LeCTR4svZS克隆表達(dá)分析以及超表達(dá)番茄植株獲得
發(fā)布時間:2021-03-21 20:51
乙烯信號轉(zhuǎn)導(dǎo)負(fù)調(diào)控因子Raf類蛋白激酶CTR在植物生長發(fā)育過程中有著重要的作用,番茄CTR屬于多基因家族,有LeCTR1, LeCTR2, LeCTR3, LeCTR4個成員,其中LeCTR4有多個剪切本,其生物學(xué)作用目前尚不清楚。在乙烯條件下,LeCTR1的表達(dá)量上升,隨著果實的成熟,LeCTR1的表達(dá)量也會隨之上升。LeCTR3和LeCTR4在葉片中表達(dá)量較高,并且對乙烯不敏感。表明多基因家族成員有著各自不同的功能。本研究通過克隆LeCTR4sv1發(fā)現(xiàn)了一個新的LeCTR4svZS轉(zhuǎn)錄本,分析發(fā)現(xiàn)其具有Raf類蛋白激酶CTR4的結(jié)構(gòu),并有miR1917剪切位點,并通過番茄組織特異性表達(dá)研究,弄清其在番茄發(fā)育過程中的時空表達(dá)模式,通過構(gòu)建LeCTR4svZS和抗miR1917剪切的mLeCTR4svZS的超表達(dá)植株。為進(jìn)一步了解乙烯信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑和選擇性剪切奠定基礎(chǔ)。主要結(jié)果如下:1.在中蔬六號番茄中,克隆得到CTR4一個新的轉(zhuǎn)錄本(CTR4svZS),通過序列比對,發(fā)現(xiàn)其序列比NCBI數(shù)據(jù)庫的CTR4sv1ORF區(qū)多了一段序列,運用生物信息學(xué)手段發(fā)現(xiàn)CTR4svZS具有CTR家族基因...
【文章來源】:沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:62 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 前言
1.1 乙烯
1.2 乙烯轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑
1.2.1 乙烯受體
1.2.2 CTR基因家族
1.2.3 EIN2,EIN5,EIN6,EIN7及下游轉(zhuǎn)錄因子
1.3 miRNA簡介
1.4 選擇性剪切
1.5 研究的目的與意義
2 實驗材料與方法
2.1 實驗材料
2.1.1 材料處理與采集
2.1.2 實驗藥品及載體
2.2 試驗方法
2.2.1 番茄CTR4svZS基因克隆
2.2.2 生物信息學(xué)分析
2.2.3 qRT-PCR分析番茄CTR基因家族成員表達(dá)量變化
2.2.4 qRT-PCR分析番茄miRNA1917表達(dá)量變化
2.2.5 脫落率調(diào)查
2.2.6 CTR4svZS(miR1917位點未突變)轉(zhuǎn)基因重組質(zhì)粒構(gòu)建
2.2.7 CTR4svZS(miR1917位點突變)轉(zhuǎn)基因重組質(zhì)粒構(gòu)建
2.2.8 CTR4svZS(miR1917位點未突變)及mCTR4svZS(miR1917位點突變)重組質(zhì)粒農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化
2.2.9 CTR4svZS(miR1917位點未突變)及mCTR4svZS(miR1917位點突變)轉(zhuǎn)基因番茄遺傳轉(zhuǎn)化
2.2.10 T0代轉(zhuǎn)基因番茄植株陽性鑒定
3 結(jié)果與分析
3.1 番茄CTR4svZS序列分析
3.2 生物信息學(xué)分析
3.2.1 蛋白理化分析
3.2.2 二級結(jié)構(gòu)域分析
3.2.3 系統(tǒng)進(jìn)化樹
3.2.4 外顯子內(nèi)含子分析
3.3 番茄CTR家族成員在番茄生長發(fā)育不同時期的qRT-PCR分析
3.4 CTR4svZS及miR1917在番茄發(fā)育不同時期qRT-PCR分析
3.5 低溫脅迫下CTR基因家族成員qRT-PCR分析
3.6 低溫脅迫下CTR4svZS及miRl917 qRT-PCR分析
3.7 脫落率調(diào)查
3.8 乙烯及1-mcp處理對CTR基因家族不同成員表達(dá)量的影響
3.8.1 非處理條件下,CTR基因家族成員表達(dá)量分析
3.8.2 乙烯處理對CTR基因家族成員的影響
3.8.3 1-mcp處理對CTR基因家族成員的影響
