香蕉Aux/IAA家族鑒定及其在P.indica誘導(dǎo)的FocTR4抗性中的表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-04-26 02:16
香蕉(Musa spp.)是世界四大水果之一,不斷惡化的自然環(huán)境(干旱、鹽堿、熱脅迫、寒潮等等)和病蟲(chóng)害是近些年香蕉產(chǎn)業(yè)發(fā)展的主要限制因素,其中病原為尖孢鐮刀菌古巴;4號(hào)生理小種(Fusarium oxysporum f.sp.cubense Tropical Race 4,FocTR4)的香蕉枯萎病影響最為嚴(yán)重。改良現(xiàn)有品種和選育產(chǎn)量高、風(fēng)味好且抗逆的香蕉新品種是最根本的解決辦法,而香蕉栽培種大多為三倍體,常規(guī)雜交育種存在一定障礙,所以轉(zhuǎn)基因育種是未來(lái)香蕉育種的重要途徑,挖掘抗逆基因是第一步。印度梨形孢(Piriformospora indica,P.indica)是近些年來(lái)被定殖于多種植物以增強(qiáng)植株本身抗逆能力的類叢枝菌根真菌。前期研究發(fā)現(xiàn)定殖P.indica的‘天寶蕉’相對(duì)于無(wú)定殖植株在感染FocTR4后一定程度上延緩了其病情發(fā)展。已有研究表明FocTR4和P.indica對(duì)植物體生長(zhǎng)素具有較大影響,在此前提下,本研究開(kāi)展了在枯萎病菌侵染兩個(gè)月時(shí)四組實(shí)驗(yàn)組處理[無(wú)任何處理的對(duì)照組(CK)、P.indica定殖組(P+)、P.indica定殖和FocTR4侵染組(PF)、Foc...
【文章來(lái)源】:福建農(nóng)林大學(xué)福建省
【文章頁(yè)數(shù)】:97 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
縮寫(xiě)詞
摘要
ABSTRACT
第一章 引言
1 Aux/IAA基因家族研究現(xiàn)狀
1.1 Aux/IAA家族基因編碼蛋白結(jié)構(gòu)特征
1.2 Aux/IAA基因家族與植物生長(zhǎng)發(fā)育
1.3 Aux/IAA基因家族與植物抗逆
1.3.1 Aux/IAA基因家族與非生物脅迫
1.3.2 Aux/IAA基因家族與生物脅迫
2 香蕉枯萎病防控和抗病育種研究現(xiàn)狀
2.1 香蕉枯萎病的防治
2.1.1 化學(xué)防治
2.1.2 生物防治
2.1.3 輪作與套種
2.1.4 綜合防控
2.2 抗枯萎病香蕉育種
2.2.1 誘變育種
2.2.2 芽變選種
2.2.3 組培苗突變體篩選育種
2.2.4 選擇育種
2.2.5 常規(guī)雜交育種
2.2.6 遺傳改良轉(zhuǎn)基因育種
2.3 香蕉抗病基因和枯萎病菌致病基因的挖掘
2.3.1 香蕉抗病基因的挖掘
2.3.2 枯萎病菌致病相關(guān)基因的挖掘
3 P.indica增強(qiáng)植物抗病性研究現(xiàn)狀
4 本研究的意義及主要內(nèi)容
4.1 研究意義
4.2 主要研究?jī)?nèi)容
第二章 P.indica和FocTR4對(duì)香蕉生長(zhǎng)素含量及部分生長(zhǎng)素相關(guān)基因表達(dá)的影響分析
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 植物材料
1.1.2 試劑
1.2 方法
1.2.1 植物材料處理
1.2.2 生長(zhǎng)素含量測(cè)定
1.2.3 RNA提取和定量反轉(zhuǎn)錄
1.2.4 生長(zhǎng)素相關(guān)基因的選擇
1.2.5 實(shí)時(shí)定量PCR
2 結(jié)果與分析
2.1 FocTR4侵染兩個(gè)月后四組樣品表型觀察
2.2 四組樣品生長(zhǎng)素含量測(cè)定
2.3 生長(zhǎng)素相關(guān)基因的表達(dá)分析
3 討論
第三章 香蕉Aux/IAA基因家族成員鑒定、生物信息學(xué)分析及密碼子偏好性分析
第一節(jié) 香蕉Aux/IAA基因家族成員鑒定和生物信息學(xué)分析
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
1.2.1 數(shù)據(jù)庫(kù)檢索和理化性質(zhì)分析
