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基于葉綠體基因和微衛(wèi)星的中國(guó)西南地區(qū)特有種泡核桃譜系地理學(xué)和群體結(jié)構(gòu)研究

發(fā)布時(shí)間:2021-10-11 01:36
  中國(guó)西南地區(qū)具有活躍的構(gòu)造,形成了一個(gè)動(dòng)態(tài)的、嚴(yán)重侵蝕的景觀,從而影響動(dòng)、植物居群的遺傳結(jié)構(gòu)。泡核桃是中國(guó)特有的落葉經(jīng)濟(jì)樹種,已經(jīng)長(zhǎng)期栽培,營(yíng)養(yǎng)價(jià)值高。另外泡核桃是喬木,枝繁葉茂,具有凈化空氣的能力,常常用于綠化和觀賞。本研究使用5個(gè)葉綠體DNA序列片段和22個(gè)核微衛(wèi)星位點(diǎn)標(biāo)記對(duì)中國(guó)西南地區(qū)的36個(gè)野生泡核桃居群共765個(gè)個(gè)體進(jìn)行了基因測(cè)序,推斷泡核桃的遺傳多樣性、遺傳結(jié)構(gòu)、遺傳分化和當(dāng)代/歷史基因流水平。本次研究的結(jié)果表和結(jié)論如下:1、泡核桃的遺傳多樣性;赾pDNA標(biāo)記,泡核桃確實(shí)具有相對(duì)較低的遺傳多樣性(Hd=0.2026;π=0.00080);贓ST-SSR標(biāo)記,36個(gè)居群的期望雜合度(HE)低于胡桃屬的其他種(黑核桃:HE=0.807;胡桃楸:HE=0.77)。導(dǎo)致這個(gè)現(xiàn)象的原因可能是:泡核桃是地方性物種,具有相對(duì)較小的種群規(guī)模,由于基因漂變、奠基者效應(yīng)和其他隨機(jī)原因,通常會(huì)比那些更常見和分布更廣的物種具有較低的遺傳多樣性。2、泡核桃的遺傳分化。在母系遺傳cpDNA標(biāo)記中居群遺傳分化... 

【文章來源】:西北大學(xué)陜西省 211工程院校

【文章頁數(shù)】:84 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

基于葉綠體基因和微衛(wèi)星的中國(guó)西南地區(qū)特有種泡核桃譜系地理學(xué)和群體結(jié)構(gòu)研究


基于溯祖方法對(duì)群體中個(gè)體譜系的理論模型

核桃,采樣分布,圓點(diǎn)


2.1 樣品的采集根據(jù)國(guó)家標(biāo)本平臺(tái)(NSII;http://www.nsii.org.cn/2017/home.php)和中國(guó)數(shù)字標(biāo)本館(CVH;http://www.cvh.ac.cn/class)泡核桃物種分布范圍標(biāo)本數(shù)據(jù)的記錄。在 2015-201年期間,我們對(duì)大多數(shù)泡核桃的自然地理分布區(qū)進(jìn)行了全面的野外調(diào)查和樣品采集,本研究的植物樣品均采自云南和貴州兩省的山林,林道或者村莊附近,一共采集了 36 個(gè)居群,765 個(gè)個(gè)體。樣本詳細(xì)信息可于表一中查詢(表 2.1),樣本點(diǎn)地理位置見圖 2.1所有取樣的樹木都是成熟、健康的成年樹,每個(gè)采樣個(gè)體之間至少相隔 50 m,根據(jù)物種分布和種群大小不同,每個(gè)居群采集 6-31 個(gè)個(gè)體的新鮮葉片,并置于放硅膠的塑封袋中密封干燥,保存于西北大學(xué)進(jìn)化實(shí)驗(yàn)室內(nèi)。所有樣本均根據(jù)中國(guó)植物志鑒定[Flora oChina, 1999]。同時(shí)測(cè)定并記錄每個(gè)采集樣點(diǎn)的經(jīng)緯度和海拔。然后使用 ArcGIS v10.(ESRI Inc., Redlands, California, USA)繪制所有樣本點(diǎn)的地理分布圖。

情景模式,核桃,附注,居群


圖 2.2 3 個(gè)泡核桃的預(yù)測(cè)進(jìn)化歷史情景模式Fig 2.2 3 predict evolutionary historical scenarios patterns for J. sigillata i附注 1:N1,N2 代表有效群體大小附注 2:t 代表世代數(shù)附注 3:Pop1 包括泡核桃 22 個(gè)居群的 377 個(gè)個(gè)體,Pop2 包括泡核桃 14 個(gè)居群的Note1: N1, N2 show effective population sizeNote2: t shows generation numbersNote3: Pop1 includes 377 individuals in 22 populations and Pop2 includes 388populations

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[2]胡桃屬植物分子系統(tǒng)發(fā)育和生物地理研究進(jìn)展[J]. 趙鵬,周惠娟,劉占林,Keith E. Woeste,呼東峰,黨萌,李忠虎,王瑪麗,趙桂仿.  林業(yè)科學(xué). 2014(11)
[3]珍貴樹種核桃楸的生態(tài)學(xué)問題及培育前景[J]. 馬萬里,羅菊春,荊濤,Joni Kujansuu.  內(nèi)蒙古師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)漢文版). 2005(04)
[4]云南省珍稀瀕危植物及國(guó)家保護(hù)植物區(qū)系成分分析[J]. 鄒新慧,何平,陳建民,馬洪菊.  西南師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2002(06)
[5]種間雜交培育的5個(gè)核桃早實(shí)新品系[J]. 范志遠(yuǎn),習(xí)學(xué)良.  湖南林業(yè)科技. 2002(01)
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碩士論文
[1]胡桃組植物遺傳標(biāo)記開發(fā)應(yīng)用和中國(guó)核桃譜系進(jìn)化歷史研究[D]. 馮曉佳.西北大學(xué) 2018
[2]枹櫟和短柄枹櫟的居群遺傳結(jié)構(gòu)和譜系地理學(xué)研究[D]. 王雁紅.西北大學(xué) 2015



本文編號(hào):3429537

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