3.9 Gateway TOPO入門重組質(zhì)粒菌落PCR電泳檢測
3.10 LR反應(yīng)構(gòu)建轉(zhuǎn)基因終載重組質(zhì)粒
3.11 CTR4svZS及mCTR4svZS轉(zhuǎn)基因植株獲得
3.12 T0代轉(zhuǎn)基因番茄PCR擴(kuò)增檢測
4 結(jié)果與討論
4.1 CTR4svZS是CTR4基因的一個新的轉(zhuǎn)錄本
4.2 乙烯對番茄CTR基因家族成員的表達(dá)調(diào)控
4.3 低溫脅迫對番茄CTR基因家族的表達(dá)調(diào)控
4.4 miR1917在果實成熟和脫落中的表達(dá)變化
4.5 CTR4svZS突變及CTR4svZS未突變轉(zhuǎn)基因番茄T0代植株獲得
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]植物乙烯信號轉(zhuǎn)導(dǎo)研究進(jìn)展[J]. 牟望舒,應(yīng)鐵進(jìn). 園藝學(xué)報. 2014(09)
[2]植物miRNA的進(jìn)化[J]. 魏強(qiáng),梁永宏,李廣林. 遺傳. 2013(03)
[3]siRNA與miRNA在生物體基因調(diào)控中沉默機(jī)制的比較[J]. 張超,龐全海. 中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報. 2012(05)
[4]miRNA*生物合成及其功能研究的新發(fā)現(xiàn)[J]. 馬圣運,白玉,韓凝,王君暉,翁曉燕,邊紅武,朱睦元. 遺傳. 2012(04)
[5]MicroRNAs in tomato plants[J]. ZUO JinHua,WANG YunXiang,LIU HaiPing,MA YuanZheng,JU Zheng,ZHAI BaiQiang,FU DaQi,ZHU Yi,LUO YunBo & ZHU BenZhong College of Food Science and Nutritional Engineering,China Agricultural University,Beijing 100083,China. Science China(Life Sciences). 2011(07)
[6]番茄中microRNAs研究進(jìn)展[J]. 左進(jìn)華,王云香,劉海萍,馬遠(yuǎn)征,鞠正,翟百強(qiáng),傅達(dá)奇,朱毅,羅云波,朱本忠. 中國科學(xué):生命科學(xué). 2011(05)
[7]Ctr1基因mRNA轉(zhuǎn)錄水平與細(xì)胞內(nèi)銅離子濃度的相關(guān)性[J]. 付世新,王瑤,羅春海,張麗,齊長學(xué). 中國生物制品學(xué)雜志. 2010(05)
[8]小麥類CTR1基因的克隆和特性分析[J]. 秘彩莉,溫小杰,張學(xué)勇,劉旭. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2009(11)
[9]植物逆境miRNA研究進(jìn)展[J]. 沈亞歐,林海建,張志明,高世斌,潘光堂. 遺傳. 2009(03)
[10]乙烯的生物合成與信號傳遞[J]. 陳濤,張勁松. 植物學(xué)通報. 2006(05)
博士論文
[1]黃瓜乙烯信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑相關(guān)基因的克隆分析及黃瓜遺傳轉(zhuǎn)化體系研究[D]. 別蓓蓓.上海交通大學(xué) 2014
[2]SEPALLATA類MADS盒基因SLMBP21參與番茄花柄離區(qū)發(fā)育的分子機(jī)制研究[D]. 劉旦梅.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013
[3]乙烯調(diào)控的生長素合成控制體細(xì)胞胚胎發(fā)生的分子機(jī)理[D]. 白波.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[4]MicorRNA調(diào)節(jié)胡楊抗逆性狀的分子機(jī)制研究[D]. 李博生.北京林業(yè)大學(xué) 2013
[5]外源乙烯通過調(diào)節(jié)乙烯受體和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)元件基因表達(dá)影響月季切花開放[D]. 譚輝.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
