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基于InDels分子標記的扁豆遺傳多樣性分析

發(fā)布時間:2021-11-02 06:37
  扁豆是一種古老農作物和重要的經濟作物,系豆科、蝶形花亞科、扁豆屬。具有優(yōu)良的品質和較高的營養(yǎng)價值。扁豆的用途廣泛,可食用、藥用,其莖葉亦可用作家畜的飼料。但由于扁豆是小眾的栽培作物,在我國較少有大面積的種植,在遺傳育種、品質改良等方面的基礎研究也較為缺乏,如何選育優(yōu)良的扁豆品種并提高品質是當前農業(yè)科技工作者面臨的一大難題。我們對其遺傳多樣性的分析,有利于扁豆種質資源的收集、保存和利用,對進一步探明扁豆品種間的親緣關系,以及下一步開展遺傳改良和育種提供相關的理論依據。本研究根據豫翠扁1號與原始種白扁豆轉錄組的測序結果,獲得了118035個非重復序列的Unigenes,其中共含有12365個插入/缺失位點(In Dels位點),我們挑選出其中插入/缺失大于5bp的突變位點,并根據插入/缺失位點兩側的堿基序列設計In Dels引物。利用瓊脂糖凝膠電泳篩選已設計的引物;利用聚丙烯酰胺凝膠電泳對白扁豆和豫翠扁1號兩品種基因組間的插入/缺失進行驗證以及對相關疑似的雜交品種進行鑒定分析;并利用已篩選的引物和高效毛細管電泳對21個扁豆品種進行遺傳多樣性分析。主要研究結果如下:1.依據轉錄組的測序結果,... 

【文章來源】:河南工業(yè)大學河南省

【文章頁數】:63 頁

【學位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 引言
    1.1 扁豆的概述
    1.2 遺傳多樣性的概念及研究意義
    1.3 遺傳多樣性的研究方法
        1.3.1 形態(tài)標記
        1.3.2 細胞學標記
        1.3.3 生化標記
        1.3.4 分子標記
            1.3.4.1 分子標記的種類和特點
            1.3.4.2 第三代分子標記—In Dels標記
    1.4 分子標記在扁豆種質資源中的應用
    1.5 分子標記的電泳檢測技術之比較
    1.6 研究的目的和意義
2 材料與方法
    2.1 實驗材料
        2.1.1 In Dels引物的篩選材料
        2.1.2 遺傳多樣性分析材料
        2.1.3 雜交扁豆的鑒定材料
        2.1.4 主要儀器和耗材
        2.1.5 主要試劑和溶液
    2.2 實驗方法
        2.2.1 引物設計
        2.2.2 DNA的提取
        2.2.3 DNA的質量檢測
        2.2.4 PCR擴增
        2.2.5 PCR擴增產物的電泳檢測
            2.2.5.1 瓊脂糖凝膠電泳篩選引物
            2.2.5.2 聚丙烯酰胺凝膠(PAGE)電泳檢測
            2.2.5.3 高效毛細管電泳檢測
        2.2.6 數據處理與分析
3 結果與分析
    3.1 提取DNA的質量檢測結果
    3.2 PCR反應體系中退火溫度的篩選
    3.3 In Dels引物的瓊脂糖凝膠電泳篩選結果
    3.4 聚丙烯酰胺凝膠電泳的檢測結果
    3.5 遺傳多樣性的分析結果
        3.5.1 毛細管電泳檢測分析結果
        3.5.2 部分In Dels引物的多態(tài)性
        3.5.3 21 份扁豆品種的聚類分析結果
4 討論
    4.1 扁豆DNA的提取質量
    4.2 引物退火溫度的確定
    4.3 PAGE電泳與銀染及判讀條帶
    4.4 毛細管電泳技術的應用
    4.5 扁豆種質遺傳多樣性及親緣關系的探討
    4.6 轉錄組測序的In Dels原始數據與實驗結果之間的對比
    4.7 In Dels分子標記的應用前景
結論
參考文獻
致謝
個人簡歷


【參考文獻】:
期刊論文
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[2]中國328個玉米品種(組合)SSR標記遺傳多樣性分析[J]. 王鳳格,田紅麗,趙久然,王璐,易紅梅,宋偉,高玉倩,楊國航.  中國農業(yè)科學. 2014(05)
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[7]扁豆的研究概況[J]. 沈奇,王顯生,高文瑞,李華勇,吳燕.  金陵科技學院學報. 2012(02)
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博士論文
[1]中國核桃品種的遺傳多樣性研究[D]. 馬慶國.中國林業(yè)科學研究院 2012

碩士論文
[1]基于SSR熒光標記毛細管電泳的油菜品種DNA指紋鑒定技術平臺的建立與應用[D]. 宋偉林.中國農業(yè)科學院 2013
[2]基于SSR熒光標記和毛細管電泳檢測技術的我國煙草審(認)定品種遺傳多樣性研究[D]. 陳雅瓊.中國農業(yè)科學院 2011
[3]高通量SSR檢測方法在玉米遺傳圖譜構建中的應用[D]. 鄒麗梅.海南大學 2010
[4]黃瓜高密度SSR遺傳圖譜構建及其應用[D]. 任毅.中國農業(yè)科學院 2009
[5]扁豆DNA提取方法研究[D]. 田廣厚.西北農林科技大學 2007
[6]蕎麥種質資源遺傳多樣性分析[D]. 趙麗娟.中國農業(yè)科學院 2006



本文編號:3471526

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