葡萄ABCG基因亞家族半分子成員克隆及表達(dá)分析
發(fā)布時間:2021-10-11 15:31
葡萄假單性結(jié)實(shí)型無核品種正常受精的胚珠發(fā)生敗育解體,其過程類似于細(xì)胞程序性死亡(Programmed Cell Death,PCD)。前期研究已表明VvABCG20可能在葡萄胚珠敗育過程中發(fā)揮重要作用。本研究從葡萄基因組中篩選ABCG亞家族半分子成員并進(jìn)行生物信息學(xué)分析,從‘黑比諾’葡萄中克隆ABCG基因亞家族的半分子成員。利用實(shí)時熒光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)和半定量PCR(semi-quantitative real-time PCR,sqRT-PCR)技術(shù)對葡萄ABCG基因亞家族的半分子成員進(jìn)行組織表達(dá)特異性分析和在‘無核白’與‘黑比諾’葡萄胚珠發(fā)育過程中的表達(dá)分析,初步明確葡萄ABCG基因亞家族半分子成員與葡萄胚珠發(fā)育的關(guān)系。同時構(gòu)建在擬南芥中與VvABCG20直系同源基因AtABCG20的RNAi干擾載體以初步探究VvABCG20在胚珠發(fā)育過程中的功能。主要獲得以下研究結(jié)果:1、以擬南芥中ABCG亞家族半分子成員為模板,在葡萄基因組中進(jìn)行比對并經(jīng)過篩選后得到30個ABCG基因亞家族半分子成員;對這30個成員進(jìn)行生物信息學(xué)...
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:52 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 葡萄無核機(jī)理研究進(jìn)展
1.2 ABC基因家族研究進(jìn)展
1.3 植物中ABC基因家族研究進(jìn)展
1.4 植物中ABCG基因家族研究進(jìn)展
1.5 研究目的和意義
第二章 葡萄ABCG亞家族半分子成員的鑒定、克隆與生物信息學(xué)分析
2.1 材料與方法
2.1.1 材料
2.1.2 葡萄VvABCG基因家族半分子成員的分離與鑒定
2.1.3 葡萄VvABCG基因亞家族半分子成員開放閱讀框擴(kuò)增
2.1.4 葡萄VvABCG基因亞家族半分子成員生物信息學(xué)分析
2.1.5 半定量PCR表達(dá)分析和定量PCR表達(dá)分析
2.1.6. AtABCG20植物RNAi干擾載體構(gòu)建
2.1.7 農(nóng)桿菌感受態(tài)制備及電擊轉(zhuǎn)化
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 葡萄ABCG亞家族半分子成員的分離與鑒定
2.2.2 葡萄ABCG亞家族半分子成員的染色體定位與同線性分析
2.2.3 葡萄ABCG亞家族半分子成員外顯子/內(nèi)含子結(jié)構(gòu)分析及系統(tǒng)發(fā)育樹分析
2.2.4 葡萄ABCG亞家族半分子成員多序列比對
2.2.5 葡萄ABCG亞家族半分子成員的表達(dá)分析
2.2.6 AtABCG20植物RNAi干擾載體構(gòu)建及轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌
2.3 討論
2.3.1 葡萄ABCG亞家族半分子成員的擴(kuò)增
2.3.2 ABCG亞家族半分子成員轉(zhuǎn)運(yùn)底物多樣性
2.3.3 ABCG亞家族半分子成員在葡萄和擬南芥中的進(jìn)化
2.3.4 VvABCG6和VvABCG20的功能預(yù)測
2.3.5 VvABCG26的功能預(yù)測
2.3.6 VvABCG14的功能預(yù)測
2.3.7 VvABCG15.1、VvABCG15.2、VvABCG15.3、VvABCG15.4 和VvABCG7的功能預(yù)測
第三章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Plant pleiotropic drug resistance transporters:Transport mechanism, gene expression,and function[J]. Mohammed Nuruzzaman,Ru Zhang,Hong-Zhe Cao,Zhi-Yong Luo. Journal of Integrative Plant Biology. 2014(08)
[2]ABC轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白與巴西橡膠樹產(chǎn)膠代謝[J]. 聶智毅,黎瑜,曾日中. 熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(12)
[3]植物ATP結(jié)合盒(ABC)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白研究進(jìn)展[J]. 邵若玄,沈憶珂,周文彬,方佳,鄭炳松. 浙江農(nóng)林大學(xué)學(xué)報. 2013(05)
[4]全基因組與串聯(lián)復(fù)制后白菜基因的保留[J]. 方璐,程鋒,武劍,王曉武. 生物技術(shù)通報. 2012(11)
[5]植物ABC轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白研究綜述[J]. 趙胡,李裕紅. 海峽科學(xué). 2012(02)
[6]WBC27,an Adenosine Tri-phosphate-binding Cassette Protein,Controls Pollen Wall Formation and Patterning in Arabidopsis[J]. Xiao-Ying Dou1,Ke-Zhen Yang1,Yi Zhang2,Wei Wang1,Xiao-Lei Liu1,Li-Qun Chen1,Xue-Qin Zhang1 and De Ye1 1State Key Laboratory of Plant Physiology and Biochemistry,College of Biological Sciences,China Agricultural University,Beijing 100193,China 2Key Laboratory of Biotechnology and Crop Quality Improvement,Ministry of Agriculture,Southwest University,Chongqing 400716,China. Journal of Integrative Plant Biology. 2011(01)
[7]假單性結(jié)實(shí)無核葡萄胚敗育時期的研究[J]. 孫博,曹后男,何偉,鞏艷明,宗長玲. 延邊大學(xué)農(nóng)學(xué)學(xué)報. 2009(03)
[8]酵母細(xì)胞中ABC轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的分類和功能[J]. 王繼紅,李西川,蔣伶活. 細(xì)胞生物學(xué)雜志. 2009(04)
