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黃花菜秋水仙堿合成相關(guān)基因篩選及遺傳圖譜構(gòu)建

發(fā)布時(shí)間:2021-07-11 14:31
  黃花菜(Hemerocallis citrina Baroni)是一種在我國(guó)栽培范圍廣泛的藥食兼用型功能性蔬菜,由于新鮮花蕾含有次生代謝物秋水仙堿,過(guò)量食用易引起中毒反應(yīng)。同時(shí),我國(guó)黃花菜種質(zhì)資源豐富,由于有性繁殖世代周期長(zhǎng),生產(chǎn)上多采用無(wú)性繁殖,導(dǎo)致黃花菜有性雜交育種進(jìn)展緩慢,缺少對(duì)優(yōu)良品種與性狀的系統(tǒng)性選育。開(kāi)展黃花菜秋水仙堿生物合成相關(guān)基因篩選及遺傳圖譜構(gòu)建,有利于完成黃花菜農(nóng)藝性狀相關(guān)基因的定位與克隆,摸清黃花菜秋水仙堿合成相關(guān)基因,為后期分子標(biāo)記輔助選擇育種奠定理論基礎(chǔ)。本研究以山西大同地方品種’大同’黃花菜盛花期的根、即將開(kāi)放花蕾和葉為試驗(yàn)材料,基于IlluminaHiSeq 2500平臺(tái)進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,篩選與秋水仙堿合成相關(guān)的基因;開(kāi)發(fā)適用于黃花菜實(shí)時(shí)熒光定量PCR的內(nèi)參基因,并對(duì)其穩(wěn)定性進(jìn)行評(píng)價(jià);以轉(zhuǎn)錄組測(cè)序?yàn)榛A(chǔ),開(kāi)發(fā)EST-SSR分子標(biāo)記,利用黃花菜種內(nèi)、黃花菜與萱草種間雜交群體構(gòu)建種內(nèi)及種間遺傳圖譜,為黃花菜基因定位、表達(dá)分析及分子標(biāo)記輔助選擇育種奠定基礎(chǔ)。主要研究結(jié)果如下:1.以黃花菜地方品種’大同’盛花期的根、即將開(kāi)放花蕾和葉為材料進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,經(jīng)組裝獲得9... 

【文章來(lái)源】:山西農(nóng)業(yè)大學(xué)山西省

【文章頁(yè)數(shù)】:129 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【部分圖文】:

黃花菜秋水仙堿合成相關(guān)基因篩選及遺傳圖譜構(gòu)建


圖1-2遺傳重組與配子類型??

序列,長(zhǎng)度分布圖,功能注釋


占全部Unigene的14.21%。各長(zhǎng)度范圍內(nèi)Unigene數(shù)量如圖2-2所不。??表2-1樣品測(cè)序數(shù)據(jù)評(píng)估統(tǒng)計(jì)??Table?2-1?Evaluation?statistics?of?sequencing?data?from?samples?? ̄Reads總數(shù)?GC含量 ̄ ̄質(zhì)量值SO的堿基百分比??Sample?Reads?number?GC?content?Q30?percentage??根?17828652?47.44%?91.47%??花蕾?19861393?47.88%?90.32%??葉?18470470?49.34%?90.09%???Hemerocallis?Unigene?Length?Distribution??100000?-??10000?-?I?I??i:?Mllli麵ill??識(shí)爾滯p鱗PS?纖娜娜,??Length?(nt)??圖2-2?Unigene長(zhǎng)度分布圖??Fig.?2-2?Unigene?length?distribution??2.2基因功能注釋??利用BLAST軟件對(duì)Unigene進(jìn)行功能注釋,將Unigene序列與NR、Swiss-Prot、??GO、COG、KOG、KEGG及Pfcm等7個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì),獲得Unigene的功能注釋(表??2-2)。BLAST?參數(shù)?E-value?不大于?KT5,?HMMER?參數(shù)?E-value?不大于?HT'?通過(guò)?BLAST??比對(duì),最終獲得41796個(gè)有注釋信息的Unigene。其中NR數(shù)據(jù)庫(kù)中注釋到的Unigene??數(shù)目最多

通路圖,秋水仙堿,乙酰轉(zhuǎn)移酶,甲基轉(zhuǎn)移酶


其余催化反應(yīng)中所涉及到的6種酶(多酚氧化酶、酪氨酸脫羧酶、細(xì)胞色素??P-450氧化酶、0-甲基轉(zhuǎn)移酶、脫甲酰酶、N-乙酰轉(zhuǎn)移酶)均已經(jīng)過(guò)生物化學(xué)同位素示??蹤法鑒定(圖2-3)。??cytoclirotii??0-??P-4S8?(0?>?(C?t)??U4.21??(S)-autumnalme??MS)?-iso?tlrocy?mbi?e??????0-nvethvlA?nJr〇#鄭?bi?Sz澹崳?(\?^??M?2?H20?adeno?yl-l?-methionine?^'-a^ettos^-t-homoevsteine??oxyejesi?rjADP"?H4??NADPH?cvtochrome?P4SS?/??I?14?13.-?、、'*Hl2.0??dgAcet^kokhicifia?N-?N-f〇ft?^dftmecafci?e??acetyltrai^sferAse?(Ca)?l^poi^ticd}?<Sefon}?vlasc?{Ca)??2?3?S?-?1?14.13-?351?-?^??(S)-colchicine-^?—??deacctvlcokWcrne-4?—--r—demeceicme-^i??N-forntyldenvecolcuie??i?\?t?\

【參考文獻(xiàn)】:
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碩士論文
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[5]萱草屬植物營(yíng)養(yǎng)成分分析及品質(zhì)評(píng)價(jià)[D]. 楊利.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
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[7]漳州水仙鱗莖盤轉(zhuǎn)錄組分析及類黃酮合成途徑基因的表達(dá)[D]. 羅鵬.福建農(nóng)林大學(xué) 2014
[8]不同倍性大花萱草雜交親和性的研究[D]. 雷媛.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[9]黃花菜中秋水仙堿的提取及其抑菌性能研究[D]. 朱禮芳.福建農(nóng)林大學(xué) 2013
[10]不同倍性萱草(Hemerocallis spp.&cvs.)雜交育種研究[D]. 何琦.北京林業(yè)大學(xué) 2012



本文編號(hào):3278276

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