基于轉(zhuǎn)錄組測序的苦瓜熱激蛋白相關(guān)基因分析
發(fā)布時(shí)間:2021-08-24 18:25
為獲得苦瓜葉片高溫脅迫狀態(tài)下表達(dá)的相關(guān)基因,本研究以高溫脅迫下苦瓜葉片為實(shí)驗(yàn)材料,采用Illumina HiSeq 2500高通量測序技術(shù)對(duì)正常溫度(26℃)和高溫脅迫(38℃)下苦瓜葉片轉(zhuǎn)錄測序后進(jìn)行組裝,再利用KEGG、Pfam、Swiss-Prot和NR數(shù)據(jù)庫平臺(tái)對(duì)熱激蛋白的相關(guān)功能基因篩選,共獲得24個(gè)熱激蛋白相關(guān)基因,包括得20個(gè)熱激蛋白基因、2個(gè)位于葉綠體中的小熱激蛋白以及2個(gè)熱激轉(zhuǎn)錄因子。聚類分析研究表明,涉及到熱激蛋白相關(guān)的20個(gè)Unigene廣泛分布于3大類中,其中c42567和c43094這兩個(gè)親緣關(guān)系最近;兩個(gè)小熱激蛋白c42963和c12133的親緣關(guān)系次之;c35683和c3040兩個(gè)熱激轉(zhuǎn)錄因子親緣關(guān)系最遠(yuǎn)。通過本次研究中獲取的24個(gè)熱激蛋白相關(guān)Unigene信息,有助于深入研究苦瓜耐高溫脅迫機(jī)理等提供數(shù)據(jù)信息。
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(10)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:9 頁
【部分圖文】:
24個(gè)熱激蛋白相關(guān)Unigene親緣關(guān)系分析
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于Illumina HiSeq 2500測序技術(shù)對(duì)高溫脅迫下苦瓜葉片轉(zhuǎn)錄組特性分析[J]. 杜文麗,陳中釤,許端祥,高山,溫慶放. 分子植物育種. 2019(02)
[2]熱激轉(zhuǎn)錄因子在植物抗非生物脅迫中的功能研究進(jìn)展[J]. 李麗,劉雙清,楊遠(yuǎn)航,戴良英,李魏. 生物技術(shù)進(jìn)展. 2018(03)
[3]紫色黃秋葵轉(zhuǎn)錄組功能基因測序及分析[J]. 張少平,邱珊蓮,鄭云云,張帥,吳松海,何炎森,鄭開斌. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2017(04)
[4]番茄轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究進(jìn)展[J]. 劉冠,趙婷婷,楊歡歡,張冬野,姜景彬,李景富,許向陽. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2016(10)
[5]植物熱激蛋白研究進(jìn)展[J]. 栗振義,龍瑞才,張鐵軍,楊青川,康俊梅. 生物技術(shù)通報(bào). 2016(02)
[6]植物熱激蛋白70基因家族及其生物學(xué)功能研究進(jìn)展[J]. 王明強(qiáng),張道遠(yuǎn). 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2015(02)
[7]熱激蛋白與植物耐熱性關(guān)系的研究進(jìn)展[J]. 王濤,唐頌豪,何梅,謝寅峰,張往祥. 西北林學(xué)院學(xué)報(bào). 2014(06)
[8]植物耐熱性研究進(jìn)展[J]. 王濤,田雪瑤,謝寅峰,張往祥. 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)). 2013(05)
[9]苦瓜育種及相關(guān)基礎(chǔ)研究進(jìn)展[J]. 陳小鳳,黃如葵,黃玉輝,羅海玲,陳振東. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2011(03)
[10]苦瓜種質(zhì)遺傳多樣性的RAPD和ISSR分析[J]. 高山,林碧英,許端祥,傅睿清,林峰,林義章,潘東明. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2010(01)
碩士論文
[1]低溫脅迫下西葫蘆轉(zhuǎn)錄組分析與SSR分子標(biāo)記開發(fā)[D]. 張宏亮.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
本文編號(hào):3360495
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(10)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:9 頁
【部分圖文】:
24個(gè)熱激蛋白相關(guān)Unigene親緣關(guān)系分析
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于Illumina HiSeq 2500測序技術(shù)對(duì)高溫脅迫下苦瓜葉片轉(zhuǎn)錄組特性分析[J]. 杜文麗,陳中釤,許端祥,高山,溫慶放. 分子植物育種. 2019(02)
[2]熱激轉(zhuǎn)錄因子在植物抗非生物脅迫中的功能研究進(jìn)展[J]. 李麗,劉雙清,楊遠(yuǎn)航,戴良英,李魏. 生物技術(shù)進(jìn)展. 2018(03)
[3]紫色黃秋葵轉(zhuǎn)錄組功能基因測序及分析[J]. 張少平,邱珊蓮,鄭云云,張帥,吳松海,何炎森,鄭開斌. 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2017(04)
[4]番茄轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究進(jìn)展[J]. 劉冠,趙婷婷,楊歡歡,張冬野,姜景彬,李景富,許向陽. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2016(10)
[5]植物熱激蛋白研究進(jìn)展[J]. 栗振義,龍瑞才,張鐵軍,楊青川,康俊梅. 生物技術(shù)通報(bào). 2016(02)
[6]植物熱激蛋白70基因家族及其生物學(xué)功能研究進(jìn)展[J]. 王明強(qiáng),張道遠(yuǎn). 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2015(02)
[7]熱激蛋白與植物耐熱性關(guān)系的研究進(jìn)展[J]. 王濤,唐頌豪,何梅,謝寅峰,張往祥. 西北林學(xué)院學(xué)報(bào). 2014(06)
[8]植物耐熱性研究進(jìn)展[J]. 王濤,田雪瑤,謝寅峰,張往祥. 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)). 2013(05)
[9]苦瓜育種及相關(guān)基礎(chǔ)研究進(jìn)展[J]. 陳小鳳,黃如葵,黃玉輝,羅海玲,陳振東. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2011(03)
[10]苦瓜種質(zhì)遺傳多樣性的RAPD和ISSR分析[J]. 高山,林碧英,許端祥,傅睿清,林峰,林義章,潘東明. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2010(01)
碩士論文
[1]低溫脅迫下西葫蘆轉(zhuǎn)錄組分析與SSR分子標(biāo)記開發(fā)[D]. 張宏亮.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
本文編號(hào):3360495
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