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香蕉Aux/IAA家族鑒定及其在P.indica誘導(dǎo)的FocTR4抗性中的表達分析

發(fā)布時間:2021-04-26 02:16
  香蕉(Musa spp.)是世界四大水果之一,不斷惡化的自然環(huán)境(干旱、鹽堿、熱脅迫、寒潮等等)和病蟲害是近些年香蕉產(chǎn)業(yè)發(fā)展的主要限制因素,其中病原為尖孢鐮刀菌古巴;4號生理小種(Fusarium oxysporum f.sp.cubense Tropical Race 4,FocTR4)的香蕉枯萎病影響最為嚴(yán)重。改良現(xiàn)有品種和選育產(chǎn)量高、風(fēng)味好且抗逆的香蕉新品種是最根本的解決辦法,而香蕉栽培種大多為三倍體,常規(guī)雜交育種存在一定障礙,所以轉(zhuǎn)基因育種是未來香蕉育種的重要途徑,挖掘抗逆基因是第一步。印度梨形孢(Piriformospora indica,P.indica)是近些年來被定殖于多種植物以增強植株本身抗逆能力的類叢枝菌根真菌。前期研究發(fā)現(xiàn)定殖P.indica的‘天寶蕉’相對于無定殖植株在感染FocTR4后一定程度上延緩了其病情發(fā)展。已有研究表明FocTR4和P.indica對植物體生長素具有較大影響,在此前提下,本研究開展了在枯萎病菌侵染兩個月時四組實驗組處理[無任何處理的對照組(CK)、P.indica定殖組(P+)、P.indica定殖和FocTR4侵染組(PF)、Foc... 

【文章來源】:福建農(nóng)林大學(xué)福建省

【文章頁數(shù)】:97 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【文章目錄】:
縮寫詞
摘要
ABSTRACT
第一章 引言
    1 Aux/IAA基因家族研究現(xiàn)狀
        1.1 Aux/IAA家族基因編碼蛋白結(jié)構(gòu)特征
        1.2 Aux/IAA基因家族與植物生長發(fā)育
        1.3 Aux/IAA基因家族與植物抗逆
            1.3.1 Aux/IAA基因家族與非生物脅迫
            1.3.2 Aux/IAA基因家族與生物脅迫
    2 香蕉枯萎病防控和抗病育種研究現(xiàn)狀
        2.1 香蕉枯萎病的防治
            2.1.1 化學(xué)防治
            2.1.2 生物防治
            2.1.3 輪作與套種
            2.1.4 綜合防控
        2.2 抗枯萎病香蕉育種
            2.2.1 誘變育種
            2.2.2 芽變選種
            2.2.3 組培苗突變體篩選育種
            2.2.4 選擇育種
            2.2.5 常規(guī)雜交育種
            2.2.6 遺傳改良轉(zhuǎn)基因育種
        2.3 香蕉抗病基因和枯萎病菌致病基因的挖掘
            2.3.1 香蕉抗病基因的挖掘
            2.3.2 枯萎病菌致病相關(guān)基因的挖掘
    3 P.indica增強植物抗病性研究現(xiàn)狀
    4 本研究的意義及主要內(nèi)容
        4.1 研究意義
        4.2 主要研究內(nèi)容
第二章 P.indica和FocTR4對香蕉生長素含量及部分生長素相關(guān)基因表達的影響分析
    1 材料與方法
        1.1 材料
            1.1.1 植物材料
            1.1.2 試劑
        1.2 方法
            1.2.1 植物材料處理
            1.2.2 生長素含量測定
            1.2.3 RNA提取和定量反轉(zhuǎn)錄
            1.2.4 生長素相關(guān)基因的選擇
            1.2.5 實時定量PCR
    2 結(jié)果與分析
        2.1 FocTR4侵染兩個月后四組樣品表型觀察
        2.2 四組樣品生長素含量測定
        2.3 生長素相關(guān)基因的表達分析
    3 討論
第三章 香蕉Aux/IAA基因家族成員鑒定、生物信息學(xué)分析及密碼子偏好性分析
    第一節(jié) 香蕉Aux/IAA基因家族成員鑒定和生物信息學(xué)分析
        1 材料與方法
            1.1 材料
            1.2 方法
                1.2.1 數(shù)據(jù)庫檢索和理化性質(zhì)分析
                1.2.2 系統(tǒng)進化關(guān)系分析
                1.2.3 基因結(jié)構(gòu)分析
                1.2.4 染色體定位
                1.2.5 保守基序分析
                1.2.6 可變剪切驗證
        2 結(jié)果與分析
            2.1 香蕉Aux/IAA家族成員基本信息、蛋白理化性質(zhì)分析
            2.2 系統(tǒng)進化關(guān)系分析
            2.3 香蕉Aux/IAA家族成員基因結(jié)構(gòu)分析
            2.4 染色體定位分析結(jié)果
            2.5 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域和保守基序分析
            2.6 可變剪切驗證結(jié)果
        3 討論
            3.1 香蕉Aux/IAA基因家族成員較多且存在可變剪切現(xiàn)象
            3.2 保守結(jié)構(gòu)域和基序與Aux/IAA定位及功能相關(guān)
    第二節(jié) 香蕉Aux/IAA基因家族密碼子偏好性分析
        1 材料與方法
            1.1 材料
            1.2 方法
        2 結(jié)果與分析
            2.1 香蕉Aux/IAA基因家族的ENC和 GC分析
            2.2 同義密碼子相對使用度(RSCU)分析
            2.3 最優(yōu)密碼子的確定
            2.4 香蕉Aux/IAA基因家族成員堿基組成分析
            2.5 香蕉Aux/IAA基因家族成員受體系統(tǒng)選擇
        3 討論
            3.1 香蕉Aux/IAA基因家族密碼子偏好性分析
            3.2 香蕉Aux/IAA基因家族密碼子偏好性的影響因素
            3.3 香蕉Aux/IAA基因家族成員受體系統(tǒng)選擇
第四章 香蕉Aux/IAA基因家族成員啟動子順式作用元件預(yù)測與部分成員定量表達分析
    1 材料與方法
        1.1 材料
        1.2 方法
    2 結(jié)果與分析
    3 討論
第五章 香蕉Aux/IAA家族部分成員在P.indica誘導(dǎo)的FocTR4抗性中的表達分析
    1 材料與方法
        1.1 材料
        1.2 方法
    2 結(jié)果與分析
    3 討論
第六章 成員MaIAA25、MaIAA31亞細(xì)胞定位分析
    1 材料與方法
        1.1 材料
            1.1.1 植物材料
            1.1.2 載體和菌種
            1.1.3 試劑
            1.1.4 培養(yǎng)基
        1.2 方法
            1.2.1 引物設(shè)計和PCR擴增
            1.2.2 單酶切和目的片段回收
            1.2.3 重組載體構(gòu)建和大腸桿菌轉(zhuǎn)化
            1.2.4 農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化和鑒定
            1.2.5 農(nóng)桿菌介導(dǎo)法侵染洋蔥表皮細(xì)胞及顯微觀察
    2 結(jié)果與分析
    3 討論
第七章 結(jié)論與展望
    1 結(jié)論
        1.1 P.indica和FocTR4對香蕉生長素含量及部分生長素相關(guān)基因表達的影響分析
        1.2 香蕉Aux/IAA家族成員鑒定、生物信息學(xué)分析及密碼子偏好性分析
            1.2.1 香蕉Aux/IAA家族成員鑒定和生物信息學(xué)分析
            1.2.2 香蕉Aux/IAA家族成員密碼子偏好性分析
        1.3 香蕉Aux/IAA基因家族成員啟動子順式作用元件預(yù)測與部分成員定量表達分析
        1.4 香蕉Aux/IAA家族部分成員在P.indica誘導(dǎo)的FocTR4抗性中的表達分析
        1.5 成員MaIAA25、MaIAA31亞細(xì)胞定位分析
    2 展望
參考文獻
在學(xué)碩士期間發(fā)表學(xué)術(shù)論文與研究成果
致謝


