百合體胚發(fā)生過程中pre-miR171及eTM171表達分析與載體構(gòu)建
發(fā)布時間:2022-02-26 19:22
百合是世界著名的球根花卉,具有較高的觀賞價值。然而目前大量珍貴野生資源瀕臨滅絕,種質(zhì)保存方面尚存在困難,國內(nèi)擁有自主知識產(chǎn)權(quán)的品種較少。體細胞胚發(fā)生對于解決百合種質(zhì)保存、遺傳性狀改良、種球繁育等問題具有重要意義,但目前有關(guān)于百合體胚發(fā)生的相關(guān)分子機制研究尚未明確。本課題組研究表明miR171在調(diào)控百合體胚發(fā)生過程中起到重要作用,本研究克隆了細葉百合(Lilium pumilum DC.Fisch)miR171前體(pre-miR171);使用qRT-PCR技術(shù)探討百合體細胞胚發(fā)生過程中pre-miR171及內(nèi)源誘捕靶標(eTM171)的表達模式;使用雙酶切方法進行miR171過表達載體的構(gòu)建,并采用小串聯(lián)模擬靶標技術(shù)及CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù)構(gòu)建了mi R171沉默和敲除載體,為揭示百合體胚發(fā)生過程中miR171的產(chǎn)生、加工和調(diào)控過程,以及深入研究百合體胚發(fā)生過程中eTM-miR171-SCL6的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)奠定了基礎(chǔ)。主要試驗結(jié)果如下:1.lpu-pre-miR171a/b的克隆及表達分析根據(jù)miRNA前體具有高度保守的特點,成功克隆得到了細葉百合lpu-miR171a、lpu...
【文章來源】:沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:61 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
英文摘要
1 前言
1.1 百合體細胞胚發(fā)生的最新研究進展
1.2 植物體細胞胚發(fā)生過程中關(guān)鍵miRNA的研究進展
1.2.1 植物miRNA的生物合成
1.2.2 miRNA成熟體參與調(diào)控植物體胚發(fā)生的研究進展
1.2.3 miRNA前體在體胚發(fā)生過程中的研究進展
1.3 miR171的研究進展
1.3.1 miR171家族的研究進展
1.3.2 miR171調(diào)控植物體細胞胚發(fā)生的研究進展
1.4 植物內(nèi)源誘捕靶標(eTM)的研究進展
1.5 植物miRNA功能的研究進展
1.6 CRISPR/Cas9技術(shù)在園藝植物基因組編輯中的研究進展
1.7 本文研究的目的與意義
2 細葉百合pre-miR171a/b的克隆及表達分析
2.1 材料與方法
2.1.1 試驗材料
2.1.2 主要試驗儀器設(shè)備及耗材
2.1.3 常用試劑及培養(yǎng)基的配制
2.1.4 百合體胚總RNA提取及cDNA合成
2.1.5 pre-miR171a/b的PCR擴增反應(yīng)
2.1.6 PCR擴增產(chǎn)物的純化、連接、轉(zhuǎn)化及測序
2.1.7 對測序結(jié)果進行生物信息學(xué)分析
2.1.8 pre-miR171的qRT-PCR分析
2.1.9 數(shù)據(jù)分析
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 細葉百合體細胞胚總RNA提取結(jié)果
2.2.2 lpu-pre-miR171a/b的克隆
2.2.3 lpu-pre-miR171a/b二級結(jié)構(gòu)預(yù)測
2.2.4 pre-miR171a/b引物特異性分析
2.2.5 百合體胚發(fā)生過程中pre-miR171的表達分析
2.3 討論
2.3.1 pre-miR171a/b序列分析
2.3.2 百合體胚發(fā)生過程中miR171與pre-miR171表達關(guān)聯(lián)性分析
3 百合體胚發(fā)生過程中eTM171表達分析
3.1 材料與方法
3.1.1 試驗材料
3.1.2 RNA提取及cDNA合成
3.1.3 eTM171的qRT-PCR引物設(shè)計
3.1.4 eTM171的qRT-PCR分析
3.1.5 數(shù)據(jù)分析
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 eTM171引物特異性分析
3.2.2 百合體胚發(fā)生過程中eTM171的表達分析
3.3 討論
3.3.1 百合體胚發(fā)生過程中miR171及其eTM的表達關(guān)聯(lián)性分析
3.3.2 百合體胚發(fā)生過程中eTM-miR171-SCL6調(diào)控網(wǎng)絡(luò)初探
4 細葉百合miR171a/b的載體構(gòu)建
4.1 材料與方法
4.1.1 主要試劑
4.1.2 試驗所用的菌株與載體
4.1.3 miR171a/b過表達載體的構(gòu)建
4.1.4 miR171a/bSTTM表達載體的構(gòu)建
4.1.5 miR171a/b打靶載體的構(gòu)建
