菊花（Chrysanthemum × morifolitum）是世界上最重要的觀賞作物,干旱脅迫是主要限制菊花生產(chǎn)的因素之一。然而在廣義菊屬中存在著大量抗旱性極強(qiáng)的種質(zhì),如太行菊、灌木亞菊等,還極少參與到現(xiàn)代菊花育種中。這些種質(zhì)不僅有著極強(qiáng)的抗旱性,且同時具有其他優(yōu)良性狀,如抗風(fēng)、抗病蟲等,研究并發(fā)掘這些優(yōu)異種質(zhì)及其重要性狀的關(guān)鍵基因,對菊花抗性育種及現(xiàn)有菊花性狀的改良具有重要意義。本文基于課題組前期種質(zhì)篩選評價(jià)數(shù)據(jù),進(jìn)一步對初選廣義菊屬中抗旱種質(zhì)進(jìn)行干旱脅迫,根據(jù)形態(tài)指標(biāo)、生理指標(biāo)和光合指標(biāo)等指標(biāo)進(jìn)一步評價(jià),發(fā)現(xiàn)太行菊是其中最優(yōu)的抗旱種質(zhì),并對太行菊進(jìn)行內(nèi)源ABA測定,結(jié)合光合指標(biāo),選擇脅迫3.5小時作為太行菊早期響應(yīng)干旱脅迫的重要時間節(jié)點(diǎn),并以此進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組高通量測序及生物信息學(xué)分析,初步探究其對干旱脅迫響應(yīng)的調(diào)控機(jī)制。主要結(jié)果如下:（1）根據(jù)前期種質(zhì)篩選評價(jià)數(shù)據(jù),初選出廣義菊屬野生種質(zhì)甘菊（Chrysanthemum×lavandulifolium）、野菊（Chrysanthemum indicum）、灌木亞菊（Ajania fruticulosa）和太行菊（Opisthopapp... 

【文章來源】：北京林業(yè)大學(xué)北京市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：83 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖３－１?ＡｌＲＪｎｉｇｅｎｅ長度分布情況??Ｆｉｇ．３－１?Ｌｅｎｇｔｈ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?Ａｌｌ－Ｕｎｉｇｅｎｅ?ｓｅｑｕｅｎｃｅ??

２?ＧＯ分類??根據(jù)ＮＲ注釋信息能得到ＧＯ功能注釋。Ｇｅｎｅ?Ｏｎｔｏｌｏｇｙ?（簡稱ＧＯ）是一個國際標(biāo)??的基因功能分類體系，提供了一套動態(tài)更新的標(biāo)準(zhǔn)詞匯表（ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ??ａｂｕｌａｒｙ）來全面描述生物體中基因和基因產(chǎn)物的屬性。ＧＯ總共有三個ｏｎｔｏｌｏｇｙ，??描述基因的分子功能（ｍｏｌｅｃｕｌａｒ?ｆｕｎｃｔｉｏｎ）、細(xì)胞組分（ｃｅｌｌｕｌａｒ?ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ）、??的生物過程（ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ?ｐｒｏｃｅｓｓ）。ＧＯ功能分析一方面給出差異表達(dá)基因的??功能分類注釋？，另一方面給出差異表達(dá)基因的ＧＯ功能顯著性富集分析。根據(jù)ＮＲ??信息，使用Ｂｌａｓｔ２Ｇ０軟件得到Ｕｎｉｇｅｎｅ的ＧＯ注釋信息。得到每個Ｕｎｉｇｅｎｅ的??注釋后，用ＷＥＧ０軟件對所有Ｕｎｉｇｅｎｅ做ＧＯ功能分類統(tǒng)計(jì)，從宏觀上認(rèn)識該物種??因功能分布特征。分類結(jié)果如圖３－３，注釋到ＧＯ數(shù)據(jù)庫的４４１４７條Ｕｎｉｇｅｎｅ歸??５６個功能。由圖可知，進(jìn)行ＧＯ注釋之后，其中，歸類數(shù)目在５０００－１００００條之??分類有：生物調(diào)節(jié)（ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ?ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ）、細(xì)胞組成的組織或生物合成??ｃｅｌｌｕｌａｒ?ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ?ｏｒｇａｎｉｚａｔｉｏｎ?ｏｒ?ｂｉｏｇｅｎｅｓｉｓ?）、建立或定位功能??

步得到Ｕｎｉｇｅｎｅ的Ｐａｔｈｗａｙ注釋。ＫＥＧＧ?Ｐａｔｈｗａｙ分成３個ｌｅｖｅｌ，?ｌｅｖｅｌ?３擁有具體的通??路圖和響應(yīng)的基因，通過比對將Ｕｎｉｇｅｎｅ注釋到各ｌｅｖｅｌ?３中的通路圖上，共有５１３１８??條基因成功注釋，如圖３－５，。其中，代謝通路（Ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ）中，注釋最多的是全局??和概述地圖（Ｇｌｏｂａｌ?ｍａｐ）和糖代謝（Ｃａｒｂｏｈｙｄｒａｔｅ?ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ?），分別為２０３０６??和８９８５條，占成功注釋到ＫＥＧＧ數(shù)據(jù)庫中Ｕｎｉｇｅｎｅ總數(shù)的比例為２９．?５７％和１７．?５１％：其次??為遺傳信息處理（Ｇｅｎｅｔｉｃ?Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ?Ｐｒｏｃｅｓｓｉｎｇ）歸類里的翻譯（Ｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎ），??有８０３７條

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號：3517390