長鏈非編碼RNA（lncRNA）是一類長度介于200 nt-100000 nt之間,但是不具備編碼蛋白能力的RNA片段。LncRNA起初被認(rèn)為是基因組轉(zhuǎn)錄的“噪音”,是RNA聚合酶II的副產(chǎn)物,是不具有生物學(xué)功能的“垃圾”序列。最近幾年,隨著測序技術(shù)的發(fā)展,越來越多的lncRNA被廣泛的研究,但是,lncRNA在植物上的表達(dá)及起源卻仍舊不清楚。為了進(jìn)一步了解lncRNA在植物中的表達(dá)特性及進(jìn)化模式。本研究通過對栽培番茄（Heinz1706）和醋栗番茄（LA1589）的轉(zhuǎn)錄組分析,總共鑒定了353和595個基因座產(chǎn)生的413和709個多外顯子的lncRNA轉(zhuǎn)錄本。通過系統(tǒng)的比較lncRNA的相對表達(dá)水平和序列差異,發(fā)現(xiàn)lncRNA的保守性很差,大約只有0.4%的lncRNA在茄科中都被鑒定出來。與潘那利番茄基因組相比,有75%的特有l(wèi)ncRNA在啟動子或者轉(zhuǎn)錄區(qū)域存在著片段的插入缺失,并且多個lncRNA的形成都與轉(zhuǎn)座事件密切相關(guān)。進(jìn)一步對一個果實(shí)特異表達(dá)的lncRNA-314分析發(fā)現(xiàn),lncRNA-314是通過兩次進(jìn)化事件才形成的:首先在多毛番茄和潘那利番茄分化的時候,在番茄的10號染... 

【文章來源】：華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校

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【學(xué)位級別】：博士

【圖文】：

LncRNAs的類型

圖 1-2 lncRNA 調(diào)控編碼基因表達(dá)的模型。Fig.1-2 Model of lncRNAinvolvement in regulating coding genes (Wierzbicki 2012)..1.1.2 長鏈非編碼 RNA 的分布和意義

lncRNA的主要作用方式


本文編號：3385535