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基于InDels分子標(biāo)記的扁豆遺傳多樣性分析

發(fā)布時(shí)間:2021-11-02 06:37
  扁豆是一種古老農(nóng)作物和重要的經(jīng)濟(jì)作物,系豆科、蝶形花亞科、扁豆屬。具有優(yōu)良的品質(zhì)和較高的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值。扁豆的用途廣泛,可食用、藥用,其莖葉亦可用作家畜的飼料。但由于扁豆是小眾的栽培作物,在我國(guó)較少有大面積的種植,在遺傳育種、品質(zhì)改良等方面的基礎(chǔ)研究也較為缺乏,如何選育優(yōu)良的扁豆品種并提高品質(zhì)是當(dāng)前農(nóng)業(yè)科技工作者面臨的一大難題。我們對(duì)其遺傳多樣性的分析,有利于扁豆種質(zhì)資源的收集、保存和利用,對(duì)進(jìn)一步探明扁豆品種間的親緣關(guān)系,以及下一步開(kāi)展遺傳改良和育種提供相關(guān)的理論依據(jù)。本研究根據(jù)豫翠扁1號(hào)與原始種白扁豆轉(zhuǎn)錄組的測(cè)序結(jié)果,獲得了118035個(gè)非重復(fù)序列的Unigenes,其中共含有12365個(gè)插入/缺失位點(diǎn)(In Dels位點(diǎn)),我們挑選出其中插入/缺失大于5bp的突變位點(diǎn),并根據(jù)插入/缺失位點(diǎn)兩側(cè)的堿基序列設(shè)計(jì)In Dels引物。利用瓊脂糖凝膠電泳篩選已設(shè)計(jì)的引物;利用聚丙烯酰胺凝膠電泳對(duì)白扁豆和豫翠扁1號(hào)兩品種基因組間的插入/缺失進(jìn)行驗(yàn)證以及對(duì)相關(guān)疑似的雜交品種進(jìn)行鑒定分析;并利用已篩選的引物和高效毛細(xì)管電泳對(duì)21個(gè)扁豆品種進(jìn)行遺傳多樣性分析。主要研究結(jié)果如下:1.依據(jù)轉(zhuǎn)錄組的測(cè)序結(jié)果,... 

【文章來(lái)源】:河南工業(yè)大學(xué)河南省

【文章頁(yè)數(shù)】:63 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 引言
    1.1 扁豆的概述
    1.2 遺傳多樣性的概念及研究意義
    1.3 遺傳多樣性的研究方法
        1.3.1 形態(tài)標(biāo)記
        1.3.2 細(xì)胞學(xué)標(biāo)記
        1.3.3 生化標(biāo)記
        1.3.4 分子標(biāo)記
            1.3.4.1 分子標(biāo)記的種類和特點(diǎn)
            1.3.4.2 第三代分子標(biāo)記—In Dels標(biāo)記
    1.4 分子標(biāo)記在扁豆種質(zhì)資源中的應(yīng)用
    1.5 分子標(biāo)記的電泳檢測(cè)技術(shù)之比較
    1.6 研究的目的和意義
2 材料與方法
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.1.1 In Dels引物的篩選材料
        2.1.2 遺傳多樣性分析材料
        2.1.3 雜交扁豆的鑒定材料
        2.1.4 主要儀器和耗材
        2.1.5 主要試劑和溶液
    2.2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.2.1 引物設(shè)計(jì)
        2.2.2 DNA的提取
        2.2.3 DNA的質(zhì)量檢測(cè)
        2.2.4 PCR擴(kuò)增
        2.2.5 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的電泳檢測(cè)
            2.2.5.1 瓊脂糖凝膠電泳篩選引物
            2.2.5.2 聚丙烯酰胺凝膠(PAGE)電泳檢測(cè)
            2.2.5.3 高效毛細(xì)管電泳檢測(cè)
        2.2.6 數(shù)據(jù)處理與分析
3 結(jié)果與分析
    3.1 提取DNA的質(zhì)量檢測(cè)結(jié)果
    3.2 PCR反應(yīng)體系中退火溫度的篩選
    3.3 In Dels引物的瓊脂糖凝膠電泳篩選結(jié)果
    3.4 聚丙烯酰胺凝膠電泳的檢測(cè)結(jié)果
    3.5 遺傳多樣性的分析結(jié)果
        3.5.1 毛細(xì)管電泳檢測(cè)分析結(jié)果
        3.5.2 部分In Dels引物的多態(tài)性
        3.5.3 21 份扁豆品種的聚類分析結(jié)果
4 討論
    4.1 扁豆DNA的提取質(zhì)量
    4.2 引物退火溫度的確定
    4.3 PAGE電泳與銀染及判讀條帶
    4.4 毛細(xì)管電泳技術(shù)的應(yīng)用
    4.5 扁豆種質(zhì)遺傳多樣性及親緣關(guān)系的探討
    4.6 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的In Dels原始數(shù)據(jù)與實(shí)驗(yàn)結(jié)果之間的對(duì)比
    4.7 In Dels分子標(biāo)記的應(yīng)用前景
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[3]基于黃瓜基因組重測(cè)序的InDel標(biāo)記開(kāi)發(fā)及其應(yīng)用[J]. 李斯更,沈鏑,劉博,邱楊,張曉輝,張忠華,王海平,李錫香.  植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2013(02)
[4]大麥SSR標(biāo)記遺傳多樣性及其與農(nóng)藝性狀關(guān)聯(lián)分析[J]. 賴勇,王鵬喜,范貴強(qiáng),司二靜,王晉,楊軻,孟亞雄,李葆春,馬小樂(lè),尚勛武,王化俊.  中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(02)
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博士論文
[1]中國(guó)核桃品種的遺傳多樣性研究[D]. 馬慶國(guó).中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院 2012

碩士論文
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[2]基于SSR熒光標(biāo)記和毛細(xì)管電泳檢測(cè)技術(shù)的我國(guó)煙草審(認(rèn))定品種遺傳多樣性研究[D]. 陳雅瓊.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2011
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[4]黃瓜高密度SSR遺傳圖譜構(gòu)建及其應(yīng)用[D]. 任毅.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2009
[5]扁豆DNA提取方法研究[D]. 田廣厚.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2007
[6]蕎麥種質(zhì)資源遺傳多樣性分析[D]. 趙麗娟.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2006



本文編號(hào):3471526

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