甜瓜農(nóng)藝性狀與SSR標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析和特異材料的遺傳構(gòu)成
發(fā)布時間:2021-05-11 16:59
甜瓜種質(zhì)資源極其豐富,表型變異也極為廣泛,了解這些性狀的遺傳規(guī)律能夠指導(dǎo)甜瓜育種。分子標(biāo)記和生物信息學(xué)方法被廣泛應(yīng)用于圖譜構(gòu)建、遺傳多樣性分析和基因定位等方面,在當(dāng)前甜瓜育種中有較大的應(yīng)用空間和潛力。本研究利用62個SSR標(biāo)記對甜瓜材料的8個農(nóng)藝性狀進行關(guān)聯(lián)分析,挖掘出了與甜瓜農(nóng)藝性狀相關(guān)聯(lián)的標(biāo)記位點。另外通過序列比對,開發(fā)出了與甜瓜果肉顏色緊密連鎖的InDel分子標(biāo)記。本文旨在探尋和開發(fā)可應(yīng)用于甜瓜育種中的功能型分子標(biāo)記,以實現(xiàn)對甜瓜性狀的預(yù)測以及快速篩選,達到精確育種的目標(biāo)。主要研究內(nèi)容及結(jié)果如下:1.對144份甜瓜材料3個季度的16個農(nóng)藝性狀表型數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn),甜瓜性狀變異極其豐富。其中8個質(zhì)量性狀多樣性變化范圍為0.362.29,平均值為1.16;8個數(shù)量性狀的變異系數(shù)范圍為10.0%49.0%,其中平均單瓜重的變異系數(shù)最大。三個季度平均單瓜重平均值的變化范圍為25.671937.33 g,平均值為910.84 g,其變幅最大為74.5倍。結(jié)果表明材料群體具有豐富的表型變異。2.選取遺傳多樣性較高的8個性狀,在14...
【文章來源】:天津大學(xué)天津市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:86 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第1章 緒論
1.1 甜瓜的特性
1.1.1 甜瓜的起源和分類
1.1.2 甜瓜的遺傳多樣性
1.2 甜瓜相關(guān)性狀遺傳研究進展
1.3 關(guān)聯(lián)分析
1.3.1 關(guān)聯(lián)分析的原理和策略
1.3.2 關(guān)聯(lián)分析的基礎(chǔ)—連鎖不平衡
1.3.3 關(guān)聯(lián)分析在作物中的研究進展
1.4 分子標(biāo)記
1.4.1 SSR標(biāo)記技術(shù)及應(yīng)用
1.4.2 InDel標(biāo)記技術(shù)及應(yīng)用
1.4.3 SNP標(biāo)記及應(yīng)用
1.4.4 分子標(biāo)記在甜瓜育種中的研究進展
1.5 研究內(nèi)容及目的和意義
1.5.1 研究內(nèi)容
1.5.2 研究目的和意義
1.5.3 技術(shù)路線
第2章 甜瓜重要性狀與分子標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析
2.1 材料與方法
2.1.1 實驗材料
2.1.2 表型性狀調(diào)查及變異分析
2.1.3 DNA提取及檢測
2.1.4 SSR標(biāo)記全基因組掃描
2.1.5 SSR標(biāo)記遺傳多樣性分析
2.1.6 SSR標(biāo)記與甜瓜農(nóng)藝性狀關(guān)聯(lián)分析
2.1.7 優(yōu)異等位變異挖掘和特異材料分析
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 甜瓜表型性狀遺傳多樣性分析
2.2.2 SSR標(biāo)記多樣性分析
2.2.3 基于遺傳距離的聚類分析
2.2.4 群體結(jié)構(gòu)分析
2.2.5 連鎖不平衡分析
2.2.6 SSR標(biāo)記對性狀關(guān)聯(lián)分析
2.2.7 部分性狀關(guān)聯(lián)位點等位變異表型效應(yīng)及特異性材料分析
2.3 討論
第3章 甜瓜果肉和果皮顏色相關(guān)分子標(biāo)記的開發(fā)和應(yīng)用