[9]假單性結(jié)實(shí)無核葡萄胚敗育機(jī)理研究[J]. 王躍進(jìn),江淑平,劉小寧,張劍俠. 西北植物學(xué)報. 2007(10)
[10]無核葡萄與中國野生葡萄雜種胚發(fā)育和敗育的細(xì)胞學(xué)研究[J]. 王飛,王躍進(jìn),周會玲,萬怡震,楊進(jìn)孝. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2005(03)
本文編號:3430786
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:52 頁
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摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 葡萄無核機(jī)理研究進(jìn)展
1.2 ABC基因家族研究進(jìn)展
1.3 植物中ABC基因家族研究進(jìn)展
1.4 植物中ABCG基因家族研究進(jìn)展
1.5 研究目的和意義
第二章 葡萄ABCG亞家族半分子成員的鑒定、克隆與生物信息學(xué)分析
2.1 材料與方法
2.1.1 材料
2.1.2 葡萄VvABCG基因家族半分子成員的分離與鑒定
2.1.3 葡萄VvABCG基因亞家族半分子成員開放閱讀框擴(kuò)增
2.1.4 葡萄VvABCG基因亞家族半分子成員生物信息學(xué)分析
2.1.5 半定量PCR表達(dá)分析和定量PCR表達(dá)分析
2.1.6. AtABCG20植物RNAi干擾載體構(gòu)建
2.1.7 農(nóng)桿菌感受態(tài)制備及電擊轉(zhuǎn)化
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 葡萄ABCG亞家族半分子成員的分離與鑒定
2.2.2 葡萄ABCG亞家族半分子成員的染色體定位與同線性分析
2.2.3 葡萄ABCG亞家族半分子成員外顯子/內(nèi)含子結(jié)構(gòu)分析及系統(tǒng)發(fā)育樹分析
2.2.4 葡萄ABCG亞家族半分子成員多序列比對
2.2.5 葡萄ABCG亞家族半分子成員的表達(dá)分析
2.2.6 AtABCG20植物RNAi干擾載體構(gòu)建及轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌
2.3 討論
2.3.1 葡萄ABCG亞家族半分子成員的擴(kuò)增
2.3.2 ABCG亞家族半分子成員轉(zhuǎn)運(yùn)底物多樣性
2.3.3 ABCG亞家族半分子成員在葡萄和擬南芥中的進(jìn)化
2.3.4 VvABCG6和VvABCG20的功能預(yù)測
2.3.5 VvABCG26的功能預(yù)測
2.3.6 VvABCG14的功能預(yù)測
2.3.7 VvABCG15.1、VvABCG15.2、VvABCG15.3、VvABCG15.4 和VvABCG7的功能預(yù)測
第三章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Plant pleiotropic drug resistance transporters:Transport mechanism, gene expression,and function[J]. Mohammed Nuruzzaman,Ru Zhang,Hong-Zhe Cao,Zhi-Yong Luo. Journal of Integrative Plant Biology. 2014(08)
[2]ABC轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白與巴西橡膠樹產(chǎn)膠代謝[J]. 聶智毅,黎瑜,曾日中. 熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(12)
[3]植物ATP結(jié)合盒(ABC)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白研究進(jìn)展[J]. 邵若玄,沈憶珂,周文彬,方佳,鄭炳松. 浙江農(nóng)林大學(xué)學(xué)報. 2013(05)
[4]全基因組與串聯(lián)復(fù)制后白菜基因的保留[J]. 方璐,程鋒,武劍,王曉武. 生物技術(shù)通報. 2012(11)
[5]植物ABC轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白研究綜述[J]. 趙胡,李裕紅. 海峽科學(xué). 2012(02)
[6]WBC27,an Adenosine Tri-phosphate-binding Cassette Protein,Controls Pollen Wall Formation and Patterning in Arabidopsis[J]. Xiao-Ying Dou1,Ke-Zhen Yang1,Yi Zhang2,Wei Wang1,Xiao-Lei Liu1,Li-Qun Chen1,Xue-Qin Zhang1 and De Ye1 1State Key Laboratory of Plant Physiology and Biochemistry,College of Biological Sciences,China Agricultural University,Beijing 100193,China 2Key Laboratory of Biotechnology and Crop Quality Improvement,Ministry of Agriculture,Southwest University,Chongqing 400716,China. Journal of Integrative Plant Biology. 2011(01)
[7]假單性結(jié)實(shí)無核葡萄胚敗育時期的研究[J]. 孫博,曹后男,何偉,鞏艷明,宗長玲. 延邊大學(xué)農(nóng)學(xué)學(xué)報. 2009(03)
[8]酵母細(xì)胞中ABC轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的分類和功能[J]. 王繼紅,李西川,蔣伶活. 細(xì)胞生物學(xué)雜志. 2009(04)
[9]假單性結(jié)實(shí)無核葡萄胚敗育機(jī)理研究[J]. 王躍進(jìn),江淑平,劉小寧,張劍俠. 西北植物學(xué)報. 2007(10)
[10]無核葡萄與中國野生葡萄雜種胚發(fā)育和敗育的細(xì)胞學(xué)研究[J]. 王飛,王躍進(jìn),周會玲,萬怡震,楊進(jìn)孝. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2005(03)
本文編號:3430786
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