AP2/ERF（APETALA2/ethylene-responsive element binding factor）家族,是一類植物轉(zhuǎn)錄因子,它們與植物的生長(zhǎng)發(fā)育和脅迫應(yīng)答有著密切的聯(lián)系,是一類備受科學(xué)工作者關(guān)注的重要轉(zhuǎn)錄因子。蘭科植物作為世界上最大和分布最廣泛的植物大家族之一,擁有著大約736個(gè)科屬的大約28,000種,以其多種多樣的生長(zhǎng)形式和復(fù)雜特殊的結(jié)構(gòu)而備受關(guān)注。小蘭嶼蝴蝶蘭（Phalaenopsis equestris）基因組草圖的完成,讓我們得以擁有豐富的數(shù)據(jù)來(lái)研究蘭科植物的AP2/ERF家族。我們以小蘭嶼蝴蝶蘭全基因組數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),利用生物信息學(xué)手段,明確了小蘭嶼蝴蝶蘭AP2/ERF家族的107個(gè)轉(zhuǎn)錄因子,根據(jù)這些轉(zhuǎn)錄因子的AP2/ERF結(jié)構(gòu)域特點(diǎn),系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系以及基因結(jié)構(gòu),我們將107個(gè)AP2/ERF家族轉(zhuǎn)錄因子分成了4個(gè)亞家族（AP2、ERF、RAV、Soloist）,并在ERF亞家族下分成10個(gè)亞組。結(jié)合高通量測(cè)序數(shù)據(jù)分析AP2/ERF基因家族在小蘭嶼蝴蝶蘭花、葉、莖、根四個(gè)器官中的表達(dá)模式,預(yù)測(cè)小蘭嶼蝴蝶蘭AP2/ERF家族基因可能具有的功能。本研究所獲得的結(jié)果... 

【文章來(lái)源】：中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院北京市

【文章頁(yè)數(shù)】：75 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第一章 緒論
    1.1 引言
        1.1.1 研究背景
        1.1.2 國(guó)內(nèi)外研究現(xiàn)狀及評(píng)述
    1.2 研究目標(biāo)和主要研究?jī)?nèi)容
        1.2.1 關(guān)鍵科學(xué)問(wèn)題與研究目標(biāo)
        1.2.2 主要研究?jī)?nèi)容
    1.3 研究技術(shù)路線
第二章 試驗(yàn)材料與方法
    2.1 基因預(yù)測(cè)
    2.2 序列多重比對(duì)及系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建
    2.3 基因結(jié)構(gòu)和保守結(jié)構(gòu)域分析
    2.4 miR172靶基因的預(yù)測(cè)
    2.5 基因表達(dá)模式分析
第三章 結(jié)果與分析
    3.1 小蘭嶼蝴蝶蘭AP2/ERF基因的預(yù)測(cè)
    3.2 系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系分析和序列多重比對(duì)
        3.2.1 序列多重比對(duì)
        3.2.2 系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系分析
    3.3 基因結(jié)構(gòu)和保守結(jié)構(gòu)域分析
        3.3.1 基因結(jié)構(gòu)分析
        3.3.2 基因保守結(jié)構(gòu)域分析
    3.4 miR172靶基因的預(yù)測(cè)
    3.5 表達(dá)模式分析
第四章 結(jié)論與討論
    4.1 結(jié)論
    4.2 討論
    4.3 展望
參考文獻(xiàn)
附錄 小蘭嶼蝴蝶蘭AP2/ERF基因家族成員與特征
致謝
詳細(xì)摘要


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]番茄NAC轉(zhuǎn)錄因子家族的鑒定及生物信息學(xué)分析[J]. 陳秀玲,王傲雪,張珍珠,李景富.  植物生理學(xué)報(bào). 2014(04)
[2]中國(guó)蘭科植物研究雜記(英文)[J]. 金偉濤,何疆海,朱正明,金效華.  熱帶亞熱帶植物學(xué)報(bào). 2014(01)
[3]一個(gè)小麥AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子家族單獨(dú)亞族基因的克隆及分析[J]. 莊靜,陳建民,彭日荷,高峰,朱波,付曉燕,熊愛生,姚泉洪.  麥類作物學(xué)報(bào). 2009(05)
[4]毛竹基因組大小和序列構(gòu)成的比較分析[J]. 桂毅杰,王晟,全麗艷,周昌平,龍士豹,鄭華軍,金亮,張憲銀,馬乃訓(xùn),樊龍江.  中國(guó)科學(xué)（C輯:生命科學(xué)）. 2007(04)
[5]蝴蝶蘭組織培養(yǎng)與快速繁殖技術(shù)研究進(jìn)展[J]. 肖麗紅,黃鑫文,陳創(chuàng)國(guó).  廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2007(03)
[6]Arabidopsis RAV1 is down-regulated by brassinosteroid and may act as a negative regulator during plant development[J]. Yu Xin HU~*, Yong Hong WANG~*, Xin Fang LIU, Jia Yang LI~(**) Institute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China..  Cell Research. 2004(01)

博士論文
[1]梅花脫水素基因家族的克隆與功能分析[D]. 杜棟良.北京林業(yè)大學(xué) 2013

碩士論文
[1]蝴蝶蘭組培快繁體系的研究[D]. 楊海燕.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006



本文編號(hào)：3243452