黃燈籠辣椒eIF4Es基因的克隆及其與PVMV-VPg互作研究
發(fā)布時間:2021-09-29 16:29
黃燈籠辣椒(Capsicum chinense)是海南省特有的辣椒品種,隨著種植業(yè)的不斷發(fā)展病毒病已成為海南黃燈籠辣椒減產(chǎn)的首要因素。甜椒脈斑駁病毒(Pepper veinal mottle virus,PVMV)屬于馬鈴薯Y病毒屬(Potyvirus)病毒,是制約海南辣椒產(chǎn)業(yè)發(fā)展的主要因素。Potyvirus病毒基因組5’端有1個稱作VPg(virus genome linked protein)的基因組連接蛋白,在病毒侵染寄主的過程中VPg和真核翻譯起始因子4E(eukaryotie translation initiation factor 4E,eIF4E)相互作用,是完成病毒侵染復(fù)制所需。本研究通過克隆黃燈籠辣椒eIF4E家族的4個基因,利用LexA-酵母雙雜交體系和雙分子熒光互補(bǔ)技術(shù)探索PVMV-VPg和黃燈籠辣椒eIF4E家族編碼蛋白的相互作用,為通過eIF4E進(jìn)行基因編輯,獲得抗病毒育種的新材料打下基礎(chǔ)。具體結(jié)果如下:(1)利用生物信息學(xué)技術(shù)找出eIF4E家族的所有基因,設(shè)計引物。以黃燈籠辣椒嫩葉作為實驗材料提取RNA,然后用RT-PCR方法擴(kuò)增4個eIF4E基因的OR...
【文章來源】:海南大學(xué)海南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1?PVMV病毒主要癥狀??Fig.l?the?main?symptoms?of?Pepper?veinal?mottle?virus?in?Hainan??
其基因組為一條正義單鏈?RNA?(single?strand?RNA?of?positive?sense,+ssRNA),??大小約為9.8?kb,可以編碼通過自身裂解方式成為多個己成熟的蛋白的多聚蛋白。馬??鈴薯Y病毒屬病毒基因組結(jié)構(gòu)如圖2所示,各基因編碼蛋白如表1。PVMV的全基因??組序列包含9793nt,3'端具有poly(A)尾結(jié)構(gòu),5'端共價結(jié)合VPg蛋白(\%115。1"(^11-??linked?genomic)?(Andrew?MQK.,2012;?Go?rsaneF.,2001;?Zhang?Set?al.,?2015)。??PVMV與其它的馬鈴薯Y病毒屬家族一樣,會在侵染的寄主細(xì)胞質(zhì)內(nèi)形成車輪狀的??病毒粒子包涵體結(jié)構(gòu)或者核內(nèi)涵體(Gibbs?A?etal.,2010)。??r??-UTR?「'I?HC-Pro?P3?Cl?VPg?Nla?Nb?CP?3.-LTR??■一一《丄?1?II?11?I?I?1?-?P〇^(A)??"*〇?〇>?Oi??3?5?S??圖2馬鈴薯Y病毒屬基因組結(jié)構(gòu)??Fig2.Genomic?map?of?the?genus?Potyvirus??表1馬鈴薯Y病毒屬病毒所編碼蛋白的功能(Urcuqui-Inchimaetal.,2001;李向東等,2006)??Tablel.?The?function?of?protein?encoded?by?Potj^irus.??蛋白質(zhì)??Ti?蛋白酶活性,病毒復(fù)制,移動,寄主癥狀表達(dá),干擾寄主防御方應(yīng)??HC-Pro?蛋白酶活性,復(fù)制,蚜傳,移動,沉默抑制子,寄主癥狀顯示??P3?復(fù)制
圖3?eEF4E家庭成員的進(jìn)化(Joshi?B?et?al.,2005)??Fig.3?Evolution?of?eIF4E?family?members?(Joshi?B?et?al.,?2005)??1.3.2?eIF4E參與真核生物蛋白質(zhì)翻譯的起始??eIF4E能夠和侵染寄主的病毒的5’端帽子結(jié)構(gòu)的特異位點交叉結(jié)合從而啟動??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]植物CRISPR/Cas9基因組編輯系統(tǒng)與突變分析[J]. 馬興亮,劉耀光. 遺傳. 2016(02)
[2]甜椒脈斑駁病毒(PVMV)在海南的發(fā)現(xiàn)與檢測[J]. 梁潔,王健華,章紹延,余乃通,張雨良,王祥,劉志昕. 熱帶作物學(xué)報. 2015(05)
[3]小麥黃花葉病毒編碼VPg蛋白N端結(jié)構(gòu)是VPg與核仁蛋白Fibrillarin互作區(qū)域[J]. 邊靚,向榮,孫麗英,陳劍平. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2014(01)
[4]雙分子熒光互補(bǔ)技術(shù)(BiFC)分析玉米SSⅠ與PPDK1之間的蛋白互作[J]. 崔喜艷,張繼曉,竇瑤,孫小杰,尹悅佳,劉相國. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2013(07)
[5]雙分子熒光互補(bǔ)技術(shù)及其在植物病毒學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 鄭紅英,燕飛,侯明生,陳劍平. 病毒學(xué)報. 2009(04)
[6]雙分子熒光互補(bǔ)技術(shù)[J]. 樊晉宇,崔宗強(qiáng),張先恩. 中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報. 2008(08)
[7]真核翻譯起始因子4E[J]. 鄭志芳,朱世澤. 醫(yī)學(xué)分子生物學(xué)雜志. 2008(02)
[8]馬鈴薯Y病毒屬病毒基因功能研究進(jìn)展[J]. 李向東,于曉慶,古勤生,劉金亮,竺曉平,郭興啟. 山東科學(xué). 2006(03)
[9]3種辣椒新病毒的發(fā)生與血清學(xué)鑒定[J]. 馮蘭香,張寶璽,謝丙炎,王立浩,楊宇紅,毛勝利. 中國蔬菜. 2005(12)
[10]無抗性標(biāo)記基因轉(zhuǎn)基因植物研究進(jìn)展[J]. 張余洋,歐陽波,葉志彪. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2004(05)
博士論文
[1]辣椒病毒病研究[D]. 張竹青.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
碩士論文
[1]香蕉束頂病毒(BBTV)NSP與其它組份編碼蛋白互作研究[D]. 王祥.海南大學(xué) 2015
[2]番木瓜eIF4E和eIFiso4E的克隆及其與PRSV-VPg互作研究[D]. 吳金燕.海南大學(xué) 2010
本文編號:3414048
【文章來源】:海南大學(xué)海南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1?PVMV病毒主要癥狀??Fig.l?the?main?symptoms?of?Pepper?veinal?mottle?virus?in?Hainan??