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 miR171a/b過表達載體的構(gòu)建
4.2.2 miR171a/bSTTM表達載體的構(gòu)建
4.2.3 百合miR171a/b打靶載體的構(gòu)建
4.3 討論
結(jié)論
主要創(chuàng)新點
參考文獻
附錄
致謝
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表文章
【參考文獻】:
期刊論文
[1]CRISPR/Cas9-mediated base-editing system efficiently generates gain-of-function mutations in Arabidopsis[J]. Yiyu Chen,Zhiping Wang,Hanwen Ni,Yong Xu,Qijun Chen,Linjian Jiang. Science China(Life Sciences). 2017(05)
[2]龍眼miR171家族進化特性及其表達分析[J]. 曾友競,林玉玲,崔彤彤,陳曉慧,徐小萍,張梓浩,程春振,陳裕坤,賴鐘雄. 西北植物學(xué)報. 2017(02)
[3]Long Non-coding RNAs and Their Biological Roles in Plants[J]. Xue Liu,Lili Hao,Dayong Li,Lihuang Zhu,Songnian Hu. Genomics,Proteomics & Bioinformatics. 2015(03)
[4]麻竹轉(zhuǎn)錄因子DlSCL6的基因克隆及在擬南芥中異位表達[J]. 楊麗,陳東亮,彭鎮(zhèn)華,趙韓生,高志民. 林業(yè)科學(xué). 2014(11)
[5]百合類體細胞胚和體細胞胚的形態(tài)學(xué)與組織學(xué)研究[J]. 吳澤,鐘雄輝,曹興,宮本賀,程運河,陳全全,義鳴放. 園藝學(xué)報. 2014(08)
[6]miRNA在植物重金屬脅迫應(yīng)答中的作用[J]. 張林,丁艷菲,王熠,朱誠. 植物生理學(xué)報. 2014(05)
[7]楊樹MIR171基因家族進化與功能分化研究[J]. 劉志祥,曾超珍,曾渭賢,徐剛標,譚曉風(fēng). 植物遺傳資源學(xué)報. 2014(02)
[8]Short Tandem Target Mimic:A Long Journey to the Engineered Molecular Landmine for Selective Destruction/Blockage of MicroRNAs in Plants and Animals[J]. Guiliang Tang,Xiaoqing Tang. Journal of Genetics and Genomics. 2013(06)
[9]龍眼胚性愈傷組織miR398b前體克隆及其在龍眼體胚發(fā)生過程中的表達分析[J]. 林玉玲,賴鐘雄. 熱帶作物學(xué)報. 2012(11)
[10]落葉松體胚發(fā)育中5個miRNA前體與成熟體的表達[J]. 張俊紅,張守攻,吳濤,韓素英,楊文華,齊力旺. 植物學(xué)報. 2012(05)
博士論文
[1]兩種中國原產(chǎn)百合體細胞胚發(fā)生及miRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)初步解析[D]. 張靜.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]MiRNA生物合成過程的系統(tǒng)動力學(xué)研究[D]. 王霞.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2013
碩士論文
[1]五種不同品系切花百合體細胞胚發(fā)生的組織形態(tài)學(xué)觀察[D]. 聶茹霞.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]兩種中國原產(chǎn)百合體細胞胚發(fā)生發(fā)育的組織學(xué)初探[D]. 薛冰洋.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[3]百合體胚發(fā)生過程中miR166及其靶基因的鑒定與表達分析[D]. 楊越.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[4]基于體細胞胚發(fā)生的五種切花百合高效再生體系建立[D]. 嚴瑞.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[5]百合體胚發(fā)生過程中miR171及其靶基因SCL6的鑒定與表達分析[D]. 賈娜娜.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[6]Tae-miR9677前體及其小串聯(lián)模擬靶標表達載體構(gòu)建及小麥遺傳轉(zhuǎn)化研究[D]. 李趙杰.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[7]白菜miR158的表達及其在花粉發(fā)育中的功能鑒定[D]. 馬智明.浙江大學(xué) 2016
