新疆野核桃遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建
發(fā)布時(shí)間:2021-10-08 01:02
新疆野生核桃(Juglans regia)即為我國栽培核桃的直系祖先,它是屬于胡桃科、胡桃屬植物。在我國主要分布于新疆伊犁鞏留野核桃溝內(nèi),是我國極為珍稀的野生自然資源。但其在構(gòu)建遺傳連鎖圖譜及利用分子標(biāo)記輔助育種方面,明顯滯后于其他野生果樹樹種,目前,國內(nèi)尚未有關(guān)于其圖譜構(gòu)建的報(bào)道。對(duì)選取的F1野核桃資源開展表型性狀,分子標(biāo)記遺傳多樣性及關(guān)聯(lián)分析檢測(cè)和評(píng)價(jià),并采用DNA標(biāo)記構(gòu)建野核桃分子連鎖圖,將為新疆野核桃今后展開相關(guān)農(nóng)藝性狀的基因精細(xì)定位、QTL以及MAS選擇育種等奠定科學(xué)基礎(chǔ)。本研究以野核桃溝的野核桃母本與父本及其雜交的F1代為作圖群體,利用SSR和SRAP對(duì)適宜于野核桃反應(yīng)體系優(yōu)化篩選,性狀調(diào)查關(guān)聯(lián)度分析,以及標(biāo)記的分離遺傳分析等方面進(jìn)行了研究,制作出了目前首張新疆野核桃分子連鎖圖。并且對(duì)其株高、莖粗以及最大葉長等相關(guān)性狀分析研究。具體研究結(jié)果如下:1.本研究選取兩棵長勢(shì)較好且表型性狀差異較大的野核桃樹(父本:平底圓核桃,母本:橢圓核桃)進(jìn)行人工授粉雜交,得到368株F1代個(gè)體,并在苗期測(cè)定了F1代的8個(gè)相關(guān)數(shù)量性狀。2.對(duì)SSR和SRAP標(biāo)記進(jìn)行篩選,從115對(duì)SSR標(biāo)記中篩...
【文章來源】:新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)新疆維吾爾自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:68 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
提取的新疆野核桃樣品DNA電泳檢測(cè)結(jié)果
圖 2-1 提取的新疆野核桃樣品 DNA 電泳檢測(cè)結(jié)果Figure 2-1 Electrophic results of genomic DNA of Juglans regia2.2.2 分子標(biāo)記的多態(tài)性分析SSR 為共顯性的單座位基因標(biāo)記,能夠很好地反映出基因的雜合性,本試驗(yàn)選用了115 對(duì) SSR 引物,經(jīng)過 PCR 擴(kuò)增、電泳分析,所用引物部分能在新疆野核桃基因組中擴(kuò)增出穩(wěn)定的條帶,其中 46 對(duì) SSR 引物在作圖群體的雙親間表現(xiàn)為多態(tài),并且條帶清晰,重復(fù)性好,便于統(tǒng)計(jì),多態(tài)率為 40%。選用這 46 對(duì)引物用于群體擴(kuò)增。對(duì) F1 單株進(jìn)行 SSR-PCR 擴(kuò)增,共產(chǎn)生 70 個(gè)多態(tài)性標(biāo)記位點(diǎn),平均每對(duì)引物產(chǎn)生 1.52 個(gè)多態(tài)性標(biāo)記位點(diǎn),如圖 2-2。
圖 2-3 SSR 引物 WCD102 在部分群體單株的擴(kuò)增結(jié)果Figure 2-3 the amplification patterns of WCD102 in some individualsM:Marker;P1:平底圓核桃;P2:橢圓核桃;1,2,3……:群體單株M:Marker;P1:Flat round walnut;P2:The elliptical walnut;1,2,3…:some individuals對(duì) 100 對(duì) SRAP 引物進(jìn)行篩選,篩選出 17 對(duì)表現(xiàn)差異且重復(fù)性好并穩(wěn)定遺傳的引物用于圖譜的構(gòu)建。對(duì) F1 單株進(jìn)行 SRAP-PCR 擴(kuò)增,17 對(duì)引物共產(chǎn)生 39 個(gè)多態(tài)性標(biāo)記,平均每對(duì)引物產(chǎn)生 2.29 個(gè)多態(tài)性標(biāo)記。在雙親及 4 個(gè)隨機(jī)單株間進(jìn)行篩選,如圖2-4。圖 2-4 部分 SRAP 引物篩選結(jié)果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]利用SSR、SRAP和ISSR分子標(biāo)記構(gòu)建首張丹參遺傳連鎖圖譜[J]. 宗成堃,宋振巧,陳海梅,劉昶,王建華,郭林林,劉甜,潘玉玲. 藥學(xué)學(xué)報(bào). 2015(03)
[2]利用基因芯片技術(shù)進(jìn)行小麥遺傳圖譜構(gòu)建及粒重QTL分析[J]. 陳廣鳳,李青芳,張晗,師翠蘭,孫彩鈴,鄧志英,劉凱,谷植群,田紀(jì)春. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(24)
