新疆枸杞和棗種質(zhì)資源遺傳多樣性分析
發(fā)布時間:2021-10-16 03:40
枸杞(Lycium bararum L.)為茄科(Solanaceae)枸杞屬(lycium L.),是一種藥食同源植物,具有重要的藥用價值和經(jīng)濟價值。新疆作為我國枸杞主產(chǎn)區(qū)之一,蘊藏著豐富的種質(zhì)資源,由于長期的自然選擇和人工選育使得枸杞基因型高度雜合,遺傳背景十分復(fù)雜,從分子生物學(xué)角度對其種質(zhì)資源遺傳變異的研究往往滯后于育種實踐,這些均給其種質(zhì)資源的有效利用、鑒定、品種選育中的親本選配帶來困難,從而影響了遺傳育種效率的提高。因此,開展新疆枸杞種質(zhì)資源遺傳多樣性研究,有利于其種質(zhì)資源評價、新品種選育和合理利用。本試驗以新疆枸杞種質(zhì)資源圃栽培品種(系)和野生種共30份樣品為試材,采用SRAP和SCoT標(biāo)記對30份枸杞種質(zhì)資源進行遺傳多樣性分析,并構(gòu)建其DNA指紋圖譜。棗(Ziziphus jujuba Mill.)植物分類學(xué)上屬于鼠李科(Rhamnaceae)棗屬(Ziziphus Mill.)植物,是原產(chǎn)于中國的特有果樹,既具有經(jīng)濟效益又是生態(tài)經(jīng)濟林樹種。新疆由于獨特的地理位置和得天獨厚的氣候條件使其擁有較為豐富的品種資源,其南部已成為中國棗的主要栽培地區(qū)之一。本試驗在前人相關(guān)研究的基...
【文章來源】:新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)新疆維吾爾自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:77 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
部分枸杞樣品基因組DNA提取結(jié)果
新疆枸杞和棗種質(zhì)資源遺傳多樣性分析進行統(tǒng)計分析,位點統(tǒng)計結(jié)果(表 3-1)。12 對 SRAP 多態(tài)性引物共檢測出 DNA 位點 310個,具有多態(tài)性位點 264 個,每對引物檢測的位點數(shù)為 14-34 個不等,平均為 25.83 個,多態(tài)位點數(shù)為 11-34 個不等,平均為 22 個,不同引物組合擴增多態(tài)性百分率存在較大差異,從 59.26-100%不等,平均為 84.61%,其中,me2-em6 和 me2-em1 引物組合多態(tài)性百分率最高,均達到 100%,me4-em2 引物組合多態(tài)性百分率最低,為 59.26%,12 對引物檢測位點的多態(tài)信息含量(PIC)值變化范圍在 0.76-0.93 之間,平均為 0.83,說明大部分引物組合擴增多態(tài)性較豐富,SRAP 標(biāo)記適合于新疆枸杞種質(zhì)資源遺傳多樣性研究,具有較高的多態(tài)性檢測力。
基于 30 份枸杞樣品間的遺傳相似系數(shù),用 UPGMA 法對 30 份枸杞樣品進行聚獲得親緣關(guān)系聚類圖(圖 3-3),在遺傳相似性系數(shù)為 0.70 時,可將供試材料分,第Ⅰ大類包括野紅果枸杞、野黑果枸杞、野生雪青色果和野生黃果枸杞 4 個這說明 4 個野生種間遺傳差異小,親緣關(guān)系近,其中,野生雪青色果和野生黃間的親緣關(guān)系最近,在相似系數(shù)為 0.76 時,第Ⅱ大類又可細分為ⅴ個亞類,首枸杞一個品種作為ⅰ個亞類,第ⅱ亞類是‘寧杞 1 號’和‘寧杞 5 號’2 個品起,第ⅲ亞類是‘蒙杞 1 號’和‘白刺枸杞’2 個品種被分為一類,第ⅳ亞類杞 3 號’、‘精杞 5 號’、0901、1016、1017 和‘寧杞 7 號’,其中,‘精杞 3 號杞 5 號’,1016 和 1017 分別表現(xiàn)出遺傳變異程度低,遺傳背景相近的親緣關(guān)類包括剩余的 15 個品種,其中,‘精杞 1 號’和‘精杞 4 號’,‘精杞 8 號’和 101寧菜 1 號’,1018 和 1021 有較近的親緣關(guān)系,1101、1102 和 1103 被分為一它們遺傳基礎(chǔ)狹窄,遺傳變異小,父本或母本相同。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]柴達木地區(qū)野生黑果枸杞種群遺傳多樣性的AFLP分析[J]. 王錦楠,陳進福,陳武生,周新洋,許東,李際紅,亓?xí)? 植物生態(tài)學(xué)報. 2015(10)
[2]利用SSR技術(shù)對十七份枸杞材料進行遺傳多樣性分析及標(biāo)準(zhǔn)指紋圖譜構(gòu)建[J]. 邵千順,高磊,南雄雄,徐美隆,李永華,王錦秀. 北方園藝. 2015(12)
[3]制干辣椒SCoT-PCR體系優(yōu)化及引物篩選[J]. 李寧,楊濤,楊生保,唐亞萍,王柏柯,王強,帕提古麗,余慶輝. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2015(04)
[4]新疆杏品種(系)遺傳多樣性分析及DNA指紋圖譜庫構(gòu)建[J]. 劉娟,廖康,曼蘇爾·那斯?fàn)?孫琪,劉歡,賈楊. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(04)
[5]SCoT分子標(biāo)記在植物研究中的應(yīng)用進展[J]. 龍治堅,范理璋,徐剛,胡尚連,韓國輝. 植物遺傳資源學(xué)報. 2015(02)
