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黃瓜ACS基因家族分析及CsACS2基因在花性型發(fā)育中的功能鑒定

發(fā)布時(shí)間:2021-07-11 02:29
  黃瓜由于花性型分化的多樣性,已成為研究植物性型分化的模式植物。黃瓜性型主要受3對(duì)主效基因F/f,M/m,A/a,這3個(gè)主效基因均已被克隆并被證實(shí)為編碼控制乙烯生物合成關(guān)鍵酶—1-氨基環(huán)丙烷-1-羧酸合酶(1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase,ACC合成酶)。因此,在全基因組水平上了解黃瓜ACS基因家族,對(duì)于黃瓜性型決定機(jī)制的研究有重要意義。本研究利用黃瓜基因組數(shù)據(jù)庫(kù)等多個(gè)公共數(shù)據(jù)庫(kù)資源,鑒定出黃瓜ACS基因家族成員并進(jìn)行了相關(guān)生物信息學(xué)分析,家族基因表達(dá)模式分析及候選基因的克隆。并對(duì)鑒定出的CsACS2(即黃瓜單性花控制基因M)的功能在擬南芥中進(jìn)行了初步研究,主要研究成果如下:1.利用“Aminotransferase class Ⅰ and Ⅱ”保守結(jié)構(gòu)域(Pfam:PF00155)的HMM profile和Hmmer 3.0軟件在黃瓜基因組數(shù)據(jù)庫(kù)的蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)中獲得48條候選的蛋白質(zhì)序列。進(jìn)一步分析后最終獲得8條預(yù)測(cè)為具有依賴(lài)PLP的保守結(jié)構(gòu)域和ACC合成酶功能的蛋白質(zhì)序列并進(jìn)行生物信息學(xué)分析。8個(gè)候選的黃瓜ACS基因家族成員中,Cs... 

【文章來(lái)源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:64 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

黃瓜ACS基因家族分析及CsACS2基因在花性型發(fā)育中的功能鑒定


黃瓜中五種常見(jiàn)的性型Fig.1-1Thefivemajorsextypesincucumberplants

黃瓜ACS基因家族分析及CsACS2基因在花性型發(fā)育中的功能鑒定


乙烯生物合成途徑(YangandHoffmann1984)

黃瓜ACS基因家族分析及CsACS2基因在花性型發(fā)育中的功能鑒定


擬南芥和番茄ACS蛋白的分類(lèi)(LyzengaandStone2012)

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]黃瓜性別決定相關(guān)基因和性別表達(dá)機(jī)制[J]. 陳惠明,盧向陽(yáng),許亮,易克,田云.  植物生理學(xué)通訊. 2005(01)
[2]我國(guó)黃瓜栽培的現(xiàn)狀及其發(fā)展趨勢(shì)[J]. 李懷智.  蔬菜. 2003(08)
[3]MapDraw,在Excel中繪制遺傳連鎖圖的宏[J]. 劉仁虎,孟金陵.  遺傳. 2003(03)

博士論文
[1]中國(guó)華東葡萄抗白粉病芪合成酶基因及啟動(dòng)子克隆與功能分析[D]. 徐偉榮.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2010



本文編號(hào):3277146

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