森林草莓基因組中DNA甲基化修飾酶基因的鑒定及初步研究
發(fā)布時間:2021-04-05 23:52
DNA甲基化是植物重要的表觀遺傳修飾之一。目前,已發(fā)現(xiàn)DNA甲基化與植物的生長發(fā)育、形態(tài)建成等方面有著密切的聯(lián)系,但是關于DNA甲基化對植物果實發(fā)育的影響,尤其是對非呼吸躍變型果實發(fā)育影響的研究很少。在本研究中,我們首先對森林草毒(Fragaria vesca)等作物中的DNA甲基化修飾基因進行了鑒定,發(fā)現(xiàn)森林草莓中有9個含DNA甲基轉移酶結構域的基因(包括8個DNA甲基化酶基因,1個tRNA甲基化酶基因),以及4個DNA去甲基化酶基因。對鑒定出的這些基因進行進化分析、結構域分析、motif結構、外顯子結構等分析,發(fā)現(xiàn)也可分為與之前研究相一致的幾類。森林草莓的甲基化酶分為四類,其中CMT3家族有3個,MET1家族有1個,DRM1/2家族有4個,甲基化tRNA的DNMT2家族有1個;DNA去甲基化酶有兩類,其中DME家族有1個,DML(ROS1、DML2、DML3)家族有3個。前人研究表明,森林草莓從薔薇科分化出來后,近期并未發(fā)生明顯的基因復制事件,我們的Mcscan結果也發(fā)現(xiàn):森林草莓中已鑒定出的這些基因,近期并未涉及全基因組擴張事件(Whole-genome duplications...
【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:79 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
DNA甲基化酶和去甲基化酶基因在15個物種中的分布數(shù)目Figure2-1NumbersofinvestigatedgenesencodingDNAmethyltransferaseanddemethylaseinthe15species
2.2?DNA甲基化修飾酶基因在森林草莓果實發(fā)育后期的表達情況分析??我們選取了草莓果實發(fā)育及成熟過程中的五個關鍵時期:大綠果期、白果期、轉??色前期、粉果期、紅果期(圖3-2),并用qRT-RCR檢測了草莓果實發(fā)育及成熟過程??中幾個關鍵時期,DNA甲基化酶基因和DNA去甲基化酶基因的表達情況(圖3-3)。??觀察果實發(fā)育后期的表達情況(圖3-3),發(fā)現(xiàn)八個DNA甲基化酶中有三種??(抑-艦/辦/〇從2,?Fv-we/Z^/os#,Fv-wcY/y/teeP)在轉色前期表達量最高,三種??(Fv-嫌/%/os’e7,jPv-we/Z^/as^,/^-艦 ̄/似65)在粉果期表達量最高。四個DNA??去甲基化酶基因中有兩個(Fv-Jeme/Z^/ave/,?Fv-tfewe//2_y/osx,J)是在轉色前期表達量??最高。從RT-qRCR結果整體來看,有很多DNA甲基化酶和DNA去甲基化酶基因都??是在轉色前期或粉果期表達量最高
Fv-demethylase1??Fv:dIml。樱。幔桑澹?DME-丨?ike(DML)??圖3-3?DNA甲基化酶基因和DNA去甲基化酶基因在果實不同發(fā)育時期的表達情況??Figure3-3?Expression?proiles?of?DNA?methylase?genes?and?DNA?demethylase?genes??during?fr
【參考文獻】:
期刊論文
[1]鹽脅迫對植物影響的研究進展[J]. 孫曰波,楊志瑩,趙從凱. 濰坊高等職業(yè)教育. 2014(03)
[2]干旱脅迫對黃瓜幼苗葉綠素含量和光合特性的影響[J]. 吳順,張雪芹,蔡燕. 中國農(nóng)學通報. 2014(01)
[3]DNA甲基化在植物抗逆反應中的研究進展及其育種應用[J]. 黃菲,李雪梅,王文生,傅彬英. 中國農(nóng)業(yè)科技導報. 2013(06)
[4]干旱脅迫下馬鈴薯幼苗DNA甲基化研究[J]. 李媛媛,程鵬,熊興耀,洪亞輝. 中國馬鈴薯. 2012(01)
[5]5-氮雜胞苷對小麥生長發(fā)育及DNA甲基化的影響[J]. 陳芳,王子成. 河南大學學報(自然科學版). 2011(01)
[6]近30a黃淮海農(nóng)作區(qū)冬小麥單產(chǎn)潛力的影響因素分析[J]. 王宏,陳阜,石全紅,范士超,褚慶全. 農(nóng)業(yè)工程學報. 2010(S1)
[7]DNA甲基化及其對植物發(fā)育的調控[J]. 關錄飛,吳笑女,徐啟江. 生物技術通訊. 2008(04)
[8]植物表觀遺傳與DNA甲基化[J]. 屠發(fā)志,彭世清. 生物技術通訊. 2007(01)
[9]鹽脅迫對植物影響的研究進展[J]. 楊少輝,季靜,王罡,宋英今. 分子植物育種. 2006(S1)
[10]水稻冷脅迫誘導的甲基化差異片段CIDM7的分離和分析[J]. 華揚,陳學峰,熊建華,張義平,朱英國. 遺傳. 2005(04)
