為了解黃秋葵抗南方根結(jié)線蟲相關(guān)基因組學(xué),利用Illumina Hi-seq TM2500高通量測序技術(shù)研究受南方根結(jié)線蟲侵染后黃秋葵種質(zhì)12C2轉(zhuǎn)錄組基因的差異表達。結(jié)果表明,接種南方根結(jié)線蟲18 h后,從接種和未接種的黃秋葵種質(zhì)12C2根尖中共獲得71.49 Gb有效數(shù)據(jù),Q30堿基百分比均達到94.0%以上。共獲得2 318個差異表達基因（DEGs）,包括1 156個上調(diào)基因,1 162個下調(diào)基因,其中功能注釋基因2 202個。根據(jù)unigene庫序列進行GO、KOG和KEGG注釋,細(xì)胞壁代謝相關(guān)基因——內(nèi)切葡聚糖酶基因家族、聚半乳糖醛酸酶基因家族、葡聚糖內(nèi)-1,3-β葡糖苷酶基因家族和果膠裂解酶基因家族下調(diào)表達,植物激素代謝相關(guān)基因——生長素響應(yīng)蛋白基因、生長素流入運輸載體基因下調(diào)表達,茉莉酸合成酶基因上調(diào)表達,調(diào)控相關(guān)基因表達的WRKY和MYB轉(zhuǎn)錄因子基因家族上調(diào)表達,參與植物細(xì)胞的膜聯(lián)蛋白基因家族上調(diào)表達,植物細(xì)胞周期蛋白基因家族下調(diào)表達。本研究結(jié)果為開展黃秋葵抗南方根結(jié)線蟲基因組學(xué)和分子生物學(xué)研究奠定了基礎(chǔ)。 

【文章來源】：核農(nóng)學(xué)報. 2020,34(12)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：9 頁

【部分圖文】：

差異表達基因KOG功能注釋

【參考文獻】：
期刊論文
[1]黃秋葵根結(jié)線蟲病的病原鑒定[J]. 練冬梅,賴正鋒,姚運法,洪建基.  福建農(nóng)業(yè)科技. 2019(03)
[2]黃秋葵花和果莢轉(zhuǎn)錄組測序及類黃酮代謝差異表達分析[J]. 姚運法,張少平,練冬梅,賴正鋒,黃慧明,洪建基.  西北植物學(xué)報. 2018(11)
[3]超聲波輔助提取秋葵果膠工藝優(yōu)化及理化性質(zhì)分析[J]. 吳劍夫,程安瑋,孫金月,祝霞.  核農(nóng)學(xué)報. 2018(10)
[4]紫色黃秋葵轉(zhuǎn)錄組功能基因測序及分析[J]. 張少平,邱珊蓮,鄭云云,張帥,吳松海,何炎森,鄭開斌.  核農(nóng)學(xué)報. 2017(04)
[5]植物膜聯(lián)蛋白基因研究進展[J]. 王立科,張邊江,唐寧,楊平,周峰,陳全戰(zhàn).  分子植物育種. 2016(08)
[6]非模式生物轉(zhuǎn)錄組研究[J]. 劉紅亮,鄭麗明,劉青青,權(quán)富生,張涌.  遺傳. 2013(08)
[7]茉莉酸合成相關(guān)基因Spr2與LePrs在番茄抗根結(jié)線蟲中的作用[J]. 張立寧,程繼鴻,楊瑞,孫中華,吳春霞,王紹輝.  中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(19)
[8]黃秋葵的應(yīng)用價值及栽培技術(shù)研究進展[J]. 劉東祥,葉花蘭,劉國道.  安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2006(15)

博士論文
[1]煙草對南方根結(jié)線蟲抗性機理研究[D]. 邢雪霞.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]辣椒與根結(jié)線蟲不親和互作相關(guān)基因的分離及功能分析[D]. 茆振川.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2007



本文編號：3208546