【參考文獻】:
期刊論文
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[2]菌株BM-24的分離鑒定及對香蕉枯萎病菌的抑菌活性[J]. 黃霄,陳波,周登博,譚昕,張錫炎.  植物保護學(xué)報. 2013(02)
[3]不同藥劑防治香蕉枯萎病效果評價[J]. 郭立佳,楊臘英,彭軍,王國芬,梁昌聰,劉磊,黃俊生.  中國農(nóng)學(xué)通報. 2013(01)
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[5]茶樹抗寒調(diào)控轉(zhuǎn)錄因子ICE1密碼子偏性分析[J]. 時慧,王玉,楊路成,丁兆堂.  園藝學(xué)報. 2012(07)
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[8]抗枯萎病香蕉新品系農(nóng)科1號的選育[J]. 劉紹欽,梁張慧,黃熾輝,黃玉香.  廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2007(01)
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博士論文
[1]香蕉SOD基因家族的全基因組鑒定及功能分析[D]. 馮新.福建農(nóng)林大學(xué) 2016
[2]復(fù)合拮抗菌發(fā)酵液對香蕉枯萎病及土壤微生物區(qū)系的影響[D]. 周登博.海南大學(xué) 2013
[3]水稻組織特異表達啟動子的分離克隆、功能分析及應(yīng)用[D]. 葉榮建.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012

碩士論文
[1]單子葉植物基因組結(jié)構(gòu)和功能的比較基因組研究[D]. 于佳祥.華北理工大學(xué) 2016
[2]玉米苗期干旱脅迫下可變剪接及其調(diào)控因子的研究[D]. 李嬌.鄭州大學(xué) 2013
[3]香蕉枯萎病拮抗芽孢桿菌的篩選及其定殖特性研究[D]. 朱利林.海南大學(xué) 2012
[4]香蕉與枯萎病病程相關(guān)基因的鑒定[D]. 鄭雯.海南大學(xué) 2010



本文編號:3160535

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