[6]DNA分子標(biāo)記在林木遺傳育種中的應(yīng)用[J]. 張金然. 北京農(nóng)業(yè). 2014(33)
[7]貴州桃種質(zhì)資源遺傳多樣性的SCoT分析[J]. 陳紅,楊鑫,安華明. 西北植物學(xué)報. 2014(08)
[8]葡萄種質(zhì)資源SRAP-PCR反應(yīng)體系的建立及優(yōu)化[J]. 苑煒,朱瑜,代培紅,夏培蓓,羅淑萍. 新疆農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(07)
[9]我國枸杞主產(chǎn)區(qū)生產(chǎn)現(xiàn)狀調(diào)研及建議[J]. 徐常青,劉賽,徐榮,陳君,喬海莉,金紅宇,林晨,郭昆,程惠珍. 中國中藥雜志. 2014(11)
[10]陜北棗品種群遺傳結(jié)構(gòu)的SSR分析[J]. 殷曉,張春梅,李新崗,黃建,王長柱,練春蘭. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2014(06)
博士論文
[1]芒果SCoT分子標(biāo)記與逆境和重要開花時間相關(guān)基因研究[D]. 羅聰.廣西大學(xué) 2012
[2]基于EST-SSR、Genomic-SSR和SCoT標(biāo)記的柑橘連鎖圖譜構(gòu)建及雜種和多倍體遺傳分析[D]. 韓國輝.西南大學(xué) 2012
碩士論文
[1]梨分子遺傳圖譜的構(gòu)建及其部分果實性狀的定位分析[D]. 王文魁.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]瀕危植物山白樹遺傳多樣性分析[D]. 何燕妮.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2014
[3]枸杞品種(系)分子鑒定及親緣關(guān)系分析[D]. 尹躍.福建農(nóng)林大學(xué) 2013
[4]安徽及周邊地區(qū)棗種質(zhì)資源遺傳多樣性及系統(tǒng)關(guān)系研究[D]. 孫雯雯.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[5]蕓豆AFLP分子標(biāo)記體系的建立及其適宜重慶低海拔地區(qū)種植的品種篩選[D]. 孫富年.西南大學(xué) 2008
[6]扁桃種質(zhì)資源RAPD和ISSR分析[D]. 孫晉科.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[7]廣西龍眼遺傳多樣性及親緣關(guān)系的AFLP分析[D]. 李江舟.廣西大學(xué) 2007
[8]中國甘藍型油菜品種遺傳多樣性、演化規(guī)律分析及指紋圖譜構(gòu)建[D]. 文雁成.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2006
[9]中國棗資源研究與利用[D]. 高京草.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2005
[10]中國地方稻種初級核心種質(zhì)的SSR遺傳多樣性分析及核心種質(zhì)的構(gòu)建[D]. 張冬玲.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué) 2004
本文編號:3439074
【文章來源】:新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)新疆維吾爾自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:77 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
部分枸杞樣品基因組DNA提取結(jié)果
新疆枸杞和棗種質(zhì)資源遺傳多樣性分析進行統(tǒng)計分析,位點統(tǒng)計結(jié)果(表 3-1)。12 對 SRAP 多態(tài)性引物共檢測出 DNA 位點 310個,具有多態(tài)性位點 264 個,每對引物檢測的位點數(shù)為 14-34 個不等,平均為 25.83 個,多態(tài)位點數(shù)為 11-34 個不等,平均為 22 個,不同引物組合擴增多態(tài)性百分率存在較大差異,從 59.26-100%不等,平均為 84.61%,其中,me2-em6 和 me2-em1 引物組合多態(tài)性百分率最高,均達到 100%,me4-em2 引物組合多態(tài)性百分率最低,為 59.26%,12 對引物檢測位點的多態(tài)信息含量(PIC)值變化范圍在 0.76-0.93 之間,平均為 0.83,說明大部分引物組合擴增多態(tài)性較豐富,SRAP 標(biāo)記適合于新疆枸杞種質(zhì)資源遺傳多樣性研究,具有較高的多態(tài)性檢測力。
