蘋果WRKY基因家族的鑒定、表達分析及MdWRKY118基因的功能驗證
發(fā)布時間:2021-09-11 12:08
WRKY蛋白是一類存在于高等植物中的轉(zhuǎn)錄因子,具有十分廣泛的作用,直接或間接參與植物生長、發(fā)育等生理過程,并且在植物應答非生物脅迫和生物脅迫中扮演著重要角色。本研究通過對蘋果WRKY基因家族的鑒定和分析,解析其成員間的進化關(guān)系,并分析了部分WRKY基因在外源激素處理和真菌侵染過程中的表達譜。此外,利用轉(zhuǎn)基因技術(shù)進一步研究了MdWRKY118的功能。主要研究結(jié)果如下:1、通過生物信息學的研究方法,從蘋果基因組中鑒定出119個MdWRKY基因,并對其進化關(guān)系、基因結(jié)構(gòu)、保守基序、染色體分布、基因重復等進行了分析。結(jié)果顯示119個MdWRKY基因根據(jù)其WRKY保守結(jié)構(gòu)域的類型可分為3種類型(Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ),而Ⅱ類成員又可以進一步分為5個亞類(Ⅱa、Ⅱb、Ⅱc、Ⅱd和Ⅱe)。其中,24個WRKY基因?qū)儆冖耦?包含2個WRKY結(jié)構(gòu)域,其鋅指結(jié)構(gòu)為C2H2。81個Ⅱ類成員的鋅指結(jié)構(gòu)同樣為C2H2,但是它們只含有一個WRKY結(jié)構(gòu)域。而14個Ⅲ類成員同樣只有一個WRKY結(jié)構(gòu)域,不同的是其鋅指結(jié)構(gòu)為C2HC型。我們發(fā)現(xiàn)在同組或同子組中的WRKY基因具有類似的內(nèi)含子/外顯子結(jié)構(gòu),并且其保守基序的分布也具有較...
【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:93 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-1蘋果與擬南芥基因的系統(tǒng)進化樹??Figure?2-1?Phylogenetic?trees?of?IVRKVgenes?in?apple?and?Arubiclopsis??
2結(jié)果與分析??2.1蘋果葉片RNA的分離??本研宄中采用CTAB法提取蘋果葉片RNA,如圖3-1,?RNA帶型完整清晰,其??OD260/OD28Q在1.8?2.2之間,濃度均在600?ng/吣以上,且反轉(zhuǎn)錄的cDNA呈彌散的??條帶,可以用于熒光定量PCR的分析。??1??圖3-1蘋果葉片RNA及合成的cDNA??Figure?3-1?RNA?extracted?from?apple?leaves?and?cDNA?synthesis?of?the?RNA??2.2蘋果WRKY基因家族在斑點落葉病菌侵染下表達情況的分析??很多研宄表明WRKY轉(zhuǎn)錄因子在響應生物脅迫中扮演著重要角色(Dong?et?al,??2003;?Guo?etal,2014;?Wang?et?al,2014;?Jiang?et?al,?2014)。通過轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-seq)??34??
圖3-3?13個蘋果咖燈基因響應斑點落葉病菌侵染的表達分析??Fig?
【參考文獻】:
期刊論文
[1]擬南芥果膠甲酯化酶基因PME17在抵御丁香假單胞桿菌番茄致病變種DC3000株中的功能[J]. 張倩,鮑依群,譚小云. 植物生理學報. 2015(07)
[2]富士蘋果MdWRKY40b基因克隆及其對白粉病的抗性分析[J]. 羅昌國,袁啟鳳,裴曉紅,吳亞維,鄭偉,章鎮(zhèn). 西北植物學報. 2013(12)
[3]蘋果斑點落葉病抗病性種質(zhì)評價及遺傳分析[J]. 呂松,王憶,張新忠,李天紅,韓振海. 中國農(nóng)業(yè)大學學報. 2012(04)
[4]幾種殺菌劑防治蘋果斑點落葉病田間藥效試驗[J]. 時春喜,黃磊,惠浩浩,姜軍俠,白偉. 西北農(nóng)業(yè)學報. 2011(11)
[5]幾種果實不同組織總RNA提取及質(zhì)量分析[J]. 李志強,李瑩,陶建敏,喬玉山,渠慎春,章鎮(zhèn). 果樹學報. 2008(05)
[6]植物抗逆相關(guān)ERF轉(zhuǎn)錄因子研究綜述[J]. 劉武,戴良英. 中國農(nóng)學通報. 2007(04)
[7]生長季蘋果斑點落葉病流行主導因素的確定[J]. 胡同樂,曹克強,王樹桐,甄文超. 植物病理學報. 2005(04)
本文編號:3392973
【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:93 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-1蘋果與擬南芥基因的系統(tǒng)進化樹??Figure?2-1?Phylogenetic?trees?of?IVRKVgenes?in?apple?and?Arubiclopsis??
2結(jié)果與分析??2.1蘋果葉片RNA的分離??本研宄中采用CTAB法提取蘋果葉片RNA,如圖3-1,?RNA帶型完整清晰,其??OD260/OD28Q在1.8?2.2之間,濃度均在600?ng/吣以上,且反轉(zhuǎn)錄的cDNA呈彌散的??條帶,可以用于熒光定量PCR的分析。??1??圖3-1蘋果葉片RNA及合成的cDNA??Figure?3-1?RNA?extracted?from?apple?leaves?and?cDNA?synthesis?of?the?RNA??2.2蘋果WRKY基因家族在斑點落葉病菌侵染下表達情況的分析??很多研宄表明WRKY轉(zhuǎn)錄因子在響應生物脅迫中扮演著重要角色(Dong?et?al,??2003;?Guo?etal,2014;?Wang?et?al,2014;?Jiang?et?al,?2014)。通過轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-seq)??34??
圖3-3?13個蘋果咖燈基因響應斑點落葉病菌侵染的表達分析??Fig?
【參考文獻】:
期刊論文
[1]擬南芥果膠甲酯化酶基因PME17在抵御丁香假單胞桿菌番茄致病變種DC3000株中的功能[J]. 張倩,鮑依群,譚小云. 植物生理學報. 2015(07)
[2]富士蘋果MdWRKY40b基因克隆及其對白粉病的抗性分析[J]. 羅昌國,袁啟鳳,裴曉紅,吳亞維,鄭偉,章鎮(zhèn). 西北植物學報. 2013(12)
[3]蘋果斑點落葉病抗病性種質(zhì)評價及遺傳分析[J]. 呂松,王憶,張新忠,李天紅,韓振海. 中國農(nóng)業(yè)大學學報. 2012(04)
[4]幾種殺菌劑防治蘋果斑點落葉病田間藥效試驗[J]. 時春喜,黃磊,惠浩浩,姜軍俠,白偉. 西北農(nóng)業(yè)學報. 2011(11)
[5]幾種果實不同組織總RNA提取及質(zhì)量分析[J]. 李志強,李瑩,陶建敏,喬玉山,渠慎春,章鎮(zhèn). 果樹學報. 2008(05)
[6]植物抗逆相關(guān)ERF轉(zhuǎn)錄因子研究綜述[J]. 劉武,戴良英. 中國農(nóng)學通報. 2007(04)
[7]生長季蘋果斑點落葉病流行主導因素的確定[J]. 胡同樂,曹克強,王樹桐,甄文超. 植物病理學報. 2005(04)
本文編號:3392973
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