1.2.2 系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系分析
1.2.3 基因結(jié)構(gòu)分析
1.2.4 染色體定位
1.2.5 保守基序分析
1.2.6 可變剪切驗(yàn)證
2 結(jié)果與分析
2.1 香蕉Aux/IAA家族成員基本信息、蛋白理化性質(zhì)分析
2.2 系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系分析
2.3 香蕉Aux/IAA家族成員基因結(jié)構(gòu)分析
2.4 染色體定位分析結(jié)果
2.5 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域和保守基序分析
2.6 可變剪切驗(yàn)證結(jié)果
3 討論
3.1 香蕉Aux/IAA基因家族成員較多且存在可變剪切現(xiàn)象
3.2 保守結(jié)構(gòu)域和基序與Aux/IAA定位及功能相關(guān)
第二節(jié) 香蕉Aux/IAA基因家族密碼子偏好性分析
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2 結(jié)果與分析
2.1 香蕉Aux/IAA基因家族的ENC和 GC分析
2.2 同義密碼子相對(duì)使用度(RSCU)分析
2.3 最優(yōu)密碼子的確定
2.4 香蕉Aux/IAA基因家族成員堿基組成分析
2.5 香蕉Aux/IAA基因家族成員受體系統(tǒng)選擇
3 討論
3.1 香蕉Aux/IAA基因家族密碼子偏好性分析
3.2 香蕉Aux/IAA基因家族密碼子偏好性的影響因素
3.3 香蕉Aux/IAA基因家族成員受體系統(tǒng)選擇
第四章 香蕉Aux/IAA基因家族成員啟動(dòng)子順式作用元件預(yù)測(cè)與部分成員定量表達(dá)分析
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2 結(jié)果與分析
3 討論
第五章 香蕉Aux/IAA家族部分成員在P.indica誘導(dǎo)的FocTR4抗性中的表達(dá)分析
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2 結(jié)果與分析
3 討論
第六章 成員MaIAA25、MaIAA31亞細(xì)胞定位分析
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 植物材料
1.1.2 載體和菌種
1.1.3 試劑
1.1.4 培養(yǎng)基
1.2 方法
1.2.1 引物設(shè)計(jì)和PCR擴(kuò)增
1.2.2 單酶切和目的片段回收
1.2.3 重組載體構(gòu)建和大腸桿菌轉(zhuǎn)化
1.2.4 農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化和鑒定
1.2.5 農(nóng)桿菌介導(dǎo)法侵染洋蔥表皮細(xì)胞及顯微觀察
2 結(jié)果與分析
3 討論
第七章 結(jié)論與展望
1 結(jié)論
1.1 P.indica和FocTR4對(duì)香蕉生長(zhǎng)素含量及部分生長(zhǎng)素相關(guān)基因表達(dá)的影響分析
1.2 香蕉Aux/IAA家族成員鑒定、生物信息學(xué)分析及密碼子偏好性分析
1.2.1 香蕉Aux/IAA家族成員鑒定和生物信息學(xué)分析
1.2.2 香蕉Aux/IAA家族成員密碼子偏好性分析
1.3 香蕉Aux/IAA基因家族成員啟動(dòng)子順式作用元件預(yù)測(cè)與部分成員定量表達(dá)分析
1.4 香蕉Aux/IAA家族部分成員在P.indica誘導(dǎo)的FocTR4抗性中的表達(dá)分析
1.5 成員MaIAA25、MaIAA31亞細(xì)胞定位分析
2 展望
參考文獻(xiàn)
在學(xué)碩士期間發(fā)表學(xué)術(shù)論文與研究成果
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]施用淡紫擬青霉與套作對(duì)香蕉枯萎病控病作用的影響[J]. 汪軍,王國(guó)芬,楊臘英,郭立佳,潘江禹,毛超,戴青冬,黃俊生. 果樹(shù)學(xué)報(bào). 2013(05)
