結(jié)球甘藍(lán)萌發(fā)階段RNA聚合酶Ⅲ轉(zhuǎn)錄的BoNR8長(zhǎng)非編碼RNA研究
發(fā)布時(shí)間:2022-01-17 05:00
非編碼RNA大多由RNA聚合酶Ⅰ轉(zhuǎn)錄,它們沒有開放閱讀框及編碼蛋白質(zhì)的能力,以RNA分子形式廣泛存在于生物體中,其中占人類全部轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的近98%,占擬南芥(Arabidopsis thaliana)全部轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的近71%,釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)中占近29%。這些非編碼RNA通過(guò)與特定蛋白質(zhì)結(jié)合或影響其他RNA活性來(lái)調(diào)控基因的表達(dá),在染色質(zhì)改變、轉(zhuǎn)錄調(diào)控過(guò)程中起重要作用。種子萌發(fā)是植物生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中重要的過(guò)渡階段,它決定了植物萌發(fā)后應(yīng)對(duì)外界環(huán)境的抵抗能力。目前在植物中發(fā)現(xiàn)了一些miRNAs參與種子萌發(fā),如miRNA160(負(fù)調(diào)控ARF10(Auxin Response Factors 10)基因的表達(dá),影響擬南芥種子萌發(fā));miRNA163(作用于PXMT1 mRNA促進(jìn)擬南芥種子萌發(fā)和幼苗發(fā)育階段根的生長(zhǎng));miRNA402(鹽脅迫條件下,促進(jìn)擬南芥種子萌發(fā)和幼苗生長(zhǎng))等。遺憾的是,萌發(fā)相關(guān)的長(zhǎng)非編碼RNA還未見報(bào)道。結(jié)球甘藍(lán)是十字花科(Brassicaceae)蕓薹屬(Brassica)植物,具有豐富的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值和經(jīng)濟(jì)價(jià)值。雖然對(duì)結(jié)球甘藍(lán)全基因組進(jìn)...
【文章來(lái)源】:東北林業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:81 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-1.?RNA聚合_?III啟動(dòng)子類型及轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物??Fiure?1-1.?Promoter?tes?of?RNAolmerase?III?1??
NA相比沒有獨(dú)立和明顯的特征,不能使用單一的方法識(shí)別和預(yù)測(cè)長(zhǎng)非編碼??RNA[24,〇??(1?)轉(zhuǎn)錄干涉??二????r???^ ̄ ̄r ̄??(2?)介導(dǎo)染色質(zhì)重抅?\瞧??和組蛋白修飾?4?。ǎ?)小分子RNA前體???"I??/?\??/\?(5)調(diào)控蛋白質(zhì)活性?(7)改變蛋白質(zhì)細(xì)胞定位??^1,??wmmmmaOBammmm??=-??????(3?)調(diào)控可變剪接?(4?)產(chǎn)生內(nèi)源性siRNA?(?6?)?RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合體??結(jié)構(gòu)的組成成分??圖1-2.長(zhǎng)非編碼RNA作用機(jī)制丨251??|251??Fig?1-2.?Mechanism?of?long?non-coding?RNA?1??1.3植物中長(zhǎng)非編碼RNA研究進(jìn)展??植物中非編碼RNA研宄起步較晚,長(zhǎng)非編碼RNA研宄更是少之又少。己經(jīng)發(fā)現(xiàn)的??幾個(gè)功能性長(zhǎng)非編碼RNA,如擬南芥J//八S7128'291、苜蓿和扣|311、番茄??7P5//|3G|、水稻?as'/V/1321?和?ay£M)/)卯1331、大豆?Gw£A/6)Z>/0[341?等均由?RNA?聚合酶?II??轉(zhuǎn)錄,而RNA是擬南芥中發(fā)現(xiàn)的RNA聚合酶III?III型啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄的新長(zhǎng)非編碼??RNA〖181。??目前發(fā)現(xiàn)的功能性植物長(zhǎng)非編碼RNA作用機(jī)制清楚的為數(shù)不多,只有以下七種??(表?1-1)。擬南芥中/4///W7?(Induced?By?Phosphate?Starvation?1)通過(guò)模仿的祀??基因P//G2抑制了?W/7?399活性,維持磷酸鹽饑餓條件下擬南芥根的正常生長(zhǎng),29];??r〇QL4/A?(cold?induced?antisense
