辣椒及大蒜病毒多重RT-PCR檢測體系的建立
發(fā)布時(shí)間:2021-08-11 22:58
辣椒、大蒜均具有較高的營養(yǎng)價(jià)值和獨(dú)特的風(fēng)味,是蔬菜作物和調(diào)味品之一,但辣椒病毒病廣泛發(fā)生,造成減產(chǎn)30%-50%甚至絕收;大蒜無性繁殖過程中病毒可在植物體內(nèi)逐代積累,導(dǎo)致種性退化。辣椒、大蒜的病毒病防治,需要有快速、有效的檢測方法,以確定病毒感染情況或脫毒效果與質(zhì)量。本研究以辣椒的煙草花葉病毒(Tobacco Mosaic Virus,TMW)、黃瓜花葉病毒(Cucumber Mosaic Virus, CMV)、馬鈴薯Y病毒(Potato Virus Y, PVY)、蠶豆萎蔫病毒-2 (Broad Bean Vascula Wilt Virus-2, BBWV-2)和大蒜的韭蔥黃條病毒(Leek Yellow Stripe Virus, LYSV)、洋蔥黃矮病毒(Onion Yellow Dwarf Virus, OYDV)、蔥潛隱病毒(Shallot Latent Virus, SLV)、青蔥X病毒屬病毒(Allexiviruses)為研究對象,分別建立了四重RT-PCR檢測體系,并用這兩個(gè)體系分別對湖南辣椒、大蒜病毒發(fā)生情況進(jìn)行了研究。此外,對湖南長沙、茶陵Allexivirus...
【文章來源】:湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)湖南省
【文章頁數(shù)】:63 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
疑似感病辣椒FYg1symptomofsuspectedpepper
2.3.1辣椒葉片總RNA提取??W湖南省長沙市湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)蔬菜基地、株洲市體陵縣辣椒主產(chǎn)區(qū)疑似感病辣椒??葉片為材料(圖1),提取總RNA,通過1.2%的瓊脂糖凝膠電泳檢測提取結(jié)果(圖2),??結(jié)果表明,能清晰地看到總RNA的28S、18S條帶,且條帶沒有出現(xiàn)明顯彌散,RNA完??整性較好,能被后續(xù)實(shí)驗(yàn)使用。??H??圖1疑似感病辣椒??Fig?1?symp化m?of?suspected?pepper??17??
椒病毒單重RT-PC民檢測體系的建立??據(jù)北京全式金生物有限公司PCR擴(kuò)增試劑2?X?Taq?Master?Mix常用的PCR反應(yīng)體??行辣椒TSWV、CMV、TMV、PVY和BBWV-2單重PCR擴(kuò)增,針對擴(kuò)增的結(jié)果,??PCR反應(yīng)的種種因素(如PCR反應(yīng)循環(huán)數(shù)、引物濃度等)進(jìn)行適當(dāng)調(diào)整,由不度的實(shí)驗(yàn)得出最適宜的退火溫度,通過比較試驗(yàn)結(jié)果確定最佳單重PCR反應(yīng)體??序。單重PCR體系組分包括2XTaq?Master?Mix?12.5?UL,上、下游特異性引物??,模板CDNA2?"L,?ddEbQ補(bǔ)足至25?UL。單重PC民反應(yīng)程序?yàn);9?#176;C預(yù)變94°C變性30s;?57’C退火30s;?72°C延伸Imin;循環(huán)數(shù)為35;最后72°C延伸lOmin用該體系對疑似感病辣椒樣品進(jìn)行單重RT-PCR擴(kuò)增,單重PC民擴(kuò)增引物序列果表明,不能從樣品中擴(kuò)增出大小為25化P?(TSWV)的特異性條帶,能擴(kuò)增??為323bp?(CMV)、2巧?bp?(TMV)、480bp?(PVY)和?1057bp?(BBWV-2)條帶,條帶大小與試驗(yàn)設(shè)計(jì)相符,見圖3、4、5、6,說明樣品未被TSWV侵染,CMV、TMV、PVY和BBWV-2侵染。運(yùn)用該體系篩選出被CMV、TMV、PVY??V-2四種病毒復(fù)合侵染的辣椒樣品。??M?1?2?3?4?5?6?7??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]貴州辣椒病毒病的種類檢測[J]. 王莉爽,陳文,譚清群,陳小均,吳石平,何海永,楊學(xué)輝. 貴州農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(08)