3.1 甜瓜果肉顏色相關(guān)分子標(biāo)記InDel-Or1 的開發(fā)及應(yīng)用
3.1.1 材料與方法
3.1.2 結(jié)果與分析
3.1.3 討論
3.2 甜瓜果皮顏色相關(guān)分子標(biāo)記的驗證
3.2.1 材料與方法
3.2.2 結(jié)果與分析
3.2.3 討論
第4章 全文結(jié)論
參考文獻
附錄
發(fā)表論文和參加科研情況說明
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]芝麻SNP和InDel標(biāo)記遺傳多樣性、群體結(jié)構(gòu)及連鎖不平衡分析[J]. 魏利斌,苗紅梅,李春,段迎輝,徐芳芳,張海洋. 分子植物育種. 2017(08)
[2]甜瓜果實相關(guān)性狀QTL分析[J]. 欒非時,矯士琦,盛云燕,朱子成. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2017(03)
[3]甜瓜果實性狀遺傳規(guī)律的研究進展[J]. 于翠香,韓忠才,王占海,張海燕,楊貴春. 東北農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(03)
[4]InDel標(biāo)記的研究和應(yīng)用進展[J]. 楊潔,赫佳,王丹碧,施恩,楊文宇,耿其芳,王中生. 生物多樣性. 2016(02)
[5]基于SSR標(biāo)記的板栗地方品種遺傳多樣性與關(guān)聯(lián)分析[J]. 江錫兵,湯丹,龔榜初,賴俊聲. 園藝學(xué)報. 2015(12)
[6]甜瓜果實顏色3個質(zhì)量性狀基因的定位[J]. 楊光華,范榮,楊小鋒,侯軍亮,袁士臣,曹明,王學(xué)林,李勁松. 園藝學(xué)報. 2014(05)
[7]橙色果肉甜瓜β-胡蘿卜素積累的分子機理[J]. 趙軍林,于喜艷,王秀峰. 山東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(05)
[8]甜瓜地方品種6個產(chǎn)量相關(guān)性狀與SSR標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析[J]. 蘇艷,胡建斌,黃松,王盼喬,李瓊. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2013(11)
[9]甜瓜果實相關(guān)性狀QTL分析[J]. 張雪嬌,高鵬,欒非時. 中國蔬菜. 2013(18)
[10]中國甜瓜種質(zhì)資源形態(tài)性狀遺傳多樣性分析[J]. 胡建斌,馬雙武,簡在海,王吉明,李瓊,蘇艷. 植物遺傳資源學(xué)報. 2013(04)
博士論文
[1]黃瓜種質(zhì)遺傳多樣性的形態(tài)和分子評價及其親緣關(guān)系研究[D]. 李錫香.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2002
本文編號:3181771
【文章來源】:天津大學(xué)天津市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:86 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第1章 緒論
1.1 甜瓜的特性
1.1.1 甜瓜的起源和分類
1.1.2 甜瓜的遺傳多樣性
1.2 甜瓜相關(guān)性狀遺傳研究進展
1.3 關(guān)聯(lián)分析
1.3.1 關(guān)聯(lián)分析的原理和策略
1.3.2 關(guān)聯(lián)分析的基礎(chǔ)—連鎖不平衡
1.3.3 關(guān)聯(lián)分析在作物中的研究進展
1.4 分子標(biāo)記
1.4.1 SSR標(biāo)記技術(shù)及應(yīng)用
1.4.2 InDel標(biāo)記技術(shù)及應(yīng)用
1.4.3 SNP標(biāo)記及應(yīng)用
1.4.4 分子標(biāo)記在甜瓜育種中的研究進展
1.5 研究內(nèi)容及目的和意義
1.5.1 研究內(nèi)容
1.5.2 研究目的和意義
1.5.3 技術(shù)路線
第2章 甜瓜重要性狀與分子標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析