2結(jié)球甘藍(lán)中RNA聚合酶丨丨丨轉(zhuǎn)錄的B0NR8?RNA的發(fā)現(xiàn)??穩(wěn)定的二級(jí)結(jié)構(gòu),可以在結(jié)球甘藍(lán)中穩(wěn)定存在。??y??acauCcW^cac??CA?ucuAAucq,u^??O增?1??i?/??cc^cCAAUaau*auC*A??if?c?dG=-83.16?kcal/mol??冷UuC??ccc??圖2-2.?/WV/^?RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)??Figure?2-2.?The?prediction?of?BoNRS?RNA?secondary?structure.??2.3.3煙草無(wú)細(xì)胞系統(tǒng)中RNA轉(zhuǎn)錄特性分析??根據(jù)RNA聚合酶II和RNA聚合酶III對(duì)a-鵝膏膽堿敏感度不同,我們?cè)跓煵轃o(wú)細(xì)??胞轉(zhuǎn)錄系統(tǒng)加入0.5?ng?/nil的a-鵝詩(shī)膽堿分析了?RNA轉(zhuǎn)錄特性,聚合酶II轉(zhuǎn)錄??的i;2?snRNA及聚合酶丨丨丨轉(zhuǎn)錄的RNA作為對(duì)照被使川。圖2-3表明,加入a-鵝??膏膽破后,"2?snRNA的轉(zhuǎn)錄受到影響(加入a-鵝膏膽堿后泳道2A:f/2?snRNA轉(zhuǎn)錄物??產(chǎn)生),而沁似和RNA轉(zhuǎn)朵沒有受到影響,表明RNA與狀RNA?—??樣,是依賴于RNA聚合_1]丨轉(zhuǎn)錄的非編碼RNA。??-15-??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]植物長(zhǎng)鏈非編碼RNA研究進(jìn)展[J]. 黃小慶,李丹丹,吳娟. 遺傳. 2015(04)
[2]長(zhǎng)非編碼RNA研究進(jìn)展[J]. 陳曉敏,張棟棟,駱健俊,陳潤(rùn)生. 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2014(10)
[3]水楊酸誘導(dǎo)植物抗病性機(jī)制的研究進(jìn)展[J]. 高琪昕,胡新喜,王歡妍,曹可,索歡,何長(zhǎng)征. 中國(guó)馬鈴薯. 2014(04)
[4]長(zhǎng)非編碼RNA生物特征研究與分析[J]. 郭杏莉,高琳,劉永軒,黨合萱,王羽,楊曉飛,羅海濤. 科學(xué)通報(bào). 2013(27)
[5]植物種子休眠與萌發(fā)調(diào)控機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 程鵬,王平,孫吉康,費(fèi)明亮,楊輝. 中南林業(yè)科技大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(05)
[6]Cu2+對(duì)擬南芥根的局部毒性及誘導(dǎo)DNA損傷和細(xì)胞死亡[J]. 魏志琴,陳志勇,秦蓉,王宇濤,李韶山. 植物學(xué)報(bào). 2013(03)
[7]ABA與植物耐鹽信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑的研究進(jìn)展[J]. 畢影東,劉清醒,郭長(zhǎng)虹,郭東林. 中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2013(09)
[8]甘藍(lán)非編碼RNA基因BoNR1的克隆與表達(dá)分析[J]. 宋江華,汪承剛,王素,單國(guó)雷,朱世東. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2011(04)
[9]種子休眠與萌發(fā)過(guò)程的生理調(diào)控機(jī)理[J]. 潘琳,徐程揚(yáng). 種子. 2010(06)
[10]ABA與植物的耐鹽性[J]. 劉琳,曾幼玲,張富春. 植物生理學(xué)通訊. 2009(02)
本文編號(hào):3594087
【文章來(lái)源】:東北林業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:81 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-1.?RNA聚合_?III啟動(dòng)子類型及轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物??Fiure?1-1.?Promoter?tes?of?RNAolmerase?III?1??