基于 30 份枸杞樣品間的遺傳相似系數(shù),用 UPGMA 法對 30 份枸杞樣品進行聚獲得親緣關(guān)系聚類圖(圖 3-3),在遺傳相似性系數(shù)為 0.70 時,可將供試材料分,第Ⅰ大類包括野紅果枸杞、野黑果枸杞、野生雪青色果和野生黃果枸杞 4 個這說明 4 個野生種間遺傳差異小,親緣關(guān)系近,其中,野生雪青色果和野生黃間的親緣關(guān)系最近,在相似系數(shù)為 0.76 時,第Ⅱ大類又可細分為ⅴ個亞類,首枸杞一個品種作為ⅰ個亞類,第ⅱ亞類是‘寧杞 1 號’和‘寧杞 5 號’2 個品起,第ⅲ亞類是‘蒙杞 1 號’和‘白刺枸杞’2 個品種被分為一類,第ⅳ亞類杞 3 號’、‘精杞 5 號’、0901、1016、1017 和‘寧杞 7 號’,其中,‘精杞 3 號杞 5 號’,1016 和 1017 分別表現(xiàn)出遺傳變異程度低,遺傳背景相近的親緣關(guān)類包括剩余的 15 個品種,其中,‘精杞 1 號’和‘精杞 4 號’,‘精杞 8 號’和 101寧菜 1 號’,1018 和 1021 有較近的親緣關(guān)系,1101、1102 和 1103 被分為一它們遺傳基礎(chǔ)狹窄,遺傳變異小,父本或母本相同。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]柴達木地區(qū)野生黑果枸杞種群遺傳多樣性的AFLP分析[J]. 王錦楠,陳進福,陳武生,周新洋,許東,李際紅,亓?xí)? 植物生態(tài)學(xué)報. 2015(10)
[2]利用SSR技術(shù)對十七份枸杞材料進行遺傳多樣性分析及標(biāo)準(zhǔn)指紋圖譜構(gòu)建[J]. 邵千順,高磊,南雄雄,徐美隆,李永華,王錦秀. 北方園藝. 2015(12)
[3]制干辣椒SCoT-PCR體系優(yōu)化及引物篩選[J]. 李寧,楊濤,楊生保,唐亞萍,王柏柯,王強,帕提古麗,余慶輝. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2015(04)
[4]新疆杏品種(系)遺傳多樣性分析及DNA指紋圖譜庫構(gòu)建[J]. 劉娟,廖康,曼蘇爾·那斯?fàn)?孫琪,劉歡,賈楊. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(04)
[5]SCoT分子標(biāo)記在植物研究中的應(yīng)用進展[J]. 龍治堅,范理璋,徐剛,胡尚連,韓國輝. 植物遺傳資源學(xué)報. 2015(02)
[6]DNA分子標(biāo)記在林木遺傳育種中的應(yīng)用[J]. 張金然. 北京農(nóng)業(yè). 2014(33)
[7]貴州桃種質(zhì)資源遺傳多樣性的SCoT分析[J]. 陳紅,楊鑫,安華明. 西北植物學(xué)報. 2014(08)
[8]葡萄種質(zhì)資源SRAP-PCR反應(yīng)體系的建立及優(yōu)化[J]. 苑煒,朱瑜,代培紅,夏培蓓,羅淑萍. 新疆農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(07)
[9]我國枸杞主產(chǎn)區(qū)生產(chǎn)現(xiàn)狀調(diào)研及建議[J]. 徐常青,劉賽,徐榮,陳君,喬海莉,金紅宇,林晨,郭昆,程惠珍. 中國中藥雜志. 2014(11)
[10]陜北棗品種群遺傳結(jié)構(gòu)的SSR分析[J]. 殷曉,張春梅,李新崗,黃建,王長柱,練春蘭. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2014(06)
博士論文
[1]芒果SCoT分子標(biāo)記與逆境和重要開花時間相關(guān)基因研究[D]. 羅聰.廣西大學(xué) 2012
[2]基于EST-SSR、Genomic-SSR和SCoT標(biāo)記的柑橘連鎖圖譜構(gòu)建及雜種和多倍體遺傳分析[D]. 韓國輝.西南大學(xué) 2012
碩士論文
[1]梨分子遺傳圖譜的構(gòu)建及其部分果實性狀的定位分析[D]. 王文魁.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]瀕危植物山白樹遺傳多樣性分析[D]. 何燕妮.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2014
[3]枸杞品種(系)分子鑒定及親緣關(guān)系分析[D]. 尹躍.福建農(nóng)林大學(xué) 2013
[4]安徽及周邊地區(qū)棗種質(zhì)資源遺傳多樣性及系統(tǒng)關(guān)系研究[D]. 孫雯雯.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[5]蕓豆AFLP分子標(biāo)記體系的建立及其適宜重慶低海拔地區(qū)種植的品種篩選[D]. 孫富年.西南大學(xué) 2008
[6]扁桃種質(zhì)資源RAPD和ISSR分析[D]. 孫晉科.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[7]廣西龍眼遺傳多樣性及親緣關(guān)系的AFLP分析[D]. 李江舟.廣西大學(xué) 2007
[8]中國甘藍型油菜品種遺傳多樣性、演化規(guī)律分析及指紋圖譜構(gòu)建[D]. 文雁成.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2006
[9]中國棗資源研究與利用[D]. 高京草.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2005
[10]中國地方稻種初級核心種質(zhì)的SSR遺傳多樣性分析及核心種質(zhì)的構(gòu)建[D]. 張冬玲.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué) 2004
本文編號:3439074
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