蜻蜓鳳梨AfPIF4基因的克隆與功能鑒定
發(fā)布時(shí)間:2021-07-22 18:49
蜻蜓鳳梨(Aechmea fasciata)隸屬鳳梨科,為多年生草本單子葉植物,具有非常高的觀賞價(jià)值,深受人們的喜愛。但是由于其營養(yǎng)生長期較長,所以人們一直通過控制栽培環(huán)境的溫度、光照時(shí)間和使用乙烯等激素條件調(diào)控其開花時(shí)間以滿足市場的需求,但截至目前,蜻蜓鳳梨的開花機(jī)理尚不清楚,導(dǎo)致人工催花效果不十分理想。為了解析蜻蜓鳳梨開花機(jī)理,本研究根據(jù)轉(zhuǎn)錄組中的片段信息,利用cDNA 快速末端擴(kuò)增(Rapid amplification of cDNA end,RACE)的技術(shù)從蜻蜓鳳梨中獲得一個(gè)光敏色素因子(PIFs)的cDNA全長序列,并將其命名為AfPIF4。AfPIF4基因cDNA全長1 343 bp,開放閱讀框?yàn)?296 bp,編碼431個(gè)氨基酸。利用NCBI分析氨基酸序列結(jié)果顯示:AfPIF4含有bHLH蛋白家族共有的功能結(jié)構(gòu)域bHLH,與海棗(Phoenix dactylifera),大豆(Glycine max),玉米(Zea mays),番茄(Solanum lycopersicum)中的 PIF 同源性分別為52%,49%,42%,39%。進(jìn)化樹分析顯示AfPIF4與小果野芭...
【文章來源】:海南大學(xué)海南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:57 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1:轉(zhuǎn)錄因子激活報(bào)告基因原理??Figure?1:?The?principle?of?transcription?factors?activate?report?gene??
2.2.2.1蜻蜓鳳梨材料的選取??組織特異性樣品的采集:分別選取生長溫室大棚內(nèi),溫度控制在25-30°C的生長??健壯,無病害的盆栽幼株,成株(圖2),2種材料各。持。將每株的外圍葉剝掉,??分離根,莖,心葉,外葉;為了進(jìn)一步研究J/P/fV在蜻蜓鳳梨幼株和成株對乙烯的??響應(yīng),我們使用乙烯對其進(jìn)行了不同時(shí)間的處理:〇h,?lh,6h,?24h取其莖尖,用清??水清洗干凈,放置于采樣管,液弒速凍,-8(TC保存。??圖2:蜻蜓鳳梨材料??注:A:小株;B:成株;C:開花植株??V'x^uhyI:?Aechmea?fasciatd?|)lants??Note:?A:?Juvenile?plan;?B:?Miilurc?phinl;?C:?Flowering?plnnl??17??
3.1.1蜻蜓鳳梨RNA的提取??本研究提取蜻蜓鳳梨心葉的總RNA,測其OD26G/28()比值分別為1.9909,?1.8991,??1.9805,均在1.8?2.0范圍內(nèi),瓊脂糖凝膠電泳顯示結(jié)果(圖3),質(zhì)量達(dá)到后續(xù)所??需。??1?2?3??*28S??18S??圖3:蜻蜓鳳梨心葉總RNA的瓊脂糖凝膠電泳圖譜??注:1-3:蜻蜓鳳梨3株心葉RNA??Figure?3:?Agrose?electrophoresis?results?of?total?RNA?extracted?from?the?cotyledon?oiA.?fasciata??Note:?1-3:?The?RNA?extracted?from?the?central?leaves?oi?A.?fasciata??3.1.2?4/P/iW基因的克隆??3.1.2.?M/P/F4基因編碼區(qū)序列的獲得??我們通過RACE技術(shù)獲得了?的5'端序列528?bp?(圖5A)和31端序??列1?I90bp?(圖5B),根據(jù)所得cDNA片段,尋找j/P/fV的開放閱讀框?yàn)椋保玻梗??bp,推測其編碼了?431個(gè)氨基酸(圖4),據(jù)此再次設(shè)計(jì)帶有Kpnl和Xbal酶切位點(diǎn)??的特異性引物,利用PCR技術(shù)擴(kuò)增得到目的片段(圖5C),測序結(jié)果顯示與RACE??拼接序列相同
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]牛大力總RNA提取的CTAB法改進(jìn)及優(yōu)化[J]. 郝宏剛,李志英,叢漢卿,徐立. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(18)
[2]生長素合成途徑的研究進(jìn)展[J]. 王家利,劉冬成,郭小麗,張愛民. 植物學(xué)報(bào). 2012(03)
[3]受乙烯誘導(dǎo)表達(dá)的蜻蜓鳳梨MAPKK基因的克隆與序列分析[J]. 張鯤,徐立,叢漢卿,丁靜,郝宏剛,李志英. 熱帶生物學(xué)報(bào). 2011(02)
[4]植物基因的遺傳轉(zhuǎn)化方法[J]. 鐘育海,申艮寶. 安徽農(nóng)學(xué)通報(bào)(上半月刊). 2010(11)
[5]觀賞鳳梨組培快繁技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 龔明霞,何鐵光,黃如葵,方峰. 廣西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(05)
[6]甘露糖正向篩選體系的建立及在擬南芥遺傳轉(zhuǎn)化中的應(yīng)用[J]. 楊彩云,尹偉倫,夏新莉. 分子植物育種. 2009(06)
[7]鳳梨類植物的種質(zhì)資源與分類[J]. 何業(yè)華,胡中沂,馬均,方少秋,盧敏,謝志亮,彭兵. 經(jīng)濟(jì)林研究. 2009(03)
[8]觀賞鳳梨乙烯催花機(jī)理的研究進(jìn)展[J]. 信彩云,李志英. 熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué). 2009(02)
[9]觀賞鳳梨生物技術(shù)研究進(jìn)展(綜述)[J]. 劉慧春,潘曉韻,朱開元,王煒勇. 亞熱帶植物科學(xué). 2007(04)
[10]鳳梨亞科光萼荷屬與其近源屬親緣關(guān)系的ISSR分子鑒定[J]. 李萍,石金磊,胡永紅,陳醇,蔣昌華,王佳,明鳳. 種子. 2007(11)
本文編號:3297699
【文章來源】:海南大學(xué)海南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:57 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1:轉(zhuǎn)錄因子激活報(bào)告基因原理??Figure?1:?The?principle?of?transcription?factors?activate?report?gene??
