大王杜鵑（Rhododendron rex subsp.rex）為杜鵑花科（Ericaceae）杜鵑屬（Rhododendron）常綠杜鵑亞屬（Subgen.Hymenanthes）常綠小喬木,分布于云南東北部、四川西南部等地。由于長期外界人為干擾對其生境的破壞導致該物種目前呈相互隔離的片段化分布格局,其野生種群受到嚴重威脅,但目前對大王杜鵑基礎生物學方面的研究幾乎處于空白狀態(tài),特別是關于大王杜鵑基因組及遺傳標記方面的信息十分有限,嚴重阻礙了大王杜鵑遺傳多樣性和種質(zhì)資源的有效保護。鑒于此,本文在對大王杜鵑種群分布調(diào)查的基礎上,開展了大王杜鵑的轉錄組分析、環(huán)境適應性及化學物質(zhì)合成功能基因挖掘、EST-SSR和SNPs分子標記開發(fā)等方面研究,旨在為該物種的開發(fā)利用和種質(zhì)資源保護提供科學依據(jù)。主要研究結果和結論如下:1.大王杜鵑轉錄組測序分析研究基于第二代測序技術（NGS）,通過Illumina HiSeq4000測序平臺得到大王杜鵑新鮮葉片的轉錄組序列（NCBI登錄號為SRP108011）,使用Blast算法（E<1E-5）與Nr,String,Swissprot和KEGG數(shù)據(jù)庫比對... 

【文章來源】：云南大學云南省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：99 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

大王杜鵑所有unigenes長度分布

大王杜鵑Nr分布結果比較

大王杜鵑基因序列的GO綜合分析

【參考文獻】：
期刊論文
[1]藏在深閨人不識的大王杜鵑[J]. 劉芳黎,申仕康.  大自然. 2017(03)
[2]杜鵑屬植物保護生物學研究進展[J]. 馬宏,李太強,劉雄芳,萬友名,李鈺瑩,劉秀賢,李正紅.  世界林業(yè)研究. 2017(04)
[3]園林園藝中的高山杜鵑[J]. 劉娟,劉紅梅,張美娟.  園林. 2017(04)
[4]基于新一代高通量測序技術開發(fā)巨人半邊蓮Lobelia deckenii的SSR標記[J]. 米奇,龍志成,Muchuku John Kamau,陳進明,王青鋒.  植物科學學報. 2015(06)
[5]秦嶺山區(qū)美容杜鵑五個野生種群遺傳多樣性的ISSR分析[J]. 趙冰,鄭茜子,李厚華.  廣西植物. 2015(05)
[6]貴州百里杜鵑自然保護區(qū)杜鵑屬植物分子系統(tǒng)學研究[J]. 何云松,王孜昌,黃家勇,張玉武,陳翔.  種子. 2015(09)
[7]大樹杜鵑播種苗培育技術[J]. 畢瑋,陳芳,劉敏,陳偉,吳濤,李貴祥.  遼寧林業(yè)科技. 2015(03)
[8]冷休克蛋白的生物學功能研究進展[J]. 王輝,丁協(xié)剛,李世文,鄭航,鄭新民.  中華臨床醫(yī)師雜志(電子版). 2015(08)
[9]貴州30種杜鵑屬植物葉背表皮顯微形態(tài)特征[J]. 陳翔,黃承玲,張玉武,李葦潔,龍成昌.  廣西植物. 2015(01)
[10]高通量測序技術的發(fā)展及其在生命科學中的應用[J]. 杜玲,劉剛,陸健,劉丑生,哈福.  中國畜牧獸醫(yī). 2014(12)

博士論文
[1]利用RNA-seq技術在云南山茶中解析重要分子通路與開發(fā)多態(tài)性EST-SSR[D]. 姚秋陽.云南大學 2015
[2]杜仲4種活性成分合成系列基因多樣性及序列特征[D]. 李鐵柱.中南林業(yè)科技大學 2015
[3]長白山高山紅景天保護遺傳學研究[D]. 趙偉.吉林大學 2014
[4]長白山牛皮杜鵑的遺傳多樣性與分子親緣地理學研究[D]. 劉雁飛.吉林大學 2013
[5]基于EST數(shù)據(jù)庫和轉錄組測序的茶樹DNA分子標記開發(fā)與應用研究[D]. 王麗鴛.中國農(nóng)業(yè)科學院 2011

碩士論文
[1]云南轎子山大王杜鵑的種子生理及遺傳多樣性研究[D]. 蘇應雄.云南大學 2017
[2]黎平雜邊禾dss-1突變體光合生理特性及基因定位研究[D]. 陳錫.貴州大學 2016
[3]短花針茅SNP標記開發(fā)與遺傳多樣性研究[D]. 周俊梅.內(nèi)蒙古大學 2015
[4]基于NSSR和CPSSR標記的臺灣杉遺傳多樣性研究[D]. 李江偉.華中農(nóng)業(yè)大學 2014
[5]沙冬青轉錄組、小RNA組及低溫應答基因表達譜研究[D]. 宋志丹.中南林業(yè)科技大學 2012
[6]桉樹EST-SNP的開發(fā)及EST圖譜構建[D]. 張曉紅.南京林業(yè)大學 2009
[7]丹頂鶴孵卵期行為比較和親緣關系的研究[D]. 計子娟.東北農(nóng)業(yè)大學 2009
[8]百合查爾酮合成酶基因（CHS）及其啟動子的克隆與分析[D]. 楊麗.西北農(nóng)林科技大學 2006



本文編號：3089433