瓊花不孕花和可孕花轉(zhuǎn)錄組分析及發(fā)育過程形態(tài)結(jié)構(gòu)觀察
發(fā)布時間:2022-01-01 10:00
瓊花花型奇特,通常由外圍八朵不孕花和中間大量可孕花組成,不孕花形態(tài)比可孕花大近百倍,然而形成這兩種顯著差異花型的發(fā)育調(diào)控機制卻不清楚。我們利用新一代高通量測序平臺結(jié)合生物信息學(xué)的方法,從mRNA轉(zhuǎn)錄水平上對瓊花不孕花、可孕花進行轉(zhuǎn)錄組學(xué)比較分析,獲得了這兩種花器官發(fā)育高度差異表達的基因。同時利用細胞生物學(xué)、解剖結(jié)構(gòu)方法研究了這兩種花型發(fā)育過程中的形態(tài)結(jié)構(gòu)變化。主要結(jié)果如下:(1)從外部形態(tài)、器官組織解剖和細胞超微結(jié)構(gòu)三方面,比較了不孕花和和可孕花發(fā)育過程中形態(tài)結(jié)構(gòu)變化特征,找到了兩種花型在組織學(xué)和細胞學(xué)水平的差異。(2)分別成功提取瓊花不孕花和可孕花total RNA,用Illumina High-seqTM 2500測序平臺對瓊花進行轉(zhuǎn)錄組測序,共獲得了278,909,605個raw reads,去除低質(zhì)量序列、接頭序列、含N比例大于5%的序列,獲得了267,723,356個clean reads,測序質(zhì)量高。Trinity拼接最終獲得132,788個平均長度為740bp的轉(zhuǎn)錄本,每條基因中最長的轉(zhuǎn)錄本作為unigene,共獲得105,683個unigeneo(3)將unigenes...
【文章來源】:揚州大學(xué)江蘇省
【文章頁數(shù)】:76 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
花器官發(fā)育ABC模型(Ma,2000)
.3.3?ABCDE?模型??A、B、CH類基因是花器官重要的重要調(diào)控基因,但是將它們過量表達并沒有使葉片??變成其他花器官twi,這預(yù)示著由營養(yǎng)器官向花器官轉(zhuǎn)變過程中還有其他花特征基因的參??。PelazW發(fā)現(xiàn)類似基因JGZ2、和^說9與花器官特異性表達有關(guān),立個基因??任何一個或兩個發(fā)生突變時,對花器官的形成并沒有明顯的影響.而當(dāng)這王個基因同時??生突變時,就只能形成花專,呈現(xiàn)出B、C類基因雙巧變時的表型。遠表明^GZ2、??基因(后被重新命名為祐尸2、化尸j基因)與之前的A、B、C類基因不??,因此,將這H個基因稱為E類基因。E類基因主要參與粵片、花瓣、雄蕊、必皮和胚??的形成和發(fā)育,控制花分生組織的形成fW。隨后,在非洲菊(Ger6era/2_y6rWa)中發(fā)現(xiàn)??雄蕊發(fā)育所必須的G/?C公/基因tW,同時,在水稻中發(fā)現(xiàn)了漿片和雄蕊正常發(fā)育所必須??基卸叩它們都是屬于同一類基因,都為E類基因。由此,ABC模型進一步??ABCDE型(或AE)1-4。??
聚體模型??述模型無法在蛋白層次更好地解釋花器官發(fā)育的調(diào)控過程,結(jié)合MADS,ThdssentW首度提出了花器官發(fā)育"四聚體模型"(圖1-5),該模型認編碼的蛋白相互作用構(gòu)成四聚體,調(diào)控花器官的發(fā)育。在花器官發(fā)育的AB了心>2基因外均屬于MADS-box家族基因,MADS-box是真核生物中重,在植物中參與花器官的發(fā)育twi,開花時間的調(diào)節(jié)twi,在根、莖、葉、果起著重要的作用。通過凝膠阻滯、酵母雙雜交實驗表明,控制花器官發(fā)蛋白能夠形成同源或異源二聚體,二聚體繼而形成H元或四元蛋白復(fù)合官形成tni。四聚體模型顯示在不考慮胚珠的情況下,四輪花器官的發(fā)育是基因的蛋白質(zhì)產(chǎn)物所形成的四聚體決定的。通過對模式植物擬南芥的研APl-APl-?-?(?為未知蛋白)決定第一輪花器官粵片的形成;乂P7、---二
【參考文獻】:
期刊論文
[1]花器官大小調(diào)控機制的研究進展[J]. 張栩佳,胡靈芝,陳哲皓,李穎,王利琳. 植物生理學(xué)報. 2014(06)
[2]植物細胞核雄性不育基因研究進展[J]. 楊莉芳,刁現(xiàn)民. 植物遺傳資源學(xué)報. 2013(06)
[3]ELE restrains empty glumes from developing into lemmas[J]. Lilan Hong a, 1, Qian Qian b, 1, Keming Zhu c, 1, Ding Tang a, Zejun Huang a, Ling Gao a, Ming Li a, Minghong Gu c, Zhukuan Cheng a, a State Key Laboratory of Plant Genomics and National Center for Plant Gene Research, Institute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China b State Key Laboratory of Rice Biology, China National Rice Research Institute, Hangzhou 310006, China c Key Laboratory of Crop Genetics and Physiology of Jiangsu Province/Key Laboratory of Plant Functional Genomics of Ministry of Education, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China. 遺傳學(xué)報. 2010(02)