碩士論文
[1]乙烯影響雌配子發(fā)育的分子機(jī)制研究[D]. 滕曉棟.上海師范大學(xué) 2014
[2]甜瓜乙烯信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑關(guān)鍵因子CTR1基因的克隆及表達(dá)特性分析[D]. 姚遠(yuǎn).內(nèi)蒙古大學(xué) 2011
[3]甜櫻桃果實中五個乙烯信號轉(zhuǎn)導(dǎo)基因的克隆及其表達(dá)[D]. 吳艷艷.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
本文編號:3093523
【文章來源】:沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:62 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 前言
1.1 乙烯
1.2 乙烯轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑
1.2.1 乙烯受體
1.2.2 CTR基因家族
1.2.3 EIN2,EIN5,EIN6,EIN7及下游轉(zhuǎn)錄因子
1.3 miRNA簡介
1.4 選擇性剪切
1.5 研究的目的與意義
2 實驗材料與方法
2.1 實驗材料
2.1.1 材料處理與采集
2.1.2 實驗藥品及載體
2.2 試驗方法
2.2.1 番茄CTR4svZS基因克隆
2.2.2 生物信息學(xué)分析
2.2.3 qRT-PCR分析番茄CTR基因家族成員表達(dá)量變化
2.2.4 qRT-PCR分析番茄miRNA1917表達(dá)量變化
2.2.5 脫落率調(diào)查
2.2.6 CTR4svZS(miR1917位點未突變)轉(zhuǎn)基因重組質(zhì)粒構(gòu)建
2.2.7 CTR4svZS(miR1917位點突變)轉(zhuǎn)基因重組質(zhì)粒構(gòu)建
2.2.8 CTR4svZS(miR1917位點未突變)及mCTR4svZS(miR1917位點突變)重組質(zhì)粒農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化
2.2.9 CTR4svZS(miR1917位點未突變)及mCTR4svZS(miR1917位點突變)轉(zhuǎn)基因番茄遺傳轉(zhuǎn)化
2.2.10 T0代轉(zhuǎn)基因番茄植株陽性鑒定
3 結(jié)果與分析
3.1 番茄CTR4svZS序列分析
3.2 生物信息學(xué)分析
3.2.1 蛋白理化分析
3.2.2 二級結(jié)構(gòu)域分析
3.2.3 系統(tǒng)進(jìn)化樹
3.2.4 外顯子內(nèi)含子分析
3.3 番茄CTR家族成員在番茄生長發(fā)育不同時期的qRT-PCR分析
3.4 CTR4svZS及miR1917在番茄發(fā)育不同時期qRT-PCR分析
3.5 低溫脅迫下CTR基因家族成員qRT-PCR分析
3.6 低溫脅迫下CTR4svZS及miRl917 qRT-PCR分析
3.7 脫落率調(diào)查
3.8 乙烯及1-mcp處理對CTR基因家族不同成員表達(dá)量的影響
3.8.1 非處理條件下,CTR基因家族成員表達(dá)量分析
3.8.2 乙烯處理對CTR基因家族成員的影響
3.8.3 1-mcp處理對CTR基因家族成員的影響
3.9 Gateway TOPO入門重組質(zhì)粒菌落PCR電泳檢測
3.10 LR反應(yīng)構(gòu)建轉(zhuǎn)基因終載重組質(zhì)粒
3.11 CTR4svZS及mCTR4svZS轉(zhuǎn)基因植株獲得
3.12 T0代轉(zhuǎn)基因番茄PCR擴(kuò)增檢測
4 結(jié)果與討論
4.1 CTR4svZS是CTR4基因的一個新的轉(zhuǎn)錄本
4.2 乙烯對番茄CTR基因家族成員的表達(dá)調(diào)控
4.3 低溫脅迫對番茄CTR基因家族的表達(dá)調(diào)控
4.4 miR1917在果實成熟和脫落中的表達(dá)變化
4.5 CTR4svZS突變及CTR4svZS未突變轉(zhuǎn)基因番茄T0代植株獲得
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]植物乙烯信號轉(zhuǎn)導(dǎo)研究進(jìn)展[J]. 牟望舒,應(yīng)鐵進(jìn). 園藝學(xué)報. 2014(09)
