西南特有植物大王杜鵑的轉(zhuǎn)錄組分析與EST-SSR分子標(biāo)記開發(fā)
發(fā)布時間:2021-03-19 10:25
大王杜鵑(Rhododendron rex subsp.rex)為杜鵑花科(Ericaceae)杜鵑屬(Rhododendron)常綠杜鵑亞屬(Subgen.Hymenanthes)常綠小喬木,分布于云南東北部、四川西南部等地。由于長期外界人為干擾對其生境的破壞導(dǎo)致該物種目前呈相互隔離的片段化分布格局,其野生種群受到嚴(yán)重威脅,但目前對大王杜鵑基礎(chǔ)生物學(xué)方面的研究幾乎處于空白狀態(tài),特別是關(guān)于大王杜鵑基因組及遺傳標(biāo)記方面的信息十分有限,嚴(yán)重阻礙了大王杜鵑遺傳多樣性和種質(zhì)資源的有效保護。鑒于此,本文在對大王杜鵑種群分布調(diào)查的基礎(chǔ)上,開展了大王杜鵑的轉(zhuǎn)錄組分析、環(huán)境適應(yīng)性及化學(xué)物質(zhì)合成功能基因挖掘、EST-SSR和SNPs分子標(biāo)記開發(fā)等方面研究,旨在為該物種的開發(fā)利用和種質(zhì)資源保護提供科學(xué)依據(jù)。主要研究結(jié)果和結(jié)論如下:1.大王杜鵑轉(zhuǎn)錄組測序分析研究基于第二代測序技術(shù)(NGS),通過Illumina HiSeq4000測序平臺得到大王杜鵑新鮮葉片的轉(zhuǎn)錄組序列(NCBI登錄號為SRP108011),使用Blast算法(E<1E-5)與Nr,String,Swissprot和KEGG數(shù)據(jù)庫比對...
【文章來源】:云南大學(xué)云南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:99 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
大王杜鵑所有unigenes長度分布
大王杜鵑Nr分布結(jié)果比較
大王杜鵑基因序列的GO綜合分析
【參考文獻】:
期刊論文
[1]藏在深閨人不識的大王杜鵑[J]. 劉芳黎,申仕康. 大自然. 2017(03)
[2]杜鵑屬植物保護生物學(xué)研究進展[J]. 馬宏,李太強,劉雄芳,萬友名,李鈺瑩,劉秀賢,李正紅. 世界林業(yè)研究. 2017(04)
[3]園林園藝中的高山杜鵑[J]. 劉娟,劉紅梅,張美娟. 園林. 2017(04)
[4]基于新一代高通量測序技術(shù)開發(fā)巨人半邊蓮Lobelia deckenii的SSR標(biāo)記[J]. 米奇,龍志成,Muchuku John Kamau,陳進明,王青鋒. 植物科學(xué)學(xué)報. 2015(06)
[5]秦嶺山區(qū)美容杜鵑五個野生種群遺傳多樣性的ISSR分析[J]. 趙冰,鄭茜子,李厚華. 廣西植物. 2015(05)
[6]貴州百里杜鵑自然保護區(qū)杜鵑屬植物分子系統(tǒng)學(xué)研究[J]. 何云松,王孜昌,黃家勇,張玉武,陳翔. 種子. 2015(09)
[7]大樹杜鵑播種苗培育技術(shù)[J]. 畢瑋,陳芳,劉敏,陳偉,吳濤,李貴祥. 遼寧林業(yè)科技. 2015(03)
[8]冷休克蛋白的生物學(xué)功能研究進展[J]. 王輝,丁協(xié)剛,李世文,鄭航,鄭新民. 中華臨床醫(yī)師雜志(電子版). 2015(08)
[9]貴州30種杜鵑屬植物葉背表皮顯微形態(tài)特征[J]. 陳翔,黃承玲,張玉武,李葦潔,龍成昌. 廣西植物. 2015(01)
[10]高通量測序技術(shù)的發(fā)展及其在生命科學(xué)中的應(yīng)用[J]. 杜玲,劉剛,陸健,劉丑生,哈福. 中國畜牧獸醫(yī). 2014(12)
博士論文
[1]利用RNA-seq技術(shù)在云南山茶中解析重要分子通路與開發(fā)多態(tài)性EST-SSR[D]. 姚秋陽.云南大學(xué) 2015
[2]杜仲4種活性成分合成系列基因多樣性及序列特征[D]. 李鐵柱.中南林業(yè)科技大學(xué) 2015
[3]長白山高山紅景天保護遺傳學(xué)研究[D]. 趙偉.吉林大學(xué) 2014
[4]長白山牛皮杜鵑的遺傳多樣性與分子親緣地理學(xué)研究[D]. 劉雁飛.吉林大學(xué) 2013
[5]基于EST數(shù)據(jù)庫和轉(zhuǎn)錄組測序的茶樹DNA分子標(biāo)記開發(fā)與應(yīng)用研究[D]. 王麗鴛.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2011
碩士論文
[1]云南轎子山大王杜鵑的種子生理及遺傳多樣性研究[D]. 蘇應(yīng)雄.云南大學(xué) 2017
[2]黎平雜邊禾dss-1突變體光合生理特性及基因定位研究[D]. 陳錫.貴州大學(xué) 2016
[3]短花針茅SNP標(biāo)記開發(fā)與遺傳多樣性研究[D]. 周俊梅.內(nèi)蒙古大學(xué) 2015
[4]基于NSSR和CPSSR標(biāo)記的臺灣杉遺傳多樣性研究[D]. 李江偉.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[5]沙冬青轉(zhuǎn)錄組、小RNA組及低溫應(yīng)答基因表達譜研究[D]. 宋志丹.中南林業(yè)科技大學(xué) 2012
