采用生物信息學(xué)方法,從中國(guó)辣椒（Capsicum chinense Jacq.）全基因組序列中鑒定得到28個(gè)熱脅迫轉(zhuǎn)錄因子（HSF）候選基因,并對(duì)這些候選基因的染色體分布、基因結(jié)構(gòu)及編碼蛋白的3D結(jié)構(gòu)特征進(jìn)行了分析。結(jié)果顯示:28個(gè)候選基因的編碼蛋白長(zhǎng)度為128～526 aa;系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果表明,HSF可分為A、B、C 3個(gè)亞家族。進(jìn)一步對(duì)熱脅迫處理后的中國(guó)辣椒種質(zhì)進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析,共檢測(cè)到27個(gè)HSF轉(zhuǎn)錄本,與對(duì)照組相比,實(shí)驗(yàn)組中有25個(gè)基因?qū)崦{迫有不同程度的響應(yīng)。 

【文章來(lái)源】：植物科學(xué)學(xué)報(bào). 2020,38(02)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：11 頁(yè)

【部分圖文】：

中國(guó)辣椒HSF基因在染色體上的分布

本研究將擬南芥中的24個(gè)HSF基因及中國(guó)辣椒中篩選出的28個(gè)HSF候選基因構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)（圖4）。結(jié)果顯示，這些HSF基因序列可分為A、B、C 3個(gè)亞家族。其中，A族成員的數(shù)量最多，擬南芥中有17個(gè)，中國(guó)辣椒中有17個(gè)；B族成員其次，擬南芥中有5個(gè)，中國(guó)辣椒中有9個(gè)；C族成員最少，在擬南芥和中國(guó)辣椒中各有2個(gè)。圖3 HSF基因蛋白的基序分析

HSF基因蛋白的基序分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]番茄熱激轉(zhuǎn)錄因子（Hsf）基因家族鑒定及表達(dá)分析[J]. 陳勇兵,王燕,張海利.  農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2015(04)



本文編號(hào)：3554092