棗（Ziziphus jujuba Mill.2n=2x=24）,隸屬鼠李科（Rhamnaceae）棗屬（Ziziphus Mill.）,是我國重要的經(jīng)濟林樹種,在我國農(nóng)林業(yè)產(chǎn)業(yè)中占有重要地位。良種是棗產(chǎn)業(yè)持續(xù)健康發(fā)展的基礎,目前,棗樹育種主要依賴常規(guī)育種,育種周期長,效率低。分子標記輔助選擇能夠極大地提高育種效率,縮短育種周期,但是棗樹遺傳圖譜構(gòu)建和分子輔助選擇方面的研究明顯落后于其他果樹。本研究以99株‘冬棗’和‘映山紅’雜交F1子代為作圖群體,采用限制性酶切位點關(guān)聯(lián)DNA測序（RAD-seq）技術(shù),開發(fā)大量SNP標記和InDel標記,結(jié)合SSR標記,構(gòu)建并優(yōu)化了棗樹高密度遺傳圖譜,并對棗樹生長相關(guān)性狀以及抗寒性狀進行了QTL定位分析。主要研究結(jié)果如下：1.將RAD-seq技術(shù)獲得的序列（-98.76 Gb clean reads）比對到參考基因組,通過一系列篩選過濾,最終得到符合孟德爾分離比的標記7939個,其中SNP標記7026個和InDel標記913個。2.將RAD技術(shù)所得標記加入97個SSR標記,采用“擬測交”策略進行遺傳圖譜構(gòu)建。最終4669個標記被定位到遺傳圖譜上,其中... 

【文章來源】：北京林業(yè)大學北京市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：75 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
引言
1. 文獻綜述
    1.1 棗產(chǎn)業(yè)現(xiàn)狀和育種目標
    1.2 棗育種進展
        1.2.1 野生資源的馴化利用和種質(zhì)資源調(diào)查
        1.2.2 常規(guī)育種
        1.2.3 生物技術(shù)育種
            1.2.3.1 離體培養(yǎng)的研究
            1.2.3.2 分子育種研究
    1.3 遺傳圖譜構(gòu)建
        1.3.1 作圖群體的創(chuàng)建
        1.3.2 遺傳標記的選擇
            1.3.2.1 經(jīng)典遺傳標記
            1.3.2.2 分子標記
        1.3.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析
    1.4 QTL定位
    1.5 本研究的立項依據(jù),主要研究內(nèi)容和技術(shù)路線
2. 材料與方法
    2.1 實驗材料
        2.1.1 作圖群體獲得
        2.1.2 實驗試劑
        2.1.3 實驗儀器設備
    2.2 實驗方法
        2.2.1 基因組DNA提取與檢測
        2.2.2 RAD文庫構(gòu)建
        2.2.3 上機測序
        2.2.4 RAD序列分析、標記檢測與過濾
            2.2.4.1 RAD序列分離和質(zhì)控
            2.2.4.2 標記檢測和過濾
            2.2.4.3 圖譜標記篩選
        2.2.5 連鎖群劃分及圖譜構(gòu)建
        2.2.6 基因組長度估算
        2.2.7 遺傳圖譜與物理圖譜共線性分析
        2.2.8 表型性狀調(diào)查
            2.2.8.1 株高和地徑
            2.2.8.2 葉面積
            2.2.8.3 抗寒性
        2.2.9 QTL定位
3. 結(jié)果與分析
    3.1 RAD測序結(jié)果分析
    3.2 標記開發(fā)與上圖標記篩選
    3.3 圖譜構(gòu)建
    3.4 遺傳圖譜與物理圖譜共線性
    3.5 作圖群體表型性狀統(tǒng)計分析
    3.6 QTL定位
4. 討論
    4.1. 親本選擇及作圖群體構(gòu)建
    4.2 作圖標記的開發(fā)
    4.3 棗樹高密度遺傳圖譜的構(gòu)建和應用
    4.4 遺傳圖譜與物理圖譜的比較
    4.5 棗樹重要性狀的QTL定位
5. 結(jié)論和展望
    5.1 主要結(jié)論
    5.2 存在問題和展望
參考文獻
附錄
個人簡介
導師簡介
致謝


【參考文獻】：
期刊論文
[1]棗組織培養(yǎng)及相關(guān)生物技術(shù)研究進展[J]. 趙寧,馮建燦,葉霞,譚彬,李繼東,鄭先波,齊賢,連曉東.  果樹學報. 2015(06)
[2]中國棗生產(chǎn)與科研成就及前沿進展[J]. 劉孟軍,王玖瑞,劉平,趙錦,趙智慧,代麗,李憲松,劉志國.  園藝學報. 2015(09)
[3]主要果樹果實品質(zhì)遺傳改良與提升實踐[J]. 陳學森,郭文武,徐娟,叢佩華,王力榮,劉崇懷,李秀根,吳樹敬,姚玉新,陳曉流.  中國農(nóng)業(yè)科學. 2015(17)
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[5]棗基因組的微衛(wèi)星特征[J]. 馬秋月,戴曉港,陳贏男,張得芳,廖卓毅,李淑嫻.  林業(yè)科學. 2013(12)
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[7]棗樹育種技術(shù)研究進展[J]. 李百云,魏天軍.  寧夏農(nóng)林科技. 2013(11)
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博士論文
[1]牡丹高密度遺傳圖譜構(gòu)建及重要性狀QTL分析[D]. 蔡長福.北京林業(yè)大學 2015
[2]梅花遺傳連鎖圖譜構(gòu)建和表型性狀QTLs分析[D]. 孫麗丹.北京林業(yè)大學 2013
[3]茶樹高密度遺傳圖譜構(gòu)建及重要性狀QTL定位[D]. 馬建強.中國農(nóng)業(yè)科學院 2013
[4]棗（Ziziphus jujuba Mill.）遺傳連鎖圖譜構(gòu)建及性狀的QTL定位研究[D]. 申連英.河北農(nóng)業(yè)大學 2005

碩士論文
[1]利用RAD-seq測序構(gòu)建美洲黑楊×小葉楊高密度遺傳連鎖圖譜[D]. 王瑩.南京林業(yè)大學 2014
[2]棗樹再生體系的建立及離體加倍的初步研究[D]. 金琪.北京林業(yè)大學 2014
[3]棗、酸棗離體培養(yǎng)研究[D]. 王艷.河北農(nóng)業(yè)大學 2011
[4]冬棗實生后代主要性狀遺傳變異規(guī)律及棗實生苗抗寒性研究[D]. 馬慶華.河北農(nóng)業(yè)大學 2004
[5]棗實生后代主要性狀遺傳變異規(guī)律的研究[D]. 李鵬麗.河北農(nóng)業(yè)大學 2003



本文編號：3229179