[2]菌株BM-24的分離鑒定及對(duì)香蕉枯萎病菌的抑菌活性[J]. 黃霄,陳波,周登博,譚昕,張錫炎. 植物保護(hù)學(xué)報(bào). 2013(02)
[3]不同藥劑防治香蕉枯萎病效果評(píng)價(jià)[J]. 郭立佳,楊臘英,彭軍,王國(guó)芬,梁昌聰,劉磊,黃俊生. 中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2013(01)
[4]香蕉枯萎病生防菌AF11的鑒定及其定殖研究[J]. 胡偉,趙蘭鳳,張亮,楊江舟,張靜,李華興. 中國(guó)生物防治學(xué)報(bào). 2012(03)
[5]茶樹(shù)抗寒調(diào)控轉(zhuǎn)錄因子ICE1密碼子偏性分析[J]. 時(shí)慧,王玉,楊路成,丁兆堂. 園藝學(xué)報(bào). 2012(07)
[6]改性石灰氮防治香蕉枯萎病及其恢復(fù)香蕉生產(chǎn)的效果[J]. 杜志勇,樊小林. 果樹(shù)學(xué)報(bào). 2008(03)
[7]密碼子偏性的分析方法及相關(guān)研究進(jìn)展[J]. 吳憲明,吳松鋒,任大明,朱云平,賀福初. 遺傳. 2007(04)
[8]抗枯萎病香蕉新品系農(nóng)科1號(hào)的選育[J]. 劉紹欽,梁張慧,黃熾輝,黃玉香. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2007(01)
[9]香蕉枯萎病及其防治研究進(jìn)展[J]. 王振中. 中國(guó)植保導(dǎo)刊. 2006(07)
[10]香蕉受枯萎病菌侵染后內(nèi)源激素含量的變化[J]. 唐倩菲,楊媚,周而勛,敖世恩,姜子德,陳厚彬. 華南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2006(02)
博士論文
[1]香蕉SOD基因家族的全基因組鑒定及功能分析[D]. 馮新.福建農(nóng)林大學(xué) 2016
[2]復(fù)合拮抗菌發(fā)酵液對(duì)香蕉枯萎病及土壤微生物區(qū)系的影響[D]. 周登博.海南大學(xué) 2013
[3]水稻組織特異表達(dá)啟動(dòng)子的分離克隆、功能分析及應(yīng)用[D]. 葉榮建.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
碩士論文
[1]單子葉植物基因組結(jié)構(gòu)和功能的比較基因組研究[D]. 于佳祥.華北理工大學(xué) 2016
[2]玉米苗期干旱脅迫下可變剪接及其調(diào)控因子的研究[D]. 李嬌.鄭州大學(xué) 2013
[3]香蕉枯萎病拮抗芽孢桿菌的篩選及其定殖特性研究[D]. 朱利林.海南大學(xué) 2012
[4]香蕉與枯萎病病程相關(guān)基因的鑒定[D]. 鄭雯.海南大學(xué) 2010
本文編號(hào):3160535
【文章來(lái)源】:福建農(nóng)林大學(xué)福建省
【文章頁(yè)數(shù)】:97 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
縮寫(xiě)詞
摘要
ABSTRACT
第一章 引言
1 Aux/IAA基因家族研究現(xiàn)狀
1.1 Aux/IAA家族基因編碼蛋白結(jié)構(gòu)特征
1.2 Aux/IAA基因家族與植物生長(zhǎng)發(fā)育
1.3 Aux/IAA基因家族與植物抗逆
1.3.1 Aux/IAA基因家族與非生物脅迫
1.3.2 Aux/IAA基因家族與生物脅迫
2 香蕉枯萎病防控和抗病育種研究現(xiàn)狀
2.1 香蕉枯萎病的防治
2.1.1 化學(xué)防治
2.1.2 生物防治
2.1.3 輪作與套種
2.1.4 綜合防控
2.2 抗枯萎病香蕉育種
2.2.1 誘變育種
2.2.2 芽變選種
2.2.3 組培苗突變體篩選育種
2.2.4 選擇育種
2.2.5 常規(guī)雜交育種
2.2.6 遺傳改良轉(zhuǎn)基因育種
2.3 香蕉抗病基因和枯萎病菌致病基因的挖掘
2.3.1 香蕉抗病基因的挖掘
2.3.2 枯萎病菌致病相關(guān)基因的挖掘
3 P.indica增強(qiáng)植物抗病性研究現(xiàn)狀
4 本研究的意義及主要內(nèi)容
4.1 研究意義
