基于蛋白質(zhì)組學(xué)與轉(zhuǎn)錄組學(xué)解析黃瓜/南瓜嫁接親和性機(jī)理
發(fā)布時(shí)間:2021-04-20 13:21
黃瓜(Cucumis sativus L.)是設(shè)施栽培的主要蔬菜作物,但其根系脆弱,對各種生物脅迫和非生物脅迫的抗性普遍較弱。研究表明,利用抗性優(yōu)良的砧木進(jìn)行嫁接栽培是提高蔬菜作物抗性的一條有效途徑,黃瓜嫁接育苗技術(shù)已廣泛應(yīng)用于園藝生產(chǎn)。但黃瓜優(yōu)良抗性砧木品種并不豐富,嫁接不親和嚴(yán)重限制了優(yōu)良砧木的有效利用,目前關(guān)于嫁接親和性的研究大多停留在生理生化方面,分子生物學(xué)方面的報(bào)道相對較少。本研究首先以嫁接成活率和幼苗質(zhì)量為指標(biāo)篩選出兩種親和性有顯著差異的南瓜砧木‘東洋神力’(Cucurbita moschata D.)和‘黑籽南瓜’(Cucurbita ficifolia Bouche);之后再以它們作砧木,以‘津春4號(hào)’黃瓜為接穗,以未嫁接和自嫁接黃瓜為對照,從蛋白質(zhì)組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)幾個(gè)方面探討了嫁接親和性的分子機(jī)制。主要研究結(jié)果如下:1.以‘津春4號(hào)’為接穗,研究抗性優(yōu)良的15種砧木南瓜品種嫁接對黃瓜植株成活率、幼苗質(zhì)量的影響。采用隸屬函數(shù)法,評(píng)價(jià)嫁接親和性對黃瓜幼苗質(zhì)量的影響。結(jié)果表明,‘東洋神力’嫁接的成活率顯著低于其它品種,幼苗質(zhì)量以砧木‘黑籽南瓜’嫁接苗幼苗質(zhì)量較高,‘東洋神力’...
【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:101 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略詞表
前言
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 嫁接親和性研究進(jìn)展
2 蛋白質(zhì)組學(xué)及其在嫁接研究中的應(yīng)用
2.1 蛋白質(zhì)組學(xué)概述
2.2 蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法
2.3 蛋白質(zhì)組學(xué)在嫁接研究中的應(yīng)用
3 轉(zhuǎn)錄組學(xué)及其在嫁接研究中的應(yīng)用
3.1 轉(zhuǎn)錄組學(xué)概述
3.2 轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法
3.3 轉(zhuǎn)錄組學(xué)在嫁接研究上的應(yīng)用
第二章 不同砧木嫁接對黃瓜嫁接苗成活率和生長的影響
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 試驗(yàn)處理
1.3 測定指標(biāo)及方法
1.4 數(shù)據(jù)處理與分析
2 結(jié)果與分析
2.1 不同砧木嫁接對黃瓜幼苗成活率的影響
2.2 不同砧木嫁接對黃瓜幼苗生長的影響
3 討論
第三章 嫁接親和/不親和對黃瓜幼苗生理特性的影響
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 試驗(yàn)處理
1.3 測定指標(biāo)及方法
1.3.1 產(chǎn)量和果實(shí)品質(zhì)
1.3.2 石蠟切片制作
1.3.3 葉綠素?zé)晒?br> 1.3.4 抗氧化酶活測定
1.3.5 苯丙素代謝途徑相關(guān)酶和物質(zhì)含量測定
1.3.6 葉綠素含量的測定
1.4 數(shù)據(jù)處理及分析
2 結(jié)果與分析
2.1 產(chǎn)量和果實(shí)品質(zhì)
2.2 隔離層的形成
2.3 抗氧化酶活性
2.4 苯丙素代謝中的酶活和物質(zhì)含量
2.5 葉綠素?zé)晒鈪?shù)以及葉綠素含量
3 討論
第四章 嫁接親和/不親和的黃瓜幼苗蛋白質(zhì)組學(xué)分析
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料與處理設(shè)置
1.2 試驗(yàn)方法
1.2.1 蛋白提取
1.2.2 2-DE
1.2.3 圖像和數(shù)據(jù)分析
1.2.4 凝膠消化,MALDI-TOF/TOF MS和數(shù)據(jù)庫搜索
1.2.5 功能分類
2 結(jié)果與討論
2.1 親和和不親和組合的葉片蛋白應(yīng)答
2.2 差異表達(dá)蛋白的功能分類與聚類分析
2.3 光合作用相關(guān)蛋白
