基于nSSR和cpSSR標(biāo)記的中國(guó)棗遺傳多樣性研究
發(fā)布時(shí)間:2021-12-10 11:38
棗(Ziziphus jujuba Mill.)是原產(chǎn)我國(guó)的重要果樹(shù)。棗和酸棗(Z.jujuba var.spinosa)資源豐富,在長(zhǎng)期的人工選擇和自然選擇過(guò)程中產(chǎn)生大量的遺傳變異。本研究選取我國(guó)298份代表性種質(zhì)(213份棗和85份酸棗類(lèi)型),用10對(duì)細(xì)胞核SSR(nSSR)和7對(duì)葉綠體SSR(cpSSR)標(biāo)記,研究我國(guó)棗和酸棗的遺傳多樣性、遺傳結(jié)構(gòu)、單倍型網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)和遺傳演化關(guān)系。主要取得如下結(jié)論:(1)遺傳多樣性研究發(fā)現(xiàn),酸棗群體的核、質(zhì)遺傳多樣性大于棗群體。在核基因組水平上,酸棗的期望雜合度(He)和香農(nóng)指數(shù)(I)分別為0.750和1.797,大于棗(He、I分別為0.736,1.604);在葉綠體基因組水平上,酸棗的多樣性(h)和香農(nóng)指數(shù)(I)分別為0.462和0.809,大于棗(h、I分別為0.418,0.738)。Nei’s遺傳距離、分子方差分析及群體特有等位變異證實(shí),棗和酸棗群體間親緣關(guān)系近,遺傳分化程度低,群體間Nei’s遺傳距離為0.191,核、質(zhì)水平的遺傳分化分別為10%和1%。(2)遺傳結(jié)構(gòu)的結(jié)果顯示,當(dāng)K=2時(shí),棗被劃分成2個(gè)類(lèi)群,一類(lèi)以酸棗為體,集中分布在黃...
【文章來(lái)源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:61 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 棗種質(zhì)資源概述
1.1.1 棗種質(zhì)資源的組成和劃分
1.1.2 棗種質(zhì)資源的研究意義
1.2 棗遺傳多樣性研究中遺傳標(biāo)記的應(yīng)用
1.2.1 形態(tài)學(xué)標(biāo)記
1.2.2 細(xì)胞學(xué)標(biāo)記
1.2.3 蛋白質(zhì)標(biāo)記
1.2.4 DNA分子標(biāo)記
1.3 棗的起源與演化研究進(jìn)展
1.3.1 棗起源研究進(jìn)展
1.3.2 酸棗與棗演化研究進(jìn)展
1.4 本研究的目的和意義
1.4.1 研究目的和意義
1.4.2 研究?jī)?nèi)容
1.4.3 研究的技術(shù)路線
第二章 材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 待篩選引物及篩選所用材料
2.1.2 棗遺傳多樣性研究材料
2.2 主要儀器和試劑
2.2.1 主要儀器
2.2.2 主要試劑
2.2.3 相關(guān)試劑配制方法
2.3 試驗(yàn)方法
2.3.1 引物合成及DNA提取
2.3.2 瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)
2.3.3 聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測(cè)
2.3.4 SSR數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
第三章 結(jié)果與分析
3.1 cpSSR引物的篩選
3.2 棗和酸棗遺傳多樣性指數(shù)分析
3.3 棗和酸棗的群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
3.4 棗和酸棗的單倍型分析
3.5 棗和酸棗的聚類(lèi)分析
第四章 結(jié)論與討論
4.1 遺傳多樣性分析
4.2 遺傳結(jié)構(gòu)分析
4.3 遺傳關(guān)系分析
參考文獻(xiàn)
附錄
縮略詞
致謝
作者簡(jiǎn)介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]棗基因組大小研究[J]. 沈慧,黃建,佟巖,李新崗. 西北林學(xué)院學(xué)報(bào). 2016(03)
[2]主要果樹(shù)果實(shí)品質(zhì)遺傳改良與提升實(shí)踐[J]. 陳學(xué)森,郭文武,徐娟,叢佩華,王力榮,劉崇懷,李秀根,吳樹(shù)敬,姚玉新,陳曉流. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(17)
[3]Genetic Diversity and Population Structure in Landraces and Improved Rice Varieties from India[J]. Shailesh D.KUMBHAR,Pawan L.KULWAL,Jagannath V.PATIL,Chandrakant D.SARAWATE,Anil P.GAIKWAD,Ashok S.JADHAV. Rice Science. 2015(03)