[8]野生百合高效再生體系建立及愈傷組織增殖調(diào)控研究[D]. 馬怡迪.浙江大學(xué) 2015
[9]麝香百合胚性愈傷誘導(dǎo)及農(nóng)桿菌介導(dǎo)的遺傳轉(zhuǎn)化體系的優(yōu)化[D]. 張倩.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[10]百合(Lilium)鱗莖薄層胚性愈傷組織誘導(dǎo)及再生植株遺傳穩(wěn)定性鑒定[D]. 陳龍.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2013
本文編號:3644978
【文章來源】:沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:61 頁
【學(xué)位級別】:碩士
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摘要
英文摘要
1 前言
1.1 百合體細胞胚發(fā)生的最新研究進展
1.2 植物體細胞胚發(fā)生過程中關(guān)鍵miRNA的研究進展
1.2.1 植物miRNA的生物合成
1.2.2 miRNA成熟體參與調(diào)控植物體胚發(fā)生的研究進展
1.2.3 miRNA前體在體胚發(fā)生過程中的研究進展
1.3 miR171的研究進展
1.3.1 miR171家族的研究進展
1.3.2 miR171調(diào)控植物體細胞胚發(fā)生的研究進展
1.4 植物內(nèi)源誘捕靶標(eTM)的研究進展
1.5 植物miRNA功能的研究進展
1.6 CRISPR/Cas9技術(shù)在園藝植物基因組編輯中的研究進展
1.7 本文研究的目的與意義
2 細葉百合pre-miR171a/b的克隆及表達分析
2.1 材料與方法
2.1.1 試驗材料
2.1.2 主要試驗儀器設(shè)備及耗材
2.1.3 常用試劑及培養(yǎng)基的配制
2.1.4 百合體胚總RNA提取及cDNA合成
2.1.5 pre-miR171a/b的PCR擴增反應(yīng)
2.1.6 PCR擴增產(chǎn)物的純化、連接、轉(zhuǎn)化及測序
2.1.7 對測序結(jié)果進行生物信息學(xué)分析
2.1.8 pre-miR171的qRT-PCR分析
2.1.9 數(shù)據(jù)分析
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 細葉百合體細胞胚總RNA提取結(jié)果
2.2.2 lpu-pre-miR171a/b的克隆
2.2.3 lpu-pre-miR171a/b二級結(jié)構(gòu)預(yù)測
2.2.4 pre-miR171a/b引物特異性分析
2.2.5 百合體胚發(fā)生過程中pre-miR171的表達分析
2.3 討論
2.3.1 pre-miR171a/b序列分析
2.3.2 百合體胚發(fā)生過程中miR171與pre-miR171表達關(guān)聯(lián)性分析
3 百合體胚發(fā)生過程中eTM171表達分析
3.1 材料與方法
3.1.1 試驗材料
3.1.2 RNA提取及cDNA合成
3.1.3 eTM171的qRT-PCR引物設(shè)計
3.1.4 eTM171的qRT-PCR分析
3.1.5 數(shù)據(jù)分析
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 eTM171引物特異性分析
3.2.2 百合體胚發(fā)生過程中eTM171的表達分析
3.3 討論
3.3.1 百合體胚發(fā)生過程中miR171及其eTM的表達關(guān)聯(lián)性分析
3.3.2 百合體胚發(fā)生過程中eTM-miR171-SCL6調(diào)控網(wǎng)絡(luò)初探
4 細葉百合miR171a/b的載體構(gòu)建
4.1 材料與方法
4.1.1 主要試劑
4.1.2 試驗所用的菌株與載體
4.1.3 miR171a/b過表達載體的構(gòu)建
4.1.4 miR171a/bSTTM表達載體的構(gòu)建
4.1.5 miR171a/b打靶載體的構(gòu)建
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 miR171a/b過表達載體的構(gòu)建
4.2.2 miR171a/bSTTM表達載體的構(gòu)建
4.2.3 百合miR171a/b打靶載體的構(gòu)建
4.3 討論
結(jié)論
主要創(chuàng)新點
參考文獻
附錄
致謝
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表文章
【參考文獻】:
期刊論文
[1]CRISPR/Cas9-mediated base-editing system efficiently generates gain-of-function mutations in Arabidopsis[J]. Yiyu Chen,Zhiping Wang,Hanwen Ni,Yong Xu,Qijun Chen,Linjian Jiang. Science China(Life Sciences). 2017(05)
