基于RNA-Seq技術(shù)分析菜心葉片衰老相關(guān)基因
發(fā)布時(shí)間:2021-11-14 08:28
菜心(Brassica rapa var.parachinensis)是我國(guó)重要的葉菜類蔬菜之一,具有較高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。菜心采收之后,其生命周期進(jìn)入衰老階段。在貯藏過(guò)程中由衰老引發(fā)的葉片黃化導(dǎo)致品質(zhì)劣變和貨架期縮短,是菜心采后生物學(xué)研究的核心問(wèn)題之一。目前植物葉片衰老機(jī)制研究主要集中在擬南芥和水稻等模式植物上,而前人對(duì)菜心采后研究多集中在衰老生理過(guò)程的描述和采后實(shí)用處理技術(shù)領(lǐng)域,對(duì)菜心葉片衰老及其調(diào)控的分子機(jī)理缺乏系統(tǒng)了解。因此,借鑒模式植物的研究結(jié)果,加深對(duì)菜心采后葉片衰老及其調(diào)控機(jī)制的認(rèn)識(shí),將為生產(chǎn)上改進(jìn)菜心采后貯藏保鮮技術(shù)措施提供新的重要理論依據(jù)。本研究利用RNA-Seq,對(duì)菜心葉片衰老過(guò)程中的基因表達(dá)變化情況進(jìn)行分析,篩選與葉片衰老相關(guān)的差異表達(dá)基因。主要研究結(jié)果如下:1.提取貯藏在常溫(25℃)PE(Polyethylene)氣調(diào)包裝里0 d、2 d和5 d的菜心葉片進(jìn)行RNA-Seq測(cè)序,經(jīng)讀段拼接后共獲得了75651個(gè)unigenes,為分析菜心采后葉片衰老表達(dá)譜提供了參考基因序列。2.分析了菜心采后葉片衰老表達(dá)譜,鑒定到了3604個(gè)差異表達(dá)基因。通過(guò)基因表達(dá)模式聚類分析,...
【文章來(lái)源】:華南農(nóng)業(yè)大學(xué)廣東省
【文章頁(yè)數(shù)】:70 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
菜心葉片總RNA瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)
圖 2 菜心 Unigens 和 Transcipts 長(zhǎng)度分布.1.3 注釋結(jié)果評(píng)估為了對(duì)菜心轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行基因功能分析,使用 Blastx 程序,將 Unigenes 比對(duì)到
菜心NR注釋中最優(yōu)比對(duì)結(jié)果的物種分布
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]NAC轉(zhuǎn)錄因子在植物生長(zhǎng)發(fā)育中的調(diào)控作用[J]. 楊曉娜,田云,盧向陽(yáng). 化學(xué)與生物工程. 2014(01)
[2]植物轉(zhuǎn)錄因子NAP亞家族的研究進(jìn)展[J]. 范凱,王學(xué)德,袁淑娜,王銘. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(02)
[3]國(guó)內(nèi)外葉類蔬菜貯藏保鮮技術(shù)研究現(xiàn)狀[J]. 周凝,龍淦華,沈培奇. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(15)
[4]殼聚糖涂膜對(duì)延緩菜心采后衰老效果的研究[J]. 劉順枝,孫茹,江月玲,劉俊鳴,胡位榮. 食品科技. 2012(10)
[5]不同真空預(yù)冷條件對(duì)菜心外觀品質(zhì)的影響[J]. 王惠惠,陳于隴,徐玉娟,吳繼軍,王維民,范梅紅. 農(nóng)產(chǎn)品加工(學(xué)刊). 2012(06)
[6]1-MCP對(duì)貯藏期間菜心衰老進(jìn)程的影響[J]. 張魯斌,朱世江,王光. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(11)
[7]鮮切蒜薹貨架期MAP保鮮效果研究[J]. 李喜宏,王秀麗,張利,李莉. 食品科技. 2010(08)
[8]BTH處理對(duì)菜心耐貯性的影響研究[J]. 王光,張魯斌,張法梅,朱世江. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2009(12)
[9]茉莉酸甲酯處理對(duì)菜心耐貯性的影響[J]. 張法梅,劉少群,蘇蔚,朱世江. 農(nóng)業(yè)工程學(xué)報(bào). 2009(S1)
[10]中草藥涂膜對(duì)小白菜保鮮效果的影響[J]. 王本翠,劉正霞,吳愛(ài)現(xiàn),陳海華,李文香. 長(zhǎng)江蔬菜. 2009(10)
碩士論文
[1]MAP和1-MCP對(duì)山野菜貯藏生理及品質(zhì)的影響研究[D]. 齊國(guó)光.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
本文編號(hào):3494300
【文章來(lái)源】:華南農(nóng)業(yè)大學(xué)廣東省
【文章頁(yè)數(shù)】:70 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
菜心葉片總RNA瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)
圖 2 菜心 Unigens 和 Transcipts 長(zhǎng)度分布.1.3 注釋結(jié)果評(píng)估為了對(duì)菜心轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行基因功能分析,使用 Blastx 程序,將 Unigenes 比對(duì)到
菜心NR注釋中最優(yōu)比對(duì)結(jié)果的物種分布
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]NAC轉(zhuǎn)錄因子在植物生長(zhǎng)發(fā)育中的調(diào)控作用[J]. 楊曉娜,田云,盧向陽(yáng). 化學(xué)與生物工程. 2014(01)
[2]植物轉(zhuǎn)錄因子NAP亞家族的研究進(jìn)展[J]. 范凱,王學(xué)德,袁淑娜,王銘. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(02)
[3]國(guó)內(nèi)外葉類蔬菜貯藏保鮮技術(shù)研究現(xiàn)狀[J]. 周凝,龍淦華,沈培奇. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(15)
[4]殼聚糖涂膜對(duì)延緩菜心采后衰老效果的研究[J]. 劉順枝,孫茹,江月玲,劉俊鳴,胡位榮. 食品科技. 2012(10)
[5]不同真空預(yù)冷條件對(duì)菜心外觀品質(zhì)的影響[J]. 王惠惠,陳于隴,徐玉娟,吳繼軍,王維民,范梅紅. 農(nóng)產(chǎn)品加工(學(xué)刊). 2012(06)
[6]1-MCP對(duì)貯藏期間菜心衰老進(jìn)程的影響[J]. 張魯斌,朱世江,王光. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(11)
[7]鮮切蒜薹貨架期MAP保鮮效果研究[J]. 李喜宏,王秀麗,張利,李莉. 食品科技. 2010(08)
[8]BTH處理對(duì)菜心耐貯性的影響研究[J]. 王光,張魯斌,張法梅,朱世江. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2009(12)
[9]茉莉酸甲酯處理對(duì)菜心耐貯性的影響[J]. 張法梅,劉少群,蘇蔚,朱世江. 農(nóng)業(yè)工程學(xué)報(bào). 2009(S1)
[10]中草藥涂膜對(duì)小白菜保鮮效果的影響[J]. 王本翠,劉正霞,吳愛(ài)現(xiàn),陳海華,李文香. 長(zhǎng)江蔬菜. 2009(10)
碩士論文
[1]MAP和1-MCP對(duì)山野菜貯藏生理及品質(zhì)的影響研究[D]. 齊國(guó)光.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
本文編號(hào):3494300
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/yylw/3494300.html
最近更新
教材專著