[2]甜椒脈斑駁病毒(PVMV)在海南的發(fā)現(xiàn)與檢測[J]. 梁潔,王健華,章紹延,余乃通,張雨良,王祥,劉志昕. 熱帶作物學(xué)報(bào). 2015(05)
[3]重慶辣椒病毒病病原初步鑒定和分析[J]. 郭思瑤,童艷,黃婭,羅信福,青玲. 園藝學(xué)報(bào). 2015(02)
[4]2.0%好普水劑防治辣椒病毒病的效果[J]. 張春冬. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(04)
[5]幾種新疆加工型辣椒種子病毒的檢測和鑒定[J]. 張強(qiáng),羅明,李克梅,張春竹,楚金平,馬建江. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2014(06)
[6]辣椒抗黃瓜花葉病毒病研究進(jìn)展[J]. 郭廣君,刁衛(wèi)平,劉金兵,潘寶貴,戈偉,王述彬. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2014(S1)
[7]辣椒輕斑駁病毒(PMMoV)新疆加工型辣椒分離物的鑒定和致病型分析[J]. 張強(qiáng),張春竹,李克梅,羅明,楚金平. 中國農(nóng)學(xué)通報(bào). 2014(25)
[8]大蒜X病毒逆轉(zhuǎn)錄環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增檢測方法的建立[J]. 趙桐,李長紅,周前進(jìn),陳先鋒,陳炯,陳劍平. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2013(06)
[9]辣椒病毒病發(fā)生的綜合治理[J]. 陳言. 蔬菜. 2013(09)
[10]中國馬鈴薯Y病毒的檢測鑒定及CP基因的分子變異[J]. 高芳鑾,沈建國,史鳳陽,方治國,謝聯(lián)輝,詹家綏. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(15)
碩士論文
[1]重慶辣椒病毒病的病原鑒定及多重RT-PCR檢測體系的構(gòu)建[D]. 黃婭.西南大學(xué) 2015
[2]新疆辣椒和茄子上兩種病毒的分子鑒定[D]. 張建云.石河子大學(xué) 2013
[3]三種大蒜病毒的RT-PCR及多重RT-PCR檢測研究[D]. 許蕊.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[4]大蒜莖尖脫毒體系的建立與病毒電鏡檢測分析[D]. 馬雯.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[5]北疆大蒜病毒病的調(diào)查和洋蔥黃矮病毒的鑒定及序列分析[D]. 陳棟.石河子大學(xué) 2008
本文編號:3337060
【文章來源】:湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)湖南省
【文章頁數(shù)】:63 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
疑似感病辣椒FYg1symptomofsuspectedpepper
2.3.1辣椒葉片總RNA提取??W湖南省長沙市湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)蔬菜基地、株洲市體陵縣辣椒主產(chǎn)區(qū)疑似感病辣椒??葉片為材料(圖1),提取總RNA,通過1.2%的瓊脂糖凝膠電泳檢測提取結(jié)果(圖2),??結(jié)果表明,能清晰地看到總RNA的28S、18S條帶,且條帶沒有出現(xiàn)明顯彌散,RNA完??整性較好,能被后續(xù)實(shí)驗(yàn)使用。??H??圖1疑似感病辣椒??Fig?1?symp化m?of?suspected?pepper??17??