4.2 主要研究?jī)?nèi)容
第二章 P.indica和FocTR4對(duì)香蕉生長(zhǎng)素含量及部分生長(zhǎng)素相關(guān)基因表達(dá)的影響分析
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 植物材料
1.1.2 試劑
1.2 方法
1.2.1 植物材料處理
1.2.2 生長(zhǎng)素含量測(cè)定
1.2.3 RNA提取和定量反轉(zhuǎn)錄
1.2.4 生長(zhǎng)素相關(guān)基因的選擇
1.2.5 實(shí)時(shí)定量PCR
2 結(jié)果與分析
2.1 FocTR4侵染兩個(gè)月后四組樣品表型觀察
2.2 四組樣品生長(zhǎng)素含量測(cè)定
2.3 生長(zhǎng)素相關(guān)基因的表達(dá)分析
3 討論
第三章 香蕉Aux/IAA基因家族成員鑒定、生物信息學(xué)分析及密碼子偏好性分析
第一節(jié) 香蕉Aux/IAA基因家族成員鑒定和生物信息學(xué)分析
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
1.2.1 數(shù)據(jù)庫(kù)檢索和理化性質(zhì)分析
1.2.2 系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系分析
1.2.3 基因結(jié)構(gòu)分析
1.2.4 染色體定位
1.2.5 保守基序分析
1.2.6 可變剪切驗(yàn)證
2 結(jié)果與分析
2.1 香蕉Aux/IAA家族成員基本信息、蛋白理化性質(zhì)分析
2.2 系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系分析
2.3 香蕉Aux/IAA家族成員基因結(jié)構(gòu)分析
2.4 染色體定位分析結(jié)果
2.5 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域和保守基序分析
2.6 可變剪切驗(yàn)證結(jié)果
3 討論
3.1 香蕉Aux/IAA基因家族成員較多且存在可變剪切現(xiàn)象
3.2 保守結(jié)構(gòu)域和基序與Aux/IAA定位及功能相關(guān)
第二節(jié) 香蕉Aux/IAA基因家族密碼子偏好性分析
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2 結(jié)果與分析
2.1 香蕉Aux/IAA基因家族的ENC和 GC分析
2.2 同義密碼子相對(duì)使用度(RSCU)分析
2.3 最優(yōu)密碼子的確定
2.4 香蕉Aux/IAA基因家族成員堿基組成分析
2.5 香蕉Aux/IAA基因家族成員受體系統(tǒng)選擇
3 討論
3.1 香蕉Aux/IAA基因家族密碼子偏好性分析
3.2 香蕉Aux/IAA基因家族密碼子偏好性的影響因素
3.3 香蕉Aux/IAA基因家族成員受體系統(tǒng)選擇
第四章 香蕉Aux/IAA基因家族成員啟動(dòng)子順式作用元件預(yù)測(cè)與部分成員定量表達(dá)分析
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2 結(jié)果與分析
3 討論
第五章 香蕉Aux/IAA家族部分成員在P.indica誘導(dǎo)的FocTR4抗性中的表達(dá)分析
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2 結(jié)果與分析
3 討論
第六章 成員MaIAA25、MaIAA31亞細(xì)胞定位分析
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 植物材料
1.1.2 載體和菌種
1.1.3 試劑
1.1.4 培養(yǎng)基
1.2 方法
1.2.1 引物設(shè)計(jì)和PCR擴(kuò)增
1.2.2 單酶切和目的片段回收
1.2.3 重組載體構(gòu)建和大腸桿菌轉(zhuǎn)化
1.2.4 農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化和鑒定
1.2.5 農(nóng)桿菌介導(dǎo)法侵染洋蔥表皮細(xì)胞及顯微觀察