博士論文
[1]干旱脅迫誘導水稻產(chǎn)生可遺傳表觀遺傳變異及其相關生理代謝變化的研究[D]. 張春玉.東北師范大學 2013
[2]玉米冷脅迫反應的表觀調控機制[D]. 胡勇.武漢大學 2012
[3]蘿卜春化作用及其與DNA甲基化水平的關系[D]. 汪炳良.浙江大學 2004
碩士論文
[1]全基因組DNA甲基化對甘藍型油菜春化作用的影響[D]. 高金燕.鄭州大學 2012
[2]干旱脅迫及海水栽培對茄子生長和生理特性的影響[D]. 王建國.南京農(nóng)業(yè)大學 2008
本文編號:3120338
【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:79 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
DNA甲基化酶和去甲基化酶基因在15個物種中的分布數(shù)目Figure2-1NumbersofinvestigatedgenesencodingDNAmethyltransferaseanddemethylaseinthe15species
2.2?DNA甲基化修飾酶基因在森林草莓果實發(fā)育后期的表達情況分析??我們選取了草莓果實發(fā)育及成熟過程中的五個關鍵時期:大綠果期、白果期、轉??色前期、粉果期、紅果期(圖3-2),并用qRT-RCR檢測了草莓果實發(fā)育及成熟過程??中幾個關鍵時期,DNA甲基化酶基因和DNA去甲基化酶基因的表達情況(圖3-3)。??觀察果實發(fā)育后期的表達情況(圖3-3),發(fā)現(xiàn)八個DNA甲基化酶中有三種??(抑-艦/辦/〇從2,?Fv-we/Z^/os#,Fv-wcY/y/teeP)在轉色前期表達量最高,三種??(Fv-嫌/%/os’e7,jPv-we/Z^/as^,/^-艦 ̄/似65)在粉果期表達量最高。四個DNA??去甲基化酶基因中有兩個(Fv-Jeme/Z^/ave/,?Fv-tfewe//2_y/osx,J)是在轉色前期表達量??最高。從RT-qRCR結果整體來看,有很多DNA甲基化酶和DNA去甲基化酶基因都??是在轉色前期或粉果期表達量最高
Fv-demethylase1??Fv:dIml。樱。幔桑澹?DME-丨?ike(DML)??圖3-3?DNA甲基化酶基因和DNA去甲基化酶基因在果實不同發(fā)育時期的表達情況??Figure3-3?Expression?proiles?of?DNA?methylase?genes?and?DNA?demethylase?genes??during?fr
【參考文獻】:
期刊論文
[1]鹽脅迫對植物影響的研究進展[J]. 孫曰波,楊志瑩,趙從凱. 濰坊高等職業(yè)教育. 2014(03)
[2]干旱脅迫對黃瓜幼苗葉綠素含量和光合特性的影響[J]. 吳順,張雪芹,蔡燕. 中國農(nóng)學通報. 2014(01)
[3]DNA甲基化在植物抗逆反應中的研究進展及其育種應用[J]. 黃菲,李雪梅,王文生,傅彬英. 中國農(nóng)業(yè)科技導報. 2013(06)
[4]干旱脅迫下馬鈴薯幼苗DNA甲基化研究[J]. 李媛媛,程鵬,熊興耀,洪亞輝. 中國馬鈴薯. 2012(01)
[5]5-氮雜胞苷對小麥生長發(fā)育及DNA甲基化的影響[J]. 陳芳,王子成. 河南大學學報(自然科學版). 2011(01)
[6]近30a黃淮海農(nóng)作區(qū)冬小麥單產(chǎn)潛力的影響因素分析[J]. 王宏,陳阜,石全紅,范士超,褚慶全. 農(nóng)業(yè)工程學報. 2010(S1)
[7]DNA甲基化及其對植物發(fā)育的調控[J]. 關錄飛,吳笑女,徐啟江. 生物技術通訊. 2008(04)
[8]植物表觀遺傳與DNA甲基化[J]. 屠發(fā)志,彭世清. 生物技術通訊. 2007(01)
[9]鹽脅迫對植物影響的研究進展[J]. 楊少輝,季靜,王罡,宋英今. 分子植物育種. 2006(S1)
[10]水稻冷脅迫誘導的甲基化差異片段CIDM7的分離和分析[J]. 華揚,陳學峰,熊建華,張義平,朱英國. 遺傳. 2005(04)
博士論文
[1]干旱脅迫誘導水稻產(chǎn)生可遺傳表觀遺傳變異及其相關生理代謝變化的研究[D]. 張春玉.東北師范大學 2013
[2]玉米冷脅迫反應的表觀調控機制[D]. 胡勇.武漢大學 2012
[3]蘿卜春化作用及其與DNA甲基化水平的關系[D]. 汪炳良.浙江大學 2004
碩士論文
[1]全基因組DNA甲基化對甘藍型油菜春化作用的影響[D]. 高金燕.鄭州大學 2012
[2]干旱脅迫及海水栽培對茄子生長和生理特性的影響[D]. 王建國.南京農(nóng)業(yè)大學 2008
本文編號:3120338
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