[3]野生毛花獼猴桃果實(shí)表型性狀及SSR遺傳多樣性分析[J]. 湯佳樂,黃春輝,吳寒,郎彬彬,曲雪艷,徐小彪. 園藝學(xué)報(bào). 2014(06)
[4]甜菜遺傳連鎖圖譜初步構(gòu)建[J]. 王茂芊,李博,王華忠. 作物學(xué)報(bào). 2014(02)
[5]新疆野核桃蛋白質(zhì)分離純化及理化性質(zhì)研究[J]. 常雪花,李忠. 食品工業(yè). 2013(09)
[6]中國普通野生稻遺傳多樣性研究進(jìn)展[J]. 楊慶文,黃娟. 作物學(xué)報(bào). 2013(04)
[7]新疆野核桃油脂肪酸組成分析[J]. 劉華英,劉俊霞,包東東,張銳利. 中國油脂. 2012(09)
[8]新疆野核桃不同小葉數(shù)復(fù)葉構(gòu)件生物量可塑性及分配規(guī)律[J]. 張維,任艷利,趙玉,亥依如拉木,楊允菲,李建東. 東北林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(07)
[9]用最小距離逐步取樣法構(gòu)建野核桃核心種質(zhì)[J]. 袁海濤,董玉芝,王肇延. 浙江農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(07)
[10]新疆鞏留野核桃林調(diào)查及其分析[J]. 董玉芝,朱小虎,陳虹,梁風(fēng)麗,葉爾江,王肇延. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2012(03)
博士論文
[1]陸地棉×黃褐棉種間全基因組SSR高密度遺傳圖譜的構(gòu)建[D]. Ilyas Muhammad KASHIF.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014
[2]陸地棉×毛棉種間高密度遺傳圖譜的構(gòu)建[D]. Khan,Muhammad Kashif Riaz.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013
[3]梅花遺傳連鎖圖譜構(gòu)建和表型性狀QTLs分析[D]. 孫麗丹.北京林業(yè)大學(xué) 2013
[4]鴨茅分子遺傳連鎖圖譜構(gòu)建及開花基因定位[D]. 謝文剛.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[5]大白菜分子遺傳圖譜構(gòu)建及重要農(nóng)藝性狀QTL分析[D]. 章云.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[6]高密度小麥遺傳連鎖圖譜構(gòu)建及產(chǎn)量相關(guān)性狀QTL定位[D]. 崔法.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[7]毛白楊與毛新楊轉(zhuǎn)錄組圖譜構(gòu)建及若干性狀的遺傳學(xué)聯(lián)合分析[D]. 李博.北京林業(yè)大學(xué) 2009
[8]梨(Pyrus L.)遺傳連鎖圖譜構(gòu)建及其農(nóng)藝性狀的基因定位研究[D]. 孫文英.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[9]幾種分子標(biāo)記技術(shù)的建立及其在部分柿屬植物親緣關(guān)系研究中的應(yīng)用[D]. 郭大龍.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
[10]棉花分子標(biāo)記遺傳連鎖圖構(gòu)建和產(chǎn)量、纖維品質(zhì)相關(guān)性狀定位[D]. 林忠旭.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
碩士論文
[1]西瓜遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建及果實(shí)相關(guān)性狀QTL分析[D]. 程瑤.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]向日葵SRAP分子標(biāo)記遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建[D]. 于志賢.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]梨分子遺傳圖譜的構(gòu)建及其部分果實(shí)性狀的定位分析[D]. 王文魁.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[4]陸地棉高密度遺傳圖譜構(gòu)建及衣分QTL定位[D]. 劉芳.西南大學(xué) 2014
[5]玉米遺傳圖譜構(gòu)建及重要農(nóng)藝性狀QTL定位[D]. 孫婷婷.延邊大學(xué) 2013
[6]獼猴桃遺傳多樣性的SRAP分析及GPX和cAPX基因片段的克隆[D]. 王衛(wèi).福建師范大學(xué) 2013