2 結(jié)果與分析
3 討論
第七章 結(jié)論與展望
1 結(jié)論
1.1 P.indica和FocTR4對(duì)香蕉生長(zhǎng)素含量及部分生長(zhǎng)素相關(guān)基因表達(dá)的影響分析
1.2 香蕉Aux/IAA家族成員鑒定、生物信息學(xué)分析及密碼子偏好性分析
1.2.1 香蕉Aux/IAA家族成員鑒定和生物信息學(xué)分析
1.2.2 香蕉Aux/IAA家族成員密碼子偏好性分析
1.3 香蕉Aux/IAA基因家族成員啟動(dòng)子順式作用元件預(yù)測(cè)與部分成員定量表達(dá)分析
1.4 香蕉Aux/IAA家族部分成員在P.indica誘導(dǎo)的FocTR4抗性中的表達(dá)分析
1.5 成員MaIAA25、MaIAA31亞細(xì)胞定位分析
2 展望
參考文獻(xiàn)
在學(xué)碩士期間發(fā)表學(xué)術(shù)論文與研究成果
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]施用淡紫擬青霉與套作對(duì)香蕉枯萎病控病作用的影響[J]. 汪軍,王國(guó)芬,楊臘英,郭立佳,潘江禹,毛超,戴青冬,黃俊生. 果樹(shù)學(xué)報(bào). 2013(05)
[2]菌株BM-24的分離鑒定及對(duì)香蕉枯萎病菌的抑菌活性[J]. 黃霄,陳波,周登博,譚昕,張錫炎. 植物保護(hù)學(xué)報(bào). 2013(02)
[3]不同藥劑防治香蕉枯萎病效果評(píng)價(jià)[J]. 郭立佳,楊臘英,彭軍,王國(guó)芬,梁昌聰,劉磊,黃俊生. 中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2013(01)
[4]香蕉枯萎病生防菌AF11的鑒定及其定殖研究[J]. 胡偉,趙蘭鳳,張亮,楊江舟,張靜,李華興. 中國(guó)生物防治學(xué)報(bào). 2012(03)
[5]茶樹(shù)抗寒調(diào)控轉(zhuǎn)錄因子ICE1密碼子偏性分析[J]. 時(shí)慧,王玉,楊路成,丁兆堂. 園藝學(xué)報(bào). 2012(07)
[6]改性石灰氮防治香蕉枯萎病及其恢復(fù)香蕉生產(chǎn)的效果[J]. 杜志勇,樊小林. 果樹(shù)學(xué)報(bào). 2008(03)
[7]密碼子偏性的分析方法及相關(guān)研究進(jìn)展[J]. 吳憲明,吳松鋒,任大明,朱云平,賀福初. 遺傳. 2007(04)
[8]抗枯萎病香蕉新品系農(nóng)科1號(hào)的選育[J]. 劉紹欽,梁張慧,黃熾輝,黃玉香. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2007(01)
[9]香蕉枯萎病及其防治研究進(jìn)展[J]. 王振中. 中國(guó)植保導(dǎo)刊. 2006(07)
[10]香蕉受枯萎病菌侵染后內(nèi)源激素含量的變化[J]. 唐倩菲,楊媚,周而勛,敖世恩,姜子德,陳厚彬. 華南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2006(02)
博士論文
[1]香蕉SOD基因家族的全基因組鑒定及功能分析[D]. 馮新.福建農(nóng)林大學(xué) 2016
[2]復(fù)合拮抗菌發(fā)酵液對(duì)香蕉枯萎病及土壤微生物區(qū)系的影響[D]. 周登博.海南大學(xué) 2013
[3]水稻組織特異表達(dá)啟動(dòng)子的分離克隆、功能分析及應(yīng)用[D]. 葉榮建.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
碩士論文
[1]單子葉植物基因組結(jié)構(gòu)和功能的比較基因組研究[D]. 于佳祥.華北理工大學(xué) 2016
[2]玉米苗期干旱脅迫下可變剪接及其調(diào)控因子的研究[D]. 李嬌.鄭州大學(xué) 2013
[3]香蕉枯萎病拮抗芽孢桿菌的篩選及其定殖特性研究[D]. 朱利林.海南大學(xué) 2012
[4]香蕉與枯萎病病程相關(guān)基因的鑒定[D]. 鄭雯.海南大學(xué) 2010
本文編號(hào):3160535
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