香菇栽培菌株重要農藝性狀與分子標記的關聯(lián)分析
發(fā)布時間:2021-11-10 06:00
香菇(Lentinula edodes)營養(yǎng)豐富、味道鮮美,是世界上栽培規(guī)模僅次于雙孢蘑菇的第二大食用菌,在我國食用菌產業(yè)中占有重要地位。剖析香菇重要農藝性狀的數(shù)量遺傳規(guī)律是成功選育香菇優(yōu)良菌株的前提與基礎。本研究通過關聯(lián)分析方法解析香菇重要農藝性狀的遺傳規(guī)律,挖掘影響香菇菌絲長速、生育期、形態(tài)特征及產量性狀的標記位點和候選基因,為分子標記輔助選擇育種應用于香菇中奠定基礎。1.收集89個來自于全國香菇主產區(qū)栽培菌株構建了關聯(lián)分析群體。通過兩年秋季層架栽培試驗,對供試菌株的菌絲長速、生育期、子實體形態(tài)特征及產量性狀等15個重要農藝性狀進行了統(tǒng)計分析。結果表明,菇數(shù)具有最高的變異性,其變異系數(shù)為102.82%;菌絲在木屑培養(yǎng)基中的長速變異性最低,其變異系數(shù)為5.15%。相關性分析表明,菌絲長速相關的性狀間、生育期相關的性狀間、子實體形態(tài)特征相關的性狀間及與產量相關的性狀間都存在顯著的普通相關和偏相關性。2.使用48對SSR與252對InDel標記對香菇栽培菌株群體進行了遺傳多樣性分析、群體結構分析和連鎖不平衡分析。結果表明,300個標記在89個栽培菌株中共檢測到880個等位基因,其中82%...
【文章來源】:華中農業(yè)大學湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略語表
1 前言
1.1 香菇概況
1.1.1 香菇生物學特性
1.1.2 香菇營養(yǎng)價值與保健功能
1.1.3 香菇風味物質
1.1.4 香菇栽培技術
1.1.5 香菇育種研究
1.2 關聯(lián)分析
1.2.1 關聯(lián)分析概述
1.2.2 關聯(lián)分析的基礎
1.2.3 關聯(lián)分析方法與策略
1.2.4 關聯(lián)分析在真菌中的應用
1.3 課題研究目的與意義及技術路線
1.3.1 研究目的與意義
1.3.2 技術路線
2 材料與方法
2.1 實驗材料
2.1.1 關聯(lián)分析群體
2.1.2 供試培養(yǎng)基
2.2 農藝性狀測定
2.2.1 菌絲體性狀測定
2.2.2 子實體性狀測定
2.3 基因型分型
2.3.1 香菇菌絲體DNA提取與檢測
2.3.2 分子標記的篩選與擴增
2.3.3 PAGE電泳和銀染檢測
2.4 數(shù)據(jù)分析
2.4.1 農藝性狀統(tǒng)計分析
2.4.2 遺傳多樣性分析
2.4.3 群體結構分析
2.4.4 親緣關系分析
2.4.5 連鎖不平衡分析
2.4.6 關聯(lián)分析
2.4.7 優(yōu)異位點及優(yōu)異等位變異
3 結果與分析
3.1 農藝性狀表型特征分析
3.2 簡單相關和偏相關分析
3.3 關聯(lián)群體內的群體結構
3.4 菌株間的親緣關系
3.5 關聯(lián)群體的遺傳多樣性
3.6 標記位點間的連鎖不平衡及其衰減
3.7 香菇重要農藝性狀的關聯(lián)分析
3.7.1 生育期性狀
3.7.2 子實體形態(tài)特征性狀
3.7.3 產量性狀
3.8 優(yōu)異等位變異
3.8.1 生育期性狀
3.8.2 子實體形態(tài)特征性狀
3.8.3 產量性狀
4 討論
4.1 香菇栽培菌株農藝性狀分析
4.2 香菇栽培菌株的遺傳多樣性
4.3 香菇栽培菌株的連鎖不平衡
4.4 香菇栽培菌株的群體結構
4.5 與香菇農藝性狀相關聯(lián)的標記位點
4.6 影響香菇農藝性狀的候選基因
參考文獻
附錄1 引物列表
附錄2 位于關聯(lián)位點上下游2kb區(qū)段內的基因
附錄3 常用試劑配方
附錄4 攻讀碩士學位期間發(fā)表的論文
致謝
本文編號:3486721
【文章來源】:華中農業(yè)大學湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略語表
1 前言
1.1 香菇概況
1.1.1 香菇生物學特性
1.1.2 香菇營養(yǎng)價值與保健功能
1.1.3 香菇風味物質
1.1.4 香菇栽培技術
1.1.5 香菇育種研究
1.2 關聯(lián)分析
1.2.1 關聯(lián)分析概述
1.2.2 關聯(lián)分析的基礎
1.2.3 關聯(lián)分析方法與策略
1.2.4 關聯(lián)分析在真菌中的應用
1.3 課題研究目的與意義及技術路線
1.3.1 研究目的與意義
1.3.2 技術路線
2 材料與方法
2.1 實驗材料
2.1.1 關聯(lián)分析群體
2.1.2 供試培養(yǎng)基
2.2 農藝性狀測定
2.2.1 菌絲體性狀測定
2.2.2 子實體性狀測定
2.3 基因型分型
2.3.1 香菇菌絲體DNA提取與檢測
2.3.2 分子標記的篩選與擴增
2.3.3 PAGE電泳和銀染檢測
2.4 數(shù)據(jù)分析
2.4.1 農藝性狀統(tǒng)計分析
2.4.2 遺傳多樣性分析
2.4.3 群體結構分析
2.4.4 親緣關系分析
2.4.5 連鎖不平衡分析
2.4.6 關聯(lián)分析
2.4.7 優(yōu)異位點及優(yōu)異等位變異
3 結果與分析
3.1 農藝性狀表型特征分析
3.2 簡單相關和偏相關分析
3.3 關聯(lián)群體內的群體結構
3.4 菌株間的親緣關系
3.5 關聯(lián)群體的遺傳多樣性
3.6 標記位點間的連鎖不平衡及其衰減
3.7 香菇重要農藝性狀的關聯(lián)分析
3.7.1 生育期性狀
3.7.2 子實體形態(tài)特征性狀
3.7.3 產量性狀
3.8 優(yōu)異等位變異
3.8.1 生育期性狀
3.8.2 子實體形態(tài)特征性狀
3.8.3 產量性狀
4 討論
4.1 香菇栽培菌株農藝性狀分析
4.2 香菇栽培菌株的遺傳多樣性
4.3 香菇栽培菌株的連鎖不平衡
4.4 香菇栽培菌株的群體結構
4.5 與香菇農藝性狀相關聯(lián)的標記位點
4.6 影響香菇農藝性狀的候選基因
參考文獻
附錄1 引物列表
附錄2 位于關聯(lián)位點上下游2kb區(qū)段內的基因
附錄3 常用試劑配方
附錄4 攻讀碩士學位期間發(fā)表的論文
致謝
本文編號:3486721
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