2.4 碳水化合物與能量代謝相關(guān)蛋白
2.5 蛋白質(zhì)合成、折疊裝配和降解的相關(guān)蛋白
2.6 氨基酸代謝相關(guān)蛋白
2.7 脅迫防御相關(guān)蛋白
2.8 其他功能蛋白
3 結(jié)論
第五章 高通量測序研究親和性不同的砧木嫁接對黃瓜葉片轉(zhuǎn)錄組的影響
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料與處理設(shè)置
1.2 測定指標(biāo)和方法
1.2.1 cDNA制備和測序
1.2.2 cDNA序列裝配和功能分類
1.2.3 差異表達(dá)基因(DEGs)的鑒定
1.2.4 熒光定量PCR(qRT-PCR)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 轉(zhuǎn)錄組測序和映射到參考基因組
2.2 嫁接誘導(dǎo)的差異基因及其功能鑒定和通路顯著性富集分析
2.2.1 嫁接誘導(dǎo)的DEGs
2.2.2 DEGs的功能鑒定
2.2.3 DEGs的Pathway顯著性富集分析
2.3 嫁接親和性有關(guān)的特異DEGs
2.4 qRT-PCR對轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果進(jìn)行鑒定
3 討論
3.1 嫁接誘導(dǎo)的DEGs
3.2 與嫁接親和性有關(guān)的DEGs
3.3 代謝相關(guān)的DEGs
3.4 蛋白質(zhì)代謝相關(guān)的DEGs
3.5 運(yùn)輸相關(guān)的DEGs
3.6 轉(zhuǎn)錄調(diào)控相關(guān)的DEGs
3.7 氧化還原相關(guān)的DEGs
3.8 防御應(yīng)答相關(guān)的DEGs
3.9 信號(hào)傳導(dǎo)相關(guān)的DEGs
4 結(jié)論
全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的論文
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]黃瓜嫁接育苗技術(shù)[J]. 劉天英. 中國園藝文摘. 2013(10)
[2]植物嫁接親和性鑒定研究進(jìn)展[J]. 王威,劉燕. 湖北農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(10)
[3]設(shè)施園藝中的土壤生態(tài)問題分析及清潔生產(chǎn)對策[J]. 李萍萍. 農(nóng)業(yè)工程學(xué)報(bào). 2011(S2)
[4]嫁接與施肥對番茄產(chǎn)量及氮、磷、鉀吸收利用效率的影響[J]. 袁亭亭,宋小藝,王忠賓,楊建平,徐坤. 植物營養(yǎng)與肥料學(xué)報(bào). 2011(01)
[5]葡萄不同砧穗組合嫁接親和力研究[J]. 楊瑞,郝燕,王玉安,張輝元. 中外葡萄與葡萄酒. 2010(01)
[6]黃瓜嫁接苗和自根苗的蛋白質(zhì)組學(xué)研究[J]. 李躍建,梁根云,劉小俊,劉獨(dú)臣,房超. 園藝學(xué)報(bào). 2009(08)
[7]不同基因型砧木嫁接黃瓜結(jié)瓜盛期光合特性的比較[J]. 李欣,申書興,高彥魁,陳學(xué)平,李曉峰. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2007(02)
[8]嫁接對薄皮甜瓜光合特性、產(chǎn)量與含糖量的影響[J]. 齊紅巖,李天來,劉軼飛,李丹. 沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2006(02)
[9]砧木對嫁接西瓜生長發(fā)育、產(chǎn)量和品質(zhì)的影響[J]. 韓志平,郭世榮,朱國榮,歐陽以勇. 中國蔬菜. 2006(02)
[10]嫁接黃瓜的光合特性及葉片激素含量和可溶性蛋白研究[J]. 曾義安,朱月林,黃保健,楊立飛. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2005(01)
博士論文
[1]榨菜與紫甘藍(lán)嫁接嵌合體后代葉形變異產(chǎn)生的分子機(jī)理及新種質(zhì)的創(chuàng)制[D]. 李俊星.浙江大學(xué) 2013
[2]西瓜氮素養(yǎng)分高效吸收利用的機(jī)制研究[D]. 劉娜.浙江大學(xué) 2013
[3]砧用南瓜提高黃瓜嫁接苗耐鹽性的生理機(jī)制及蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D]. 王麗萍.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
碩士論文
