康定櫻桃（Cerasus tatsienensis（Batal.）Yu et Li）隸屬于薔薇科Rosaceae櫻屬Cerasus,為我國(guó)特有種,種質(zhì)資源豐富,廣泛分布于中國(guó)的中部和西南部。其觀賞價(jià)值與木材加工價(jià)值很高,可在引種馴化后投入應(yīng)用。不過(guò),野生康定櫻桃的生存空間受到了自然環(huán)境惡化和人為破壞等因素的沖擊,且國(guó)內(nèi)外對(duì)康定櫻桃野生資源的系統(tǒng)研究極少。因此,對(duì)康定櫻桃開(kāi)展居群遺傳多樣性與遺傳結(jié)構(gòu)的研究,收集利用野生優(yōu)良康定櫻桃資源,以及改良康定櫻桃的遺傳特性等都具有重要意義。從康定櫻桃自然分布區(qū)中,采集了17個(gè)具有代表性群體的實(shí)驗(yàn)材料,經(jīng)過(guò)CTAB-硅珠法提取其總DNA,篩選得到的25對(duì)SSR引物,用10μl的PCR體系進(jìn)行擴(kuò)增,再經(jīng)過(guò)8%尿素-聚丙烯酰胺變性膠電泳及銀染過(guò)程得到目的條帶。運(yùn)用GenAlEx 6.502軟件、Popgen 32軟件、NTSYSpc 2.10e軟件、Structure軟件分析康定櫻桃的相關(guān)遺傳數(shù)據(jù),分析康定櫻桃居群的遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu),討論影響其遺傳多樣性及遺傳結(jié)構(gòu)的內(nèi)外部因素。主要研究結(jié)果如下:（1）康定櫻桃的遺傳多樣性。對(duì)上述17個(gè)居群的251個(gè)個(gè)... 

【文章來(lái)源】：南京林業(yè)大學(xué)江蘇省

【文章頁(yè)數(shù)】：62 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

康定櫻桃全國(guó)采集居群地點(diǎn)標(biāo)注Figure2-2MarkingofcollectingplaceofC.tatsienensisinChina從中國(guó)野生康定櫻桃自然分布區(qū)中，采集具有代表性的康定櫻桃居群的實(shí)驗(yàn)材料，每

圖 3-1 CTAB-硅珠法提取的康定櫻桃總 DNA 電泳圖Figure3-1 The electrophoresis of total extracted DNA of C. tatsienensis by CTAB - silicon bead methods3.2 引物篩選與 PCR 擴(kuò)增利用已提好的康定櫻桃 DNA 進(jìn)行初篩，得到了 31 對(duì)具有多態(tài)性的 SSR 引物，再經(jīng)過(guò)比較與分析，復(fù)篩得到了 25 對(duì)多態(tài)性強(qiáng)、擴(kuò)增條帶穩(wěn)定、特異性好的 SSR 引物，各引物的具體信息見(jiàn)表 3-2，部分引物的擴(kuò)增情況見(jiàn)圖 3-3。從已篩得的引物信息上可以看出，引物得到的片段長(zhǎng)短不一，大部分片段長(zhǎng)度在 20bp 以下，少數(shù)片段長(zhǎng)度達(dá)到 300 bp 以上，這種情況下需要對(duì)聚丙烯酰胺凝膠電泳時(shí)的電泳時(shí)間作調(diào)整，不能一概而論。電泳時(shí)間過(guò)長(zhǎng)會(huì)導(dǎo)致目的條帶跑出膠條外，導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)失敗電泳時(shí)間過(guò)短，目的條帶表現(xiàn)緊湊，讀數(shù)誤差偏大。從退火溫度 Tm來(lái)看，大多數(shù)引物適應(yīng)于 55 ℃條件下，最低 Tm為 50 ℃，最高 Tm為 60 ℃。從循環(huán)次數(shù)來(lái)看，絕大多數(shù)引物在循環(huán)次數(shù)為 30 次時(shí)，表現(xiàn)出良好的特異性。

引物序列primer sequence (5 -3 )觀測(cè)片段長(zhǎng)度observed fragmentsize/bp退火溫度(Tm)annealingtemperature/℃循環(huán)數(shù)circle/次來(lái)源originAGTTCAGTGTCTACACTCACATCATTCAGCCACTGC174-191 55 30ArmeniacacathayanaEST-SSRTCCCAGGTTAAACTCTTTGACACATGC132-152 58 30sweet cheerygenomic DNAAGGCCAAGGCAACCCGGTTATATGC160-188 55 30C. pseudocerasSSRTCCCAGGTTAAACTCCTTTTGACACATGC122-146 58 30C. pseudocerasSSRCTGGGCTATGGCGCACATTTACGACAGGG253 59 30P. persica(peacSSR


本文編號(hào)：3326743