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薄葉金花茶及其近緣種遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)研究

發(fā)布時(shí)間:2022-01-23 01:06
  薄葉金花茶、小花金花茶和小瓣金花茶是分布于我國(guó)廣西西南部的三種金花茶植物,它們的分布區(qū)接近且極其狹窄。因它們具有一定的觀賞價(jià)值,部分野生植株被當(dāng)?shù)鼐用褚浦?另外,土地的開發(fā)和利用導(dǎo)致這三種金花茶的生境被破壞。因此,它們的野生種群大小快速降低,并呈片斷化分布。薄葉金花茶和小花金花茶已被《中國(guó)高等植物受威脅物種名錄》列為瀕危物種。本研究利用母系遺傳的葉綠體小單拷貝區(qū)(SSC)的一個(gè)片段、兩個(gè)雙親遺傳的單拷貝核基因(PAL和waxy)以及微衛(wèi)星標(biāo)記,對(duì)三種金花茶的DNA單倍型的組成和分布進(jìn)行研究,對(duì)遺傳多樣性水平和種群遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析,結(jié)果如下:1)三種金花茶PAL基因序列比對(duì)結(jié)果總長(zhǎng)653bp,包括8個(gè)簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)和4個(gè)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn),沒(méi)有插入或缺失。7個(gè)種群共檢測(cè)得到11個(gè)單倍型。waxy基因序列比對(duì)結(jié)果總長(zhǎng)684bp,包括15個(gè)簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)和2個(gè)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn),2個(gè)插入或缺失。7個(gè)種群共檢測(cè)得到8個(gè)單倍型。cpDNA片段比對(duì)總長(zhǎng)5192bp,包括5個(gè)核酸置換位點(diǎn)。7個(gè)種群檢測(cè)得到4個(gè)單倍型。PAL基因單倍型網(wǎng)絡(luò)圖中,單倍型H11有6個(gè)種群共享,分布最廣,頻率最大,并位于網(wǎng)絡(luò)圖的... 

【文章來(lái)源】:廣西師范大學(xué)廣西壯族自治區(qū)

【文章頁(yè)數(shù)】:62 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

薄葉金花茶及其近緣種遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)研究


三種金花茶7個(gè)種群采樣地理分布圖

網(wǎng)狀進(jìn)化,金花茶,單倍型,位點(diǎn)


圖 3.1 三種金花茶單倍型網(wǎng)狀進(jìn)化圖。I 為 PAL 基因單倍型圖;Ⅱ?yàn)?waxy 基因單倍型圖;Ⅲ為 cpDNA片段單倍型圖Fig. 3.1 I Network of haplotypes based on the PAL gene; Ⅱ Network of haplotypes based on the waxygene; Ⅲ Network of haplotypes based on the cpDNA sequences3.2 微衛(wèi)星數(shù)據(jù)遺傳多樣性11 個(gè)位點(diǎn)在三種金花茶 184 個(gè)個(gè)體共檢測(cè)到等位基因 92 個(gè),平均每個(gè)位點(diǎn) 8.364 個(gè)(表3.6)。7 個(gè)種群 11 個(gè)位點(diǎn)共 77 次 Hardy-weinberg 平衡檢驗(yàn),檢測(cè)結(jié)果共有 9 次偏離平衡(P < 0.05),經(jīng) sequential Bonferroni 校正后,只有位點(diǎn) TER8 在種群 NB3 偏離平衡(表3.7)。Micro-checkerh 檢測(cè)出三個(gè)無(wú)效等位基因,分別是種群 BH2(TER3)、NB3(TER8)和 PT1(TER18)。兩兩位點(diǎn)間不存在連鎖平衡現(xiàn)象,表明兩兩位點(diǎn)之間遺傳是相對(duì)獨(dú)立的。所有數(shù)據(jù)可用于后續(xù)分析。11 各位點(diǎn)中,每個(gè)位點(diǎn)的等位基因數(shù)(NT)在 5(FLA30 和 TER3)-12(FLA20 和

分組數(shù),估計(jì)值,種群,金花茶


0.3850** 0.2197** ─ 1.4899 0.7284 0.5800.2903** 0.1656** 0.1437** ─ 1.3012 0.7910.3190** 0.2472** 0.2555** 0.1612** ─ 0.5860.3830** 0.3077** 0.3012** 0.2401** 0.2987** ─ 0.4533** 0.4281** 0.3959** 0.3627** 0.3999** 0.3514.01UCTURE 和 PCoA 分析三種金花茶遺傳結(jié)構(gòu)的結(jié)果基本一致。STRU,7 個(gè)種群 184 個(gè)個(gè)體最佳遺傳學(xué)分組 K=2(圖 3.2),此時(shí)薄葉金花金花茶的 3 個(gè)種群大部分個(gè)體分為一組,小瓣金花茶 2 個(gè)種群的大部 3.3)。PCoA 分析結(jié)果(圖 3.4),7 個(gè)種群所有個(gè)體分為兩組,即薄小花金花茶的 3 個(gè)種群分為一組,小瓣金花茶 2 個(gè)種群分為一組,但分為 2 個(gè)亞組,即兩個(gè)種群明顯分開,且種群 PT1 更接近小花金花茶的據(jù)將取樣種群分為兩組,而 DNA 測(cè)序數(shù)據(jù)無(wú)法分組,存在不一致的子標(biāo)記有不同的進(jìn)化速率。Mantel test 結(jié)果表明(圖 3.5),7 個(gè)種群間呈弱的正相關(guān)性但不顯著(R2=0.0847, p=0.23)。

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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博士論文
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[2]山茶科及紫莖屬的系統(tǒng)發(fā)育和生物地理研究[D]. 李密密.浙江大學(xué) 2011

碩士論文
[1]淡黃金花茶種群遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 盧永彬.廣西師范大學(xué) 2015



本文編號(hào):3603277

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