NA相比沒有獨(dú)立和明顯的特征,不能使用單一的方法識(shí)別和預(yù)測(cè)長(zhǎng)非編碼??RNA[24,〇??(1?)轉(zhuǎn)錄干涉??二????r???^ ̄ ̄r ̄??(2?)介導(dǎo)染色質(zhì)重抅?\瞧??和組蛋白修飾?4?。ǎ?)小分子RNA前體???"I??/?\??/\?(5)調(diào)控蛋白質(zhì)活性?(7)改變蛋白質(zhì)細(xì)胞定位??^1,??wmmmmaOBammmm??=-??????(3?)調(diào)控可變剪接?(4?)產(chǎn)生內(nèi)源性siRNA?(?6?)?RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合體??結(jié)構(gòu)的組成成分??圖1-2.長(zhǎng)非編碼RNA作用機(jī)制丨251??|251??Fig?1-2.?Mechanism?of?long?non-coding?RNA?1??1.3植物中長(zhǎng)非編碼RNA研究進(jìn)展??植物中非編碼RNA研宄起步較晚,長(zhǎng)非編碼RNA研宄更是少之又少。己經(jīng)發(fā)現(xiàn)的??幾個(gè)功能性長(zhǎng)非編碼RNA,如擬南芥J//八S7128'291、苜蓿和扣|311、番茄??7P5//|3G|、水稻?as'/V/1321?和?ay£M)/)卯1331、大豆?Gw£A/6)Z>/0[341?等均由?RNA?聚合酶?II??轉(zhuǎn)錄,而RNA是擬南芥中發(fā)現(xiàn)的RNA聚合酶III?III型啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄的新長(zhǎng)非編碼??RNA〖181。??目前發(fā)現(xiàn)的功能性植物長(zhǎng)非編碼RNA作用機(jī)制清楚的為數(shù)不多,只有以下七種??(表?1-1)。擬南芥中/4///W7?(Induced?By?Phosphate?Starvation?1)通過(guò)模仿的祀??基因P//G2抑制了?W/7?399活性,維持磷酸鹽饑餓條件下擬南芥根的正常生長(zhǎng),29];??r〇QL4/A?(cold?induced?antisense
2結(jié)球甘藍(lán)中RNA聚合酶丨丨丨轉(zhuǎn)錄的B0NR8?RNA的發(fā)現(xiàn)??穩(wěn)定的二級(jí)結(jié)構(gòu),可以在結(jié)球甘藍(lán)中穩(wěn)定存在。??y??acauCcW^cac??CA?ucuAAucq,u^??O增?1??i?/??cc^cCAAUaau*auC*A??if?c?dG=-83.16?kcal/mol??冷UuC??ccc??圖2-2.?/WV/^?RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)??Figure?2-2.?The?prediction?of?BoNRS?RNA?secondary?structure.??2.3.3煙草無(wú)細(xì)胞系統(tǒng)中RNA轉(zhuǎn)錄特性分析??根據(jù)RNA聚合酶II和RNA聚合酶III對(duì)a-鵝膏膽堿敏感度不同,我們?cè)跓煵轃o(wú)細(xì)??胞轉(zhuǎn)錄系統(tǒng)加入0.5?ng?/nil的a-鵝詩(shī)膽堿分析了?RNA轉(zhuǎn)錄特性,聚合酶II轉(zhuǎn)錄??的i;2?snRNA及聚合酶丨丨丨轉(zhuǎn)錄的RNA作為對(duì)照被使川。圖2-3表明,加入a-鵝??膏膽破后,"2?snRNA的轉(zhuǎn)錄受到影響(加入a-鵝膏膽堿后泳道2A:f/2?snRNA轉(zhuǎn)錄物??產(chǎn)生),而沁似和RNA轉(zhuǎn)朵沒有受到影響,表明RNA與狀RNA?—??樣,是依賴于RNA聚合_1]丨轉(zhuǎn)錄的非編碼RNA。??-15-??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]植物長(zhǎng)鏈非編碼RNA研究進(jìn)展[J]. 黃小慶,李丹丹,吳娟. 遺傳. 2015(04)
[2]長(zhǎng)非編碼RNA研究進(jìn)展[J]. 陳曉敏,張棟棟,駱健俊,陳潤(rùn)生. 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2014(10)
[3]水楊酸誘導(dǎo)植物抗病性機(jī)制的研究進(jìn)展[J]. 高琪昕,胡新喜,王歡妍,曹可,索歡,何長(zhǎng)征. 中國(guó)馬鈴薯. 2014(04)
[4]長(zhǎng)非編碼RNA生物特征研究與分析[J]. 郭杏莉,高琳,劉永軒,黨合萱,王羽,楊曉飛,羅海濤. 科學(xué)通報(bào). 2013(27)
[5]植物種子休眠與萌發(fā)調(diào)控機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 程鵬,王平,孫吉康,費(fèi)明亮,楊輝. 中南林業(yè)科技大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(05)
[6]Cu2+對(duì)擬南芥根的局部毒性及誘導(dǎo)DNA損傷和細(xì)胞死亡[J]. 魏志琴,陳志勇,秦蓉,王宇濤,李韶山. 植物學(xué)報(bào). 2013(03)
[7]ABA與植物耐鹽信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑的研究進(jìn)展[J]. 畢影東,劉清醒,郭長(zhǎng)虹,郭東林. 中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2013(09)
[8]甘藍(lán)非編碼RNA基因BoNR1的克隆與表達(dá)分析[J]. 宋江華,汪承剛,王素,單國(guó)雷,朱世東. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2011(04)
[9]種子休眠與萌發(fā)過(guò)程的生理調(diào)控機(jī)理[J]. 潘琳,徐程揚(yáng). 種子. 2010(06)
[10]ABA與植物的耐鹽性[J]. 劉琳,曾幼玲,張富春. 植物生理學(xué)通訊. 2009(02)
本文編號(hào):3594087
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