香菇基于RNA-Seq構建遺傳連鎖圖及重要性狀的QTL定位
發(fā)布時間:2022-01-14 10:54
香菇(Lentinula edodes)是一種具有較高食藥用價值的大型真菌,其栽培起源于中國。對香菇菌株進行遺傳改良是香菇產業(yè)持續(xù)發(fā)展的基礎。對于受多基因控制的香菇數(shù)量性狀,利用與數(shù)量性狀連鎖分子標記進行分子標記輔助選擇,是對香菇菌株進行遺傳改良的有效方法。目前,香菇遺傳連鎖圖主要基于非特異性分子標記構建,標記還很難與基因組信息對應。本研究基于香菇LQ-15測交群體,考察了群體136個菌株的10個農藝性狀,并對其中110個菌株進行轉錄組測序,開發(fā)SNP標記用于構建香菇高密度遺傳連鎖圖,進行10個農藝性狀的QTL定位,篩選控制農藝性狀的候選基因,用于香菇品種的改良。1、進行測交群體LQ-15的栽培試驗,測定包括出菇期、菇形性狀、產量性狀在內的10個性狀的表型,并結合2012年該群體的栽培數(shù)據(jù),對兩年數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計分析和BLUP校正。統(tǒng)計分析表明,菌蓋重量、菌柄重量、單菇重、單袋菇數(shù)在兩年表型數(shù)據(jù)中變異系數(shù)較大。相關性分析表明,除菌蓋重量外,其余9個性狀在兩年間均呈極顯著正相關;10個農藝性狀中,菇形性狀兩兩間呈極顯著正相關,產量性狀中單袋菇數(shù)與單菇重、單袋產量分別呈極顯著負相關和正相關。方...
【文章來源】:華中農業(yè)大學湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:96 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
香菇L-54菌株在木屑培養(yǎng)基上的生活史Figure1-1LifecycleofLentinulaedodes(L-54)growninsawdust注:引自KwanHSandChumWYWinnie(2009)
24 圖 3-1 LQ-15 群體中香菇農藝性狀的頻率分布Fig3-1 Frequency distribution of measured agronomic traits in LQ-15 of Lentinula edodes
29 圖 3-2 LQ-15 群體農藝性狀 BLUP 值和均值Fig 3-2 BLUP values and line means of measured agronomic traits in LQ-15 of Lentinula edodesSL(mm)SW(g)SD(mm)PW(g)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]玉米秸稈的再利用——代料栽培秋季香菇初探[J]. 陳黃曌,鄧曉旭,霍婧媛. 資源節(jié)約與環(huán)保. 2017(11)
[2]香菇栽培技術研究現(xiàn)狀[J]. 常曉嬌,吳春華,常廣寧,趙彩云,劉靜. 南方農業(yè). 2017(24)
[3]中國香菇栽培模式現(xiàn)狀及透氣袋模式技術要點[J]. 李玉,尚曉冬,宋春艷,周峰,李正鵬,李巧珍,譚琦. 農業(yè)工程技術. 2017(16)
[4]不同栽培基質對香菇頭潮菇產量及子實體營養(yǎng)成分的影響[J]. 柴美清,李青,韓鵬遠,趙毅,李云霞,張鎖峰,姚宇升. 中國農學通報. 2017(15)
[5]天水地區(qū)蘋果樹枝屑栽培香菇技術要點[J]. 孫潔,魏志貞,王俊羿. 食用菌. 2017(03)
[6]香菇栽培技術研究[J]. 弋淮. 農業(yè)科技與信息. 2017(06)
[7]玉米秸稈代料栽培香菇試驗[J]. 王洪奇,陳順,于廣峰,冀寶贏,柴林山,孫麗梅. 食用菌. 2017(02)
[8]植物鋅指蛋白的功能研究進展[J]. 王偉英,李海明,戴藝民,林江波. 中國園藝文摘. 2016(07)
[9]利用紫穗槐替代部分木屑栽培香菇的培養(yǎng)料配方研究[J]. 彭學文,解文強,周廷斌,吳志會. 河北農業(yè)科學. 2016(02)
[10]香菇布勒雜交新菌株玉豐一號的選育[J]. 曹玉謙,李長莉. 食用菌. 2016(02)
博士論文
[1]香菇重要農藝性狀的QTL定位[D]. 龔文兵.華中農業(yè)大學 2014
[2]組蛋白H2B單泛素化參與擬南芥抗大麗輪枝菌毒素防衛(wèi)反應的機理研究[D]. 裴寶磊.中國農業(yè)大學 2014
[3]擬南芥核孔蛋白Nup96的鑒定及其在開花時間和生物鐘調控中的功能分析[D]. 王旭.中國農業(yè)科學院 2014
[4]香菇分子遺傳圖譜構建和數(shù)量性狀座位(QTL)分析[D]. 林范學.華中農業(yè)大學 2008
[5]金頂側耳基因連鎖圖譜與雙—單交配機制解析及高溫型菌株選育研究[D]. 姚芳杰.吉林農業(yè)大學 2002
碩士論文
[1]香菇栽培菌株重要農藝性狀與分子標記的關聯(lián)分析[D]. 李闖.華中農業(yè)大學 2016
[2]基于候選基因標記的香菇重要農藝性狀關聯(lián)分析[D]. 向星潔.華中農業(yè)大學 2015
