本選題以番茄根為材料,分離鑒定分屬于3個門、7個目、11個屬、25個種的70株內(nèi)生菌菌株,其中以變形菌門（70%）和厚壁菌門（28.57%）為主,以腸桿菌屬（32.86%）、芽孢桿菌屬（24.29%）和假單胞菌屬（18.57%）為優(yōu)勢種屬。分離菌株覆蓋了番茄根內(nèi)生菌前10個主要類群中的7個,具有廣泛的多樣性和代表性。番茄根內(nèi)生菌抑菌活性檢測結(jié)果表明,分別有44.7%、29.49%、20.51%和44.87%分離菌株對測試的大腸桿菌、枯草芽孢桿菌、金黃色葡萄球菌和黑曲霉具有抑菌活性。對挑選的各主要類群9株優(yōu)勢菌株的基因組測序和功能注釋顯示,番茄內(nèi)生菌具有多樣的次生代謝產(chǎn)物合成能力,其中6株具有與鐵載體合成相關(guān)的基因簇。進一步分析表明假單胞菌菌株p21黑曲霉抑菌活性與其分泌的pyoverdine II型鐵載體相關(guān),環(huán)境中Fe3+濃度對其抑菌活性有顯著影響。纖維素酶等在內(nèi)生菌侵染和定殖過程發(fā)揮重要作用。酶活篩選表明大多數(shù)內(nèi)生菌具有纖維素酶（78.49%）和木聚糖酶（44.57%）活性。9株內(nèi)生菌基因組注釋結(jié)果也顯示,除Rhizobium sp.r10外其他的8株測序菌均注釋有不同數(shù)目的纖維素... 

【文章來源】：福建師范大學(xué)福建省

【文章頁數(shù)】：105 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１健康番茄根內(nèi)生菌的菌群結(jié)構(gòu)（引自Ｔｉａｎ?ｅｔ?ａｌ，?２０１５ｍ）??Ｆｉ．?１?Ｅｎｄｏｈｔｅｓ?ｉｎｈａｂｉｔｉｎｔｈｅ?ｈｅａｌｔｈｔｏｍａｔｏ?ｒｏｏｔ??

?宄表明，當內(nèi)生菌穿過植物根外皮層后可繼續(xù)停留在侵入部位或者逐步向更深處占??據(jù)植物皮層細胞間隙［３１’３Ｓ’３９］（圖２）。在這些部位細菌也常以由幾百個菌體組成的小??菌落的形式存在，并且通常不會像根瘤菌那樣使宿主植物發(fā)生形態(tài)結(jié)構(gòu)的變化。但??是Ｈｕａｎｇ等［４°］對枯草芽孢桿菌ＧＸＪＭ０８?仰加以以）侵染刺槐根的研宄表??明其侵染方式與根瘤菌非常相似并且引起宿主形態(tài)結(jié)構(gòu)的變化，這對于探宄其他非??共生菌是否也同根瘤菌一樣引起宿主發(fā)生形態(tài)結(jié)構(gòu)的變化具有一定的意義。??Ａ??側(cè)根區(qū)／及也??根毛區(qū)外皮層??圖２?內(nèi)生菌侵染植物主要策略示意圖（引自Ｒｙａｎ?ｅｔ?ａｌ，?２００８［４１］）??Ｆｉｇ．?２?Ｔｈｅ?ｍａｉｎ?ｐｌａｎｔ?ｃｏｌｏｎｉｚａｔｉｏｎ?ｒｏｕｔｅｓ?ｂｙ?ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃ?ｂａｃｔｅｒｉａ．??２．２．?４侵入植物木質(zhì)部??植物木質(zhì)部是水、離子和一些低分子量有機化合物如氨基酸等的長距離運輸通??道［４２］，只有少數(shù)內(nèi)生菌能穿過植物內(nèi)皮層到達其中［３１’３７’３９’４３］。植物木質(zhì)部營養(yǎng)物質(zhì)??的濃度相對較低一些糖類的鮮重只有０．００６?－?０．０３４?Ｍ?ｍｏｌ／ｇＭ，研宄表明這些低??濃度的營養(yǎng)物質(zhì)足夠支持內(nèi)生菌的生長［４２’４５］。Ｂａｃｏｎ等用１３Ｃ０２為碳源培育馬鈴薯，??６??

２．?３細菌１６Ｓ?ｒＲＮＡ基因的ＰＣＲ擴增與測序??分別以提取的細菌基因組ＤＮＡ為模板，１４９２ｒ和２７ｆ為引物擴增細菌１６Ｓ?ｒＲＮＡ??基因，得到約１．?５?ｋｂ的ＤＮＡ片段（圖１－２）。純化的ＤＮＡ片段和Ｍａｒｋｅｒ?qū)Ρ龋兌??和濃度均符合測序要求。??ｂｐ?Ｍ?１?２?３?４?５?６７?８?９?１０??！＿?■?ｉ??圖１－２部分菌株１６Ｓ?ｒＲＡＮ基因ＰＣＲ擴增產(chǎn)物電泳圖注：Ｍ泳道代表ＤＬ２０００?Ｍａｒｋｅｒ；??１－１０泳道代表分離純化得到的１－１０號菌株１６Ｓ?ｒＲＮＡ?ＰＣＲ產(chǎn)物??Ｆｉｇ．?１－２?Ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ?ｏｆ?ＰＣＲ?ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｐｒｏｄｕｃｔｓ?ｆｏｒ?１６Ｓ?ｒＲＮＡ?ｇｅｎｅｓ??ｏｆ?ｔｈｅ?ｐａｒｔｉａｌ?ｂａｃｔｅｒｉａｌ?ｉｓｏｌａｔｅｓ??測序后，將得到的序列組裝編輯，遞交ＲＤＰ數(shù)據(jù)庫進行鑒定。在分離純化的１１５??株番茄根內(nèi)生菌中，一共鑒定得到７０株細菌（表１－１）。??表１－１番燕蕭ｚ?緩７７）根內(nèi)生菌的鑒定??Ｔａｂｌｅ?１一１?Ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｏｆ?ｔｈｅ?ｔｏｍａｔｏ?ｒｏｏｔ?ｅｎｄｏｐｈｙｔｅｓ??菌株編號?分子鑒定?一致性門?目??Ｔ?ｏＰｈｙ?ｔ?ｅ＿０?Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ?ｐｉ?ｅｃｏｇｌ?ｏｓ?ｓｉ?ｃｉ?ｄａ?９９．?１６％?變形菌假單胞菌??ＴｏＰｈｙｔｅ＿ｐｌ?Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ?ｍｏｈｎｉｉ?９９．４５％?變形菌假單胞菌??

【參考文獻】：
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本文編號：3564480