番茄SELF-PRUNING基因家族及株形調(diào)控功能研究進(jìn)展
發(fā)布時(shí)間:2021-09-17 09:00
番茄SP (SELF-PRUNING)基因調(diào)控植株的有限型生長(zhǎng)習(xí)性,其與金魚草CEN(CENRORADIALIS)基因和擬南芥TFL1(TERMINAL FLOWER 1)基因同源,屬于調(diào)控植物生長(zhǎng)習(xí)性和開花的同一類基因。目前已報(bào)道了番茄SP基因家族8個(gè)成員(SP、SP9D、SP2I、SP3D、SP5G、SP6A、SIGI和SPGB),該基因家族能直接或間接調(diào)控番茄植株的生長(zhǎng)習(xí)性,影響其株形。對(duì)番茄SP家族基因結(jié)構(gòu)特征、親緣關(guān)系、表達(dá)特性以及株形調(diào)控功能等研究進(jìn)展進(jìn)行綜述,以期為調(diào)控番茄生長(zhǎng)習(xí)性,獲得緊湊型株系、實(shí)現(xiàn)均一化和現(xiàn)代機(jī)械化采收提供有效的技術(shù)支撐。
【文章來(lái)源】:園藝學(xué)報(bào). 2020,47(09)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:10 頁(yè)
【部分圖文】:
番茄SP與同源家族蛋白系統(tǒng)發(fā)生樹分析
筆者從NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)和茄科基因組數(shù)據(jù)庫(kù)中檢索獲得8個(gè)番茄(Solanum lycopersicum)SP基因家族成員基因序列,并利用MEGA 7.0.26軟件鄰接法和GSDS 2.0在線軟件(http://gsds.cbi.pku.edu.cn/)進(jìn)行聚類及基因作圖(圖2),發(fā)現(xiàn)SIGI不含內(nèi)含子,由5′、3′兩端UTR和一段CDS區(qū)構(gòu)成;SPGB由3個(gè)CDS、2個(gè)內(nèi)含子和3′端UTR區(qū)構(gòu)成,5′端沒有UTR區(qū);SIGI和SPGB聚在一起,親緣關(guān)系較近。其余6個(gè)基因(SP3D、SP6A、SP5G、SP、SP9D和SP2G)均由4個(gè)外顯子和3個(gè)內(nèi)含子構(gòu)成。其中SP2G的5′端沒有UTR序列,3個(gè)內(nèi)含子區(qū)域較另外5個(gè)基因(SP3D、SP6A、SP5G、SP和SP9D)長(zhǎng),單獨(dú)聚為一類;SP6A和SP9D的5′和3′端均沒有UTR序列,但親緣關(guān)系較遠(yuǎn),而SP9D與SP聚為一類,表明二者親緣關(guān)系較近;SP3D、SP5G和SP包含完整的兩端UTR區(qū)、4個(gè)外顯子和3個(gè)內(nèi)含子,但并未聚在一起,而是SP3D、SP6A和SP5G聚為一類;SP3D較以上基因包含很長(zhǎng)的2個(gè)內(nèi)含子區(qū)域,結(jié)構(gòu)差異明顯(Shalit et al.,2009,Krieger et al.,2010)。2 番茄SP基因家族的表達(dá)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]番茄封頂花序節(jié)位的遺傳差異及SSR分子標(biāo)記研究[J]. 毛秀杰,王帥,王宇,曹霞,孫中峰,武春成. 北方園藝. 2018(21)
[2]串番茄主要株型性狀的遺傳研究[J]. 馮輝,王五宏,徐娜,魯博,張婷,陳紅波. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2008(12)
[3]番茄主要株型參數(shù)主基因—多基因混合模型分析[J]. 魯博,馮輝,王五宏,劉娜. 沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2008(03)
博士論文
[1]航天誘變番茄無(wú)限生長(zhǎng)習(xí)性突變體的選育及其誘變機(jī)理研究[D]. 王艷芳.浙江大學(xué) 2006
碩士論文
[1]SELF PRUNING 5G(SP5G)調(diào)控番茄開花時(shí)間的機(jī)制研究[D]. 焦志成.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2018
[2]利用Solanum pennellii漸滲群體對(duì)番茄果實(shí)、株型和育性相關(guān)位點(diǎn)的遺傳定位分析[D]. 周慧.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
本文編號(hào):3398392
【文章來(lái)源】:園藝學(xué)報(bào). 2020,47(09)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:10 頁(yè)
【部分圖文】:
番茄SP與同源家族蛋白系統(tǒng)發(fā)生樹分析
筆者從NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)和茄科基因組數(shù)據(jù)庫(kù)中檢索獲得8個(gè)番茄(Solanum lycopersicum)SP基因家族成員基因序列,并利用MEGA 7.0.26軟件鄰接法和GSDS 2.0在線軟件(http://gsds.cbi.pku.edu.cn/)進(jìn)行聚類及基因作圖(圖2),發(fā)現(xiàn)SIGI不含內(nèi)含子,由5′、3′兩端UTR和一段CDS區(qū)構(gòu)成;SPGB由3個(gè)CDS、2個(gè)內(nèi)含子和3′端UTR區(qū)構(gòu)成,5′端沒有UTR區(qū);SIGI和SPGB聚在一起,親緣關(guān)系較近。其余6個(gè)基因(SP3D、SP6A、SP5G、SP、SP9D和SP2G)均由4個(gè)外顯子和3個(gè)內(nèi)含子構(gòu)成。其中SP2G的5′端沒有UTR序列,3個(gè)內(nèi)含子區(qū)域較另外5個(gè)基因(SP3D、SP6A、SP5G、SP和SP9D)長(zhǎng),單獨(dú)聚為一類;SP6A和SP9D的5′和3′端均沒有UTR序列,但親緣關(guān)系較遠(yuǎn),而SP9D與SP聚為一類,表明二者親緣關(guān)系較近;SP3D、SP5G和SP包含完整的兩端UTR區(qū)、4個(gè)外顯子和3個(gè)內(nèi)含子,但并未聚在一起,而是SP3D、SP6A和SP5G聚為一類;SP3D較以上基因包含很長(zhǎng)的2個(gè)內(nèi)含子區(qū)域,結(jié)構(gòu)差異明顯(Shalit et al.,2009,Krieger et al.,2010)。2 番茄SP基因家族的表達(dá)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]番茄封頂花序節(jié)位的遺傳差異及SSR分子標(biāo)記研究[J]. 毛秀杰,王帥,王宇,曹霞,孫中峰,武春成. 北方園藝. 2018(21)
[2]串番茄主要株型性狀的遺傳研究[J]. 馮輝,王五宏,徐娜,魯博,張婷,陳紅波. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2008(12)
[3]番茄主要株型參數(shù)主基因—多基因混合模型分析[J]. 魯博,馮輝,王五宏,劉娜. 沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2008(03)
博士論文
[1]航天誘變番茄無(wú)限生長(zhǎng)習(xí)性突變體的選育及其誘變機(jī)理研究[D]. 王艷芳.浙江大學(xué) 2006
碩士論文
[1]SELF PRUNING 5G(SP5G)調(diào)控番茄開花時(shí)間的機(jī)制研究[D]. 焦志成.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2018
[2]利用Solanum pennellii漸滲群體對(duì)番茄果實(shí)、株型和育性相關(guān)位點(diǎn)的遺傳定位分析[D]. 周慧.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
本文編號(hào):3398392
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/yylw/3398392.html
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