椒病毒單重RT-PC民檢測體系的建立??據(jù)北京全式金生物有限公司PCR擴(kuò)增試劑2?X?Taq?Master?Mix常用的PCR反應(yīng)體??行辣椒TSWV、CMV、TMV、PVY和BBWV-2單重PCR擴(kuò)增,針對擴(kuò)增的結(jié)果,??PCR反應(yīng)的種種因素(如PCR反應(yīng)循環(huán)數(shù)、引物濃度等)進(jìn)行適當(dāng)調(diào)整,由不度的實(shí)驗(yàn)得出最適宜的退火溫度,通過比較試驗(yàn)結(jié)果確定最佳單重PCR反應(yīng)體??序。單重PCR體系組分包括2XTaq?Master?Mix?12.5?UL,上、下游特異性引物??,模板CDNA2?"L,?ddEbQ補(bǔ)足至25?UL。單重PC民反應(yīng)程序?yàn);9?#176;C預(yù)變94°C變性30s;?57’C退火30s;?72°C延伸Imin;循環(huán)數(shù)為35;最后72°C延伸lOmin用該體系對疑似感病辣椒樣品進(jìn)行單重RT-PCR擴(kuò)增,單重PC民擴(kuò)增引物序列果表明,不能從樣品中擴(kuò)增出大小為25化P?(TSWV)的特異性條帶,能擴(kuò)增??為323bp?(CMV)、2巧?bp?(TMV)、480bp?(PVY)和?1057bp?(BBWV-2)條帶,條帶大小與試驗(yàn)設(shè)計(jì)相符,見圖3、4、5、6,說明樣品未被TSWV侵染,CMV、TMV、PVY和BBWV-2侵染。運(yùn)用該體系篩選出被CMV、TMV、PVY??V-2四種病毒復(fù)合侵染的辣椒樣品。??M?1?2?3?4?5?6?7??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]貴州辣椒病毒病的種類檢測[J]. 王莉爽,陳文,譚清群,陳小均,吳石平,何海永,楊學(xué)輝. 貴州農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(08)
[2]甜椒脈斑駁病毒(PVMV)在海南的發(fā)現(xiàn)與檢測[J]. 梁潔,王健華,章紹延,余乃通,張雨良,王祥,劉志昕. 熱帶作物學(xué)報(bào). 2015(05)
[3]重慶辣椒病毒病病原初步鑒定和分析[J]. 郭思瑤,童艷,黃婭,羅信福,青玲. 園藝學(xué)報(bào). 2015(02)
[4]2.0%好普水劑防治辣椒病毒病的效果[J]. 張春冬. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(04)
[5]幾種新疆加工型辣椒種子病毒的檢測和鑒定[J]. 張強(qiáng),羅明,李克梅,張春竹,楚金平,馬建江. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2014(06)
[6]辣椒抗黃瓜花葉病毒病研究進(jìn)展[J]. 郭廣君,刁衛(wèi)平,劉金兵,潘寶貴,戈偉,王述彬. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2014(S1)
[7]辣椒輕斑駁病毒(PMMoV)新疆加工型辣椒分離物的鑒定和致病型分析[J]. 張強(qiáng),張春竹,李克梅,羅明,楚金平. 中國農(nóng)學(xué)通報(bào). 2014(25)
[8]大蒜X病毒逆轉(zhuǎn)錄環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增檢測方法的建立[J]. 趙桐,李長紅,周前進(jìn),陳先鋒,陳炯,陳劍平. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2013(06)
[9]辣椒病毒病發(fā)生的綜合治理[J]. 陳言. 蔬菜. 2013(09)
[10]中國馬鈴薯Y病毒的檢測鑒定及CP基因的分子變異[J]. 高芳鑾,沈建國,史鳳陽,方治國,謝聯(lián)輝,詹家綏. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(15)
碩士論文
[1]重慶辣椒病毒病的病原鑒定及多重RT-PCR檢測體系的構(gòu)建[D]. 黃婭.西南大學(xué) 2015
[2]新疆辣椒和茄子上兩種病毒的分子鑒定[D]. 張建云.石河子大學(xué) 2013
[3]三種大蒜病毒的RT-PCR及多重RT-PCR檢測研究[D]. 許蕊.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[4]大蒜莖尖脫毒體系的建立與病毒電鏡檢測分析[D]. 馬雯.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[5]北疆大蒜病毒病的調(diào)查和洋蔥黃矮病毒的鑒定及序列分析[D]. 陳棟.石河子大學(xué) 2008
本文編號:3337060
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