【目的】InDel（insertion/deletion,插人/缺失）在基因組上數(shù)量多、分布廣。InDel標(biāo)記是近年來發(fā)展的一種新型共顯性分子標(biāo)記,以PCR技術(shù)為基礎(chǔ),檢測方便、經(jīng)濟(jì)有效,且準(zhǔn)確性高、穩(wěn)定性好。因此,InDel標(biāo)記已經(jīng)廣泛應(yīng)用于動植物的基因型鑒定、遺傳多樣性分析、基因定位以及功能標(biāo)記開發(fā)等。但是,目前菜豆資源遺傳變異的InDel分子標(biāo)記研究尚知之甚少。【方法】利用已報(bào)道的菜豆InDel序列,合成InDel引物,通過普通PCR擴(kuò)增,檢測25份菜豆種質(zhì)資源的InDel多態(tài)性位點(diǎn),分析遺傳多樣性參數(shù),進(jìn)行UPGMA聚類分析,結(jié)合菜豆籽粒農(nóng)藝性狀評價(jià),研究菜豆種子遺傳變異特點(diǎn)。【結(jié)果】25份菜豆的種子表型差異明顯,包括單粒長度、單粒寬度、單粒厚度、百粒質(zhì)量等。種皮的顏色大致可劃分為純色和花色兩個(gè)系列。純色主要包括為黃色（7份）、黑色（5份）、白色（4份）和紅色（1份）;種皮花色的類型包括紅色帶黃斑（4份）、黃色帶紅斑（2份）、紅色帶白斑（1份）和黃色帶白斑（1份）。12對InDel多態(tài)性引物在25份菜豆中,共探測到26個(gè)InDel位點(diǎn),平均位點(diǎn)數(shù)是2.17個(gè)。引物的平均有效等位... 

【文章來源】：江西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,42(02)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：9 頁

【部分圖文】：

25份菜豆種子表型

利用12對InDel多態(tài)性引物對25份菜豆種質(zhì)資源進(jìn)行了檢測（圖2），共探測到26個(gè)InDel位點(diǎn)（表4），平均位點(diǎn)數(shù)是2.17個(gè)。引物的平均有效等位位點(diǎn)數(shù)為1.78個(gè)，多態(tài)信息含量PIC平均值是0.33，期望雜合度（He）平均值為0.42，觀察雜合度（Ho）平均值為0.52，群體的遺傳多樣性指數(shù)I為0.63。2.3 菜豆種質(zhì)資源的聚類分析

此外，在遺傳相似系數(shù)為0.95時(shí)，有兩份菜豆材料雖然種皮顏色不同（SJ0180為白色和SJ0209為黃色帶白斑），但是本研究中的InDel標(biāo)記無法區(qū)分兩者，可能是由于兩者的親緣關(guān)系較近，InDel標(biāo)記數(shù)量不夠而造成的。3 討論

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]基于InDel標(biāo)記的國內(nèi)綠豆品種遺傳多樣性分析及指紋圖譜構(gòu)建[J]. 李群三,陳景斌,顧和平,袁星星,陳新,崔瑾.  植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2019(01)
[2]利用Indel標(biāo)記鑒定‘豫甘3號’結(jié)球甘藍(lán)種子純度[J]. 楊雙娟,原玉香,魏小春,王志勇,趙艷艷,姚秋菊,蔣武生,張曉偉.  分子植物育種. 2018(08)
[3]利用InDel分子標(biāo)記分析海南山欄稻品種秈粳特性[J]. 徐建欣,楊潔,李美萱,敖莉絲,徐志軍.  中國農(nóng)學(xué)通報(bào). 2017(36)
[4]InDel分子標(biāo)記及其在水稻研究中的應(yīng)用[J]. 劉丹,孫玉友,魏才強(qiáng),解忠,李洪亮,張巍巍,程杜娟,孫國宏,徐德海.  種子. 2017(09)
[5]芝麻SNP和InDel標(biāo)記遺傳多樣性、群體結(jié)構(gòu)及連鎖不平衡分析[J]. 魏利斌,苗紅梅,李春,段迎輝,徐芳芳,張海洋.  分子植物育種. 2017(08)
[6]普通菜豆種質(zhì)資源表型鑒定及多樣性分析[J]. 王蘭芬,武晶,王昭禮,余莉,吳憲志,張時(shí)龍,王述民.  植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2016(06)
[7]普通菜豆種質(zhì)資源研究現(xiàn)狀及進(jìn)展[J]. 肖靖,李斌,石曉華,鄂成林,管洪波,鳳桐.  北方園藝. 2016(15)
[8]InDel標(biāo)記的研究和應(yīng)用進(jìn)展[J]. 楊潔,赫佳,王丹碧,施恩,楊文宇,耿其芳,王中生.  生物多樣性. 2016(02)
[9]基于InDel分子標(biāo)記的秈粳雜交稻與粳粳雜交稻的雜種優(yōu)勢比較研究[J]. 桂君梅,王林友,范小娟,祁永斌,張禮霞,范宏環(huán),金慶生,王建軍.  中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(02)
[10]番茄粉紅色果實(shí)相關(guān)基因的dCAPS和InDel標(biāo)記開發(fā)與應(yīng)用[J]. 董淑芳,王孝宣,高建昌,國艷梅,黃澤軍,杜永臣.  中國蔬菜. 2016(01)



本文編號：3571745