[2]植物miRNA的進(jìn)化[J]. 魏強(qiáng),梁永宏,李廣林. 遺傳. 2013(03)
[3]siRNA與miRNA在生物體基因調(diào)控中沉默機(jī)制的比較[J]. 張超,龐全海. 中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報. 2012(05)
[4]miRNA*生物合成及其功能研究的新發(fā)現(xiàn)[J]. 馬圣運,白玉,韓凝,王君暉,翁曉燕,邊紅武,朱睦元. 遺傳. 2012(04)
[5]MicroRNAs in tomato plants[J]. ZUO JinHua,WANG YunXiang,LIU HaiPing,MA YuanZheng,JU Zheng,ZHAI BaiQiang,FU DaQi,ZHU Yi,LUO YunBo & ZHU BenZhong College of Food Science and Nutritional Engineering,China Agricultural University,Beijing 100083,China. Science China(Life Sciences). 2011(07)
[6]番茄中microRNAs研究進(jìn)展[J]. 左進(jìn)華,王云香,劉海萍,馬遠(yuǎn)征,鞠正,翟百強(qiáng),傅達(dá)奇,朱毅,羅云波,朱本忠. 中國科學(xué):生命科學(xué). 2011(05)
[7]Ctr1基因mRNA轉(zhuǎn)錄水平與細(xì)胞內(nèi)銅離子濃度的相關(guān)性[J]. 付世新,王瑤,羅春海,張麗,齊長學(xué). 中國生物制品學(xué)雜志. 2010(05)
[8]小麥類CTR1基因的克隆和特性分析[J]. 秘彩莉,溫小杰,張學(xué)勇,劉旭. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2009(11)
[9]植物逆境miRNA研究進(jìn)展[J]. 沈亞歐,林海建,張志明,高世斌,潘光堂. 遺傳. 2009(03)
[10]乙烯的生物合成與信號傳遞[J]. 陳濤,張勁松. 植物學(xué)通報. 2006(05)
博士論文
[1]黃瓜乙烯信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑相關(guān)基因的克隆分析及黃瓜遺傳轉(zhuǎn)化體系研究[D]. 別蓓蓓.上海交通大學(xué) 2014
[2]SEPALLATA類MADS盒基因SLMBP21參與番茄花柄離區(qū)發(fā)育的分子機(jī)制研究[D]. 劉旦梅.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013
[3]乙烯調(diào)控的生長素合成控制體細(xì)胞胚胎發(fā)生的分子機(jī)理[D]. 白波.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[4]MicorRNA調(diào)節(jié)胡楊抗逆性狀的分子機(jī)制研究[D]. 李博生.北京林業(yè)大學(xué) 2013
[5]外源乙烯通過調(diào)節(jié)乙烯受體和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)元件基因表達(dá)影響月季切花開放[D]. 譚輝.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
碩士論文
[1]乙烯影響雌配子發(fā)育的分子機(jī)制研究[D]. 滕曉棟.上海師范大學(xué) 2014
[2]甜瓜乙烯信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑關(guān)鍵因子CTR1基因的克隆及表達(dá)特性分析[D]. 姚遠(yuǎn).內(nèi)蒙古大學(xué) 2011
[3]甜櫻桃果實中五個乙烯信號轉(zhuǎn)導(dǎo)基因的克隆及其表達(dá)[D]. 吳艷艷.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
本文編號:3093523
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