[3]香菇、滑子菇新品種選育研究[D]. 孫艷穎.河北師范大學 2015
[4]野生香菇數(shù)量性狀與SSR分子標記的關聯(lián)分析[D]. 徐銳.華中農業(yè)大學 2013
[5]幾種林果植物廢棄物在香菇栽培中的應用研究[D]. 張健.華中農業(yè)大學 2013
[6]香菇分子遺傳圖譜構建及漆酶活性QTL的定位[D]. 盧穎穎.華中農業(yè)大學 2012
[7]基于基因組的金針菇遺傳連鎖圖的構建與數(shù)量性狀位點(QTL)分析[D]. 張光忠.福建農林大學 2011
[8]金針菇遺傳連鎖圖的構建及菌絲生長速度的QTL定位[D]. 李博.福建農林大學 2009
本文編號:3588378
【文章來源】:華中農業(yè)大學湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:96 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
香菇L-54菌株在木屑培養(yǎng)基上的生活史Figure1-1LifecycleofLentinulaedodes(L-54)growninsawdust注:引自KwanHSandChumWYWinnie(2009)
24 圖 3-1 LQ-15 群體中香菇農藝性狀的頻率分布Fig3-1 Frequency distribution of measured agronomic traits in LQ-15 of Lentinula edodes
29 圖 3-2 LQ-15 群體農藝性狀 BLUP 值和均值Fig 3-2 BLUP values and line means of measured agronomic traits in LQ-15 of Lentinula edodesSL(mm)SW(g)SD(mm)PW(g)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]玉米秸稈的再利用——代料栽培秋季香菇初探[J]. 陳黃曌,鄧曉旭,霍婧媛. 資源節(jié)約與環(huán)保. 2017(11)
[2]香菇栽培技術研究現(xiàn)狀[J]. 常曉嬌,吳春華,常廣寧,趙彩云,劉靜. 南方農業(yè). 2017(24)
[3]中國香菇栽培模式現(xiàn)狀及透氣袋模式技術要點[J]. 李玉,尚曉冬,宋春艷,周峰,李正鵬,李巧珍,譚琦. 農業(yè)工程技術. 2017(16)
[4]不同栽培基質對香菇頭潮菇產量及子實體營養(yǎng)成分的影響[J]. 柴美清,李青,韓鵬遠,趙毅,李云霞,張鎖峰,姚宇升. 中國農學通報. 2017(15)
[5]天水地區(qū)蘋果樹枝屑栽培香菇技術要點[J]. 孫潔,魏志貞,王俊羿. 食用菌. 2017(03)
[6]香菇栽培技術研究[J]. 弋淮. 農業(yè)科技與信息. 2017(06)
[7]玉米秸稈代料栽培香菇試驗[J]. 王洪奇,陳順,于廣峰,冀寶贏,柴林山,孫麗梅. 食用菌. 2017(02)
[8]植物鋅指蛋白的功能研究進展[J]. 王偉英,李海明,戴藝民,林江波. 中國園藝文摘. 2016(07)
[9]利用紫穗槐替代部分木屑栽培香菇的培養(yǎng)料配方研究[J]. 彭學文,解文強,周廷斌,吳志會. 河北農業(yè)科學. 2016(02)
[10]香菇布勒雜交新菌株玉豐一號的選育[J]. 曹玉謙,李長莉. 食用菌. 2016(02)
博士論文
[1]香菇重要農藝性狀的QTL定位[D]. 龔文兵.華中農業(yè)大學 2014
[2]組蛋白H2B單泛素化參與擬南芥抗大麗輪枝菌毒素防衛(wèi)反應的機理研究[D]. 裴寶磊.中國農業(yè)大學 2014
[3]擬南芥核孔蛋白Nup96的鑒定及其在開花時間和生物鐘調控中的功能分析[D]. 王旭.中國農業(yè)科學院 2014
[4]香菇分子遺傳圖譜構建和數(shù)量性狀座位(QTL)分析[D]. 林范學.華中農業(yè)大學 2008
[5]金頂側耳基因連鎖圖譜與雙—單交配機制解析及高溫型菌株選育研究[D]. 姚芳杰.吉林農業(yè)大學 2002
碩士論文
[1]香菇栽培菌株重要農藝性狀與分子標記的關聯(lián)分析[D]. 李闖.華中農業(yè)大學 2016
[2]基于候選基因標記的香菇重要農藝性狀關聯(lián)分析[D]. 向星潔.華中農業(yè)大學 2015
[3]香菇、滑子菇新品種選育研究[D]. 孫艷穎.河北師范大學 2015
[4]野生香菇數(shù)量性狀與SSR分子標記的關聯(lián)分析[D]. 徐銳.華中農業(yè)大學 2013
[5]幾種林果植物廢棄物在香菇栽培中的應用研究[D]. 張健.華中農業(yè)大學 2013
[6]香菇分子遺傳圖譜構建及漆酶活性QTL的定位[D]. 盧穎穎.華中農業(yè)大學 2012
[7]基于基因組的金針菇遺傳連鎖圖的構建與數(shù)量性狀位點(QTL)分析[D]. 張光忠.福建農林大學 2011
[8]金針菇遺傳連鎖圖的構建及菌絲生長速度的QTL定位[D]. 李博.福建農林大學 2009
本文編號:3588378
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