其基因組為一條正義單鏈?RNA?(single?strand?RNA?of?positive?sense,+ssRNA),??大小約為9.8?kb,可以編碼通過自身裂解方式成為多個己成熟的蛋白的多聚蛋白。馬??鈴薯Y病毒屬病毒基因組結(jié)構(gòu)如圖2所示,各基因編碼蛋白如表1。PVMV的全基因??組序列包含9793nt,3'端具有poly(A)尾結(jié)構(gòu),5'端共價結(jié)合VPg蛋白(\%115。1"(^11-??linked?genomic)?(Andrew?MQK.,2012;?Go?rsaneF.,2001;?Zhang?Set?al.,?2015)。??PVMV與其它的馬鈴薯Y病毒屬家族一樣,會在侵染的寄主細(xì)胞質(zhì)內(nèi)形成車輪狀的??病毒粒子包涵體結(jié)構(gòu)或者核內(nèi)涵體(Gibbs?A?etal.,2010)。??r??-UTR?「'I?HC-Pro?P3?Cl?VPg?Nla?Nb?CP?3.-LTR??■一一《丄?1?II?11?I?I?1?-?P〇^(A)??"*〇?〇>?Oi??3?5?S??圖2馬鈴薯Y病毒屬基因組結(jié)構(gòu)??Fig2.Genomic?map?of?the?genus?Potyvirus??表1馬鈴薯Y病毒屬病毒所編碼蛋白的功能(Urcuqui-Inchimaetal.,2001;李向東等,2006)??Tablel.?The?function?of?protein?encoded?by?Potj^irus.??蛋白質(zhì)??Ti?蛋白酶活性,病毒復(fù)制,移動,寄主癥狀表達(dá),干擾寄主防御方應(yīng)??HC-Pro?蛋白酶活性,復(fù)制,蚜傳,移動,沉默抑制子,寄主癥狀顯示??P3?復(fù)制
圖3?eEF4E家庭成員的進(jìn)化(Joshi?B?et?al.,2005)??Fig.3?Evolution?of?eIF4E?family?members?(Joshi?B?et?al.,?2005)??1.3.2?eIF4E參與真核生物蛋白質(zhì)翻譯的起始??eIF4E能夠和侵染寄主的病毒的5’端帽子結(jié)構(gòu)的特異位點交叉結(jié)合從而啟動??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[3]小麥黃花葉病毒編碼VPg蛋白N端結(jié)構(gòu)是VPg與核仁蛋白Fibrillarin互作區(qū)域[J]. 邊靚,向榮,孫麗英,陳劍平. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2014(01)
[4]雙分子熒光互補(bǔ)技術(shù)(BiFC)分析玉米SSⅠ與PPDK1之間的蛋白互作[J]. 崔喜艷,張繼曉,竇瑤,孫小杰,尹悅佳,劉相國. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2013(07)
[5]雙分子熒光互補(bǔ)技術(shù)及其在植物病毒學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 鄭紅英,燕飛,侯明生,陳劍平. 病毒學(xué)報. 2009(04)
[6]雙分子熒光互補(bǔ)技術(shù)[J]. 樊晉宇,崔宗強(qiáng),張先恩. 中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報. 2008(08)
[7]真核翻譯起始因子4E[J]. 鄭志芳,朱世澤. 醫(yī)學(xué)分子生物學(xué)雜志. 2008(02)
[8]馬鈴薯Y病毒屬病毒基因功能研究進(jìn)展[J]. 李向東,于曉慶,古勤生,劉金亮,竺曉平,郭興啟. 山東科學(xué). 2006(03)
[9]3種辣椒新病毒的發(fā)生與血清學(xué)鑒定[J]. 馮蘭香,張寶璽,謝丙炎,王立浩,楊宇紅,毛勝利. 中國蔬菜. 2005(12)
[10]無抗性標(biāo)記基因轉(zhuǎn)基因植物研究進(jìn)展[J]. 張余洋,歐陽波,葉志彪. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2004(05)
博士論文
[1]辣椒病毒病研究[D]. 張竹青.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
碩士論文
[1]香蕉束頂病毒(BBTV)NSP與其它組份編碼蛋白互作研究[D]. 王祥.海南大學(xué) 2015
[2]番木瓜eIF4E和eIFiso4E的克隆及其與PRSV-VPg互作研究[D]. 吳金燕.海南大學(xué) 2010
本文編號:3414048
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