香蕉枯萎病菌分泌蛋白質(zhì)的差異表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2022-08-07 17:47
由尖孢鐮刀菌古巴專(zhuān)化型(Fusarium (oxysporum f.sp.cubense,Foc)引起的香蕉枯萎病是香蕉生產(chǎn)上最重要的病害之一。Foc有4個(gè)生理小種,其中為害我國(guó)植蕉區(qū)的主要是4號(hào)生理小種(Foc4)。分泌蛋白作為一類(lèi)重要的致病因子,在Foc4侵染香蕉過(guò)程中起著重要作用。采用體外模擬植物與病原菌的互作條件,以Foc4為研究對(duì)象,用巴西蕉組織提取物進(jìn)行誘導(dǎo),采用非標(biāo)記蛋白定量技術(shù)(Label-free)分析了其菌絲的分泌蛋白質(zhì)表達(dá)變化,并結(jié)合生物信息學(xué)等方法對(duì)差異表達(dá)的分泌蛋白進(jìn)行了功能預(yù)測(cè)分析。結(jié)果表明,采用Label-free的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)共鑒定了1 685個(gè)分泌蛋白。與對(duì)照相比,誘導(dǎo)條件下的Foc4有66個(gè)分泌蛋白質(zhì)差異表達(dá),其中27個(gè)上調(diào)表達(dá),39個(gè)下調(diào)表達(dá)。利用SignalP4.1、WOLF PSORT、TargetP 1.1 Server和big-PIPredictor等軟件進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)經(jīng)典分泌蛋白有43個(gè),非經(jīng)典分泌蛋白有23個(gè)。生物信息學(xué)分析結(jié)果表明,差異表達(dá)的分泌蛋白功能主要涉及細(xì)胞壁降解、蛋白修飾、氧化脅迫反應(yīng)過(guò)程、氧化還原過(guò)程和能量代謝等過(guò)程。
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本文編號(hào):3670766
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