[4]基于葉綠體DNA分析的遼寧省梨屬種質(zhì)遺傳多樣性研究[J]. 常耀軍,曹玉芬,張金梅,田路明,董星光,張瑩,齊丹,鄭迎春. 園藝學(xué)報(bào). 2014(07)
[5]陜北棗品種群遺傳結(jié)構(gòu)的SSR分析[J]. 殷曉,張春梅,李新崗,黃建,王長(zhǎng)柱,練春蘭. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2014(06)
[6]棗和酸棗基因組大小測(cè)定[J]. 吳麗萍,唐巖,李穎岳,尹丹妮,龐曉明. 北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(03)
[7]‘蘋(píng)果棗’自然三倍體倍性的發(fā)現(xiàn)與鑒定[J]. 劉學(xué)生,陳龍,王金鑫,李莉,彭建營(yíng). 園藝學(xué)報(bào). 2013(03)
[8]棗和酸棗親緣關(guān)系的RAPD分析[J]. 李瑞環(huán),李新崗,黃建,高文海. 果樹(shù)學(xué)報(bào). 2012(03)
[9]河南主栽棗品種遺傳關(guān)系的ISSR分析[J]. 李繼東,李海濤,馮建燦,畢會(huì)濤,趙旭升. 河南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(01)
[10]棗屬植物分類(lèi)學(xué)存在的科學(xué)問(wèn)題及展望[J]. 王延峰,楊宗保. 延安大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2011(04)
博士論文
[1]棗種質(zhì)資源遺傳多樣性的分子評(píng)價(jià)及其核心種質(zhì)的構(gòu)建[D]. 白瑞霞.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[2]中國(guó)栽培和野生大豆的遺傳多樣性、群體分化和演化及其育種性狀QTL的關(guān)聯(lián)分析[D]. 文自翔.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
碩士論文
[1]棗葉綠體基因組SSR開(kāi)發(fā)及遺傳多樣性研究[D]. 楊曉婷.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2014
[2]酸棗SSR引物開(kāi)發(fā)及遺傳多樣性研究[D]. 張春梅.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2013
[3]基于SSR標(biāo)記的中國(guó)棗遺傳多樣性研究[D]. 殷曉.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2013
[4]棗、酸棗的細(xì)胞學(xué)研究[D]. 陳龍.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[5]靈寶大棗遺傳多樣性的表型與ISSR分析[D]. 梁?jiǎn)?河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[6]大豆細(xì)胞質(zhì)基因組單倍型及其相互間的演化關(guān)系[D]. 田曉俊.南昌大學(xué) 2007
本文編號(hào):3532549
【文章來(lái)源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:61 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 棗種質(zhì)資源概述
1.1.1 棗種質(zhì)資源的組成和劃分
1.1.2 棗種質(zhì)資源的研究意義
1.2 棗遺傳多樣性研究中遺傳標(biāo)記的應(yīng)用
1.2.1 形態(tài)學(xué)標(biāo)記
1.2.2 細(xì)胞學(xué)標(biāo)記
1.2.3 蛋白質(zhì)標(biāo)記
1.2.4 DNA分子標(biāo)記
1.3 棗的起源與演化研究進(jìn)展
1.3.1 棗起源研究進(jìn)展
1.3.2 酸棗與棗演化研究進(jìn)展
1.4 本研究的目的和意義
1.4.1 研究目的和意義
1.4.2 研究?jī)?nèi)容
1.4.3 研究的技術(shù)路線
第二章 材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 待篩選引物及篩選所用材料
2.1.2 棗遺傳多樣性研究材料
2.2 主要儀器和試劑
2.2.1 主要儀器
2.2.2 主要試劑
2.2.3 相關(guān)試劑配制方法
2.3 試驗(yàn)方法
2.3.1 引物合成及DNA提取
2.3.2 瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)
2.3.3 聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測(cè)
2.3.4 SSR數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
