基于SNP和SSR分子標(biāo)記的番茄種質(zhì)資源遺傳多樣性分析
發(fā)布時(shí)間:2022-11-05 11:05
為分析不同番茄種質(zhì)的遺傳多樣性,利用120個(gè)SNP和29個(gè)SSR標(biāo)記對(duì)210份番茄自交系進(jìn)行基因分型。結(jié)果表明,SSR具有較高的多態(tài)性,而SNP檢測(cè)到更高的基因多樣性。在預(yù)先劃分的3個(gè)亞群中,櫻桃番茄遺傳變異最高,常規(guī)番茄品種次之,現(xiàn)代番茄品系最低,說(shuō)明早期育成的番茄品種仍具有較為豐富的遺傳多樣性。群體結(jié)構(gòu)分析發(fā)現(xiàn),SNP可將3個(gè)亞群區(qū)分開,同時(shí)常規(guī)番茄進(jìn)一步分為粉果番茄和紅果番茄2個(gè)小亞群。SSR的分析結(jié)果與SNP和預(yù)先的分類并不一致,未能將常規(guī)番茄和現(xiàn)代品系完全區(qū)分開。遺傳距離分析顯示,SNP具有更高的分辨率,可以區(qū)分所有供試材料,有6對(duì)材料組合未被SSR數(shù)據(jù)區(qū)分開。總的來(lái)說(shuō),在栽培番茄遺傳多樣性分析中,SNP標(biāo)記具有更高的效率。
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【文章目錄】:
1 結(jié)果與分析
1.1 遺傳多樣性
1.2 群體結(jié)構(gòu)
1.3 PCoA
1.4 遺傳相關(guān)性分析
2 討論
3 材料與方法
3.1 試驗(yàn)材料
3.2 分子標(biāo)記
3.3 基因型分析
3.4 數(shù)據(jù)分析
作者貢獻(xiàn)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]中國(guó)加工番茄資源遺傳多樣性分析[J]. 劉希艷,鄭崢,鄧學(xué)斌,馮晶晶,白金瑞,宋燕,劉磊,李君明. 園藝學(xué)報(bào). 2016(03)
本文編號(hào):3702489
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1 結(jié)果與分析
1.1 遺傳多樣性
1.2 群體結(jié)構(gòu)
1.3 PCoA
1.4 遺傳相關(guān)性分析
2 討論
3 材料與方法
3.1 試驗(yàn)材料
3.2 分子標(biāo)記
3.3 基因型分析
3.4 數(shù)據(jù)分析
作者貢獻(xiàn)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]中國(guó)加工番茄資源遺傳多樣性分析[J]. 劉希艷,鄭崢,鄧學(xué)斌,馮晶晶,白金瑞,宋燕,劉磊,李君明. 園藝學(xué)報(bào). 2016(03)
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