發(fā)布時(shí)間：2021-09-29 03:09

　　miRNA（microRNA）是一類非編碼的單鏈小分子RNA,約18-25nt長度,主要對靶基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄后調(diào)控。miRNA的表達(dá)比編碼基因更加迅速,翻譯過程不受影響,對目標(biāo)基因的調(diào)控效率較高,在植物的生長發(fā)育、逆境脅迫、表觀遺傳等方面起著非常重要的作用。本實(shí)驗(yàn)聯(lián)合采用高通量小RNA測序和降解組測序技術(shù),以香蕉品種“巴西蕉”及尖孢鐮刀菌古巴專化型4號小種為遺傳材料,構(gòu)建病原菌侵染四個(gè)階段的小RNA庫和降解組庫,結(jié)合生物信息學(xué)分析,建立香蕉在病原菌誘導(dǎo)下不同時(shí)段的miRNA差異表達(dá)譜,獲得香蕉病理反應(yīng)相關(guān)的已知miRNA和新miRNA,并確定各miRNA所對應(yīng)的靶基因,通過qRT-PCR進(jìn)行驗(yàn)證,解析香蕉在枯萎病菌誘導(dǎo)下的miRNA及其靶基因的表達(dá)模式和調(diào)控機(jī)理,為香蕉枯萎病的分子病理機(jī)制提供新的遺傳信息和理論揭示：1、通過小RNA高通量技術(shù)進(jìn)行測序,建立了四個(gè)小RNA庫：Banana CK、 Banana 4h、Banana 24h、Banana 6d。分別得到16013204、16551770、17733937和18429778條序列。將高質(zhì)量reads去接頭、去污染、去polyA后,... 

【文章來源】：海南大學(xué)海南省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：128 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

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植物小RNA側(cè)序流程圖

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本文編號：3413078