[2]龍眼miR171家族進化特性及其表達分析[J]. 曾友競,林玉玲,崔彤彤,陳曉慧,徐小萍,張梓浩,程春振,陳裕坤,賴鐘雄. 西北植物學(xué)報. 2017(02)
[3]Long Non-coding RNAs and Their Biological Roles in Plants[J]. Xue Liu,Lili Hao,Dayong Li,Lihuang Zhu,Songnian Hu. Genomics,Proteomics & Bioinformatics. 2015(03)
[4]麻竹轉(zhuǎn)錄因子DlSCL6的基因克隆及在擬南芥中異位表達[J]. 楊麗,陳東亮,彭鎮(zhèn)華,趙韓生,高志民. 林業(yè)科學(xué). 2014(11)
[5]百合類體細胞胚和體細胞胚的形態(tài)學(xué)與組織學(xué)研究[J]. 吳澤,鐘雄輝,曹興,宮本賀,程運河,陳全全,義鳴放. 園藝學(xué)報. 2014(08)
[6]miRNA在植物重金屬脅迫應(yīng)答中的作用[J]. 張林,丁艷菲,王熠,朱誠. 植物生理學(xué)報. 2014(05)
[7]楊樹MIR171基因家族進化與功能分化研究[J]. 劉志祥,曾超珍,曾渭賢,徐剛標,譚曉風(fēng). 植物遺傳資源學(xué)報. 2014(02)
[8]Short Tandem Target Mimic:A Long Journey to the Engineered Molecular Landmine for Selective Destruction/Blockage of MicroRNAs in Plants and Animals[J]. Guiliang Tang,Xiaoqing Tang. Journal of Genetics and Genomics. 2013(06)
[9]龍眼胚性愈傷組織miR398b前體克隆及其在龍眼體胚發(fā)生過程中的表達分析[J]. 林玉玲,賴鐘雄. 熱帶作物學(xué)報. 2012(11)
[10]落葉松體胚發(fā)育中5個miRNA前體與成熟體的表達[J]. 張俊紅,張守攻,吳濤,韓素英,楊文華,齊力旺. 植物學(xué)報. 2012(05)
博士論文
[1]兩種中國原產(chǎn)百合體細胞胚發(fā)生及miRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)初步解析[D]. 張靜.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]MiRNA生物合成過程的系統(tǒng)動力學(xué)研究[D]. 王霞.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2013
碩士論文
[1]五種不同品系切花百合體細胞胚發(fā)生的組織形態(tài)學(xué)觀察[D]. 聶茹霞.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]兩種中國原產(chǎn)百合體細胞胚發(fā)生發(fā)育的組織學(xué)初探[D]. 薛冰洋.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[3]百合體胚發(fā)生過程中miR166及其靶基因的鑒定與表達分析[D]. 楊越.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[4]基于體細胞胚發(fā)生的五種切花百合高效再生體系建立[D]. 嚴瑞.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[5]百合體胚發(fā)生過程中miR171及其靶基因SCL6的鑒定與表達分析[D]. 賈娜娜.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[6]Tae-miR9677前體及其小串聯(lián)模擬靶標表達載體構(gòu)建及小麥遺傳轉(zhuǎn)化研究[D]. 李趙杰.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[7]白菜miR158的表達及其在花粉發(fā)育中的功能鑒定[D]. 馬智明.浙江大學(xué) 2016
[8]野生百合高效再生體系建立及愈傷組織增殖調(diào)控研究[D]. 馬怡迪.浙江大學(xué) 2015
[9]麝香百合胚性愈傷誘導(dǎo)及農(nóng)桿菌介導(dǎo)的遺傳轉(zhuǎn)化體系的優(yōu)化[D]. 張倩.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[10]百合(Lilium)鱗莖薄層胚性愈傷組織誘導(dǎo)及再生植株遺傳穩(wěn)定性鑒定[D]. 陳龍.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2013
本文編號:3644978
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