2.2.2.1蜻蜓鳳梨材料的選取??組織特異性樣品的采集:分別選取生長溫室大棚內(nèi),溫度控制在25-30°C的生長??健壯,無病害的盆栽幼株,成株(圖2),2種材料各。持。將每株的外圍葉剝掉,??分離根,莖,心葉,外葉;為了進(jìn)一步研究J/P/fV在蜻蜓鳳梨幼株和成株對乙烯的??響應(yīng),我們使用乙烯對其進(jìn)行了不同時(shí)間的處理:〇h,?lh,6h,?24h取其莖尖,用清??水清洗干凈,放置于采樣管,液弒速凍,-8(TC保存。??圖2:蜻蜓鳳梨材料??注:A:小株;B:成株;C:開花植株??V'x^uhyI:?Aechmea?fasciatd?|)lants??Note:?A:?Juvenile?plan;?B:?Miilurc?phinl;?C:?Flowering?plnnl??17??
3.1.1蜻蜓鳳梨RNA的提取??本研究提取蜻蜓鳳梨心葉的總RNA,測其OD26G/28()比值分別為1.9909,?1.8991,??1.9805,均在1.8?2.0范圍內(nèi),瓊脂糖凝膠電泳顯示結(jié)果(圖3),質(zhì)量達(dá)到后續(xù)所??需。??1?2?3??*28S??18S??圖3:蜻蜓鳳梨心葉總RNA的瓊脂糖凝膠電泳圖譜??注:1-3:蜻蜓鳳梨3株心葉RNA??Figure?3:?Agrose?electrophoresis?results?of?total?RNA?extracted?from?the?cotyledon?oiA.?fasciata??Note:?1-3:?The?RNA?extracted?from?the?central?leaves?oi?A.?fasciata??3.1.2?4/P/iW基因的克隆??3.1.2.?M/P/F4基因編碼區(qū)序列的獲得??我們通過RACE技術(shù)獲得了?的5'端序列528?bp?(圖5A)和31端序??列1?I90bp?(圖5B),根據(jù)所得cDNA片段,尋找j/P/fV的開放閱讀框?yàn)椋保玻梗??bp,推測其編碼了?431個(gè)氨基酸(圖4),據(jù)此再次設(shè)計(jì)帶有Kpnl和Xbal酶切位點(diǎn)??的特異性引物,利用PCR技術(shù)擴(kuò)增得到目的片段(圖5C),測序結(jié)果顯示與RACE??拼接序列相同
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]牛大力總RNA提取的CTAB法改進(jìn)及優(yōu)化[J]. 郝宏剛,李志英,叢漢卿,徐立. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(18)
[2]生長素合成途徑的研究進(jìn)展[J]. 王家利,劉冬成,郭小麗,張愛民. 植物學(xué)報(bào). 2012(03)
[3]受乙烯誘導(dǎo)表達(dá)的蜻蜓鳳梨MAPKK基因的克隆與序列分析[J]. 張鯤,徐立,叢漢卿,丁靜,郝宏剛,李志英. 熱帶生物學(xué)報(bào). 2011(02)
[4]植物基因的遺傳轉(zhuǎn)化方法[J]. 鐘育海,申艮寶. 安徽農(nóng)學(xué)通報(bào)(上半月刊). 2010(11)
[5]觀賞鳳梨組培快繁技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 龔明霞,何鐵光,黃如葵,方峰. 廣西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(05)
[6]甘露糖正向篩選體系的建立及在擬南芥遺傳轉(zhuǎn)化中的應(yīng)用[J]. 楊彩云,尹偉倫,夏新莉. 分子植物育種. 2009(06)
[7]鳳梨類植物的種質(zhì)資源與分類[J]. 何業(yè)華,胡中沂,馬均,方少秋,盧敏,謝志亮,彭兵. 經(jīng)濟(jì)林研究. 2009(03)
[8]觀賞鳳梨乙烯催花機(jī)理的研究進(jìn)展[J]. 信彩云,李志英. 熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué). 2009(02)
[9]觀賞鳳梨生物技術(shù)研究進(jìn)展(綜述)[J]. 劉慧春,潘曉韻,朱開元,王煒勇. 亞熱帶植物科學(xué). 2007(04)
[10]鳳梨亞科光萼荷屬與其近源屬親緣關(guān)系的ISSR分子鑒定[J]. 李萍,石金磊,胡永紅,陳醇,蔣昌華,王佳,明鳳. 種子. 2007(11)
本文編號:3297699
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