柑橘類水果采摘后腐爛是柑橘產(chǎn)業(yè)損失的主要原因,其中指狀青霉（Penicillium digitatum）引發(fā)的柑橘綠霉病導(dǎo)致的損失最為嚴(yán)重。指狀青霉的防治措施主要是噴施化學(xué)農(nóng)藥,然而現(xiàn)今已有很多指狀青霉產(chǎn)生耐藥現(xiàn)象的相關(guān)報(bào)道。研究表明,指狀青霉有多種耐藥性機(jī)制。對(duì)于14α-去甲基化酶抑制劑（14α-demethylase inhibitors,DMIs）類殺菌劑,指狀青霉的耐藥機(jī)制主要包括編碼甾醇14α-去甲基化酶（CYP51）的基因發(fā)生突變,導(dǎo)致CYP51對(duì)DMIs類藥物的親和力下降。指狀青霉也可通過過量表達(dá)編碼CYP51的基因,補(bǔ)償受DMIs藥物抑制的CYP51蛋白催化活性。此外,它還可以過量表達(dá)包括ABC超家族蛋白,MFS超家族蛋白和MATE蛋白在內(nèi)的藥泵轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,將DMIs類藥物快速排出細(xì)胞,等等。為了系統(tǒng)的研究指狀青霉的耐藥機(jī)制,本文構(gòu)建了代謝網(wǎng)絡(luò)模型,對(duì)該模型進(jìn)行優(yōu)化驗(yàn)證,為指狀青霉耐藥機(jī)制研究提供新方法。代謝網(wǎng)絡(luò)模型的具體構(gòu)建過程與驗(yàn)證結(jié)果如下文。為了系統(tǒng)的研究指狀青霉的耐藥機(jī)制,本文基于Merlin自動(dòng)模型構(gòu)建軟件構(gòu)建了指狀青霉全基因組規(guī)模的代謝模型（Genome-sc... 

【文章來源】：華中師范大學(xué)湖北省211工程院校教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：51 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖１－１指狀青霉病斑和菌株形態(tài)??

物敏感株）在藥物誘導(dǎo)前后的４個(gè)樣本進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序［１７］。測(cè)序完成后我們利用比??較轉(zhuǎn)錄組學(xué)方法進(jìn)行分析。分析結(jié)果表明在咪鮮胺藥物誘導(dǎo)后，ＨＳ－Ｆ６菌株有４０２??個(gè)基因表達(dá)量發(fā)生上調(diào)（圖１－２），而ＨＳ－Ｅ３菌株只有７０個(gè)基因表達(dá)量發(fā)生上調(diào)。??ＨＳ－Ｆ６菌株中的差異表達(dá)基因主要參與甾醇生成、物質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)、抗逆作用和脂質(zhì)代謝??等生物過程。??３??

多組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析（Ｔｒａｎｓ－Ｏｍｉｃｓ）是伴隨著多種高通量測(cè)序手段出現(xiàn)的一種??新型的生物學(xué)數(shù)據(jù)分析思路，它的核心是根據(jù)細(xì)胞不同的基本功能單元（例如ＤＮＡ，??ＲＮＡ，蛋白質(zhì)或代謝物）來定義和分類不同的細(xì)胞生命活動(dòng)層面（圖１－４），生物的??相關(guān)功能由跨越多個(gè)層面的生物網(wǎng)絡(luò)協(xié)調(diào)，這些網(wǎng)絡(luò)的集合即為Ｔｒａｎｓ－Ｏｍｉｃｓ網(wǎng)絡(luò)。??大多數(shù)生物學(xué)研究是通過關(guān)注幾個(gè)特定分子進(jìn)行的，而Ｔｒａｎｓ－Ｏｍｉｃｓ分析就是通過??７??


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