南瓜CBL和CIPK基因家族的鑒定及表達(dá)模式分析
發(fā)布時間:2022-02-18 13:21
Ca2+是植物中的第二信使,逆境脅迫會導(dǎo)致鈣離子濃度的變化,鈣感受器之一的類鈣調(diào)磷酸酶B亞基蛋白(Calcineurin B-like protein,CBLs)能夠感知這種變化,并且能夠特異性結(jié)合位于下游的靶蛋白CBL互作蛋白激酶(CBL-interacting protein kinase,CIPKs),構(gòu)成CBL-CIPK信號系統(tǒng)。它們將信號傳遞,進(jìn)而激活下游一系列級聯(lián)反應(yīng),從而調(diào)控植物對逆境脅迫的應(yīng)答。南瓜(Cucurbita moschata)是異源四倍體,不同于葫蘆科二倍體的黃瓜和甜瓜等物種。模式作物擬南芥、水稻等有關(guān)CBLs和CIPKs基因家族及基因功能等方面的研究較多。2017年,南瓜基因組發(fā)布,目前有關(guān)南瓜CBLs和CIPKs基因家族的研究較少。而本文通過南瓜全基因組CBLs和CIPKs基因家族的鑒定、分析其表達(dá)模式和圍繞鹽脅迫響應(yīng)的基因進(jìn)行研究,主要的研究結(jié)果如下:1.利用生物信息學(xué)分析方法在南瓜全基因組中鑒定到8個CmCBLs和30個CmCIPKs。CBLs和CIPKs基因家族在基因結(jié)構(gòu)、保守模體和保守結(jié)構(gòu)域分析中都十分保守。系統(tǒng)進(jìn)化樹分析顯...
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省211工程院校教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:83 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
CBL和CIPK蛋白的結(jié)構(gòu)示意圖(根據(jù)BatisticandKudla2008,Duetal2011修改)
多物種CBLs基因家族的進(jìn)化樹
南瓜、擬南芥、水稻和葡萄CIPKs基因家族進(jìn)化樹
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]CIPK9: a calcium sensor-interacting protein kinase required for low-potassium tolerance in Arabidopsis[J]. Girdhar K Pandey,Yong Hwa Cheong,Beom-Gi Kim,John J Grant,Legong Li. Cell Research. 2007(05)
博士論文
[1]水稻/玉米CIPK基因家族的比較和水稻鋅指蛋白基因ZFP252功能研究[D]. 陳析豐.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[2]逆境條件下胡楊CBL-CIPK信號途徑轉(zhuǎn)導(dǎo)的分子機制研究[D]. 張和臣.北京林業(yè)大學(xué) 2010
本文編號:3630912
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省211工程院校教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:83 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
CBL和CIPK蛋白的結(jié)構(gòu)示意圖(根據(jù)BatisticandKudla2008,Duetal2011修改)
多物種CBLs基因家族的進(jìn)化樹
南瓜、擬南芥、水稻和葡萄CIPKs基因家族進(jìn)化樹
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]CIPK9: a calcium sensor-interacting protein kinase required for low-potassium tolerance in Arabidopsis[J]. Girdhar K Pandey,Yong Hwa Cheong,Beom-Gi Kim,John J Grant,Legong Li. Cell Research. 2007(05)
博士論文
[1]水稻/玉米CIPK基因家族的比較和水稻鋅指蛋白基因ZFP252功能研究[D]. 陳析豐.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[2]逆境條件下胡楊CBL-CIPK信號途徑轉(zhuǎn)導(dǎo)的分子機制研究[D]. 張和臣.北京林業(yè)大學(xué) 2010
本文編號:3630912
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