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三色堇(Viola×wittrockiana Gams.)轉(zhuǎn)錄組測序及花色相關(guān)基因的發(fā)掘與表達(dá)驗(yàn)證

發(fā)布時間:2021-10-22 07:39
  三色堇(Viola×wittrockiana Gams.),堇菜科(Violaceae)堇菜屬(Viola)花卉,是北方常見的一二年重要的冬春觀賞花卉。三色堇花的直徑約兩到三英寸,花瓣由內(nèi)部平開的三個花瓣和外圍兩個略微重疊的花瓣組成。三色堇的花色眾多,主要分紅色系、黃色系、和藍(lán)色系。帶色斑或條紋的三色堇品種花斑面積大、穩(wěn)定、觀賞價值高,因其獨(dú)特的造型被稱為“貓臉花”,且相關(guān)研究表明,三色堇是研究植物色斑形成的理想材料。為了更為清楚地了解三色堇花斑形成的分子機(jī)理,我們以大花三色堇’夢蝶’(黃底黑斑)品種為材料,利用denovo轉(zhuǎn)錄組測序Illumina HiSeq 2000對其進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,總結(jié)了其中與花色相關(guān)的基因,推測了可能的花色合成途徑,并對其中花色素苷合成相關(guān)的基因在不同花色三色堇中的表達(dá)進(jìn)行了對比分析,同時對花斑形成關(guān)鍵基因的啟動子進(jìn)行了初步克隆,優(yōu)化了克隆啟動子所用的FPNI-PCR體系。具體結(jié)果如下:(1)轉(zhuǎn)錄組測序:共獲得118747的transcripts(轉(zhuǎn)錄本),大約有43908個unigenes從轉(zhuǎn)錄本中進(jìn)一步獲得并比對6個數(shù)據(jù)庫加以注釋。總共有18979 un... 

【文章來源】:海南大學(xué)海南省 211工程院校

【文章頁數(shù)】:74 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

三色堇(Viola×wittrockiana Gams.)轉(zhuǎn)錄組測序及花色相關(guān)基因的發(fā)掘與表達(dá)驗(yàn)證


圖1-3甜菜素生物合成途徑??Fig.?1-3?The?biosynthesis?pathway?of?betalains??1.?1.5

轉(zhuǎn)錄組,測序,三色堇,材料


海南大學(xué)碩士學(xué)位論文??2轉(zhuǎn)錄組測序??與方法??材料??測序所用材料為:栽培于海南大學(xué)園藝園林學(xué)院基地三色堇(期處于第V期的黃底黑斑品種的三色堇花瓣。??康的三色堇花瓣,無菌水清洗擦干,迅速投入液氮速凍后,用,用于后續(xù)總RNA的提取。??驗(yàn)室先前的研究,人為地將三色堇花期分為VII個時期,其中,完全轉(zhuǎn)色時期,根據(jù)課題組先前研究推測,此時期三色堇基因極為重要(李琴,2013;孫海燕,2015)。??

流程圖,文庫構(gòu)建,轉(zhuǎn)錄組,三色堇


對真核生物的mRNA進(jìn)行富集。富集后先后合成cDNA的第-條鏈和第二條鏈??并純化,然后對純化后的雙鏈cDNA進(jìn)行一系列的修飾及修飾和的濃度檢驗(yàn),以??確保所獲得的cDNA文庫的質(zhì)量,具體文庫構(gòu)建原理如圖2-2。??mRNA??5*??AAAA(n)??^?fragmentation??j?reverse?transcription??5*???????A/A/A/A/A//V??|?dTXr.?dATP.?dGTP、dCTP??5*?????—??????????5*??I?39?add?A??5*??A??A????5-??I?Adaptor?ligation?P7??Rd?l?SP?Rd2?SP^^xdex??Rd2?SP?Rdl?SP??I?PC:R??P5?????Rd2?SP?P?r??Rcll?SP?"""TTi^e^r??P5?Rd2?SP??Rdl?SP?inde-c?*??圖2-2?cDNA文庫構(gòu)建流程圖??Fig.?2-2?The?workflow?of?c

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號:3450660

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