棗（Ziziphus jujuba Mill.2n=2x=24）,隸屬鼠李科（Rhamnaceae）棗屬（Ziziphus Mill.）,是我國(guó)重要的經(jīng)濟(jì)林樹種,在我國(guó)農(nóng)林業(yè)產(chǎn)業(yè)中占有重要地位。良種是棗產(chǎn)業(yè)持續(xù)健康發(fā)展的基礎(chǔ),目前,棗樹育種主要依賴常規(guī)育種,育種周期長(zhǎng),效率低。分子標(biāo)記輔助選擇能夠極大地提高育種效率,縮短育種周期,但是棗樹遺傳圖譜構(gòu)建和分子輔助選擇方面的研究明顯落后于其他果樹。本研究以99株‘冬棗’和‘映山紅’雜交F1子代為作圖群體,采用限制性酶切位點(diǎn)關(guān)聯(lián)DNA測(cè)序（RAD-seq）技術(shù),開發(fā)大量SNP標(biāo)記和InDel標(biāo)記,結(jié)合SSR標(biāo)記,構(gòu)建并優(yōu)化了棗樹高密度遺傳圖譜,并對(duì)棗樹生長(zhǎng)相關(guān)性狀以及抗寒性狀進(jìn)行了QTL定位分析。主要研究結(jié)果如下：1.將RAD-seq技術(shù)獲得的序列（-98.76 Gb clean reads）比對(duì)到參考基因組,通過一系列篩選過濾,最終得到符合孟德爾分離比的標(biāo)記7939個(gè),其中SNP標(biāo)記7026個(gè)和InDel標(biāo)記913個(gè)。2.將RAD技術(shù)所得標(biāo)記加入97個(gè)SSR標(biāo)記,采用“擬測(cè)交”策略進(jìn)行遺傳圖譜構(gòu)建。最終4669個(gè)標(biāo)記被定位到遺傳圖譜上,其中... 

【文章來源】：北京林業(yè)大學(xué)北京市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：75 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
引言
1. 文獻(xiàn)綜述
    1.1 棗產(chǎn)業(yè)現(xiàn)狀和育種目標(biāo)
    1.2 棗育種進(jìn)展
        1.2.1 野生資源的馴化利用和種質(zhì)資源調(diào)查
        1.2.2 常規(guī)育種
        1.2.3 生物技術(shù)育種
            1.2.3.1 離體培養(yǎng)的研究
            1.2.3.2 分子育種研究
    1.3 遺傳圖譜構(gòu)建
        1.3.1 作圖群體的創(chuàng)建
        1.3.2 遺傳標(biāo)記的選擇
            1.3.2.1 經(jīng)典遺傳標(biāo)記
            1.3.2.2 分子標(biāo)記
        1.3.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析
    1.4 QTL定位
    1.5 本研究的立項(xiàng)依據(jù),主要研究?jī)?nèi)容和技術(shù)路線
2. 材料與方法
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.1.1 作圖群體獲得
        2.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
        2.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器設(shè)備
    2.2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.2.1 基因組DNA提取與檢測(cè)
        2.2.2 RAD文庫構(gòu)建
        2.2.3 上機(jī)測(cè)序
        2.2.4 RAD序列分析、標(biāo)記檢測(cè)與過濾
            2.2.4.1 RAD序列分離和質(zhì)控
            2.2.4.2 標(biāo)記檢測(cè)和過濾
            2.2.4.3 圖譜標(biāo)記篩選
        2.2.5 連鎖群劃分及圖譜構(gòu)建
        2.2.6 基因組長(zhǎng)度估算
        2.2.7 遺傳圖譜與物理圖譜共線性分析
        2.2.8 表型性狀調(diào)查
            2.2.8.1 株高和地徑
            2.2.8.2 葉面積
            2.2.8.3 抗寒性
        2.2.9 QTL定位
3. 結(jié)果與分析
    3.1 RAD測(cè)序結(jié)果分析
    3.2 標(biāo)記開發(fā)與上圖標(biāo)記篩選
    3.3 圖譜構(gòu)建
    3.4 遺傳圖譜與物理圖譜共線性
    3.5 作圖群體表型性狀統(tǒng)計(jì)分析
    3.6 QTL定位
4. 討論
    4.1. 親本選擇及作圖群體構(gòu)建
    4.2 作圖標(biāo)記的開發(fā)
    4.3 棗樹高密度遺傳圖譜的構(gòu)建和應(yīng)用
    4.4 遺傳圖譜與物理圖譜的比較
    4.5 棗樹重要性狀的QTL定位
5. 結(jié)論和展望
    5.1 主要結(jié)論
    5.2 存在問題和展望
參考文獻(xiàn)
附錄
個(gè)人簡(jiǎn)介
導(dǎo)師簡(jiǎn)介
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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[2]梅花遺傳連鎖圖譜構(gòu)建和表型性狀QTLs分析[D]. 孫麗丹.北京林業(yè)大學(xué) 2013
[3]茶樹高密度遺傳圖譜構(gòu)建及重要性狀QTL定位[D]. 馬建強(qiáng).中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013
[4]棗（Ziziphus jujuba Mill.）遺傳連鎖圖譜構(gòu)建及性狀的QTL定位研究[D]. 申連英.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005

碩士論文
[1]利用RAD-seq測(cè)序構(gòu)建美洲黑楊×小葉楊高密度遺傳連鎖圖譜[D]. 王瑩.南京林業(yè)大學(xué) 2014
[2]棗樹再生體系的建立及離體加倍的初步研究[D]. 金琪.北京林業(yè)大學(xué) 2014
[3]棗、酸棗離體培養(yǎng)研究[D]. 王艷.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[4]冬棗實(shí)生后代主要性狀遺傳變異規(guī)律及棗實(shí)生苗抗寒性研究[D]. 馬慶華.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2004
[5]棗實(shí)生后代主要性狀遺傳變異規(guī)律的研究[D]. 李鵬麗.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003



本文編號(hào)：3229179