第三章 結(jié)果與分析
3.1 cpSSR引物的篩選
3.2 棗和酸棗遺傳多樣性指數(shù)分析
3.3 棗和酸棗的群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
3.4 棗和酸棗的單倍型分析
3.5 棗和酸棗的聚類(lèi)分析
第四章 結(jié)論與討論
4.1 遺傳多樣性分析
4.2 遺傳結(jié)構(gòu)分析
4.3 遺傳關(guān)系分析
參考文獻(xiàn)
附錄
縮略詞
致謝
作者簡(jiǎn)介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]棗基因組大小研究[J]. 沈慧,黃建,佟巖,李新崗. 西北林學(xué)院學(xué)報(bào). 2016(03)
[2]主要果樹(shù)果實(shí)品質(zhì)遺傳改良與提升實(shí)踐[J]. 陳學(xué)森,郭文武,徐娟,叢佩華,王力榮,劉崇懷,李秀根,吳樹(shù)敬,姚玉新,陳曉流. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(17)
[3]Genetic Diversity and Population Structure in Landraces and Improved Rice Varieties from India[J]. Shailesh D.KUMBHAR,Pawan L.KULWAL,Jagannath V.PATIL,Chandrakant D.SARAWATE,Anil P.GAIKWAD,Ashok S.JADHAV. Rice Science. 2015(03)
[4]基于葉綠體DNA分析的遼寧省梨屬種質(zhì)遺傳多樣性研究[J]. 常耀軍,曹玉芬,張金梅,田路明,董星光,張瑩,齊丹,鄭迎春. 園藝學(xué)報(bào). 2014(07)
[5]陜北棗品種群遺傳結(jié)構(gòu)的SSR分析[J]. 殷曉,張春梅,李新崗,黃建,王長(zhǎng)柱,練春蘭. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2014(06)
[6]棗和酸棗基因組大小測(cè)定[J]. 吳麗萍,唐巖,李穎岳,尹丹妮,龐曉明. 北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(03)
[7]‘蘋(píng)果棗’自然三倍體倍性的發(fā)現(xiàn)與鑒定[J]. 劉學(xué)生,陳龍,王金鑫,李莉,彭建營(yíng). 園藝學(xué)報(bào). 2013(03)
[8]棗和酸棗親緣關(guān)系的RAPD分析[J]. 李瑞環(huán),李新崗,黃建,高文海. 果樹(shù)學(xué)報(bào). 2012(03)
[9]河南主栽棗品種遺傳關(guān)系的ISSR分析[J]. 李繼東,李海濤,馮建燦,畢會(huì)濤,趙旭升. 河南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(01)
[10]棗屬植物分類(lèi)學(xué)存在的科學(xué)問(wèn)題及展望[J]. 王延峰,楊宗保. 延安大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2011(04)
博士論文
[1]棗種質(zhì)資源遺傳多樣性的分子評(píng)價(jià)及其核心種質(zhì)的構(gòu)建[D]. 白瑞霞.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[2]中國(guó)栽培和野生大豆的遺傳多樣性、群體分化和演化及其育種性狀QTL的關(guān)聯(lián)分析[D]. 文自翔.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
碩士論文
[1]棗葉綠體基因組SSR開(kāi)發(fā)及遺傳多樣性研究[D]. 楊曉婷.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2014
[2]酸棗SSR引物開(kāi)發(fā)及遺傳多樣性研究[D]. 張春梅.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2013
[3]基于SSR標(biāo)記的中國(guó)棗遺傳多樣性研究[D]. 殷曉.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2013
[4]棗、酸棗的細(xì)胞學(xué)研究[D]. 陳龍.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[5]靈寶大棗遺傳多樣性的表型與ISSR分析[D]. 梁?jiǎn)?河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[6]大豆細(xì)胞質(zhì)基因組單倍型及其相互間的演化關(guān)系[D]. 田曉俊.南昌大學(xué) 2007
本文編號(hào):3532549
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