[7]利用SSR分子標(biāo)記輔助選育轉(zhuǎn)Bt基因抗蟲棉[D]. 許新.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[8]茶樹SSR分子標(biāo)記開發(fā)及遺傳連鎖圖譜構(gòu)建[D]. 譚禮強(qiáng).四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[9]綿毛柳遺傳圖譜構(gòu)建及生物能源性狀的QTLs定位[D]. 賈會(huì)霞.中國林業(yè)科學(xué)研究院 2013
[10]小麥“糯麥1號(hào)×藁城8901”RIL群體遺傳圖譜構(gòu)建和主要農(nóng)藝及品質(zhì)性狀的QTL定位[D]. 鄭菲菲.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
本文編號(hào):3423124
【文章來源】:新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)新疆維吾爾自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:68 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
提取的新疆野核桃樣品DNA電泳檢測(cè)結(jié)果
圖 2-1 提取的新疆野核桃樣品 DNA 電泳檢測(cè)結(jié)果Figure 2-1 Electrophic results of genomic DNA of Juglans regia2.2.2 分子標(biāo)記的多態(tài)性分析SSR 為共顯性的單座位基因標(biāo)記,能夠很好地反映出基因的雜合性,本試驗(yàn)選用了115 對(duì) SSR 引物,經(jīng)過 PCR 擴(kuò)增、電泳分析,所用引物部分能在新疆野核桃基因組中擴(kuò)增出穩(wěn)定的條帶,其中 46 對(duì) SSR 引物在作圖群體的雙親間表現(xiàn)為多態(tài),并且條帶清晰,重復(fù)性好,便于統(tǒng)計(jì),多態(tài)率為 40%。選用這 46 對(duì)引物用于群體擴(kuò)增。對(duì) F1 單株進(jìn)行 SSR-PCR 擴(kuò)增,共產(chǎn)生 70 個(gè)多態(tài)性標(biāo)記位點(diǎn),平均每對(duì)引物產(chǎn)生 1.52 個(gè)多態(tài)性標(biāo)記位點(diǎn),如圖 2-2。
圖 2-3 SSR 引物 WCD102 在部分群體單株的擴(kuò)增結(jié)果Figure 2-3 the amplification patterns of WCD102 in some individualsM:Marker;P1:平底圓核桃;P2:橢圓核桃;1,2,3……:群體單株M:Marker;P1:Flat round walnut;P2:The elliptical walnut;1,2,3…:some individuals對(duì) 100 對(duì) SRAP 引物進(jìn)行篩選,篩選出 17 對(duì)表現(xiàn)差異且重復(fù)性好并穩(wěn)定遺傳的引物用于圖譜的構(gòu)建。對(duì) F1 單株進(jìn)行 SRAP-PCR 擴(kuò)增,17 對(duì)引物共產(chǎn)生 39 個(gè)多態(tài)性標(biāo)記,平均每對(duì)引物產(chǎn)生 2.29 個(gè)多態(tài)性標(biāo)記。在雙親及 4 個(gè)隨機(jī)單株間進(jìn)行篩選,如圖2-4。圖 2-4 部分 SRAP 引物篩選結(jié)果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]利用SSR、SRAP和ISSR分子標(biāo)記構(gòu)建首張丹參遺傳連鎖圖譜[J]. 宗成堃,宋振巧,陳海梅,劉昶,王建華,郭林林,劉甜,潘玉玲. 藥學(xué)學(xué)報(bào). 2015(03)
[2]利用基因芯片技術(shù)進(jìn)行小麥遺傳圖譜構(gòu)建及粒重QTL分析[J]. 陳廣鳳,李青芳,張晗,師翠蘭,孫彩鈴,鄧志英,劉凱,谷植群,田紀(jì)春. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(24)
[3]野生毛花獼猴桃果實(shí)表型性狀及SSR遺傳多樣性分析[J]. 湯佳樂,黃春輝,吳寒,郎彬彬,曲雪艷,徐小彪. 園藝學(xué)報(bào). 2014(06)
[4]甜菜遺傳連鎖圖譜初步構(gòu)建[J]. 王茂芊,李博,王華忠. 作物學(xué)報(bào). 2014(02)
[5]新疆野核桃蛋白質(zhì)分離純化及理化性質(zhì)研究[J]. 常雪花,李忠. 食品工業(yè). 2013(09)
[6]中國普通野生稻遺傳多樣性研究進(jìn)展[J]. 楊慶文,黃娟. 作物學(xué)報(bào). 2013(04)
[7]新疆野核桃油脂肪酸組成分析[J]. 劉華英,劉俊霞,包東東,張銳利. 中國油脂. 2012(09)
[8]新疆野核桃不同小葉數(shù)復(fù)葉構(gòu)件生物量可塑性及分配規(guī)律[J]. 張維,任艷利,趙玉,亥依如拉木,楊允菲,李建東. 東北林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(07)