[1]四季蜜龍眼LFY基因啟動(dòng)子克隆及嫁接新梢轉(zhuǎn)錄組測序與分析[D]. 孟珊.福建農(nóng)林大學(xué) 2013
[2]黃瓜嫁接砧木的篩選及親和性機(jī)理研究[D]. 劉芬.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[3]影響美國黑核桃嫁接成活率的生理生化特性分析及初步選優(yōu)[D]. 宋紅苗.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2004
[4]葡萄品種嫁接親和力的研究[D]. 武季玲.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2001
本文編號(hào):3149760
【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:101 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
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摘要
ABSTRACT
縮略詞表
前言
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 嫁接親和性研究進(jìn)展
2 蛋白質(zhì)組學(xué)及其在嫁接研究中的應(yīng)用
2.1 蛋白質(zhì)組學(xué)概述
2.2 蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法
2.3 蛋白質(zhì)組學(xué)在嫁接研究中的應(yīng)用
3 轉(zhuǎn)錄組學(xué)及其在嫁接研究中的應(yīng)用
3.1 轉(zhuǎn)錄組學(xué)概述
3.2 轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法
3.3 轉(zhuǎn)錄組學(xué)在嫁接研究上的應(yīng)用
第二章 不同砧木嫁接對黃瓜嫁接苗成活率和生長的影響
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 試驗(yàn)處理
1.3 測定指標(biāo)及方法
1.4 數(shù)據(jù)處理與分析
2 結(jié)果與分析
2.1 不同砧木嫁接對黃瓜幼苗成活率的影響
2.2 不同砧木嫁接對黃瓜幼苗生長的影響
3 討論
第三章 嫁接親和/不親和對黃瓜幼苗生理特性的影響
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 試驗(yàn)處理
1.3 測定指標(biāo)及方法
1.3.1 產(chǎn)量和果實(shí)品質(zhì)
1.3.2 石蠟切片制作
1.3.3 葉綠素?zé)晒?br> 1.3.4 抗氧化酶活測定
1.3.5 苯丙素代謝途徑相關(guān)酶和物質(zhì)含量測定
1.3.6 葉綠素含量的測定
1.4 數(shù)據(jù)處理及分析
2 結(jié)果與分析
2.1 產(chǎn)量和果實(shí)品質(zhì)
2.2 隔離層的形成
2.3 抗氧化酶活性
2.4 苯丙素代謝中的酶活和物質(zhì)含量
2.5 葉綠素?zé)晒鈪?shù)以及葉綠素含量
3 討論
第四章 嫁接親和/不親和的黃瓜幼苗蛋白質(zhì)組學(xué)分析
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料與處理設(shè)置
1.2 試驗(yàn)方法
1.2.1 蛋白提取
1.2.2 2-DE
1.2.3 圖像和數(shù)據(jù)分析
1.2.4 凝膠消化,MALDI-TOF/TOF MS和數(shù)據(jù)庫搜索
1.2.5 功能分類
2 結(jié)果與討論
2.1 親和和不親和組合的葉片蛋白應(yīng)答
2.2 差異表達(dá)蛋白的功能分類與聚類分析
2.3 光合作用相關(guān)蛋白
2.4 碳水化合物與能量代謝相關(guān)蛋白
2.5 蛋白質(zhì)合成、折疊裝配和降解的相關(guān)蛋白
2.6 氨基酸代謝相關(guān)蛋白
2.7 脅迫防御相關(guān)蛋白
2.8 其他功能蛋白
3 結(jié)論
第五章 高通量測序研究親和性不同的砧木嫁接對黃瓜葉片轉(zhuǎn)錄組的影響
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料與處理設(shè)置
1.2 測定指標(biāo)和方法
1.2.1 cDNA制備和測序
1.2.2 cDNA序列裝配和功能分類
1.2.3 差異表達(dá)基因(DEGs)的鑒定
1.2.4 熒光定量PCR(qRT-PCR)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 轉(zhuǎn)錄組測序和映射到參考基因組