[6]桉樹EST-SNP的開發(fā)及EST圖譜構(gòu)建[D]. 張曉紅.南京林業(yè)大學(xué) 2009
[7]丹頂鶴孵卵期行為比較和親緣關(guān)系的研究[D]. 計子娟.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[8]百合查爾酮合成酶基因(CHS)及其啟動子的克隆與分析[D]. 楊麗.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2006
本文編號:3089433
【文章來源】:云南大學(xué)云南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:99 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
大王杜鵑所有unigenes長度分布
大王杜鵑Nr分布結(jié)果比較
大王杜鵑基因序列的GO綜合分析
【參考文獻】:
期刊論文
[1]藏在深閨人不識的大王杜鵑[J]. 劉芳黎,申仕康. 大自然. 2017(03)
[2]杜鵑屬植物保護生物學(xué)研究進展[J]. 馬宏,李太強,劉雄芳,萬友名,李鈺瑩,劉秀賢,李正紅. 世界林業(yè)研究. 2017(04)
[3]園林園藝中的高山杜鵑[J]. 劉娟,劉紅梅,張美娟. 園林. 2017(04)
[4]基于新一代高通量測序技術(shù)開發(fā)巨人半邊蓮Lobelia deckenii的SSR標(biāo)記[J]. 米奇,龍志成,Muchuku John Kamau,陳進明,王青鋒. 植物科學(xué)學(xué)報. 2015(06)
[5]秦嶺山區(qū)美容杜鵑五個野生種群遺傳多樣性的ISSR分析[J]. 趙冰,鄭茜子,李厚華. 廣西植物. 2015(05)
[6]貴州百里杜鵑自然保護區(qū)杜鵑屬植物分子系統(tǒng)學(xué)研究[J]. 何云松,王孜昌,黃家勇,張玉武,陳翔. 種子. 2015(09)
[7]大樹杜鵑播種苗培育技術(shù)[J]. 畢瑋,陳芳,劉敏,陳偉,吳濤,李貴祥. 遼寧林業(yè)科技. 2015(03)
[8]冷休克蛋白的生物學(xué)功能研究進展[J]. 王輝,丁協(xié)剛,李世文,鄭航,鄭新民. 中華臨床醫(yī)師雜志(電子版). 2015(08)
[9]貴州30種杜鵑屬植物葉背表皮顯微形態(tài)特征[J]. 陳翔,黃承玲,張玉武,李葦潔,龍成昌. 廣西植物. 2015(01)
[10]高通量測序技術(shù)的發(fā)展及其在生命科學(xué)中的應(yīng)用[J]. 杜玲,劉剛,陸健,劉丑生,哈福. 中國畜牧獸醫(yī). 2014(12)
博士論文
[1]利用RNA-seq技術(shù)在云南山茶中解析重要分子通路與開發(fā)多態(tài)性EST-SSR[D]. 姚秋陽.云南大學(xué) 2015
[2]杜仲4種活性成分合成系列基因多樣性及序列特征[D]. 李鐵柱.中南林業(yè)科技大學(xué) 2015
[3]長白山高山紅景天保護遺傳學(xué)研究[D]. 趙偉.吉林大學(xué) 2014
[4]長白山牛皮杜鵑的遺傳多樣性與分子親緣地理學(xué)研究[D]. 劉雁飛.吉林大學(xué) 2013
[5]基于EST數(shù)據(jù)庫和轉(zhuǎn)錄組測序的茶樹DNA分子標(biāo)記開發(fā)與應(yīng)用研究[D]. 王麗鴛.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2011
碩士論文
[1]云南轎子山大王杜鵑的種子生理及遺傳多樣性研究[D]. 蘇應(yīng)雄.云南大學(xué) 2017
[2]黎平雜邊禾dss-1突變體光合生理特性及基因定位研究[D]. 陳錫.貴州大學(xué) 2016
[3]短花針茅SNP標(biāo)記開發(fā)與遺傳多樣性研究[D]. 周俊梅.內(nèi)蒙古大學(xué) 2015
[4]基于NSSR和CPSSR標(biāo)記的臺灣杉遺傳多樣性研究[D]. 李江偉.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[5]沙冬青轉(zhuǎn)錄組、小RNA組及低溫應(yīng)答基因表達譜研究[D]. 宋志丹.中南林業(yè)科技大學(xué) 2012
[6]桉樹EST-SNP的開發(fā)及EST圖譜構(gòu)建[D]. 張曉紅.南京林業(yè)大學(xué) 2009
[7]丹頂鶴孵卵期行為比較和親緣關(guān)系的研究[D]. 計子娟.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[8]百合查爾酮合成酶基因(CHS)及其啟動子的克隆與分析[D]. 楊麗.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2006
本文編號:3089433
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