[9]用最小距離逐步取樣法構(gòu)建野核桃核心種質(zhì)[J]. 袁海濤,董玉芝,王肇延. 浙江農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(07)
[10]新疆鞏留野核桃林調(diào)查及其分析[J]. 董玉芝,朱小虎,陳虹,梁風(fēng)麗,葉爾江,王肇延. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2012(03)
博士論文
[1]陸地棉×黃褐棉種間全基因組SSR高密度遺傳圖譜的構(gòu)建[D]. Ilyas Muhammad KASHIF.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014
[2]陸地棉×毛棉種間高密度遺傳圖譜的構(gòu)建[D]. Khan,Muhammad Kashif Riaz.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013
[3]梅花遺傳連鎖圖譜構(gòu)建和表型性狀QTLs分析[D]. 孫麗丹.北京林業(yè)大學(xué) 2013
[4]鴨茅分子遺傳連鎖圖譜構(gòu)建及開花基因定位[D]. 謝文剛.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[5]大白菜分子遺傳圖譜構(gòu)建及重要農(nóng)藝性狀QTL分析[D]. 章云.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[6]高密度小麥遺傳連鎖圖譜構(gòu)建及產(chǎn)量相關(guān)性狀QTL定位[D]. 崔法.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[7]毛白楊與毛新楊轉(zhuǎn)錄組圖譜構(gòu)建及若干性狀的遺傳學(xué)聯(lián)合分析[D]. 李博.北京林業(yè)大學(xué) 2009
[8]梨(Pyrus L.)遺傳連鎖圖譜構(gòu)建及其農(nóng)藝性狀的基因定位研究[D]. 孫文英.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[9]幾種分子標(biāo)記技術(shù)的建立及其在部分柿屬植物親緣關(guān)系研究中的應(yīng)用[D]. 郭大龍.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
[10]棉花分子標(biāo)記遺傳連鎖圖構(gòu)建和產(chǎn)量、纖維品質(zhì)相關(guān)性狀定位[D]. 林忠旭.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
碩士論文
[1]西瓜遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建及果實(shí)相關(guān)性狀QTL分析[D]. 程瑤.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]向日葵SRAP分子標(biāo)記遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建[D]. 于志賢.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]梨分子遺傳圖譜的構(gòu)建及其部分果實(shí)性狀的定位分析[D]. 王文魁.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[4]陸地棉高密度遺傳圖譜構(gòu)建及衣分QTL定位[D]. 劉芳.西南大學(xué) 2014
[5]玉米遺傳圖譜構(gòu)建及重要農(nóng)藝性狀QTL定位[D]. 孫婷婷.延邊大學(xué) 2013
[6]獼猴桃遺傳多樣性的SRAP分析及GPX和cAPX基因片段的克隆[D]. 王衛(wèi).福建師范大學(xué) 2013
[7]利用SSR分子標(biāo)記輔助選育轉(zhuǎn)Bt基因抗蟲棉[D]. 許新.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[8]茶樹SSR分子標(biāo)記開發(fā)及遺傳連鎖圖譜構(gòu)建[D]. 譚禮強(qiáng).四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[9]綿毛柳遺傳圖譜構(gòu)建及生物能源性狀的QTLs定位[D]. 賈會(huì)霞.中國林業(yè)科學(xué)研究院 2013
[10]小麥“糯麥1號(hào)×藁城8901”RIL群體遺傳圖譜構(gòu)建和主要農(nóng)藝及品質(zhì)性狀的QTL定位[D]. 鄭菲菲.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
本文編號(hào):3423124
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