2.2 嫁接誘導(dǎo)的差異基因及其功能鑒定和通路顯著性富集分析
2.2.1 嫁接誘導(dǎo)的DEGs
2.2.2 DEGs的功能鑒定
2.2.3 DEGs的Pathway顯著性富集分析
2.3 嫁接親和性有關(guān)的特異DEGs
2.4 qRT-PCR對轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果進(jìn)行鑒定
3 討論
3.1 嫁接誘導(dǎo)的DEGs
3.2 與嫁接親和性有關(guān)的DEGs
3.3 代謝相關(guān)的DEGs
3.4 蛋白質(zhì)代謝相關(guān)的DEGs
3.5 運(yùn)輸相關(guān)的DEGs
3.6 轉(zhuǎn)錄調(diào)控相關(guān)的DEGs
3.7 氧化還原相關(guān)的DEGs
3.8 防御應(yīng)答相關(guān)的DEGs
3.9 信號(hào)傳導(dǎo)相關(guān)的DEGs
4 結(jié)論
全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的論文
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]黃瓜嫁接育苗技術(shù)[J]. 劉天英. 中國園藝文摘. 2013(10)
[2]植物嫁接親和性鑒定研究進(jìn)展[J]. 王威,劉燕. 湖北農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(10)
[3]設(shè)施園藝中的土壤生態(tài)問題分析及清潔生產(chǎn)對策[J]. 李萍萍. 農(nóng)業(yè)工程學(xué)報(bào). 2011(S2)
[4]嫁接與施肥對番茄產(chǎn)量及氮、磷、鉀吸收利用效率的影響[J]. 袁亭亭,宋小藝,王忠賓,楊建平,徐坤. 植物營養(yǎng)與肥料學(xué)報(bào). 2011(01)
[5]葡萄不同砧穗組合嫁接親和力研究[J]. 楊瑞,郝燕,王玉安,張輝元. 中外葡萄與葡萄酒. 2010(01)
[6]黃瓜嫁接苗和自根苗的蛋白質(zhì)組學(xué)研究[J]. 李躍建,梁根云,劉小俊,劉獨(dú)臣,房超. 園藝學(xué)報(bào). 2009(08)
[7]不同基因型砧木嫁接黃瓜結(jié)瓜盛期光合特性的比較[J]. 李欣,申書興,高彥魁,陳學(xué)平,李曉峰. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2007(02)
[8]嫁接對薄皮甜瓜光合特性、產(chǎn)量與含糖量的影響[J]. 齊紅巖,李天來,劉軼飛,李丹. 沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2006(02)
[9]砧木對嫁接西瓜生長發(fā)育、產(chǎn)量和品質(zhì)的影響[J]. 韓志平,郭世榮,朱國榮,歐陽以勇. 中國蔬菜. 2006(02)
[10]嫁接黃瓜的光合特性及葉片激素含量和可溶性蛋白研究[J]. 曾義安,朱月林,黃保健,楊立飛. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2005(01)
博士論文
[1]榨菜與紫甘藍(lán)嫁接嵌合體后代葉形變異產(chǎn)生的分子機(jī)理及新種質(zhì)的創(chuàng)制[D]. 李俊星.浙江大學(xué) 2013
[2]西瓜氮素養(yǎng)分高效吸收利用的機(jī)制研究[D]. 劉娜.浙江大學(xué) 2013
[3]砧用南瓜提高黃瓜嫁接苗耐鹽性的生理機(jī)制及蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D]. 王麗萍.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
碩士論文
[1]四季蜜龍眼LFY基因啟動(dòng)子克隆及嫁接新梢轉(zhuǎn)錄組測序與分析[D]. 孟珊.福建農(nóng)林大學(xué) 2013
[2]黃瓜嫁接砧木的篩選及親和性機(jī)理研究[D]. 劉芬.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[3]影響美國黑核桃嫁接成活率的生理生化特性分析及初步選優(yōu)[D]. 宋紅苗.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2004
[4]葡萄品種嫁接親和力的研究[D]. 武季玲.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2001
本文編號(hào):3149760
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