[4]利用野生青狗尾草的細胞質(zhì)培育谷子質(zhì)核互作雄性不育材料[J]. 智慧,王永強,李偉,王永芳,李海權(quán),陸平,刁現(xiàn)民. 植物遺傳資源學(xué)報. 2007(03)
[5]植物雌配子體發(fā)育的分子調(diào)控研究進展[J]. 包仁艷,姜春寧,鄭彩霞,丁坤善. 北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2005(04)
[6]植物雌性不育的研究進展[J]. 胡青,高述民,李鳳蘭. 北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2004(01)
本文編號:3562141
【文章來源】:揚州大學(xué)江蘇省
【文章頁數(shù)】:76 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
花器官發(fā)育ABC模型(Ma,2000)
.3.3?ABCDE?模型??A、B、CH類基因是花器官重要的重要調(diào)控基因,但是將它們過量表達并沒有使葉片??變成其他花器官twi,這預(yù)示著由營養(yǎng)器官向花器官轉(zhuǎn)變過程中還有其他花特征基因的參??。PelazW發(fā)現(xiàn)類似基因JGZ2、和^說9與花器官特異性表達有關(guān),立個基因??任何一個或兩個發(fā)生突變時,對花器官的形成并沒有明顯的影響.而當(dāng)這王個基因同時??生突變時,就只能形成花專,呈現(xiàn)出B、C類基因雙巧變時的表型。遠表明^GZ2、??基因(后被重新命名為祐尸2、化尸j基因)與之前的A、B、C類基因不??,因此,將這H個基因稱為E類基因。E類基因主要參與粵片、花瓣、雄蕊、必皮和胚??的形成和發(fā)育,控制花分生組織的形成fW。隨后,在非洲菊(Ger6era/2_y6rWa)中發(fā)現(xiàn)??雄蕊發(fā)育所必須的G/?C公/基因tW,同時,在水稻中發(fā)現(xiàn)了漿片和雄蕊正常發(fā)育所必須??基卸叩它們都是屬于同一類基因,都為E類基因。由此,ABC模型進一步??ABCDE型(或AE)1-4。??
聚體模型??述模型無法在蛋白層次更好地解釋花器官發(fā)育的調(diào)控過程,結(jié)合MADS,ThdssentW首度提出了花器官發(fā)育"四聚體模型"(圖1-5),該模型認編碼的蛋白相互作用構(gòu)成四聚體,調(diào)控花器官的發(fā)育。在花器官發(fā)育的AB了心>2基因外均屬于MADS-box家族基因,MADS-box是真核生物中重,在植物中參與花器官的發(fā)育twi,開花時間的調(diào)節(jié)twi,在根、莖、葉、果起著重要的作用。通過凝膠阻滯、酵母雙雜交實驗表明,控制花器官發(fā)蛋白能夠形成同源或異源二聚體,二聚體繼而形成H元或四元蛋白復(fù)合官形成tni。四聚體模型顯示在不考慮胚珠的情況下,四輪花器官的發(fā)育是基因的蛋白質(zhì)產(chǎn)物所形成的四聚體決定的。通過對模式植物擬南芥的研APl-APl-?-?(?為未知蛋白)決定第一輪花器官粵片的形成;乂P7、---二
【參考文獻】:
期刊論文
[1]花器官大小調(diào)控機制的研究進展[J]. 張栩佳,胡靈芝,陳哲皓,李穎,王利琳. 植物生理學(xué)報. 2014(06)
[2]植物細胞核雄性不育基因研究進展[J]. 楊莉芳,刁現(xiàn)民. 植物遺傳資源學(xué)報. 2013(06)
[3]ELE restrains empty glumes from developing into lemmas[J]. Lilan Hong a, 1, Qian Qian b, 1, Keming Zhu c, 1, Ding Tang a, Zejun Huang a, Ling Gao a, Ming Li a, Minghong Gu c, Zhukuan Cheng a, a State Key Laboratory of Plant Genomics and National Center for Plant Gene Research, Institute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China b State Key Laboratory of Rice Biology, China National Rice Research Institute, Hangzhou 310006, China c Key Laboratory of Crop Genetics and Physiology of Jiangsu Province/Key Laboratory of Plant Functional Genomics of Ministry of Education, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China. 遺傳學(xué)報. 2010(02)
[4]利用野生青狗尾草的細胞質(zhì)培育谷子質(zhì)核互作雄性不育材料[J]. 智慧,王永強,李偉,王永芳,李海權(quán),陸平,刁現(xiàn)民. 植物遺傳資源學(xué)報. 2007(03)
[5]植物雌配子體發(fā)育的分子調(diào)控研究進展[J]. 包仁艷,姜春寧,鄭彩霞,丁坤善. 北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2005(04)
[6]植物雌性不育的研究進展[J]. 胡青,高述民,李鳳蘭. 北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2004(01)
本文編號:3562141
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