)生產(chǎn)、生態(tài)修復(fù)等方面發(fā)揮著越來(lái)越重要的作用。為厘清苔草品種間的遺傳多樣性及其與地域的關(guān)系,鑒別其種類,本研究在對(duì)青綠苔草進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的基礎(chǔ)上,借助SSR標(biāo)記技術(shù)對(duì)68份苔草資源的遺傳多樣性及群體結(jié)構(gòu)分析,以期為苔草種類的鑒別、遺傳育種等奠定基礎(chǔ)。主要研究結(jié)果如下:(1)通過(guò)對(duì)青綠苔草(Carex breviculmis)樣本進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,共獲得了總長(zhǎng)度為 41,724,615bp 的 36,403 個(gè) unigene,KOG 分類將 11,871 個(gè) unigene 注釋到 25 組,GO分類對(duì)11,629個(gè)unigene注釋到3個(gè)大組,KEGG途徑富集分析表明共有8440個(gè)unigene被注釋到50個(gè)代謝途徑,NR蛋白比對(duì)顯示苔草與鳳梨序列相似,其次為油棕和海棗。(2)開(kāi)發(fā)了 8,776個(gè)簡(jiǎn)單序列重復(fù)(SSR)分子標(biāo)記,篩選出多態(tài)性好的引物42對(duì),并對(duì)68份苔草樣品進(jìn)行擴(kuò)增,結(jié)果共擴(kuò)增出180條條帶,其中多態(tài)性條帶180條,多態(tài)性比例100%,平均每個(gè)位點(diǎn)擴(kuò)增4.3條條帶... 

【文章頁(yè)數(shù)】:69 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序開(kāi)發(fā)SSR標(biāo)記解析苔草遺傳多樣性和種群結(jié)構(gòu)


圖1.1苔草在中國(guó)的分布情況(數(shù)據(jù)來(lái)源于中國(guó)植物志)??Figure?1.1?The?distribution?of?Carex?in?China?(Data?from?Flora?of?China)??

基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序開(kāi)發(fā)SSR標(biāo)記解析苔草遺傳多樣性和種群結(jié)構(gòu)


圖1.2技術(shù)路線圖??Figure?1.2?Technology?Roadmap??

基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序開(kāi)發(fā)SSR標(biāo)記解析苔草遺傳多樣性和種群結(jié)構(gòu)


圖2.1?Unigene長(zhǎng)度分布圖??Fiure?2.1?Uniene?lenth?distribution??

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]草坪植物的新資源——苔草屬植物[J]. 馬萬(wàn)里,韓烈保,羅菊春.  草業(yè)科學(xué). 2001(02)
[2]幾種暖季型草坪草抗旱性的初步鑒定[J]. 郭愛(ài)桂,劉建秀,郭海林.  草業(yè)科學(xué). 2002(08)
[3]草坪病害生物防治研究進(jìn)展[J]. 劉明稀,易自力,趙運(yùn)林,蔣建雄.  草業(yè)學(xué)報(bào). 2004(06)
[4]苔草屬?gòu)?fù)序苔草亞屬植物果皮的掃描電鏡觀察[J]. 張樹(shù)仁,戴倫凱,梁松筠.  廣西植物. 2000(02)
[5]毛果苔草濕地營(yíng)養(yǎng)元素的積累、分配及其生物循環(huán)特征[J]. 何池全,趙魁義.  生態(tài)學(xué)報(bào). 2001(12)
[6]ISSR分子標(biāo)記技術(shù)及其在植物遺傳多樣性分析中的應(yīng)用[J]. 李海生.  生物學(xué)通報(bào). 2004(02)
[7]白穎苔草片劑(顆粒劑)的研制[J]. 倪培忠,王俐,高元清.  時(shí)珍國(guó)醫(yī)國(guó)藥. 2004(04)
[8]ISSR分子標(biāo)記及其在植物遺傳學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 王建波.  遺傳. 2002(05)
[9]苔草屬種質(zhì)資源的研究與應(yīng)用[J]. 王俊強(qiáng),呂會(huì)剛,方唯,李敏.  北京園林. 2006(02)
[10]中國(guó)桑樹(shù)選育品種ISSR指紋圖譜的構(gòu)建及遺傳多樣性分析(英文)[J]. 趙衛(wèi)國(guó),苗雪霞,臧波,張林,潘一樂(lè),黃勇平.  遺傳學(xué)報(bào). 2006(09)

博士論文
[1]假儉草種質(zhì)遺傳多樣性分析、遺傳圖譜構(gòu)建及重要性狀QTL定位[D]. 鄭軼琦.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009

碩士論文
[1]老芒麥EST-SSR分子標(biāo)記開(kāi)發(fā)與遺傳多樣性分析[D]. 周強(qiáng).蘭州大學(xué) 2016
[2]幾種冷季型草坪草的耐蔭性研究[D]. 尹淑霞.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2000
[3]山東苔草屬植物葉表皮微形態(tài)的研究[D]. 丁雪珍.山東師范大學(xué) 2008



本文編號(hào):3708365

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