2.1 材料與方法
2.1.1 實驗材料
2.1.2 表型性狀調(diào)查及變異分析
2.1.3 DNA提取及檢測
2.1.4 SSR標(biāo)記全基因組掃描
2.1.5 SSR標(biāo)記遺傳多樣性分析
2.1.6 SSR標(biāo)記與甜瓜農(nóng)藝性狀關(guān)聯(lián)分析
2.1.7 優(yōu)異等位變異挖掘和特異材料分析
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 甜瓜表型性狀遺傳多樣性分析
2.2.2 SSR標(biāo)記多樣性分析
2.2.3 基于遺傳距離的聚類分析
2.2.4 群體結(jié)構(gòu)分析
2.2.5 連鎖不平衡分析
2.2.6 SSR標(biāo)記對性狀關(guān)聯(lián)分析
2.2.7 部分性狀關(guān)聯(lián)位點等位變異表型效應(yīng)及特異性材料分析
2.3 討論
第3章 甜瓜果肉和果皮顏色相關(guān)分子標(biāo)記的開發(fā)和應(yīng)用
3.1 甜瓜果肉顏色相關(guān)分子標(biāo)記InDel-Or1 的開發(fā)及應(yīng)用
3.1.1 材料與方法
3.1.2 結(jié)果與分析
3.1.3 討論
3.2 甜瓜果皮顏色相關(guān)分子標(biāo)記的驗證
3.2.1 材料與方法
3.2.2 結(jié)果與分析
3.2.3 討論
第4章 全文結(jié)論
參考文獻
附錄
發(fā)表論文和參加科研情況說明
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]芝麻SNP和InDel標(biāo)記遺傳多樣性、群體結(jié)構(gòu)及連鎖不平衡分析[J]. 魏利斌,苗紅梅,李春,段迎輝,徐芳芳,張海洋. 分子植物育種. 2017(08)
[2]甜瓜果實相關(guān)性狀QTL分析[J]. 欒非時,矯士琦,盛云燕,朱子成. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2017(03)
[3]甜瓜果實性狀遺傳規(guī)律的研究進展[J]. 于翠香,韓忠才,王占海,張海燕,楊貴春. 東北農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(03)
[4]InDel標(biāo)記的研究和應(yīng)用進展[J]. 楊潔,赫佳,王丹碧,施恩,楊文宇,耿其芳,王中生. 生物多樣性. 2016(02)
[5]基于SSR標(biāo)記的板栗地方品種遺傳多樣性與關(guān)聯(lián)分析[J]. 江錫兵,湯丹,龔榜初,賴俊聲. 園藝學(xué)報. 2015(12)
[6]甜瓜果實顏色3個質(zhì)量性狀基因的定位[J]. 楊光華,范榮,楊小鋒,侯軍亮,袁士臣,曹明,王學(xué)林,李勁松. 園藝學(xué)報. 2014(05)
[7]橙色果肉甜瓜β-胡蘿卜素積累的分子機理[J]. 趙軍林,于喜艷,王秀峰. 山東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(05)
[8]甜瓜地方品種6個產(chǎn)量相關(guān)性狀與SSR標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析[J]. 蘇艷,胡建斌,黃松,王盼喬,李瓊. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2013(11)
[9]甜瓜果實相關(guān)性狀QTL分析[J]. 張雪嬌,高鵬,欒非時. 中國蔬菜. 2013(18)
[10]中國甜瓜種質(zhì)資源形態(tài)性狀遺傳多樣性分析[J]. 胡建斌,馬雙武,簡在海,王吉明,李瓊,蘇艷. 植物遺傳資源學(xué)報. 2013(04)
博士論文
[1]黃瓜種質(zhì)遺傳多樣性的形態(tài)和分子評價及其親緣關(guān)系研究[D]. 李錫香.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2002
本文編號:3181771
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