miRNA（microRNA）是一類非編碼的單鏈小分子RNA,約18-25nt長度,主要對靶基因進行轉(zhuǎn)錄后調(diào)控。miRNA的表達比編碼基因更加迅速,翻譯過程不受影響,對目標基因的調(diào)控效率較高,在植物的生長發(fā)育、逆境脅迫、表觀遺傳等方面起著非常重要的作用。本實驗聯(lián)合采用高通量小RNA測序和降解組測序技術(shù),以香蕉品種“巴西蕉”及尖孢鐮刀菌古巴�；�4號小種為遺傳材料,構(gòu)建病原菌侵染四個階段的小RNA庫和降解組庫,結(jié)合生物信息學分析,建立香蕉在病原菌誘導下不同時段的miRNA差異表達譜,獲得香蕉病理反應相關(guān)的已知miRNA和新miRNA,并確定各miRNA所對應的靶基因,通過qRT-PCR進行驗證,解析香蕉在枯萎病菌誘導下的miRNA及其靶基因的表達模式和調(diào)控機理,為香蕉枯萎病的分子病理機制提供新的遺傳信息和理論揭示：1、通過小RNA高通量技術(shù)進行測序,建立了四個小RNA庫：Banana CK、 Banana 4h、Banana 24h、Banana 6d。分別得到16013204、16551770、17733937和18429778條序列。將高質(zhì)量reads去接頭、去污染、去polyA后,... 

【文章來源】：海南大學海南省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：128 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１－１植物ｍｉＲＮＡ的生物合成??Ｆｉｇ＾ｌ．?Ｔｈｅ?ｐｒｏｃｅｓｓ?ｏｆ?ｍｉＲＮＡ?ｂｉｏｇｅｎｅｓｉｓ?ｉｎ?ｐｌａｎｔ??３??

植物小RNA側(cè)序流程圖

?降解組文庫測序采用Ｉｌｌｕｍｉｎａ?Ｇｅｎｏｍｅ?ａｎａｌｙｚｅｒ系統(tǒng)，樣品送往華大基因深圳公司完??成。圖２－２是降解組測序流程。??ＲＮＡ＾＾??Ｓｉｚｅ?ｆｒａｃｔｉｏｎａｔｉｏｎ?（１８－ＢＯｎｔ》????５－??５＊?ａｄａｐｔｏｒ?ｌｉｇａｔｉｏｎ?ｊ???５．——３’??３＊?ａｄａｐｔｏｒ?ｌｉｇａｔｉｏｎ?Ｉ????５＊?３＊??ＲＴ￣ＰＣ?只?Ｉ??曼―—藝?????Ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ．．，爹?５＊??圖２－１植物�。遥危翜y序流程圖??Ｆｉｇｕｒｅ２－１．?ｓｍａｌｌ?ＲＮＡ?ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ?ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔ?ｐｒｏｃｅｓｓ?ｆｏｒ?ｐｌａｎｔ??ｍＲＮＡ?－?ｔａｒｇｅｔ?ｏｆ?ｎｖＲＮＡ?ｍＲＮＡ??ＡＡＡＡＡＡ?（Ａ）＾?＾?—?－????ｆ?］＂??ｍｉＲＮＡ－ｄｉｒｅｃｔｅ＜３?Ｃｌｅａｖａｇｅ?？?ｍＲＮＡ?ｄｅｃａｙ?今??，?３＊－Ｅｎｄ?ｏｆ?ｃｌｅａｖｅｄ?ｍＲＮＡ?３＊－Ｅｎｄ?ｏｆ?ｄｅｇｒａｄｅｄ?ｍＲＮＡ??ＡＡＡＡＡＡ?（Ａ）�！�?５－Ｐｉ—Ａ—畫?ＡＡＡＡＡＡ＇Ａ）口??＾?ＰｏｌｙｌＡ）?ＲＮＡ?ｅｘ帖饑ｏｎ?？??５’－Ｐ?ＡＡＡＡＡＡ?Ｗ。??？?５．－ＲＮＡ?ａｄａｐ巧ｒ?ｌｉ妒ｔｉｏｎ??５＊?ＡＡＡＡＡＡ?（Ａ）？??命和??Ｒｅｖｅｒｓｅ?ｔ?巧?ｎｓｃ＂ｐｔ?記ｏ??命?Ｓｅｃｏｎｄ?ｓｔｒａｎｄ?ｓｙｎｔｔｔｅｓｉｓ?（ｍａｋｅ?ｃＯＮＡ）??ｙ?＂ｇ?５．??＾?＇＾ｙ＾Ｘ?Ｃｌｅａｖｅ?化?ｃａｐｔｕ?巧??▼?２０－ｂｐ?


本文編號：3413078